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            1. A tiling-deletion-based genetic screen for cis-regulatory element identification in mammalian cells

            【外文期刊】 Diao, Yarui ; Fang, Rongxin ; 等 《Nature methods》 2017年14卷6期 629-+页 SCISCIEMEDLINE

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            2. Erythromyeloid progenitors give rise to a population of osteoclasts that contribute to bone homeostasis and repair

            【外文期刊】 Yahara, Yasuhito ; Barrientos, Tomasa ; 等 《Nature cell biology》 2020年22卷1期 49-+页 SCISCIEMEDLINE

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            3. Plug-and-Play Protein Modification Using Homology-Independent Universal Genome Engineering

            【外文期刊】 Gao, Yudong ; Hisey, Erin ; 等 《Neuron》 2019年103卷4期 583-597页 SCISCIEMEDLINE

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            4. A new class of temporarily phenotypic enhancers identified by CRISPR/Cas9-mediated genetic screening

            【外文期刊】 Diao, Yarui ; Li, Bin ; 等 《Genome research》 2016年26卷3期 397-405页 SCISCIEMEDLINE

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            5. Transcription Factor-Directed Re-wiring of Chromatin Architecture for Somatic Cell Nuclear Reprogramming toward trans-Differentiation

            【外文期刊】 Dall'Agnese, Alessandra ; Caputo, Luca ; 等 《Molecular cell》 2019年76卷3期 453-472页 SCISCIEMEDLINE

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            6. A new class of temporarily phenotypic enhancers identified by CRISPR/Cas9-mediated genetic screening. oa

            【外文期刊】 Yarui,Diao ; Bin,Li ; 等 《Genome research》 2016年26卷3期 397-405页 SCIMEDLINECABP

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            7. RAP2 mediates mechanoresponses of the Hippo pathway. oa

            【外文期刊】 Zhipeng,Meng ; Yunjiang,Qiu ; 等 《Nature》 2018年560卷7720期 655-660页 SCIMEDLINECABP

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            8. Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression. oa

            【外文期刊】 Sihan,Wu ; Kristen M,Turner ; 等 《Nature》 2019年575卷7784期 699-703页 SCIMEDLINECABP

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            9. miR-203, a tumor suppressor frequently down-regulated by promoter hypermethylation in rhabdomyosarcoma. oa

            【外文期刊】 Yarui,Diao ; Xing,Guo ; 等 《The Journal of biological chemistry》 2014年289卷1期 529-39页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 DNA Methylation; JAK Kinase; Leukemia Inhibitory Factor Receptor;

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            10. Single-cell transcriptomic analyses of mouse idh1 mutant growth plate chondrocytes reveal distinct cell populations responsible for longitudinal growth and enchondroma formation.

            【外文期刊】 Vijitha,Puviindran ; Eijiro,Shimada ; 等 《Research square》

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            11. Transcription Factor-Directed Re-wiring of Chromatin Architecture for Somatic Cell Nuclear Reprogramming toward trans-Differentiation. oa

            【外文期刊】 Alessandra,Dall'Agnese ; Luca,Caputo ; 等 《Molecular cell》 2019年76卷3期 453-472.e8页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 MYOD; cell identity; chromatin organization;

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            12. Myoblast deactivation within engineered human skeletal muscle creates a transcriptionally heterogeneous population of quiescent satellite-like cells. oa

            【外文期刊】 Jason,Wang ; Torie,Broer ; 等 《Biomaterials》 2022年284卷 121508页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Activation; Engineered skeletal muscle; Human;

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            13. The COMPASS complex maintains the metastatic capacity imparted by a subpopulation of cells in UPS.

            【外文期刊】 Ga I,Ban ; Vijitha,Puviindran ; 等 《iScience》 2024年27卷7期 110187页

            【关键词】 Cancer; Epigenetics; Genomics;

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            14. CRISPR-SE: a brute force search engine for CRISPR design.

            【外文期刊】 Bin,Li ; Poshen B,Chen ; 等 《NAR genomics and bioinformatics》 2021年3卷1期 lqab013页

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            15. Vcam1+ Fibro-adipogenic Progenitors Mark Fatty Infiltration in Chronic Limb Threatening Ischemia.

