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            1. Phospholipid-Based Prodrugs for Drug Targeting in Inflammatory Bowel Disease: Computational Optimization and In-Vitro Correlation

            【外文期刊】 Dahan, Arik ; Ben-Shabat, Shimon ; 等 《Current topics in medicinal chemistry》 2016年16卷23期 2543-2548页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Drug targeting; Inflammatory bowel disease (IBD); Molecular Dynamics;

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            2. Cardiolipin switch in mitochondria: shutting off the reduction of cytochrome c and turning on the peroxidase activity. oa

            【外文期刊】 Liana V,Basova ; Igor V,Kurnikov ; 等 《Biochemistry》 2007年46卷11期 3423-34页 SCIMEDLINECABP

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            3. Phospholipid-Based Prodrugs for Drug Targeting in Inflammatory Bowel Disease: Computational Optimization and In-Vitro Correlation.

            【外文期刊】 Arik,Dahan ; Shimon,Ben-Shabat ; 等 《Current topics in medicinal chemistry》 2016年16卷23期 2543-8页 SCIMEDLINECABP

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            4. Structural requirements for optimized delivery, inhibition of oxidative stress, and antiapoptotic activity of targeted nitroxides.

            【外文期刊】 Jianfei,Jiang ; Igor,Kurnikov ; 等 《The Journal of pharmacology and experimental therapeutics》 2007年320卷3期 1050-60页 SCIMEDLINECABP

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            5. The hierarchy of structural transitions induced in cytochrome c by anionic phospholipids determines its peroxidase activation and selective peroxidation during apoptosis in cells.

            【外文期刊】 Alexander A,Kapralov ; Igor V,Kurnikov ; 等 《Biochemistry》 2007年46卷49期 14232-44页 SCIMEDLINECABP

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            6. Computational modeling and in-vitro/in-silico correlation of phospholipid-based prodrugs for targeted drug delivery in inflammatory bowel disease.

            【外文期刊】 Arik,Dahan ; Milica,Markovic ; 等 《Journal of computer-aided molecular design》 2017年31卷11期 1021-1028页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Drug targeting; Inflammatory bowel disease (IBD); Molecular dynamics;

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            7. Combining Force Fields and Neural Networks for an Accurate Representation of Bonded Interactions. oa

            【外文期刊】 Ganesh,Kamath ; Alexey,Illarionov ; 等 《The journal of physical chemistry. A》 2024年128卷4期 807-812页 SCIMEDLINECA

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            8. pH-triggered conformational switching of the diphtheria toxin T-domain: the roles of N-terminal histidines. oa

            【外文期刊】 Igor V,Kurnikov ; Alexander,Kyrychenko ; 等 《Journal of molecular biology》 2013年425卷15期 2752-64页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 FRET; F?rster resonance energy transfer; MD;

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            9. On the importance of accounting for nuclear quantum effects in ab initio calibrated force fields in biological simulations. oa

            【外文期刊】 Leonid,Pereyaslavets ; Igor,Kurnikov ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2018年115卷36期 8878-8882页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 ab initio; alkanes; force field;

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            10. Modeling Electronic Polarizability Changes in the Course of a Magnesium Ion Water Ligand Exchange Process. oa

            【外文期刊】 Igor V,Kurnikov ; Maria,Kurnikova ; 《The journal of physical chemistry. B》 2015年119卷32期 10275-86页 SCIMEDLINECA

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            11. Accurate determination of solvation free energies of neutral organic compounds from first principles. oa

            【外文期刊】 Leonid,Pereyaslavets ; Ganesh,Kamath ; 等 《Nature communications》 2022年13卷1期 414页 SCIMEDLINECA

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            12. Phospholipid-Based Prodrugs for Colon-Targeted Drug Delivery: Experimental Study and In-Silico Simulations. oa

            【外文期刊】 Milica,Markovic ; Arik,Dahan ; 等 《Pharmaceutics》 2019年11卷4期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Phospholipase A2; colon-targeted drug delivery; molecular dynamics;

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            13. Redox equilibria in hydroxylamine oxidoreductase. Electrostatic control of electron redistribution in multielectron oxidative processes.

