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            1. Characterizing and Comparing the Seasonality of Influenza-Like Illnesses and Invasive Pneumococcal Diseases Using Seasonal Waveforms

            【外文期刊】 de Celles, Matthieu Domenech ; Arduin, Helene ; 等 《American Journal of Epidemiology》 2018年187卷5期 1029-1039页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 infectious disease seasonality; influenza; influenza-like illnesses;

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            2. Mathematical models of infection transmission in healthcare settings: recent advances from the use of network structured data

            【外文期刊】 Assab, Rania ; Nekkab, Narimane ; 等 《Current opinion in infectious diseases》 2017年30卷4期 410-418页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 hospital-acquired infections; mathematical modeling; networks;

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            3. Association of Pneumococcal Conjugate Vaccine Coverage With Pneumococcal Meningitis: An Analysis of French Administrative Areas, 2001-2016

            【外文期刊】 Alari, Anna ; Cheysson, Felix ; 等 《American Journal of Epidemiology》 2019年188卷8期 1466-1474页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 administrative area variations; Bayesian inference; mixed-effect Poisson model;

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            4. Exploring individual HPV coinfections is essential to predict HPV-vaccination impact on genotype distribution: A model-based approach

            【外文期刊】 Pons-Salort, Margarita ; Letort, Veronique ; 等 《Vaccine》 2013年31卷8期 1238-1245页

            【关键词】 Coinfections; Human papillomavirus; Mathematical model;

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            5. Optimizing COVID-19 surveillance in long-term care facilities: a modelling study. oa

            【外文期刊】 David R M,Smith ; Audrey,Duval ; 等 《BMC medicine》 2020年18卷1期 386页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 COVID-19; Computational modelling; Contact network;

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            6. Antibiotic dose impact on resistance selection in the community: a mathematical model of beta-lactams and Streptococcus pneumoniae dynamics. oa

            【外文期刊】 Lulla,Opatowski ; Jonas,Mandel ; 等 《Antimicrobial agents and chemotherapy》 2010年54卷6期 2330-7页 SCIMEDLINECABP

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            7. Unraveling the seasonal epidemiology of pneumococcus. oa

            【外文期刊】 Matthieu,Domenech de Cellès ; Hélène,Arduin ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2019年116卷5期 1802-1807页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 climate; epidemiology; infectious disease seasonality;

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            8. Modeling the impact of urban and hospital eco-exposomes on antibiotic-resistance dynamics in wastewaters.

            【外文期刊】 Paul,Henriot ; Elena,Buelow ; 等 《The Science of the total environment》 2024年924卷 171643页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Antibiotic resistance; Dynamics; Eco-exposome;

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            9. Impact of pneumococcal conjugate vaccines on pneumococcal meningitis cases in France between 2001 and 2014: a time series analysis. oa

            【外文期刊】 Anna,Alari ; Hélène,Chaussade ; 等 《BMC medicine》 2016年14卷1期 211页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Pneumococcal conjugate vaccine; Pneumococcal meningitis; Serotype replacement;

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            10. Interaction of Vaccination and Reduction of Antibiotic Use Drives Unexpected Increase of Pneumococcal Meningitis.

            【外文期刊】 Matthieu Domenech,de Cellès ; Margarita,Pons-Salort ; 等 《Scientific reports》 2015年5卷 11293页

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            11. Outpatient antibiotic use attributable to viral acute lower respiratory tract infections during the cold season in France, 2010-2017.

