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            1. De Novo Genome Assembly of the Japanese Wheat Cultivar Norin 61 Highlights Functional Variation in Flowering Time and Fusarium-Resistant Genes in East Asian Genotypes

            【外文期刊】 Shimizu, Kentaro K. ; Copetti, Dario ; 等 《Plant and cell physiology》 2021年62卷1期 8-27页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Adaptation; Asian germplasm; Bread wheat;

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            2. Multiple hybrid de novo genome assembly of finger millet, an orphan allotetraploid crop

            【外文期刊】 Hatakeyama, Masaomi ; Aluri, Sirisha ; 等 《DNA research: an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes》 2018年25卷1期 39-47页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 hybrid de novo assembly; finger millet; allotetraploid genome;

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            3. Fermentation Ability of Gut Microbiota of Wild Japanese Macaques in the Highland and Lowland Yakushima: In Vitro Fermentation Assay and Genetic Analyses

            【外文期刊】 Hanya, Goro ; Tackmann, Janko ; 等 《Microbial Ecology: An International Journal》 2020年80卷2期 459-474页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Diet; In vitro fermentation assay; Meta-16S analysis;

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            4. Plant adaptive radiation mediated by polyploid plasticity in transcriptomes

            【外文期刊】 Shimizu-Inatsugi, Rie ; Terada, Aika ; 等 《Molecular ecology》 2017年26卷1期 193-207页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 advantages and disadvantages of polyploidization; ecological speciation; generalist;

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            5. The Cardamine hirsuta genome offers insight into the evolution of morphological diversity

            【外文期刊】 Gan, Xiangchao ; Hay, Angela ; 等 《Nature Plants》 2016年2卷10期

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            6. The Cardamine hirsuta genome offers insight into the evolution of morphological diversity (vol 2, 16167, 2016)

            【外文期刊】 Gan, Xiangchao ; Hay, Angela ; 等 《Nature Plants》 2016年2卷12期

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            7. Bacterial diversity and composition in the fluid of pitcher plants of the genus Nepenthes

            【外文期刊】 Takeuchi, Yayoi ; Chaffron, Samuel ; 等 《Systematic and Applied Microbiology》 2015年38卷5期 330-339页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Alphaproteobacteria; Borneo; CARD-FISH;

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            8. The Cardamine hirsuta genome offers insight into the evolution of morphological diversity

            【外文期刊】 Gan, Xiangchao ; Hay, Angela ; 等 《Nature Plants》 2016年2卷11期

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            9. Efficient Detection of Novel Nuclear Markers for Brassicaceae by Transcriptome Sequencing. oa

            【外文期刊】 Reinhold,Stockenhuber ; Stefan,Zoller ; 等 《PloS one》 2015年10卷6期 e0128181页 SCIMEDLINECABP

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            10. Plant trichomes and a single gene GLABRA1 contribute to insect community composition on field-grown Arabidopsis thaliana. oa

            【外文期刊】 Yasuhiro,Sato ; Rie,Shimizu-Inatsugi ; 等 《BMC plant biology》 2019年19卷1期 163页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Brassicaceae; Community genetics; GL1;

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            11. Reducing herbivory in mixed planting by genomic prediction of neighbor effects in the field. oa

            【外文期刊】 Yasuhiro,Sato ; Rie,Shimizu-Inatsugi ; 等 《Nature communications》 2024年15卷1期 8467页 SCIMEDLINECA

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            12. Multiple hybrid de novo genome assembly of finger millet, an orphan allotetraploid crop. oa

            【外文期刊】 Masaomi,Hatakeyama ; Sirisha,Aluri ; 等 《DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes》 2018年25卷1期 39-47页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 allotetraploid genome; finger millet; hybrid de novo assembly;

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            13. Patterns of polymorphism and selection in the subgenomes of the allopolyploid Arabidopsis kamchatica. oa

            【外文期刊】 Timothy,Paape ; Roman V,Briskine ; 等 《Nature communications》 2018年9卷1期 3909页 SCIMEDLINECA

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            14. Gene duplication and genetic exchange drive the evolution of S-RNase-based self-incompatibility in Petunia.