            【外文期刊】 Igor V,Kurnikov ; Mark A,Ratner ; 等 《Biochemistry》 2005年44卷6期 1856-63页 SCIMEDLINECABP

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            14. Cytochrome c acts as a cardiolipin oxygenase required for release of proapoptotic factors.

            【外文期刊】 Valerian E,Kagan ; Vladimir A,Tyurin ; 等 《Nature chemical biology》 2005年1卷4期 223-32页 SCIMEDLINECABP

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            15. Ab initio based calculations of electron-transfer rates in metalloproteins.

            【外文期刊】 Tatiana R,Prytkova ; Igor V,Kurnikov ; 等 《The journal of physical chemistry. B》 2005年109卷4期 1618-25页 SCIMEDLINECA

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            16. Protein-Ligand Binding Free-Energy Calculations with ARROW─A Purely First-Principles Parameterized Polarizable Force Field. oa

            【外文期刊】 Grzegorz,Nawrocki ; Igor,Leontyev ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2022年18卷12期 7751-7763页 SCIMEDLINECA

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            17. A glance at the reactivity of osma(II)cycles [Os(C-N)x(bpy)3-x](m+) (x=0-3) Covering a 1.8 V potential range toward peroxidase through Monte Carlo Simulations ((-)C-N=o-2-phenylpyridinato, bpy=2,2'-bipyridine).

            【外文期刊】 Ricardo,Cerón-Camacho ; Ronan,Le Lagadec ; 等 《Journal of inorganic biochemistry》 2014年134卷 20-4页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Cyclometalation; Electron transfer; Monte Carlo simulations;

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            18. Combining Force Fields and Neural Networks for an Accurate Representation of Chemically Diverse Molecular Interactions. oa

            【外文期刊】 Alexey,Illarionov ; Serzhan,Sakipov ; 等 《Journal of the American Chemical Society》 2023年145卷43期 23620-23629页 SCIMEDLINECABP

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            19. Crystal Structure of Cleaved Serp-1, a Myxomavirus-Derived Immune Modulating Serpin: Structural Design of Serpin Reactive Center Loop Peptides with Improved Therapeutic Function.

            【外文期刊】 Brian P,Mahon ; Sriram,Ambadapadi ; 等 《Biochemistry》 2018年57卷7期 1096-1107页 SCIMEDLINECABP

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            20. The Determination of Free Energy of Hydration of Water Ions from First Principles.

            【外文期刊】 Oleg,Butin ; Leonid,Pereyaslavets ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2024年20卷12期 5215-5224页 SCIMEDLINECA

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            21. Neural Network Corrections to Intermolecular Interaction Terms of a Molecular Force Field Capture Nuclear Quantum Effects in Calculations of Liquid Thermodynamic Properties. oa

            【外文期刊】 Igor V,Kurnikov ; Leonid,Pereyaslavets ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2024年20卷3期 1347-1357页 SCIMEDLINECA

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            22. Donor/acceptor coupling shortcuts in electron transfer within ruthenium-modified derivatives of cytochrome b(562).

            【外文期刊】 Tatiana R,Prytkova ; Vladislav V,Shunaev ; 等 《The journal of physical chemistry. B》 2015年119卷4期 1288-94页 SCIMEDLINECA

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            23. Kinetic and theoretical comprehension of diverse rate laws and reactivity gaps in Coriolus hirsutus laccase-catalyzed oxidation of acido and cyclometalated Ru(II) complexes.

            【外文期刊】 Sergey A,Kurzeev ; Alexander S,Vilesov ; 等 《Biochemistry》 2009年48卷21期 4519-27页 SCIMEDLINECABP

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            24. Prediction of cyclohexane-water distribution coefficient for SAMPL5 drug-like compounds with the QMPFF3 and ARROW polarizable force fields.

