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            1. Guest Editorial for Special Section on the 13th International Conference on Intelligent Computing (ICIC)

            【外文期刊】 Huang, De-Shuang ; Bevilacqua, Vitoantonio ; 等 《Annals of the American Thoracic Society》 2019年16卷3期 749-750页

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            2. Capsule Network for Predicting RNA-Protein Binding Preferences Using Hybrid Feature

            【外文期刊】 Shen, Zhen ; Deng, Su-Ping ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2020年17卷5期 1483-1492页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 RNA; Proteins; Convolution;

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            3. Predicting Interactions between Virus and Host Proteins Using Repeat Patterns and Composition of Amino Acids

            【外文期刊】 Alguwaizani, Saud ; Park, Byungkyu ; 等 《Journal of healthcare engineering.》 2018年2018卷Pt.2期 art. no. 1391265-art. no. 1391265页

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            4. iRO-3wPseKNC: identify DNA replication origins by three-window-based PseKNC

            【外文期刊】 Liu, Bin ; Weng, Fan ; 等 《Bioinformatics》 2018年34卷18期 3086-3093页 SCISCIEMEDLINE

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            5. An efficient method to transcription factor binding sites imputation via simultaneous completion of multiple matrices with positional consistency

            【外文期刊】 Guo, Wei-Li ; Huang, De-Shuang ; 《Molecular bioSystems》 2017年13卷9期 1827-1837页 SCISCIEMEDLINE

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            6. Predicting Interactions Between Pathogen and Human Proteins Based on the Relation Between Sequence Length and Amino Acid Composition

            【外文期刊】 Alguwaizani, Saud ; Ren, Shulei ; 等 《Current Bioinformatics》 2021年16卷6期 799-806页

            【关键词】 Protein-protein interaction; pathogen-host interaction; machine learning;

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            7. Multi-Scale Capsule Network for Predicting DNA-Protein Binding Sites

            【外文期刊】 Zhang, Qinhu ; Yu, Wenbo ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2021年18卷5期 1793-1800页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 DNA; Machine learning; Computational modeling;

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            8. Identifying cancer-related microRNAs based on gene expression data

            【外文期刊】 Zhao, Xing-Ming ; Liu, Ke-Qin ; 等 《Bioinformatics》 2015年31卷8期 1226-1234页 SCISCIEMEDLINE

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            9. PapA, a peptidoglycan-associated protein, interacts with OmpC and maintains cell envelope integrity

            【外文期刊】 Wang, Yun-Hao ; Chen, Hong-He ; 等 《Environmental microbiology》 2021年23卷2期 600-612页 SCISCIEMEDLINE

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            10. Spatiotemporal distribution and dynamic changes of myxomycetes in subtropical forests of China

            【外文期刊】 Li, Min ; Tao, Xin ; 等 《Fungal Ecology》 2021年53卷

            【关键词】 Plasmodial slime molds; Moist chamber culture technique; Field collections;

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            11. RNA-Protein Binding Sites Prediction via Multi Scale Convolutional Gated Recurrent Unit Networks

            【外文期刊】 Shen, Zhen ; Deng, Su-Ping ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2020年17卷5期 1741-1750页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Convolution; RNA; Logic gates;

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            12. Weakly-Supervised Convolutional Neural Network Architecture for Predicting Protein-DNA Binding

            【外文期刊】 Zhang, Qinhu ; Zhu, Lin ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2020年17卷2期 679-689页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 DNA; Proteins; Convolutional neural networks;

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            13. MSIT: Malonylation Sites Identification Tree

            【外文期刊】 Bao, Wenzheng ; Huang, De-Shuang ; 等 《Current Bioinformatics》 2020年15卷1期 59-67页

            【关键词】 Post translational modification; modification sites identification; flexible neural tree;

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            14. Integrated Proteogenomic Characterization of Clear Cell Renal Cell Carcinoma

            【外文期刊】 Dhanasekaran, Saravana M. ; Leprevost, Felipe da Veiga ; 等 《Cell》 2019年179卷4期 964-+页 SCISCIEMEDLINE

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            15. Thyroid autoantibodies in pregnancy are associated with hypertensive disorders of pregnancy: Ma'anshan Birth Cohort Study

            【外文期刊】 Han, Yan ; Mao, Lei-jing ; 等 《Clinical Endocrinology》 2018年88卷6期 928-935页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 cohort study; hypertension; pregnancy;

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            16. Risk factors for pediatric intussusception complicated by loss of intestine viability in China from June 2009 to May 2014: a retrospective study

            【外文期刊】 Yao, Xian-Ming ; Chen, Zhong-Liang ; 等 《Pediatric surgery international》 2015年31卷2期 163-166页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Intussusception; Loss of intestine viability; Risk factors;

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            17. Robust Classification Method of Tumor Subtype by Using Correlation Filters

            【外文期刊】 Wang, Shu-Lin ; Zhu, Yi-Hai ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2012年9卷2期 580-591页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Correlation filters; gene expression profiles; model-based method.;

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            18. An integrated strategy for functional analysis of microbial communities based on gene ontology and 16S rRNA gene.

