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            1. SiGN-SSM: open source parallel software for estimating gene networks with state space models

            【外文期刊】 Tamada, Yoshinori ; Yamaguchi, Rui ; 等 《Bioinformatics》 2011年27卷8期 1172-1173页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 gene: expression; gene network structure; GNU Affero General Public Licence version 3;

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            2. Production of reactive persulfide species in chronic obstructive pulmonary disease

            【外文期刊】 Numakura, Tadahisa ; Sugiura, Hisatoshi ; 等 《Thorax: The Journal of the British Thoracic Society》 2017年72卷12期 1074-1083页 SCISCIEMEDLINE

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            3. Variant analysis of prostate cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological pathways

            【外文期刊】 Kasajima, Rika ; Yamaguchi, Rui ; 等 《Oncology reports》 2020年43卷3期 943-952页

            【关键词】 prostate; cancer; Japanese;

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            4. Decrease in an anti-ageing factor, growth differentiation factor 11, in chronic obstructive pulmonary disease

            【外文期刊】 Onodera, Katsuhiro ; Sugiura, Hisatoshi ; 等 《Thorax: The Journal of the British Thoracic Society》 2017年72卷10期 893-904页 SCISCIEMEDLINE

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            5. Estimating gene networks from gene expression data by combining Bayesian network model with promoter element detection.

            【外文期刊】 Yoshinori,Tamada ; SunYong,Kim ; 等 《Bioinformatics (Oxford, England)》 2003年19 Suppl 2卷 ii227-36页 SCIMEDLINECABP

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            6. Extensive feature detection of N-terminal protein sorting signals.

            【外文期刊】 Hideo,Bannai ; Yoshinori,Tamada ; 等 《Bioinformatics (Oxford, England)》 2002年18卷2期 298-305页 SCIMEDLINECABP

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            7. Computational strategy for discovering druggable gene networks from genome-wide RNA expression profiles.

            【外文期刊】 Seiya,Imoto ; Yoshinori,Tamada ; 等 《Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing》 559-71页

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            8. Oncogenic roles of TOPK and MELK, and effective growth suppression by small molecular inhibitors in kidney cancer cells. oa

            【外文期刊】 Taigo,Kato ; Hiroyuki,Inoue ; 等 《Oncotarget》 2016年7卷14期 17652-64页 MEDLINE

            【关键词】 MELK; TOPK; kidney cancer;

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            9. Collocation-based sparse estimation for constructing dynamic gene networks.

            【外文期刊】 Teppei,Shimamura ; Seiya,Imoto ; 等 《Genome informatics. International Conference on Genome Informatics》 2010年24卷 164-78页 MEDLINE

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            10. Electronic structure of four-coordinate iron(I) complex supported by a bis(phosphaethenyl)pyridine ligand.

            【外文期刊】 Yumiko,Nakajima ; Yoshihide,Nakao ; 等 《Journal of the American Chemical Society》 2010年132卷29期 9934-6页 SCIMEDLINECABP

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            11. Estimating genome-wide gene networks using nonparametric Bayesian network models on massively parallel computers.

            【外文期刊】 Yoshinori,Tamada ; Seiya,Imoto ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 683-97页 SCIMEDLINEBP

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            12. Analysis of PPARalpha-dependent and PPARalpha-independent transcript regulation following fenofibrate treatment of human endothelial cells.

            【外文期刊】 Hiromitsu,Araki ; Yoshinori,Tamada ; 等 《Angiogenesis》 2009年12卷3期 221-9页 SCIMEDLINEBP

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            13. Correlation between Glycation-Related Biomarkers and Quality of Life in the General Japanese Population: The Iwaki Cross-Sectional Research Study. oa

            【外文期刊】 Masaya,Tsubokawa ; Miyuki,Nishimura ; 等 《International journal of environmental research and public health》 2022年19卷15期 MEDLINE

            【关键词】 HbA1c; diabetes; glycation;

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            14. Analysis of gene networks for drug target discovery and validation.

            【外文期刊】 Seiya,Imoto ; Yoshinori,Tamada ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2007年360卷 33-56页

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            15. Results of a Japanese multicenter, randomized trial of endoscopic stenting for non-resectable pancreatic head cancer (JM-test): Covered Wallstent versus DoubleLayer stent.

