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            1. Molecular differential analysis of uterine leiomyomas and leiomyosarcomas through weighted gene network and pathway tracing approaches

            【外文期刊】 Sahly, Nora Naif ; Banaganapalli, Babajan ; 等 《Systems biology in reproductive medicine》 2021年67卷3期 209-220页

            【关键词】 Uterine leiomyosarcoma; protein interaction network; microarray data analysis;

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            2. Identification of Causative Variants Contributing to Nonsyndromic Orofacial Clefts Using Whole-Exome Sequencing in a Saudi Family

            【外文期刊】 Al Mahdi, Hadiah Bassam ; Edris, Sherif ; 等 《Genetic testing and molecular biomarkers》 2020年24卷11期 723-731页

            【关键词】 NSOFC; bone differentiation; NRP1 gene;

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            3. Myocardial infarction biomarker discovery with integrated gene expression, pathways and biological networks analysis

            【外文期刊】 Mujalli, Abdulrahman ; Banaganapalli, Babajan ; 等 《Genomics》 2020年112卷6期 5072-5085页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Bioinformatics; Myocardial infarction; Differentially expressed genes;

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            4. Molecular modelling and dynamic simulations of sequestosome 1 (SQSTM1) missense mutations linked to Paget disease of bone

            【外文期刊】 Shaik, Noor Ahmad ; Nasser, Khalidah K. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2021年39卷7/8期 2873-2884页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 SQSTM1; Paget; protein modelling;

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            5. Replication of GWAS loci revealed the moderate effect of TNRC6B locus on susceptibility of Saudi women to develop uterine leiomyomas

            【外文期刊】 Bondagji, Nabeel Saleem ; Morad, Fatima Amanullah ; 等 《The journal of obstetrics and gynaecology research》 2017年43卷2期 330-338页

            【关键词】 benign tumor; fibroid; replication study;

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            6. Molecular insights into the coding region mutations of low-density lipoprotein receptor adaptor protein 1 (LDLRAP1) linked to familial hypercholesterolemia.

            【外文期刊】 Noor A,Shaik ; Faten,Al-Qahtani ; 等 《The journal of gene medicine》 2020年22卷6期 e3176页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 LDLRAP1; docking; familial hypercholesterolemia;

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            7. Screening for Lrrk2 G2019S and clinical comparison of Tunisian and North American Caucasian Parkinson's disease families.

            【外文期刊】 Lianna,Ishihara ; Rachel A,Gibson ; 等 《Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society》 2007年22卷1期 55-61页 SCIMEDLINE

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            8. Expanded Somatic Mutation Spectrum of MED12 Gene in Uterine Leiomyomas of Saudi Arabian Women.

            【外文期刊】 Ghada M A,Ajabnoor ; Nesma Amin,Mohammed ; 等 《Frontiers in genetics》 2018年9卷 552页

            【关键词】 Arab women uterine; Luteinizing hormone; MED12 gene;

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            9. The use of therapeutic drug monitoring for early identification of vedolizumab response in Saudi Arabian patients with inflammatory bowel disease.

            【外文期刊】 Doaa,Anbarserry ; Mahmoud,Mosli ; 等 《Scientific reports》 2023年13卷1期 1771页

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            10. Transcriptome-Based Molecular Networks Uncovered Interplay Between Druggable Genes of CD8+ T Cells and Changes in Immune Cell Landscape in Patients With Pulmonary Tuberculosis.

            【外文期刊】 Faten Ahmad,Alsulaimany ; Nidal M Omer,Zabermawi ; 等 《Frontiers in medicine》 2021年8卷 812857页

            【关键词】 CD8+T cells; Mycobacterium tuberculosis; drug target;

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            11. Identification of key regulatory genes connected to NF-κB family of proteins in visceral adipose tissues using gene expression and weighted protein interaction network. oa

            【外文期刊】 Jamal S M,Sabir ; Abdelfatteh,El Omri ; 等 《PloS one》 2019年14卷4期 e0214337页 SCIMEDLINECABP

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            12. Complex Inheritance of Rare Missense Variants in PAK2, TAP2, and PLCL1 Genes in a Consanguineous Arab Family With Multiple Autoimmune Diseases Including Celiac Disease.

            【外文期刊】 Arwa Mastoor,Alharthi ; Babajan,Banaganapalli ; 等 《Frontiers in pediatrics》 2022年10卷 895298页

            【关键词】 WES; celiac disease; complex inheritance;

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            13. Identification of a Rare Exon 19 Skipping Mutation in ALMS1 Gene in Alström Syndrome Patients From Two Unrelated Saudi Families.