            【外文期刊】 Su-Ping,Deng ; De-Shuang,Huang ; 《International journal of data mining and bioinformatics》 2015年13卷1期 63-74页 SCIMEDLINEBP

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            19. Functional SNPs in the SCGB3A2 promoter are associated with susceptibility to Graves' disease.

            【外文期刊】 Huai-Dong,Song ; Jun,Liang ; 等 《Human molecular genetics》 2009年18卷6期 1156-70页 SCIMEDLINECABP

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            20. APIS: accurate prediction of hot spots in protein interfaces by combining protrusion index with solvent accessibility. oa

            【外文期刊】 Jun-Feng,Xia ; Xing-Ming,Zhao ; 等 《BMC bioinformatics》 2010年11卷 174页 SCIMEDLINEBP

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            21. scMGATGRN: a multiview graph attention network-based method for inferring gene regulatory networks from single-cell transcriptomic data.

            【外文期刊】 Lin,Yuan ; Ling,Zhao ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2024年25卷6期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 gene regulatory network; graph attention network; graph structure learning;

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            22. Mutation Analysis and Prenatal Exclusion of Fibrodysplasia Ossificans Progressiva in a Chinese Fetus.

            【外文期刊】 Juan,Du ; Ling-Li,Huang ; 等 《Genetic testing and molecular biomarkers》 SCIMEDLINEBP

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            23. Mining the bladder cancer-associated genes by an integrated strategy for the construction and analysis of differential co-expression networks. oa

            【外文期刊】 Su-Ping,Deng ; Lin,Zhu ; 等 《BMC genomics》 2015年16 Suppl 3卷 S4页 SCIMEDLINEBP

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            24. Attractant and repellent induce opposing changes in the four-helix bundle ligand-binding domain of a bacterial chemoreceptor. oa

            【外文期刊】 Lu,Guo ; Yun-Hao,Wang ; 等 《PLoS biology》 2023年21卷12期 e3002429页 SCIMEDLINECABP

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            25. [Outcome of cochlear implantation in prelingual pediatric auditory neuropathy].

            【外文期刊】 Yong-Xin,Li ; Shuang,Liang ; 等 《Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery》 2008年43卷2期 100-4页

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            26. Normalized feature vectors: a novel alignment-free sequence comparison method based on the numbers of adjacent amino acids.

            【外文期刊】 De-Shuang,Huang ; Hong-Jie,Yu ; 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 457-67页 SCIMEDLINEBP

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            27. A Gene Selection Method for Microarray Data Based on Binary PSO Encoding Gene-to-Class Sensitivity Information.

            【外文期刊】 Fei,Han ; Chun,Yang ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 85-96页 SCIMEDLINEBP

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            28. A survey on deep learning in DNA/RNA motif mining. oa

            【外文期刊】 Ying,He ; Zhen,Shen ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2021年22卷4期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 convolutional neural network; deep learning; motif mining;

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            29. Soil microbiomes divergently respond to heavy metals and polycyclic aromatic hydrocarbons in contaminated industrial sites.

            【外文期刊】 Zhen-Ni,Yang ; Ze-Shen,Liu ; 等 《Environmental science and ecotechnology》 2022年10卷 100169页

            【关键词】 Coking plant; Electronic waste; Heavy metal;

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            30. Predicting Hub Genes Associated with Cervical Cancer through Gene Co-Expression Networks.

            【外文期刊】 Su-Ping,Deng ; Lin,Zhu ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 27-35页 SCIMEDLINEBP

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            31. Completed local binary count for rotation invariant texture classification.

            【外文期刊】 Yang,Zhao ; De-Shuang,Huang ; 等 《IEEE transactions on image processing : a publication of the IEEE Signal Processing Society》 2012年21卷10期 4492-7页 SCIMEDLINE

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            32. DiscMLA: An Efficient Discriminative Motif Learning Algorithm over High-Throughput Datasets.

            【外文期刊】 Hongbo,Zhang ; Lin,Zhu ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 1810-1820页 SCIMEDLINEBP

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            33. A Deep Learning Model for RNA-Protein Binding Preference Prediction Based on Hierarchical LSTM and Attention Network.

            【外文期刊】 Zhen,Shen ; Qinhu,Zhang ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 753-762页 SCIMEDLINEBP

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            34. Engraving copper foil to give large-scale binder-free porous CuO arrays for a high-performance sodium-ion battery anode.