            【外文期刊】 Ganesh,Kamath ; Igor,Kurnikov ; 等 《Journal of computer-aided molecular design》 2016年30卷11期 977-988页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 ARROW; Free energies; GAFF;

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            25. Dynamic docking and electron transfer between Zn-myoglobin and cytochrome b(5).

            【外文期刊】 Zhao-Xun,Liang ; Judith M,Nocek ; 等 《Journal of the American Chemical Society》 2002年124卷24期 6849-59页 SCIMEDLINECABP

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            26. Differential influence of dynamic processes on forward and reverse electron transfer across a protein-protein interface. oa

            【外文期刊】 Brian M,Hoffman ; Laura M,Celis ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2005年102卷10期 3564-9页 SCIMEDLINECABP

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            27. Electron tunneling through sensitizer wires bound to proteins.

            【外文期刊】 Matthew R,Hartings ; Igor V,Kurnikov ; 等 《Coordination chemistry reviews》 2010年254卷3期 248-253页

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            28. Cardiolipin deficiency leads to decreased cardiolipin peroxidation and increased resistance of cells to apoptosis. oa

            【外文期刊】 Zhentai,Huang ; Jianfei,Jiang ; 等 《Free radical biology & medicine》 2008年44卷11期 1935-44页 SCIMEDLINECABP

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            29. Control of cytochrome c redox reactivity through off-pathway modifications in the protein hydrogen-bonding network.

            【外文期刊】 Jie,Gu ; Soyeun,Yang ; 等 《Chemical communications (Cambridge, England)》 2014年50卷40期 5355-7页 SCIMEDLINECA

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            30. Nitric oxide inhibits peroxidase activity of cytochrome c.cardiolipin complex and blocks cardiolipin oxidation.

            【外文期刊】 Irina I,Vlasova ; Vladimir A,Tyurin ; 等 《The Journal of biological chemistry》 2006年281卷21期 14554-62页 SCIMEDLINECABP

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            31. Dynamic docking and electron-transfer between cytochrome b5 and a suite of myoglobin surface-charge mutants. Introduction of a functional-docking algorithm for protein-protein complexes.

            【外文期刊】 Zhao-Xun,Liang ; Igor V,Kurnikov ; 等 《Journal of the American Chemical Society》 2004年126卷9期 2785-98页 SCIMEDLINECABP

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            32. Donor-bridge-acceptor energetics determine the distance dependence of electron tunneling in DNA. oa

            【外文期刊】 Frederick D,Lewis ; Jianqin,Liu ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2002年99卷20期 12536-41页 SCIMEDLINECABP

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            33. Mechanisms of cardiolipin oxidation by cytochrome c: relevance to pro- and antiapoptotic functions of etoposide.

            【外文期刊】 Yulia Y,Tyurina ; Vidisha,Kini ; 等 《Molecular pharmacology》 2006年70卷2期 706-17页 SCIMEDLINECABP

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            34. Coupling coherence distinguishes structure sensitivity in protein electron transfer. oa

            【外文期刊】 Tatiana R,Prytkova ; Igor V,Kurnikov ; 等 《Science (New York, N.Y.)》 2007年315卷5812期 622-5页 SCIMEDLINECABP

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            35. Experimental and theoretical evidence for multiple Fe(IV) reactive intermediates in TAML-activator catalysis: rationalizing a counterintuitive reactivity order.

            【外文期刊】 Soumen,Kundu ; Medini,Annavajhala ; 等 《Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)》 2012年18卷33期 10244-9页 SCIMEDLINECA

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            36. Peroxidase activity and structural transitions of cytochrome c bound to cardiolipin-containing membranes. oa

            【外文期刊】 Natalia A,Belikova ; Yury A,Vladimirov ; 等 《Biochemistry》 2006年45卷15期 4998-5009页 SCIMEDLINECABP

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