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            1. The Effect of Mutations on Drug Sensitivity and Kinase Activity of Fibroblast Growth Factor Receptors: A Combined

            【外文期刊】 Tom D,Bunney ; Shunzhou,Wan ; 等 《EBioMedicine》 2015年2卷3期 194-204页

            【关键词】 Cancer; Clinical inhibitors; FGFR;

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            2. Artificial Intelligence Must Be Made More Scientific.

            【外文期刊】 Peter V,Coveney ; Roger,Highfield ; 《Journal of chemical information and modeling》 2024年64卷15期 5739-5741页 SCIMEDLINECA

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            3. Dynamic endothelial cell rearrangements drive developmental vessel regression. oa

            【外文期刊】 Claudio A,Franco ; Martin L,Jones ; 等 《PLoS biology》 2015年13卷4期 e1002125页 SCIMEDLINECABP

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            4. Validation of Patient-Specific Cerebral Blood Flow Simulation Using Transcranial Doppler Measurements.

            【外文期刊】 Derek,Groen ; Robin A,Richardson ; 等 《Frontiers in physiology》 2018年9卷 721页

            【关键词】 blood flow; computational fluid dynamics; high performance computing;

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            5. Computational biomedicine: a challenge for the twenty-first century.

            【外文期刊】 Peter V,Coveney ; Nour W,Shublaq ; 《Studies in health technology and informatics》 2012年174卷 105-10页 MEDLINE

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            6. Discrete simulation of fluid dynamics: methods.

            【外文期刊】 Luca,Biferale ; Peter V,Coveney ; 等 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2011年369卷1944期 2152-4页

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            7. Alchemical Free Energy Estimators and Molecular Dynamics Engines: Accuracy, Precision, and Reproducibility. oa

            【外文期刊】 Alexander D,Wade ; Agastya P,Bhati ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2022年18卷6期 3972-3987页 SCIMEDLINECA

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            8. TIES 2.0: A Dual-Topology Open Source Relative Binding Free Energy Builder with Web Portal. oa

            【外文期刊】 Mateusz K,Bieniek ; Alexander D,Wade ; 等 《Journal of chemical information and modeling》 2023年63卷3期 718-724页 SCIMEDLINECA

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            9. Lattice Boltzmann simulation of the flow of binary immiscible fluids with different viscosities using the Shan-Chen

            【外文期刊】 Jonathan,Chin ; Edo S,Boek ; 等 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2002年360卷1792期 547-58页

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            10. Mechanism of drug efficacy within the EGF receptor revealed by microsecond molecular dynamics simulation.

            【外文期刊】 Shunzhou,Wan ; David W,Wright ; 等 《Molecular cancer therapeutics》 2012年11卷11期 2394-400页 SCIMEDLINECABP

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            11. Resolution of discordant HIV-1 protease resistance rankings using molecular dynamics simulations.

            【外文期刊】 David W,Wright ; Peter V,Coveney ; 《Journal of chemical information and modeling》 2011年51卷10期 2636-49页 SCIMEDLINECA

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            12. A Mechanistic Model for Predicting Cell Surface Presentation of Competing Peptides by MHC Class I Molecules.

            【外文期刊】 Denise S M,Boulanger ; Ruth C,Eccleston ; 等 《Frontiers in immunology》 2018年9卷 1538页

            【关键词】 abundance; antigen presentation; interferon-γ;

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            13. A Stabilizer Framework for the Contextual Subspace Variational Quantum Eigensolver and the Noncontextual Projection oa

            【外文期刊】 Tim,Weaving ; Alexis,Ralli ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2023年19卷3期 808-821页 SCIMEDLINECA

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            14. From digital hype to analogue reality: Universal simulation beyond the quantum and exascale eras.

            【外文期刊】 Peter V,Coveney ; Roger R,Highfield ; 《Journal of computational science》 2020年46卷 101093页

            【关键词】 Analogue computing; Artificial intelligence; Computer simulation;

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            15. A vision and strategy for the virtual physiological human in 2010 and beyond.

            【外文期刊】 Peter,Hunter ; Peter V,Coveney ; 等 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2010年368卷1920期 2595-614页

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            16. Petascale lattice-Boltzmann studies of amphiphilic cubic liquid crystalline materials in a globally distributed high-

            【外文期刊】 Radhika S,Saksena ; Marco D,Mazzeo ; 等 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2010年368卷1925期 3983-99页

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            17. Flux boundary conditions in particle simulations.