            【外文期刊】 Shuang,Yuan ; Xiao-lei,Huang ; 等 《Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)》 2014年26卷14期 2273-9, 2284页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 CuO nanorod arrays; anodes; binder-free electrodes;

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            35. Interpretable deep learning of single-cell and epigenetic data reveals novel molecular insights in aging.

            【外文期刊】 Zhi-Peng,Li ; Zhaozhen,Du ; 等 《Scientific reports》 2025年15卷1期 5048页

            【关键词】 AI; Aging; Deep-learning;

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            36. High-Order Convolutional Neural Network Architecture for Predicting DNA-Protein Binding Sites.

            【外文期刊】 Qinhu,Zhang ; Lin,Zhu ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 1184-1192页 SCIMEDLINEBP

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            37. Computational prediction and characterization of cell-type-specific and shared binding sites. oa

            【外文期刊】 Qinhu,Zhang ; Pengrui,Teng ; 等 《Bioinformatics (Oxford, England)》 2023年39卷1期 SCIMEDLINECABP

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            38. [Preliminary study on the efficacy and safety of oral sildenafil in pulmonary arterial hypertension in China].

            【外文期刊】 Chang-Ming,Xiong ; Jian-Guo,He ; 等 《Zhonghua yi xue za zhi》 2011年91卷6期 370-4页

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            39. Graphical representation for DNA sequences via joint diagonalization of matrix pencil.

            【外文期刊】 Hong-Jie,Yu ; De-Shuang,Huang ; 《IEEE journal of biomedical and health informatics》 2013年17卷3期 503-11页

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            40. Quantification of the CM-Dil-labeled human umbilical cord mesenchymal stem cells migrated to the dual injured uterus in SD rat. oa

            【外文期刊】 Jia-Hua,Zheng ; Jing-Kun,Zhang ; 等 《Stem cell research & therapy》 2020年11卷1期 280页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 CM-Dil; Differentiate; Human umbilical cord mesenchymal stem cells;

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            41. Combining High Speed ELM Learning with a Deep Convolutional Neural Network Feature Encoding for Predicting Protein-RNA Interactions.

            【外文期刊】 Lei,Wang ; Zhu-Hong,You ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 972-980页 SCIMEDLINEBP

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            42. Treating cardiovascular atherosclerotic plaques with Tongmaijiangzhi (TMJZ) capsule. oa

            【外文期刊】 Hong-Qiang,Ren ; Li,Zhao ; 等 《African journal of traditional, complementary, and alternative medicines : AJTCAM》 2013年10卷6期 449-451页 MEDLINE

            【关键词】 Atherosclerotic plaques; Tongmaijiangzhi; hypertension;

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            43. Weakly-Supervised Convolutional Neural Network Architecture for Predicting Protein-DNA Binding.

            【外文期刊】 Qinhu,Zhang ; Lin,Zhu ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 679-689页 SCIMEDLINEBP

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            44. Special issue on intelligent computing in protein science.

            【外文期刊】 De-Shuang,Huang ; 《Protein and peptide letters》 2010年17卷9期 1067-8页 SCIMEDLINECABP

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            45. DLoopCaller: A deep learning approach for predicting genome-wide chromatin loops by integrating accessible chromatin landscapes. oa

            【外文期刊】 Siguo,Wang ; Qinhu,Zhang ; 等 《PLoS computational biology》 2022年18卷10期 e1010572页 SCIMEDLINECABP

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            46. Repression of P66Shc expression by SIRT1 contributes to the prevention of hyperglycemia-induced endothelial dysfunction.

            【外文期刊】 Shuang,Zhou ; Hou-Zao,Chen ; 等 《Circulation research》 2011年109卷6期 639-48页 SCIMEDLINECABP

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            47. The MC4R genotype is associated with postpartum weight reduction and glycemic changes among women with prior gestational diabetes: longitudinal analysis.

            【外文期刊】 Aline Martins,de Carvalho ; Ping,Shao ; 等 《Scientific reports》 2017年7卷1期 9654页

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            48. [Characteristics of Ammonia Adsorption and Kinetics by Nitrifying Sludge Immobilized Pellets].

            【外文期刊】 De-Shuang,Yu ; Ting-Ting,Lü ; 等 《Huan jing ke xue= Huanjing kexue》 2019年40卷2期 774-782页

            【关键词】 adsorption isotherms; adsorption kinetics model; ammonia adsorption;

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            49. Risk factors for pediatric intussusception complicated by loss of intestine viability in China from June 2009 to May 2014: a retrospective study.

            【外文期刊】 Xian-Ming,Yao ; Zhong-Liang,Chen ; 等 《Pediatric surgery international》 2015年31卷2期 163-6页 SCIMEDLINE

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            50. Predicting protein-protein interactions from protein sequences using meta predictor.

            【外文期刊】 Jun-Feng,Xia ; Xing-Ming,Zhao ; 等 《Amino acids》 2010年39卷5期 1595-9页 SCIMEDLINECABP

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