            【外文期刊】 Omar I,Saadah ; Babajan,Banaganapalli ; 等 《Frontiers in pediatrics》 2021年9卷 652011页

            【关键词】 ALMS1; Alstr?m syndrome; Saudi Arabia;

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            14. Identification of miRNA-mRNA-TFs regulatory network and crucial pathways involved in asthma through advanced systems biology approaches. oa

            【外文期刊】 Noor Ahmad,Shaik ; Khalidah,Nasser ; 等 《PloS one》 2022年17卷10期 e0271262页 SCIMEDLINECABP

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            15. Saudi Familial Hypercholesterolemia Patients With Rare LDLR Stop Gain Variant Showed Variable Clinical Phenotype and Resistance to Multiple Drug Regimen.

            【外文期刊】 Zuhier Ahmed,Awan ; Omran M,Rashidi ; 等 《Frontiers in medicine》 2021年8卷 694668页

            【关键词】 LDLR pathogenic mutations; consanguineous populations; familial hypercholesterolemia;

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            16. Identification of Causative Variants Contributing to Nonsyndromic Orofacial Clefts Using Whole-Exome Sequencing in a Saudi Family.

            【外文期刊】 Hadiah Bassam,Al Mahdi ; Sherif,Edris ; 等 《Genetic testing and molecular biomarkers》 2020年24卷11期 723-731页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 NRP1 gene; NSOFC; RPL27A gene;

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            17. Myocardial infarction biomarker discovery with integrated gene expression, pathways and biological networks analysis.

            【外文期刊】 Abdulrahman,Mujalli ; Babajan,Banaganapalli ; 等 《Genomics》 2020年112卷6期 5072-5085页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Bioinformatics; Biomarkers; Differentially expressed genes;

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            18. Structural and functional characterization of pathogenic non- synonymous genetic mutations of human insulin-degrading enzyme by in silico methods.

            【外文期刊】 Noor A,Shaik ; Mohammed,Kaleemuddin ; 等 《CNS & neurological disorders drug targets》 2014年13卷3期 517-32页 SCIMEDLINECABP

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            19. Nationwide survey on awareness of consanguinity and genetic diseases in Saudi Arabia: challenges and potential solutions to reduce the national healthcare burden. oa

            【外文期刊】 Nura A,Yousef ; Ashraf A,ElHarouni ; 等 《Human genomics》 2024年18卷1期 138页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Arabs; Consanguinity; Genetic diseases;

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            20. Molecular modelling and dynamics of CA2 missense mutations causative to carbonic anhydrase 2 deficiency syndrome.

            【外文期刊】 Noor A,Shaik ; Hifaa A,Bokhari ; 等 《Journal of biomolecular structure & dynamics》 2020年38卷14期 4067-4080页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Carbonic anhydrase 2 (CA2); bioinformatics; deleterious variants;

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            21. Novel MYO1D Missense Variant Identified Through Whole Exome Sequencing and Computational Biology Analysis Expands the Spectrum of Causal Genes of Laterality Defects.

            【外文期刊】 Rabab Said,Alsafwani ; Khalidah K,Nasser ; 等 《Frontiers in medicine》 2021年8卷 724826页

            【关键词】 gene expression; laterality defects; microfilament;

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            22. Comprehensive Computational Analysis of GWAS Loci Identifies CCR2 as a Candidate Gene for Celiac Disease Pathogenesis.

            【外文期刊】 Babajan,Banaganapalli ; Omran,Rashidi ; 等 《Journal of cellular biochemistry》 2017年118卷8期 2193-2207页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 CCR2; CELIAC DISEASE; COMPUTATIONAL BIOLOGY;

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            23. A comparative mRNA- and miRNA transcriptomics reveals novel molecular signatures associated with metastatic prostate cancers.

            【外文期刊】 Thoraia,Shinawi ; Khalidah Khalid,Nasser ; 等 《Frontiers in genetics》 2022年13卷 1066118页

            【关键词】 PPI; cancer drug targets; gene expression;

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            24. Molecular profiling of lamellar ichthyosis pathogenic missense mutations on the structural and stability aspects of TGM1 protein.

            【外文期刊】 Khalidah Khalid,Nasser ; Babajan,Banaganapalli ; 等 《Journal of biomolecular structure & dynamics》 2021年39卷14期 4962-4972页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Lamellar ichthyosis; TGM1; chitosan;

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            25. Replication of GWAS loci revealed the moderate effect of TNRC6B locus on susceptibility of Saudi women to develop uterine leiomyomas.