            【外文期刊】 Felix,Cheysson ; Christian,Brun-Buisson ; 等 《International journal of antimicrobial agents》 2021年57卷6期 106339页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Antibiotic overuse; Attributable proportion; Respiratory infection;

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            12. Collateral impacts of pandemic COVID-19 drive the nosocomial spread of antibiotic resistance: A modelling study. oa

            【外文期刊】 David R M,Smith ; George,Shirreff ; 等 《PLoS medicine》 2023年20卷6期 e1004240页 SCIMEDLINEBP

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            13. Peripatetic health-care workers as potential superspreaders. oa

            【外文期刊】 Laura,Temime ; Lulla,Opatowski ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2009年106卷43期 18420-5页 SCIMEDLINECABP

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            14. Lockdown impact on age-specific contact patterns and behaviours, France, April 2020. oa

            【外文期刊】 Paolo,Bosetti ; Bich-Tram,Huynh ; 等 《Euro surveillance : bulletin Europeen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin》 2021年26卷48期 SCIMEDLINE

            【关键词】 Europe; France; epidemiology;

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            15. Close proximity interactions support transmission of ESBL-K. pneumoniae but not ESBL-E. coli in healthcare settings. oa

            【外文期刊】 Audrey,Duval ; Thomas,Obadia ; 等 《PLoS computational biology》 2019年15卷5期 e1006496页 SCIMEDLINECABP

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            16. Modeling the transmission of antibiotic-resistant Enterobacterales in the community: A systematic review.

            【外文期刊】 Eve,Rahbé ; Philippe,Glaser ; 等 《Epidemics》 2024年48卷 100783页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Antibiotic resistance; Carriage; Community transmission;

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            17. Intrinsic epidemicity of Streptococcus pneumoniae depends on strain serotype and antibiotic susceptibility pattern. oa

            【外文期刊】 Matthieu,Domenech de Cellès ; Lulla,Opatowski ; 等 《Antimicrobial agents and chemotherapy》 2011年55卷11期 5255-61页 SCIMEDLINECABP

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            18. Modelling the impact of antimicrobial use and external introductions on commensal E. coli colistin resistance in small-scale chicken farms of the Mekong delta of Vietnam. oa

            【外文期刊】 Jonathan,Bastard ; Nguyen Thi,Nhung ; 等 《Transboundary and emerging diseases》 2022年69卷5期 e2185-e2194页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Escherichia coli; Southeast Asia; antimicrobial resistance;

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            19. Microbiome-pathogen interactions drive epidemiological dynamics of antibiotic resistance: A modeling study applied to nosocomial pathogen control.

            【外文期刊】 David Rm,Smith ; Laura,Temime ; 等 《eLife》 2021年10卷

            【关键词】 C. difficile; E. coli; K. pneumoniae;

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            20. Investigating the feasibility and potential of combining industry AMR monitoring systems: a comparison with WHO GLASS.

            【外文期刊】 Eve,Rahbé ; Aleksandra,Kovacevic ; 等 《Wellcome open research》 2024年9卷 248页

            【关键词】 GLASS; antimicrobial resistance; industry monitoring systems;

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            21. Conference report of the 2024 Antimicrobial Resistance Meeting.

            【外文期刊】 Charlotte E,Chong ; Thi Mui,Pham ; 等 《npj antimicrobials and resistance》 2024年2卷1期 43页

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            22. Inference of Significant Microbial Interactions From Longitudinal Metagenomics Data.

            【外文期刊】 Xuefeng,Gao ; Bich-Tram,Huynh ; 等 《Frontiers in microbiology》 2018年9卷 2319页

            【关键词】 Lotka-Volterra equations; bootstrap aggregation; forward stepwise regression;

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            23. Contributions of modelling for the control of COVID-19 nosocomial transmission.

            【外文期刊】 Lulla,Opatowski ; Laura,Temime ; 《Anaesthesia, critical care & pain medicine》 2022年41卷2期 101054页

            【关键词】 Healthcare settings; Interventions; Modelling;

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            24. Risk Factors for Community and Intrahousehold Transmission of SARS-CoV-2: Modeling in a Nationwide French Population-Based Cohort Study, the EpiCoV Study. oa

            【外文期刊】 Sophie,Novelli ; Lulla,Opatowski ; 等 《American journal of epidemiology》 2024年193卷1期 134-148页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 COVID-19; SARS-CoV-2; coronavirus disease 2019;

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            25. Measuring Basic Reproduction Number to Assess Effects of Nonpharmaceutical Interventions on Nosocomial SARS-CoV-2 Transmission. oa