            【外文期刊】 Hiroyuki,Isayama ; Ichiro,Yasuda ; 等 《Digestive endoscopy : official journal of the Japan Gastroenterological Endoscopy Society》 2011年23卷4期 310-5页 SCIMEDLINE

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            16. 27-Hydroxycholesterol accelerates cellular senescence in human lung resident cells.

            【外文期刊】 Yuichiro,Hashimoto ; Hisatoshi,Sugiura ; 等 《American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology》 2016年310卷11期 L1028-41页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 chronic obstructive pulmonary disease; oxysterols; senescence;

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            17. SiGN-SSM: open source parallel software for estimating gene networks with state space models.

            【外文期刊】 Yoshinori,Tamada ; Rui,Yamaguchi ; 等 《Bioinformatics (Oxford, England)》 2011年27卷8期 1172-3页 SCIMEDLINECABP

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            18. Genomic data assimilation for estimating hybrid functional Petri net from time-course gene expression data.

            【外文期刊】 Masao,Nagasaki ; Rui,Yamaguchi ; 等 《Genome informatics. International Conference on Genome Informatics》 2006年17卷1期 46-61页 MEDLINE

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            19. Insights into the Proton Transfer Mechanism of a Bilin Reductase PcyA Following Neutron Crystallography.

            【外文期刊】 Masaki,Unno ; Kumiko,Ishikawa-Suto ; 等 《Journal of the American Chemical Society》 2015年137卷16期 5452-60页 SCIMEDLINECABP

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            20. Elevated β-catenin pathway as a novel target for patients with resistance to EGF receptor targeting drugs.

            【外文期刊】 Asuka,Nakata ; Ryo,Yoshida ; 等 《Scientific reports》 2015年5卷 13076页

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            21. Sign: large-scale gene network estimation environment for high performance computing.

            【外文期刊】 Yoshinori,Tamada ; Teppei,Shimamura ; 等 《Genome informatics. International Conference on Genome Informatics》 2011年25卷1期 40-52页 MEDLINE

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            22. Iron-catalyzed Suzuki-Miyaura coupling of alkyl halides.

            【外文期刊】 Takuji,Hatakeyama ; Toru,Hashimoto ; 等 《Journal of the American Chemical Society》 2010年132卷31期 10674-6页 SCIMEDLINECABP

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            23. Natural history of stent edge dissection, tissue protrusion and incomplete stent apposition detectable only on optical coherence tomography after stent implantation – preliminary observation – .

            【外文期刊】 Teruyoshi,Kume ; Hiroyuki,Okura ; 等 《Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society》 2012年76卷3期 698-703页 SCIMEDLINEBP

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            24. Association between Gut Microbiota and Muscle Strength in Japanese General Population of the Iwaki Health Promotion Project.

            【外文期刊】 Yoshikuni,Sugimura ; Yichi,Yang ; 等 《Microorganisms》 2024年12卷3期

            【关键词】 grip strength/BMI; gut microbiota; muscle strength;

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            25. Association of visceral fat area with early-stage locomotive syndrome across various age groups: a cross-sectional study.

            【外文期刊】 Tadashi,Miyazaki ; Naoki,Ozato ; 等 《Scientific reports》 2024年14卷1期 25498页

            【关键词】 Cross-sectional study; Locomotive syndrome; Metabolic syndrome;

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            26. Novel cancer subtyping method based on patient-specific gene regulatory network.

            【外文期刊】 Mai Adachi,Nakazawa ; Yoshinori,Tamada ; 等 《Scientific reports》 2021年11卷1期 23653页

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            27. Idiopathic pulmonary fibrosis-specific Bayesian network integrating extracellular vesicle proteome and clinical information.

            【外文期刊】 Mei,Tomoto ; Yohei,Mineharu ; 等 《Scientific reports》 2024年14卷1期 1315页

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            28. Choroid plexus enlargement in mild cognitive impairment on MRI: a large cohort study.