            【外文期刊】 Nabeel Saleem,Bondagji ; Fatima Amanullah,Morad ; 等 《The journal of obstetrics and gynaecology research》 2017年43卷2期 330-338页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Saudi women; benign tumor; fibroid;

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            26. TagSNP approach for HLA risk allele genotyping of Saudi celiac disease patients: effectiveness and pitfalls. oa

            【外文期刊】 Reham H,Baaqeel ; Babajan,Banaganapalli ; 等 《Bioscience reports》 2021年41卷6期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Celiac; Genetics; HLA Typing;

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            27. Computational approaches for discovering significant microRNAs, microRNA-mRNA regulatory pathways, and therapeutic protein targets in endometrial cancer.

            【外文期刊】 Ghada,Ajabnoor ; Fai,Alsubhi ; 等 《Frontiers in genetics》 2022年13卷 1105173页

            【关键词】 PPI; cancer drug targets; endometrial cancer;

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            28. Integrative global co-expression analysis identifies key microRNA-target gene networks as key blood biomarkers for obesity.

            【外文期刊】 Abdulhadi I,Bima ; Ayman Z,Elsamanoudy ; 等 《Minerva medica》 2022年113卷3期 532-541页 SCIMEDLINE

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            29. Association of Four Missense SNPs with Preeclampsia in Saudi Women.

            【外文期刊】 Nada Mohammed,Aljuaid ; Ebtesam Ibrahim,Muharram ; 等 《Saudi journal of medicine & medical sciences》 174-180页

            【关键词】 EPHX1 gene; F5 gene; lipoprotein lipase gene;

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            30. In-silico analysis of inflammatory bowel disease (IBD) GWAS loci to novel connections. oa

            【外文期刊】 Md,Mesbah-Uddin ; Ramu,Elango ; 等 《PloS one》 2015年10卷3期 e0119420页 SCIMEDLINECABP

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            31. A Computational Protein Phenotype Prediction Approach to Analyze the Deleterious Mutations of Human MED12 Gene.

            【外文期刊】 Babajan,Banaganapalli ; Kaleemuddin,Mohammed ; 等 《Journal of cellular biochemistry》 2016年117卷9期 2023-35页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 IN SILICO ANALYSIS; MEDIATOR COMPLEX SUBUNIT 12 (MED12); NON-SYNONYMOUS GENETIC MUTATIONS (nsGMs);

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            32. Protein phenotype diagnosis of autosomal dominant calmodulin mutations causing irregular heart rhythms.

            【外文期刊】 Noor A,Shaik ; Zuhier A,Awan ; 等 《Journal of cellular biochemistry》 2018年119卷10期 8233-8248页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Ca2+ binding; CaM; calmodulin;

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            33. Potential Biomarkers for Parkinson Disease from Functional Enrichment and Bioinformatic Analysis of Global Gene Expression Patterns of Blood and Substantia Nigra Tissues. oa

            【外文期刊】 Ramu,Elango ; Babajan,Banaganapalli ; 等 《Bioinformatics and biology insights》 2023年17卷 11779322231166214页 MEDLINE

            【关键词】 Parkinson disease; bioinformatics; biomarkers;

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            34. Exome Sequencing Identifies the Extremely Rare ITGAV and FN1 Variants in Early Onset Inflammatory Bowel Disease Patients.

            【外文期刊】 Huda Husain,Al-Numan ; Rana Mohammed,Jan ; 等 《Frontiers in pediatrics》 2022年10卷 895074页

            【关键词】 WES; consanguineous; digenic inheritance;

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            35. Genome-Wide Association Study-Guided Exome Rare Variant Burden Analysis Identifies IL1R1 and CD3E as Potential Autoimmunity Risk Genes for Celiac Disease.

            【外文期刊】 Haifa,Mansour ; Babajan,Banaganapalli ; 等 《Frontiers in pediatrics》 2022年10卷 837957页

            【关键词】 GWAS; PPI; WES;

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            36. Dissecting the Role of NF-κb Protein Family and Its Regulators in Rheumatoid Arthritis Using Weighted Gene Co-Expression Network.

            【外文期刊】 Jamal S M,Sabir ; Abdelfatteh,El Omri ; 等 《Frontiers in genetics》 2019年10卷 1163页

            【关键词】 GEO; NF-κB; auto-inflammatory disease;

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            37. Whole exome sequencing of a consanguineous family identifies the possible modifying effect of a globally rare AK5 allelic variant in celiac disease development among Saudi patients. oa

            【外文期刊】 Jumana Yousuf,Al-Aama ; Noor Ahmad,Shaik ; 等 《PloS one》 2017年12卷5期 e0176664页 SCIMEDLINECABP

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            38. iPSC modeling of severe aplastic anemia reveals impaired differentiation and telomere shortening in blood progenitors. oa

            【外文期刊】 Dario,Melguizo-Sanchis ; Yaobo,Xu ; 等 《Cell death & disease》 2018年9卷2期 128页 SCIMEDLINE

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            39. Exploring somatic mutations in BRAF, KRAS, and NRAS as therapeutic targets in Saudi colorectal cancer patients through massive parallel sequencing and variant classification.