            【外文期刊】 George,Shirreff ; Jean-Ralph,Zahar ; 等 《Emerging infectious diseases》 2022年28卷7期 1345-1354页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 COVID-19; R0; SARS;

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            26. Transmissibility and pathogenicity of the emerging meningococcal serogroup W sequence type-11 complex South American strain: a mathematical modeling study. oa

            【外文期刊】 Matthieu,Domenech de Cellès ; Helen,Campbell ; 等 《BMC medicine》 2020年18卷1期 109页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Epidemiology; Invasiveness; Mathematical modeling;

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            27. Modelling the effectiveness of antiviral treatment strategies to prevent household transmission of acute respiratory viruses. oa

            【外文期刊】 Hind,Zaaraoui ; Clarisse,Schumer ; 等 《PLoS computational biology》 2024年20卷12期 e1012573页 SCIMEDLINECABP

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            28. Hospital population density and risk of respiratory infection: Is close contact density dependent?

            【外文期刊】 George,Shirreff ; Anne C M,Thiébaut ; 等 《Epidemics》 2024年49卷 100807页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Close proximity contact; Density dependence; Force of infection;

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            29. Antibiotic innovation may contribute to slowing the dissemination of multiresistant Streptococcus pneumoniae: the example of ketolides. oa

            【外文期刊】 Lulla,Opatowski ; Laura,Temime ; 等 《PloS one》 2008年3卷5期 e2089页 SCIMEDLINECABP

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            30. An agent-based model simulation of influenza interactions at the host level: insight into the influenza-related burden of pneumococcal infections. oa

            【外文期刊】 Hélène,Arduin ; Matthieu,Domenech de Cellès ; 等 《BMC infectious diseases》 2017年17卷1期 382页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Agent-based model; Between-pathogens interaction; Burden;

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            31. Assessing respiratory epidemic potential in French hospitals through collection of close contact data (April-June 2020).

            【外文期刊】 George,Shirreff ; Bich-Tram,Huynh ; 等 《Scientific reports》 2024年14卷1期 3702页

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            32. Estimating the burden of SARS-CoV-2 in France. oa

            【外文期刊】 Henrik,Salje ; Cécile,Tran Kiem ; 等 《Science (New York, N.Y.)》 2020年369卷6500期 208-211页 SCIMEDLINECABP

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            33. An algorithm to build synthetic temporal contact networks based on close-proximity interactions data. oa

            【外文期刊】 Audrey,Duval ; Quentin J,Leclerc ; 等 《PLoS computational biology》 2024年20卷6期 e1012227页 SCIMEDLINECABP

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            34. Insights into persistence mechanisms of a zoonotic virus in bat colonies using a multispecies metapopulation model. oa

            【外文期刊】 Margarita,Pons-Salort ; Jordi,Serra-Cobo ; 等 《PloS one》 2014年9卷4期 e95610页 SCIMEDLINECABP

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            35. Contribution of mathematical modeling to the fight against bacterial antibiotic resistance.

            【外文期刊】 Lulla,Opatowski ; Didier,Guillemot ; 等 《Current opinion in infectious diseases》 2011年24卷3期 279-87页 SCIMEDLINEBP

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            36. Mitigating COVID-19 outbreaks in workplaces and schools by hybrid telecommuting. oa

            【外文期刊】 Simon,Mauras ; Vincent,Cohen-Addad ; 等 《PLoS computational biology》 2021年17卷8期 e1009264页 SCIMEDLINECABP

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            37. Estimating the impact of influenza on the epidemiological dynamics of SARS-CoV-2.

            【外文期刊】 Matthieu,Domenech de Cellès ; Jean-Sebastien,Casalegno ; 等 《PeerJ》 2021年9卷 e12566页

            【关键词】 COVID-19; Influenza; Mathematical modeling;

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            38. The Impact of Cocirculating Pathogens on Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2)/Coronavirus Disease 2019 Surveillance: How Concurrent Epidemics May Introduce Bias and Decrease the Observed SARS-CoV-2 Percentage Positivity. oa

            【外文期刊】 Aleksandra,Kovacevic ; Rosalind M,Eggo ; 等 《The Journal of infectious diseases》 2022年225卷2期 199-207页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 COVID-19 surveillance; SARS-CoV-2; cocirculating respiratory viruses;

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            39. FCP: functional coverage of the proteome by structures.