            【外文期刊】 Eirik G,Flekkøy ; Rafael,Delgado-Buscalioni ; 等 《Physical review. E, Statistical, nonlinear, and soft matter physics》 2005年72卷2 Pt 2期 026703页 MEDLINECA

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            18. Rapid and accurate ranking of binding affinities of epidermal growth factor receptor sequences with selected lung oa

            【外文期刊】 Shunzhou,Wan ; Peter V,Coveney ; 《Journal of the Royal Society, Interface》 2011年8卷61期 1114-27页 SCIMEDLINEBP

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            19. Automated molecular simulation based binding affinity calculator for ligand-bound HIV-1 proteases.

            【外文期刊】 S Kashif,Sadiq ; David,Wright ; 等 《Journal of chemical information and modeling》 2008年48卷9期 1909-19页 SCIMEDLINECA

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            20. Multiscale modelling: approaches and challenges.

            【外文期刊】 Sergey,Karabasov ; Dmitry,Nerukh ; 等 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2014年372卷2021期

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            21. Computational vaccinology: quantitative approaches.

            【外文期刊】 Darren R,Flower ; Helen,McSparron ; 等 《Novartis Foundation symposium》 2003年254卷 102-20; discussion 120-5, 216-22, 250-2页

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            22. Symmetry-breaking in chiral polymerisation.

            【外文期刊】 Jonathan A D,Wattis ; Peter V,Coveney ; 《Origins of life and evolution of the biosphere : the journal of the International Society for the Study of the Origin of Life》 2005年35卷3期 243-73页 SCIMEDLINEBP

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            23. High-throughput binding affinity calculations at extreme scales. oa

            【外文期刊】 Jumana,Dakka ; Matteo,Turilli ; 等 《BMC bioinformatics》 2018年19卷Suppl 18期 482页 SCIMEDLINEBP

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            24. Hierarchically structured bioinspired nanocomposites.

            【外文期刊】 Dhriti,Nepal ; Saewon,Kang ; 等 《Nature materials》 2023年22卷1期 18-35页 SCIMEDLINECABP

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            25. Grid-based steered thermodynamic integration accelerates the calculation of binding free energies.

            【外文期刊】 Philip W,Fowler ; Shantenu,Jha ; 等 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2005年363卷1833期 1999-2015页

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            26. Principles of Small-Molecule Transport through Synthetic Nanopores.

            【外文期刊】 Tim,Diederichs ; Katya,Ahmad ; 等 《ACS nano》 2021年15卷10期 16194-16206页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 DNA; ensemble simulations; membrane transport;

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            27. Rapid and accurate prediction of binding free energies for saquinavir-bound HIV-1 proteases.

            【外文期刊】 Ileana,Stoica ; S Kashif,Sadiq ; 等 《Journal of the American Chemical Society》 2008年130卷8期 2639-48页 SCIMEDLINECABP

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            28. From base pair to bedside: molecular simulation and the translation of genomics to personalized medicine.

            【外文期刊】 David W,Wright ; Shunzhou,Wan ; 等 《Wiley interdisciplinary reviews. Systems biology and medicine》 585-98页 MEDLINE

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            29. Principles governing control of aggregation and dispersion of aqueous graphene oxide.

            【外文期刊】 James L,Suter ; Peter V,Coveney ; 《Scientific reports》 2021年11卷1期 22460页

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            30. Role of host layer flexibility in DNA guest intercalation revealed by computer simulation of layered nanomaterials.

            【外文期刊】 Mary-Ann,Thyveetil ; Peter V,Coveney ; 等 《Journal of the American Chemical Society》 2008年130卷37期 12485-95页 SCIMEDLINECABP

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            31. A computational protocol for the integration of the monotopic protein prostaglandin H2 synthase into a phospholipid oa

            【外文期刊】 Philip W,Fowler ; Peter V,Coveney ; 《Biophysical journal》 2006年91卷2期 401-10页 SCIMEDLINECABP

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            32. T-cell epitope prediction and immune complex simulation using molecular dynamics: state of the art and persisting oa

            【外文期刊】 Darren R,Flower ; Kanchan,Phadwal ; 等 《Immunome research》 2010年6 Suppl 2卷 S4页 MEDLINE

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            33. Hybrid molecular-continuum fluid models: implementation within a general coupling framework.

            【外文期刊】 Rafael,Delgado-Buscalioni ; Peter V,Coveney ; 等 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2005年363卷1833期 1975-85页

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            34. A critical appraisal of polymer-clay nanocomposites.

            【外文期刊】 Biqiong,Chen ; Julian R G,Evans ; 等 《Chemical Society reviews》 2008年37卷3期 568-94页 SCIMEDLINEBP

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            35. Layered double hydroxide minerals as possible prebiotic information storage and transfer compounds.

