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            1. Genome sequencing and comparative genomics of enterohemorrhagic Escherichia coli O145:H25 and O145:H28 reveal distinct evolutionary paths and marked variations in traits associated with virulence & colonization. oa

            【外文期刊】 Sandra C,Lorenz ; Narjol,Gonzalez-Escalona ; 等 《BMC microbiology》 2017年17卷1期 183页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Bacterial adaptation & colonization; Comparative genomics; EHEC O145:H25;

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            2. A Nonautochthonous U.S. Strain of Vibrio parahaemolyticus Isolated from Chesapeake Bay Oysters Caused the Outbreak in Maryland in 2010. oa

            【外文期刊】 Julie,Haendiges ; Jessica,Jones ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2016年82卷11期 3208-3216页 SCIMEDLINECABP

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            3. Pandemic Vibrio parahaemolyticus, Maryland, USA, 2012. oa

            【外文期刊】 Julie,Haendiges ; Marvin,Rock ; 等 《Emerging infectious diseases》 2014年20卷4期 718-20页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Maryland; PFGE pattern; USA;

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            4. Sequence Type 631 Vibrio parahaemolyticus, an Emerging Foodborne Pathogen in North America. oa

            【外文期刊】 Feng,Xu ; Narjol,Gonzalez-Escalona ; 等 《Journal of clinical microbiology》 2017年55卷2期 645-648页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Vibrio parahaemolyticus; core genome multilocus sequence type analysis; emerging pathogen;

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            5. Phylogenetic analyses of Salmonella detected along the broiler production chain in Trinidad and Tobago. oa

            【外文期刊】 Anisa S,Khan ; Rian E,Pierneef ; 等 《Poultry science》 2023年102卷2期 102322页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Salmonella; Trinidad and Tobago; WGS;

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            6. Draft Genome Sequences of Two O104:H21 Escherichia coli Isolates Causing Hemorrhagic Colitis during a 1994 Montana Outbreak Provide Insight into Their Pathogenicity. oa

            【外文期刊】 Narjol,Gonzalez-Escalona ; Melinda A,McFarland ; 等 《Genome announcements》 2013年1卷5期 MEDLINE

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            7. Parallel Evolution of Two Clades of an Atlantic-Endemic Pathogenic Lineage of Vibrio parahaemolyticus by Independent Acquisition of Related Pathogenicity Islands. oa

            【外文期刊】 Feng,Xu ; Narjol,Gonzalez-Escalona ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2017年83卷18期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 HGT; emerging pathogen; genomics;

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            8. Complete Genome Sequences of Four Enterohemolysin-Positive (ehxA) Enterocyte Effacement-Negative Shiga Toxin-Producing Escherichia coli Strains. oa

            【外文期刊】 Sandra C,Lorenz ; Michael L,Kotewicz ; 等 《Genome announcements》 2016年4卷5期 MEDLINE

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            9. Outbreak of Vibrio parahaemolyticus Sequence Type 120, Peru, 2009. oa

            【外文期刊】 Narjol,Gonzalez-Escalona ; Ronnie G,Gavilan ; 等 《Emerging infectious diseases》 2016年22卷7期 1235-7页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 El Ni?o; Peru; Vibrio parahaemolyticus;

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            10. Virulence Gene Profiles and Clonal Relationships of Escherichia coli O26:H11 Isolates from Feedlot Cattle as Determined by Whole-Genome Sequencing. oa

            【外文期刊】 Narjol,Gonzalez-Escalona ; Magaly,Toro ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2016年82卷13期 3900-3912页 SCIMEDLINECABP

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            11. Draft Genome Sequence of Bivalent Clostridium botulinum Strain IBCA10-7060, Encoding Botulinum Neurotoxin B and a New FA Mosaic Type. oa

            【外文期刊】 Narjol,Gonzalez-Escalona ; Nagarajan,Thirunavukkarasu ; 等 《Genome announcements》 2014年2卷6期 MEDLINE

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            12. Comparison of commercial RNA extraction kits for preparation of DNA-free total RNA from Salmonella cells. oa

            【外文期刊】 Lydia V,Rump ; Benedicta,Asamoah ; 等 《BMC research notes》 2010年3卷 211页 MEDLINEBP

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            13. Phylogenomic Pipeline Validation for Foodborne Pathogen Disease Surveillance. oa

            【外文期刊】 Ruth E,Timme ; Errol,Strain ; 等 《Journal of clinical microbiology》 2019年57卷5期 SCIMEDLINE

            【关键词】 Listeria ; Salmonella ; WGS;

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            14. Detection of colistin resistance mcr-1 gene in Salmonella enterica serovar Rissen isolated from mussels, Spain, 2012- to 2016. oa

            【外文期刊】 Antonio,Lozano-Leon ; Carlos,Garcia-Omil ; 等 《Euro surveillance : bulletin Europeen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin》 2019年24卷16期 SCIMEDLINE

            【关键词】 Salmonella; antimicrobial resistance; mcr-1 gene;

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            15. Single Laboratory Evaluation of the Q20+ Nanopore Sequencing Kit for Bacterial Outbreak Investigations. oa

            【外文期刊】 Maria,Hoffmann ; Jay Hee,Jang ; 等 《International journal of molecular sciences》 2024年25卷22期 SCIMEDLINE

            【关键词】 complete genomes; foodborne pathogen; longread sequencing;

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            16. Evaluating the accuracy of Listeria monocytogenes assemblies from quasimetagenomic samples using long and short reads. oa

            【外文期刊】 Seth,Commichaux ; Kiran,Javkar ; 等 《BMC genomics》 2021年22卷1期 389页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Assembly; Listeria; Metagenomics;