            【外文期刊】 Ricard,García-Serna ; Lulla,Opatowski ; 等 《Bioinformatics (Oxford, England)》 2006年22卷14期 1792-3页 SCIMEDLINECABP

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            40. Contact patterns and HPV-genotype interactions yield heterogeneous HPV-vaccine impacts depending on sexual behaviors: An individual-based model.

            【外文期刊】 Mélanie,Bonneault ; Chiara,Poletto ; 等 《Epidemics》 2022年39卷 100584页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Coinfections; Human papillomavirus; Individual-based model;

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            41. Influenza interaction with cocirculating pathogens and its impact on surveillance, pathogenesis, and epidemic profile: A key role for mathematical modelling. oa

            【外文期刊】 Lulla,Opatowski ; Marc,Baguelin ; 等 《PLoS pathogens》 2018年14卷2期 e1006770页 SCIMEDLINECABP

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            42. Exploring individual HPV coinfections is essential to predict HPV-vaccination impact on genotype distribution: a model-based approach.

            【外文期刊】 Margarita,Pons-Salort ; Véronique,Letort ; 等 《Vaccine》 2013年31卷8期 1238-45页 SCIMEDLINEBP

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            43. Exploring factors shaping antibiotic resistance patterns in Streptococcus pneumoniae during the 2020 COVID-19 pandemic.

            【外文期刊】 Aleksandra,Kovacevic ; David R M,Smith ; 等 《eLife》 2024年13卷

            【关键词】 COVID-19 pandemic; SARS-CoV-2; Streptococcus pneumoniae;

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            44. Rapid antigen testing as a reactive response to surges in nosocomial SARS-CoV-2 outbreak risk. oa

            【外文期刊】 David R M,Smith ; Audrey,Duval ; 等 《Nature communications》 2022年13卷1期 236页 SCIMEDLINECA

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            45. OutbreakTools: a new platform for disease outbreak analysis using the R software. oa

            【外文期刊】 Thibaut,Jombart ; David M,Aanensen ; 等 《Epidemics》 2014年7卷 28-34页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Bioinformatics; Epidemics; Epidemiology;

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            46. Detailed contact data and the dissemination of Staphylococcus aureus in hospitals. oa

            【外文期刊】 Thomas,Obadia ; Romain,Silhol ; 等 《PLoS computational biology》 2015年11卷3期 e1004170页 SCIMEDLINECABP

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            47. A Conceptual Discussion About the Basic Reproduction Number of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 in Healthcare Settings. oa

            【外文期刊】 Laura,Temime ; Marie-Paule,Gustin ; 等 《Clinical infectious diseases : an official publication of the Infectious Diseases Society of America》 2021年72卷1期 141-143页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 COVID-19; basic reproduction number; hospital;

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            48. Association of Pneumococcal Conjugate Vaccine Coverage With Pneumococcal Meningitis: An Analysis of French Administrative Areas, 2001-2016. oa

            【外文期刊】 Anna,Alari ; Félix,Cheysson ; 等 《American journal of epidemiology》 2019年188卷8期 1466-1474页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Bayesian inference; National Health Insurance data; administrative area variations;

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            49. Mathematical models of infection transmission in healthcare settings: recent advances from the use of network structured data.

            【外文期刊】 Rania,Assab ; Narimane,Nekkab ; 等 《Current opinion in infectious diseases》 2017年30卷4期 410-418页 SCIMEDLINEBP

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            50. Defining genomic epidemiology thresholds for common-source bacterial outbreaks: a modelling study.

            【外文期刊】 Audrey,Duval ; Lulla,Opatowski ; 等 《The Lancet. Microbe》 2023年4卷5期 e349-e357页

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