            【外文期刊】 Thamer Abdulhamid,Aljuhani ; Noor Ahmad,Shaik ; 等 《Frontiers in pharmacology》 2024年15卷 1498295页

            【关键词】 BRAF V600E; TruSight tumor 15 panel; colorectal cancer;

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            40. Induced pluripotent stem cell modelling of HLHS underlines the contribution of dysfunctional NOTCH signalling to impaired cardiogenesis. oa

            【外文期刊】 Chunbo,Yang ; Yaobo,Xu ; 等 《Human molecular genetics》 2017年26卷16期 3031-3045页 SCIMEDLINECABP

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            41. Bioinformatics insights into the genes and pathways on severe COVID-19 pathology in patients with comorbidities.

            【外文期刊】 Abdulrahman,Mujalli ; Kawthar Saad,Alghamdi ; 等 《Frontiers in physiology》 2022年13卷 1045469页

            【关键词】 COVID-19; MERS; SARS-CoV-2;

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            42. Unraveling the role of salt-sensitivity genes in obesity with integrated network biology and co-expression analysis. oa

            【外文期刊】 Jamal Sabir M,Sabir ; Abdelfatteh,El Omri ; 等 《PloS one》 2020年15卷2期 e0228400页 SCIMEDLINECABP

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            43. Evidence for the presence of somatic mitochondrial DNA mutations in right atrial appendage tissues of coronary artery disease patients.

            【外文期刊】 Kavitha,Matam ; Noor Ahmad,Shaik ; 等 《Molecular genetics and genomics : MGG》 2014年289卷4期 533-40页 SCIMEDLINECABP

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            44. Molecular differential analysis of uterine leiomyomas and leiomyosarcomas through weighted gene network and pathway tracing approaches.

            【外文期刊】 Nora Naif,Sahly ; Babajan,Banaganapalli ; 等 《Systems biology in reproductive medicine》 2021年67卷3期 209-220页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Uterine leiomyosarcoma; differentially expressed genes; microarray data analysis;

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            45. Structural characterization and conformational dynamics of alpha-1 antitrypsin pathogenic variants causing alpha-1-antitrypsin deficiency.

            【外文期刊】 Noor Ahmad,Shaik ; Najla Bint,Saud Al-Saud ; 等 《Frontiers in molecular biosciences》 2022年9卷 1051511页

            【关键词】 AATD; SERPINA1 gene; alpha-1-antitrypsin;

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            46. Replication of GWAS Coding SNPs Implicates MMEL1 as a Potential Susceptibility Locus among Saudi Arabian Celiac Disease Patients. oa

            【外文期刊】 Omar I,Saadah ; Noor Ahmad,Shaik ; 等 《Disease markers》 2015年2015卷 351673页 MEDLINEBP

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            47. Rare variant burden analysis from exomes of three consanguineous families reveals LILRB1 and PRSS3 as potential key proteins in inflammatory bowel disease pathogenesis.

            【外文期刊】 Rana Mohammed,Jan ; Huda Husain,Al-Numan ; 等 《Frontiers in medicine》 2023年10卷 1164305页

            【关键词】 Crohn’s disease; gastrointestinal tract; inflammatory bowel disease;

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            48. Protein structural insights into a rare PCSK9 gain-of-function variant (R496W) causing familial hypercholesterolemia in a Saudi family: whole exome sequencing and computational analysis.

            【外文期刊】 Noor Ahmad,Shaik ; Najla,Al-Shehri ; 等 《Frontiers in physiology》 2023年14卷 1204018页

            【关键词】 cardiovascular diseases; familial hypercholesterolemia; pcsk9;

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            49. Whole exome sequencing identifies rare biallelic ALMS1 missense and stop gain mutations in familial Alström syndrome patients. oa

            【外文期刊】 Naglaa M,Kamal ; Ahmed N,Sahly ; 等 《Saudi journal of biological sciences》 2020年27卷1期 271-278页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 ALMS1 gene; Alstrom syndrome; Autosomal recessive;

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            50. Molecular modelling and dynamic simulations of sequestosome 1 (SQSTM1) missense mutations linked to Paget disease of bone.

            【外文期刊】 Noor Ahmad,Shaik ; Khalidah K,Nasser ; 等 《Journal of biomolecular structure & dynamics》 2021年39卷8期 2873-2884页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Paget; SQSTM1; molecular dyanmics;

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