            【外文期刊】 Ken-Ichi,Kubo ; Timothy,Paape ; 等 《Nature plants》 2015年1卷 14005页

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            15. Genet assignment and population structure analysis in a clonal forest-floor herb, Cardamine leucantha, using RAD-seq. oa

            【外文期刊】 Michiaki,Tsujimoto ; Kiwako S,Araki ; 等 《AoB PLANTS》 2020年12卷1期 plz080页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Cardamine leucantha; RAD-seq; clonal plants;

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            16. The more the merrier: recent hybridization and polyploidy in cardamine. oa

            【外文期刊】 Terezie,Mandáková ; Ales,Kovarík ; 等 《The Plant cell》 2013年25卷9期 3280-95页 SCIMEDLINECABP

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            17. Bacterial diversity and composition in the fluid of pitcher plants of the genus Nepenthes.

            【外文期刊】 Yayoi,Takeuchi ; Samuel,Chaffron ; 等 《Systematic and applied microbiology》 2015年38卷5期 330-9页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Alphaproteobacteria; Borneo; CARD–FISH;

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            18. Artificial selection reveals the role of transcriptional constraints in the maintenance of life history variation.

            【外文期刊】 Joel L,Pick ; Masaomi,Hatakeyama ; 等 《Evolution letters》 2020年4卷3期 200-211页

            【关键词】 Costs of reproduction; egg size; immune defence;

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            19. Dominance in self-compatibility between subgenomes of allopolyploid Arabidopsis kamchatica shown by transgenic restoration of self-incompatibility. oa

            【外文期刊】 Chow-Lih,Yew ; Takashi,Tsuchimatsu ; 等 《Nature communications》 2023年14卷1期 7618页 SCIMEDLINECA

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            20. Genome-wide quantification of homeolog expression ratio revealed nonstochastic gene regulation in synthetic allopolyploid Arabidopsis. oa

            【外文期刊】 Satoru,Akama ; Rie,Shimizu-Inatsugi ; 等 《Nucleic acids research》 2014年42卷6期 e46页 SCIMEDLINECABP

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            21. Erratum to: Ultralong Oxford Nanopore Reads Enable the Development of a Reference-Grade Perennial Ryegrass Genome Assembly. oa

            【外文期刊】 Daniel,Frei ; Elisabeth,Veekman ; 等 《Genome biology and evolution》 2021年13卷10期 SCIMEDLINEBP

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            22. Seasonal pigment fluctuation in diploid and polyploid Arabidopsis revealed by machine learning-based phenotyping method PlantServation. oa

            【外文期刊】 Reiko,Akiyama ; Takao,Goto ; 等 《Nature communications》 2023年14卷1期 5792页 SCIMEDLINECA

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            23. Conserved but Attenuated Parental Gene Expression in Allopolyploids: Constitutive Zinc Hyperaccumulation in the Allotetraploid Arabidopsis kamchatica. oa

            【外文期刊】 Timothy,Paape ; Masaomi,Hatakeyama ; 等 《Molecular biology and evolution》 2016年33卷11期 2781-2800页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 allopolyploid; heavy metal; homeolog;

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            24. Independent origins of self-compatibility in Arabidopsis thaliana.

            【外文期刊】 Kentaro K,Shimizu ; Rie,Shimizu-Inatsugi ; 等 《Molecular ecology》 2008年17卷2期 704-14页 SCIMEDLINEBP

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            25. Trait-dependent resemblance of the flowering phenology and floral morphology of the allopolyploid Cardamine flexuosa to those of the parental diploids in natural habitats. oa

            【外文期刊】 Reiko,Akiyama ; Stefan,Milosavljevic ; 等 《Journal of plant research》 2020年133卷2期 147-155页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Cardamine; Floral morphology; Flowering phenology;

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            26. Genome sequencing of Metrosideros polymorpha (Myrtaceae), a dominant species in various habitats in the Hawaiian Islands with remarkable phenotypic variations.