            【外文期刊】 H Chris,Greenwell ; Peter V,Coveney ; 《Origins of life and evolution of the biosphere : the journal of the International Society for the Study of the Origin of Life》 2006年36卷1期 13-37页 SCIMEDLINEBP

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            36. Molecular dynamics simulations: bring biomolecular structures alive on a computer.

            【外文期刊】 Shunzhou,Wan ; Peter V,Coveney ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2007年409卷 321-39页

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            37. Principles Governing Control of Aggregation and Dispersion of Graphene and Graphene Oxide in Polymer Melts.

            【外文期刊】 James L,Suter ; Robert C,Sinclair ; 等 《Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)》 2020年32卷36期 e2003213页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 exfoliation dynamics; graphene oxide; multiscale modeling;

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            38. Multiscale computing for science and engineering in the era of exascale performance.

            【外文期刊】 Alfons G,Hoekstra ; Bastien,Chopard ; 等 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2019年377卷2142期 20180144页

            【关键词】 exascale; multiscale computing; multiscale modelling and simulation;

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            39. Uncertainty Quantification in Alchemical Free Energy Methods. oa

            【外文期刊】 Agastya P,Bhati ; Shunzhou,Wan ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2018年14卷6期 2867-2880页 SCIMEDLINECA

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            40. The influence of external electric fields on proton transfer tautomerism in the guanine-cytosine base pair. oa

            【外文期刊】 Alexander,Gheorghiu ; Peter V,Coveney ; 等 《Physical chemistry chemical physics : PCCP》 2021年23卷10期 6252-6265页 SCIMEDLINECA

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            41. Rapid, Precise, and Reproducible Prediction of Peptide-MHC Binding Affinities from Molecular Dynamics That Correlate

            【外文期刊】 Shunzhou,Wan ; Bernhard,Knapp ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2015年11卷7期 3346-56页 SCIMEDLINECA

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            42. Accurate ensemble molecular dynamics binding free energy ranking of multidrug-resistant HIV-1 proteases.

            【外文期刊】 S Kashif,Sadiq ; David W,Wright ; 等 《Journal of chemical information and modeling》 2010年50卷5期 890-905页 SCIMEDLINECA

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            43. Modelling biological complexity: a physical scientist's perspective. oa

            【外文期刊】 Peter V,Coveney ; Philip W,Fowler ; 《Journal of the Royal Society, Interface》 2005年2卷4期 267-80页 SCIMEDLINEBP

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            44. Long Time Scale Ensemble Methods in Molecular Dynamics: Ligand-Protein Interactions and Allostery in SARS-CoV-2 Targets oa

            【外文期刊】 Agastya P,Bhati ; Art,Hoti ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2023年19卷11期 3359-3378页 SCIMEDLINECA

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            45. Choice of boundary condition for lattice-Boltzmann simulation of moderate-Reynolds-number flow in complex domains.

            【外文期刊】 Rupert W,Nash ; Hywel B,Carver ; 等 《Physical review. E, Statistical, nonlinear, and soft matter physics》 2014年89卷2期 023303页 MEDLINECA

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            46. Ensembles Are Required to Handle Aleatoric and Parametric Uncertainty in Molecular Dynamics Simulation. oa

            【外文期刊】 Maxime,Vassaux ; Shunzhou,Wan ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2021年17卷8期 5187-5197页 SCIMEDLINECA

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            47. Computer simulation study of the structural stability and materials properties of DNA-intercalated layered double

            【外文期刊】 Mary-Ann,Thyveetil ; Peter V,Coveney ; 等 《Journal of the American Chemical Society》 2008年130卷14期 4742-56页 SCIMEDLINECABP

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            48. Comparison of Equilibrium and Nonequilibrium Approaches for Relative Binding Free Energy Predictions. oa

            【外文期刊】 Shunzhou,Wan ; Agastya P,Bhati ; 等 《Journal of chemical theory and computation》 2023年19卷21期 7846-7860页 SCIMEDLINECA

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            49. Chemically specific multiscale modeling of clay-polymer nanocomposites reveals intercalation dynamics, tactoid self- oa

            【外文期刊】 James L,Suter ; Derek,Groen ; 等 《Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)》 2015年27卷6期 966-84页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 clay-polymer nanocomposites; intercalation dynamics; materials properties;

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            50. Comparative analysis of nucleotide translocation through protein nanopores using steered molecular dynamics and an oa

            【外文期刊】 Hugh S C,Martin ; Shantenu,Jha ; 等 《Journal of computational chemistry》 2014年35卷9期 692-702页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 DNA; adaptive biasing force; molecular dynamics;

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