            【外文期刊】 Qunsheng,Dai ; Changxin,Wan ; 等 《bioRxiv : the preprint server for biology》

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            16. Subtype-specific 3D genome alteration in acute myeloid leukaemia. oa

            【外文期刊】 Jie,Xu ; Fan,Song ; 等 《Nature》 2022年611卷7935期 387-398页 SCIMEDLINECABP

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            17. NAD metabolic dependency in cancer is shaped by gene amplification and enhancer remodelling. oa

            【外文期刊】 Sudhir,Chowdhry ; Ciro,Zanca ; 等 《Nature》 2019年569卷7757期 570-575页 SCIMEDLINECABP

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            18. Tumor-propagating side population cells are a dynamic subpopulation in undifferentiated pleomorphic sarcoma.

            【外文期刊】 Yuning Jackie,Tang ; Vijitha,Puviindran ; 等 《JCI insight》 2021年6卷22期

            【关键词】 Cancer; Mouse models; Oncology;

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            19. Single cell analysis of Idh mutant growth plates identifies cell populations responsible for longitudinal bone growth and enchondroma formation.

            【外文期刊】 Vijitha,Puviindran ; Eijiro,Shimada ; 等 《Scientific reports》 2024年14卷1期 26208页

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            20. Decoding Heterogenous Single-cell Perturbation Responses.

            【外文期刊】 Bicna,Song ; Dingyu,Liu ; 等 《bioRxiv : the preprint server for biology》

            【关键词】 CRISPR-based genetic perturbations; Perturb-seq; computational model;

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            21. Maf family transcription factors are required for nutrient uptake in the mouse neonatal gut. oa

            【外文期刊】 Anne M,Bara ; Lei,Chen ; 等 《Development (Cambridge, England)》 2022年149卷23期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Enterocyte; Intestine; Lysosomes;

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            22. HiCAR is a robust and sensitive method to analyze open-chromatin-associated genome organization. oa

            【外文期刊】 Xiaolin,Wei ; Yu,Xiang ; 等 《Molecular cell》 2022年82卷6期 1225-1238.e6页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 HiCAR; Silencer-like promoter; chromatin accessibility;

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            23. HiCAR: Analysis of Open Chromatin Associated Long-range Chromatin Interaction Using Low-Input Materials.

            【外文期刊】 Xiaolin,Wei ; Duc,Tran ; 等 《Current protocols》 2023年3卷10期 e899页

            【关键词】 Tn5; chromatin accessibility; chromatin interaction;

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            24. Modeling kidney development, disease, and plasticity with clonal expandable nephron progenitor cells and nephron organoids.

            【外文期刊】 Biao,Huang ; Zipeng,Zeng ; 等 《bioRxiv : the preprint server for biology》

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            25. UBE2N Is Essential for Maintenance of Skin Homeostasis and Suppression of Inflammation. oa

            【外文期刊】 Min Jin,Lee ; Manel Ben,Hammouda ; 等 《The Journal of investigative dermatology》 2024年144卷12期 2742-2753页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Cutaneous biology; IL-1 signaling; Inflammation;

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            26. Neutrophils promote tumor resistance to radiation therapy. oa

            【外文期刊】 Amy J,Wisdom ; Cierra S,Hong ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2019年116卷37期 18584-18589页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 cancer biology; genetically engineered mouse model; neutrophil;

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            27. CRISPR-Cas9-based functional interrogation of unconventional translatome reveals human cancer dependency on cryptic non-canonical open reading frames. oa

            【外文期刊】 Caishang,Zheng ; Yanjun,Wei ; 等 《Nature structural & molecular biology》 2023年30卷12期 1878-1892页 SCIMEDLINECABP

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            28. A compendium of promoter-centered long-range chromatin interactions in the human genome. oa

            【外文期刊】 Inkyung,Jung ; Anthony,Schmitt ; 等 《Nature genetics》 2019年51卷10期 1442-1449页 SCIMEDLINECABP

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            29. Pro-inflammatory macrophages impair skeletal muscle regeneration in ischemic-damaged limbs by inducing precocious differentiation of satellite cells.