            【外文期刊】 Ayako,Izuno ; Masaomi,Hatakeyama ; 等 《Journal of plant research》 2016年129卷4期 727-736页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Genome; Hawaii; Heterozygosity;

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            27. Ultralong Oxford Nanopore Reads Enable the Development of a Reference-Grade Perennial Ryegrass Genome Assembly. oa

            【外文期刊】 Daniel,Frei ; Elisabeth,Veekman ; 等 《Genome biology and evolution》 2021年13卷8期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Lolium perenne ; Oxford Nanopore; forage grasses;

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            28. Fine-scale empirical data on niche divergence and homeolog expression patterns in an allopolyploid and its diploid progenitor species. oa

            【外文期刊】 Reiko,Akiyama ; Jianqiang,Sun ; 等 《The New phytologist》 2021年229卷6期 3587-3601页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Cardamine ; allopolyploid; homeolog expression;

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            29. Corrigendum. oa

            【外文期刊】 Reiko,Akiyama ; Roman V,Briskine ; 等 《The New phytologist》 2021年231卷1期 500页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Cardamine ; allopolyploid; homeolog expression;

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            30. The Cardamine hirsuta genome offers insight into the evolution of morphological diversity.

            【外文期刊】 Xiangchao,Gan ; Angela,Hay ; 等 《Nature plants》 2016年2卷11期 16167页

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            31. The population genomic signature of environmental association and gene flow in an ecologically divergent tree species Metrosideros polymorpha (Myrtaceae).

            【外文期刊】 Ayako,Izuno ; Kanehiro,Kitayama ; 等 《Molecular ecology》 2017年26卷6期 1515-1532页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Metrosideros ; Hawaii; RAD sequencing;

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            32. In situ enzyme activity in the dissolved and particulate fraction of the fluid from four pitcher plant species of the genus Nepenthes. oa

            【外文期刊】 Yayoi,Takeuchi ; Michaela M,Salcher ; 等 《PloS one》 2011年6卷9期 e25144页 SCIMEDLINECABP

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            33. Evolution of self-compatibility in Arabidopsis by a mutation in the male specificity gene.

            【外文期刊】 Takashi,Tsuchimatsu ; Keita,Suwabe ; 等 《Nature》 2010年464卷7293期 1342-6页 SCIMEDLINECABP

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            34. Female sterility associated with increased clonal propagation suggests a unique combination of androdioecy and asexual reproduction in populations of Cardamine amara (Brassicaceae). oa

            【外文期刊】 Andrew,Tedder ; Matthias,Helling ; 等 《Annals of botany》 2015年115卷5期 763-76页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Arabidopsis thaliana; Brassicaceae; Cardamine amara;

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            35. Geographic Variation in Genomic Signals of Admixture Between Two Closely Related European Sepsid Fly Species.

            【外文期刊】 Athene,Giesen ; Wolf U,Blanckenhorn ; 等 《Evolutionary biology》 2023年50卷4期 395-412页

            【关键词】 ABBA–BABA test; Gene flow; Introgression;

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            36. A low-coverage 3' RNA-seq to detect homeolog expression in polyploid wheat.

            【外文期刊】 Jianqiang,Sun ; Moeko,Okada ; 等 《NAR genomics and bioinformatics》 2023年5卷3期 lqad067页

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            37. A Recently Formed Triploid Cardamine insueta Inherits Leaf Vivipary and Submergence Tolerance Traits of Parents.

            【外文期刊】 Jianqiang,Sun ; Rie,Shimizu-Inatsugi ; 等 《Frontiers in genetics》 2020年11卷 567262页

            【关键词】 RNA-seq; allopolyploid; ecological niche;

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            38. ARPEGGIO: Automated Reproducible Polyploid EpiGenetic GuIdance workflOw. oa

            【外文期刊】 Stefan,Milosavljevic ; Tony,Kuo ; 等 《BMC genomics》 2021年22卷1期 547页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Allopolyploids; Automation; Bisulfite-sequencing;

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            39. Plant adaptive radiation mediated by polyploid plasticity in transcriptomes.