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            17. Global Expansion of Pacific Northwest Vibrio parahaemolyticus Sequence Type 36. oa

            【外文期刊】 Michel,Abanto ; Ronnie G,Gavilan ; 等 《Emerging infectious diseases》 2020年26卷2期 323-326页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Canada; El Ni?o; North America;

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            18. Genomic analysis of the diversity, antimicrobial resistance and virulence potential of clinical Campylobacter jejuni and Campylobacter coli strains from Chile. oa

            【外文期刊】 Veronica,Bravo ; Assaf,Katz ; 等 《PLoS neglected tropical diseases》 2021年15卷2期 e0009207页 SCIMEDLINEBP

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            19. Draft Genome Sequences of 33 Salmonella enterica Clinical and Wildlife Isolates from Chile. oa

            【外文期刊】 Magaly,Toro ; Patricio,Retamal ; 等 《Genome announcements》 2015年3卷2期 MEDLINE

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            20. Epidemic Dynamics of Vibrio parahaemolyticus Illness in a Hotspot of Disease Emergence, Galicia, Spain. oa

            【外文期刊】 Jaime,Martinez-Urtaza ; Joaquin,Trinanes ; 等 《Emerging infectious diseases》 2018年24卷5期 852-859页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Galicia; Spain; Vibrio parahaemolyticus;

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            21. Prevalence, distribution and evolutionary significance of the IS629 insertion element in the stepwise emergence of Escherichia coli O157:H7. oa

            【外文期刊】 Lydia V,Rump ; Markus,Fischer ; 等 《BMC microbiology》 2011年11卷 133页 SCIMEDLINEBP

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            22. Choice of library preparation affects sequence quality, genome assembly, and precise in silico prediction of virulence genes in shiga toxin-producing Escherichia coli. oa

            【外文期刊】 Julie,Haendiges ; Karen,Jinneman ; 等 《PloS one》 2021年16卷3期 e0242294页 SCIMEDLINECABP

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            23. Draft Genome Sequences of Clinical Vibrio parahaemolyticus Strains Isolated in Maryland (2010 to 2013). oa

            【外文期刊】 Julie,Haendiges ; Ruth,Timme ; 等 《Genome announcements》 2014年2卷4期 MEDLINE

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            24. In vivo commensal control of Clostridioides difficile virulence. oa

            【外文期刊】 Brintha P,Girinathan ; Nicholas,DiBenedetto ; 等 《Cell host & microbe》 2021年29卷11期 1693-1708.e7页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Clostridioides difficile; Clostridium sardiniense; Paraclostridium bifermentans;

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            25. Draft Genome Sequence of a Clostridium botulinum Isolate from Water Used for Cooling at a Plant Producing Low-Acid Canned Foods. oa

            【外文期刊】 Uma,Basavanna ; Narjol,Gonzalez-Escalona ; 等 《Genome announcements》 2013年1卷1期 MEDLINE

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            26. Whole-Genome Sequencing Analysis of Salmonella enterica Serovar Enteritidis Isolates in Chile Provides Insights into Possible Transmission between Gulls, Poultry, and Humans. oa

            【外文期刊】 Magaly,Toro ; Patricio,Retamal ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2016年82卷20期 6223-6232页 SCIMEDLINECABP

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            27. Whole-genome single-nucleotide-polymorphism analysis for discrimination of Clostridium botulinum group I strains. oa

            【外文期刊】 Narjol,Gonzalez-Escalona ; Ruth,Timme ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2014年80卷7期 2125-32页 SCIMEDLINECABP

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            28. Defining a Core Genome Multilocus Sequence Typing Scheme for the Global Epidemiology of Vibrio parahaemolyticus. oa

            【外文期刊】 Narjol,Gonzalez-Escalona ; Keith A,Jolley ; 等 《Journal of clinical microbiology》 2017年55卷6期 1682-1697页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Vibrio parahaemolyticus; cgMLST; clinical;

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            29. Genomic Variation and Evolution of Vibrio parahaemolyticus ST36 over the Course of a Transcontinental Epidemic Expansion. oa

            【外文期刊】 Jaime,Martinez-Urtaza ; Ronny,van Aerle ; 等 《mBio》 2017年8卷6期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Pacific Northwest; Vibrio parahaemolyticus; WGS;

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            30. Genomic diversity and virulence profiles of historical Escherichia coli O157 strains isolated from clinical and environmental sources. oa

            【外文期刊】 Lydia V,Rump ; Narjol,Gonzalez-Escalona ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2015年81卷2期 569-77页 SCIMEDLINECABP

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            31. Genome Sequences of 64 Non-O157:H7 Shiga Toxin-Producing Escherichia coli Strains. oa

            【外文期刊】 Magaly,Toro ; Guojie,Cao ; 等 《Genome announcements》 2015年3卷5期 MEDLINE

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            32. Draft Genome Sequences of Two Salmonella Strains from the SARA Collection, SARA64 (Muenchen) and SARA33 (Heidelberg), Provide Insight into Their Antibiotic Resistance. oa

            【外文期刊】 Brenda S,Kroft ; Eric W,Brown ; 等 《Genome announcements》 2013年1卷5期 MEDLINE

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            33. Core Genome Multilocus Sequence Typing for Identification of Globally Distributed Clonal Groups and Differentiation of Outbreak Strains of Listeria monocytogenes. oa

            【外文期刊】 Yi,Chen ; Narjol,Gonzalez-Escalona ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2016年82卷20期 6258-6272页 SCIMEDLINECABP

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