            【外文期刊】 Kevin W,Southerland ; Yueyuan,Xu ; 等 《bioRxiv : the preprint server for biology》

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            30. A tiling-deletion-based genetic screen for cis-regulatory element identification in mammalian cells. oa

            【外文期刊】 Yarui,Diao ; Rongxin,Fang ; 等 《Nature methods》 2017年14卷6期 629-635页 SCIMEDLINECABP

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            31. Long-term expandable mouse and human-induced nephron progenitor cells enable kidney organoid maturation and modeling of plasticity and disease. oa

            【外文期刊】 Biao,Huang ; Zipeng,Zeng ; 等 《Cell stem cell》 2024年31卷6期 921-939.e17页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 CAKUT; CRISPR screen; NPC;

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            32. Prolonged hypernutrition impairs TREM2-dependent efferocytosis to license chronic liver inflammation and NASH development. oa

            【外文期刊】 Xiaochen,Wang ; Qifeng,He ; 等 《Immunity》 2023年56卷1期 58-77.e11页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 TREM2; chronic inflammation; efferocytosis;

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            33. Long noncoding RNA study: Genome-wide approaches.

            【外文期刊】 Shuang,Tao ; Yarui,Hou ; 等 《Genes & diseases》 2023年10卷6期 2491-2510页

            【关键词】 Cancer-related lncRNAs; Computational pipelines; Genome-wide study;

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            34. A screen for regeneration-associated silencer regulatory elements in zebrafish. oa

            【外文期刊】 Kazunori,Ando ; Jianhong,Ou ; 等 《Developmental cell》 2024年59卷5期 676-691.e5页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 enhancer; fin regeneration; heart regeneration;

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            35. Functional MRI Investigation of Ultrasound Stimulation at ST 36. oa

            【外文期刊】 Yarui,Wei ; Ling,Mei ; 等 《Evidence-based complementary and alternative medicine : eCAM》 2020年2020卷 6794013页 MEDLINE

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            36. The Hippo pathway mediates Semaphorin signaling.

            【外文期刊】 Zhipeng,Meng ; Fu-Long,Li ; 等 《Science advances》 2022年8卷21期 eabl9806页

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            37. Plug-and-Play Protein Modification Using Homology-Independent Universal Genome Engineering. oa

            【外文期刊】 Yudong,Gao ; Erin,Hisey ; 等 《Neuron》 2019年103卷4期 583-597.e8页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 CRISPR; HiUGE; genomics;

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            38. Skeletal muscle regeneration failure in ischemic-damaged limbs is associated with pro-inflammatory macrophages and premature differentiation of satellite cells. oa

            【外文期刊】 Kevin W,Southerland ; Yueyuan,Xu ; 等 《Genome medicine》 2023年15卷1期 95页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Chronic limb-threatening ischemia; Macrophage polarization; Murine hindlimb ischemia;

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            39. Erythromyeloid progenitors give rise to a population of osteoclasts that contribute to bone homeostasis and repair. oa

            【外文期刊】 Yasuhito,Yahara ; Tomasa,Barrientos ; 等 《Nature cell biology》 2020年22卷1期 49-59页 SCIMEDLINECABP

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            40. Crosstalk between RNA m6A and DNA methylation regulates transposable element chromatin activation and cell fate in human pluripotent stem cells. oa

            【外文期刊】 Tongyu,Sun ; Yueyuan,Xu ; 等 《Nature genetics》 2023年55卷8期 1324-1335页 SCIMEDLINECABP

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            41. UBE2N is essential for maintenance of skin homeostasis and suppression of inflammation.

            【外文期刊】 Min Jin,Lee ; Manel Ben,Hammouda ; 等 《bioRxiv : the preprint server for biology》

            【关键词】 IL-1 signaling; UBE2N; cutaneous biology;

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            42. Regulation of transposable elements and stem cell fate by crosstalk between RNA and DNA methylation

            【外文期刊】 Sun, Tongyu ; Diao, Yarui ; 《Nature Genetics》 2023年55卷8期 1259-1260页 SCISCIEMEDLINE

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            43. A compendium of promoter-centered long-range chromatin interactions in the human genome

            【外文期刊】 Jung, Inkyung ; Schmitt, Anthony ; 等 《Nature Genetics》 2019年51卷10期 1442-1449页 SCISCIEMEDLINE

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            44. Maf family transcription factors are required for nutrient uptake in the mouse neonatal gut

            【外文期刊】 Bara, Anne M. ; Chen, Lei ; 等 2022年149卷23期 dev201251-dev201251页

            【关键词】 Enterocyte; Intestine; Lysosomes;

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            45. A compendium of promoter-centered long-range chromatin interactions in the human genome

            【外文期刊】 Jung, Inkyung ; Schmitt, Anthony ; 等 《Nature Genetics》 2019年51卷10期 1442-+页 SCISCIEMEDLINE

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