            【外文期刊】 Rie,Shimizu-Inatsugi ; Aika,Terada ; 等 《Molecular ecology》 2017年26卷1期 193-207页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 advantages and disadvantages of polyploidization; ecological speciation; generalist;

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            40. Phenotypic variation of a new synthetic allotetraploid Arabidopsis kamchatica enhanced in natural environment.

            【外文期刊】 Rie,Shimizu-Inatsugi ; Aki,Morishima ; 等 《Frontiers in plant science》 2022年13卷 1058522页

            【关键词】 Arabidopsis; in natura; neopolyploid;

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            41. Genome assembly and annotation of Arabidopsis halleri, a model for heavy metal hyperaccumulation and evolutionary ecology.

            【外文期刊】 Roman V,Briskine ; Timothy,Paape ; 等 《Molecular ecology resources》 2017年17卷5期 1025-1036页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Arabidopsis halleri ; Tada mine; de novo assembly;

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            42. Fermentation Ability of Gut Microbiota of Wild Japanese Macaques in the Highland and Lowland Yakushima: In Vitro Fermentation Assay and Genetic Analyses.

            【外文期刊】 Goro,Hanya ; Janko,Tackmann ; 等 《Microbial ecology》 2020年80卷2期 459-474页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Diet; Digestion; Generalists;

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            43. The allopolyploid Arabidopsis kamchatica originated from multiple individuals of Arabidopsis lyrata and Arabidopsis halleri.

            【外文期刊】 Rie,Shimizu-Inatsugi ; Judita,Lihová ; 等 《Molecular ecology》 2009年18卷19期 4024-48页 SCIMEDLINEBP

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            44. Erratum: The Cardamine hirsuta genome offers insight into the evolution of morphological diversity.

            【外文期刊】 Xiangchao,Gan ; Angela,Hay ; 等 《Nature plants》 2016年2卷 16189页

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            45. Multiple wheat genomes reveal global variation in modern breeding. oa

            【外文期刊】 Sean,Walkowiak ; Liangliang,Gao ; 等 《Nature》 2020年588卷7837期 277-283页 SCIMEDLINECABP

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            46. Conserved but Attenuated Parental Gene Expression in Allopolyploids: Constitutive Zinc Hyperaccumulation in the Allotetraploid Arabidopsis kamchatica

            【外文期刊】 Paape, Timothy ; Hatakeyama, Masaomi ; 等 《Molecular biology and evolution》 2016年33卷11期 2781-2800页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 allopolyploid; homeolog; hyperaccumulation;

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            47. Fine-scale empirical data on niche divergence and homeolog expression patterns in an allopolyploid and its diploid progenitor species

            【外文期刊】 Akiyama, Reiko ; Sun, Jianqiang ; 等 《The New Phytologist》 2021年229卷6期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 allopolyploid; Cardamine; homeolog expression;

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            48. The Cardamine hirsuta genome offers insight into the evolution of morphological diversity (vol 2, 16167, 2016)

            【外文期刊】 Gan, Xiangchao ; Hay, Angela ; 等 《Nature Plants》 2016年2卷10期

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            49. Female sterility associated with increased clonal propagation suggests a unique combination of androdioecy and asexual reproduction in populations of Cardamine amara (Brassicaceae)

            【外文期刊】 Tedder, Andrew ; Helling, Matthias ; 等 《Annals of Botany》 2015年115卷5期 763-776页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Cardamine amara; Brassicaceae; Arabidopsis thaliana;

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            50. Metal accumulation and its effect on leaf herbivory in an allopolyploid species Arabidopsis kamchatica inherited from a diploid hyperaccumulator A. halleri

            【外文期刊】 Shimizu-Inatsugi, Rie ; Milosavljevic, Silvija ; 等 《Plant Species Biology》 2021年36卷2期 208-217页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 allotetraploid; Arabidopsis kamchatica; elemental defense;

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