            【外文期刊】 Yoshihito,Umemura ; Keita,Watanabe ; 等 《European radiology》 2024年34卷8期 5297-5304页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Choroid plexus; Hippocampal volume; Mild cognitive impairment;

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            29. Gradual increase of high mobility group protein b1 in the lungs after the onset of acute exacerbation of idiopathic pulmonary fibrosis.

            【外文期刊】 Masahito,Ebina ; Hiroyuki,Taniguchi ; 等 《Pulmonary medicine》 2011年2011卷 916486页

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            30. Definition of a Dietary Pattern Expressing the Intake of Vegetables and Fruits and Its Association with Intestinal Microbiota. oa

            【外文期刊】 Toshitaka,Yamauchi ; Naoko,Koyama ; 等 《Nutrients》 2023年15卷9期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 dietary patterns; diversity; microbiota;

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            31. Outcome of basal cell carcinoma excision with 2 mm surgical margin in Japanese patients: A retrospective study of one-step surgery.

            【外文期刊】 Kaori,Kyono ; Yoshinori,Tamada ; 等 《JPRAS open》 2025年43卷 216-226页

            【关键词】 Basal cell carcinoma (BCC); Local recurrence; Narrow surgical margin;

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            32. Utilizing evolutionary information and gene expression data for estimating gene networks with bayesian network models.

            【外文期刊】 Yoshinori,Tamada ; Hideo,Bannai ; 等 《Journal of bioinformatics and computational biology》 2005年3卷6期 1295-313页 SCIMEDLINEBP

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            33. The effect of ligands on FePt-Fe3O4 core-shell magnetic nanoparticles.

            【外文期刊】 Dong-Hyun,Kim ; Yoshinori,Tamada ; 等 《Journal of nanoscience and nanotechnology》 2014年14卷3期 2648-52页 MEDLINECA

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            34. Identification of transforming activity of free fatty acid receptor 2 by retroviral expression screening. oa

            【外文期刊】 Hisashi,Hatanaka ; Mamiko,Tsukui ; 等 《Cancer science》 2010年101卷1期 54-9页 SCIMEDLINECABP

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            35. Association between NF-E2-related factor 2 polymorphism and age-related hearing loss in the general Japanese population from the Iwaki health promotion project.

            【外文期刊】 Takashi,Kasai ; Akira,Sasaki ; 等 《Acta oto-laryngologica》 2025年145卷1期 36-42页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Iwaki Health Promotion Project; NRF2 SNP-617; age-related hearing loss;

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            36. A novel strategy to search conserved transcription factor binding sites among coexpressing genes in human.

            【外文期刊】 Yosuke,Hatanaka ; Masao,Nagasaki ; 等 《Genome informatics. International Conference on Genome Informatics》 2008年20卷 212-21页 MEDLINE

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            37. Enzalutamide versus flutamide for castration-resistant prostate cancer after combined androgen blockade therapy with bicalutamide: the OCUU-CRPC study.

            【外文期刊】 Taro,Iguchi ; Satoshi,Tamada ; 等 《International journal of clinical oncology》 2020年25卷3期 486-494页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Castration-resistant prostate cancer; Enzalutamide; Flutamide;

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            38. Effects of rewarming therapies on outcomes in accidental hypothermia: A secondary analysis of a multicenter prospective study.

            【外文期刊】 Kana,Sugiyama ; Osamu,Nomura ; 等 《The American journal of emergency medicine》 2024年79卷 91-96页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Accidental hypothermia; ICE-CRASH study; Rewarming rate;

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            39. Factors Associated with Reduced Heart Rate Variability in the General Japanese Population: The Iwaki Cross-Sectional Research Study.

            【外文期刊】 Masaya,Tsubokawa ; Miyuki,Nishimura ; 等 《Healthcare (Basel, Switzerland)》 2022年10卷5期

            【关键词】 R–R interval; general Japanese population; heart rate variability;

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            40. Identifying drug active pathways from gene networks estimated by gene expression data.

            【外文期刊】 Yoshinori,Tamada ; Seiya,Imoto ; 等 《Genome informatics. International Conference on Genome Informatics》 2005年16卷1期 182-91页 MEDLINE

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            41. [Every-other-day TS-1 administration for recurrent or non-curative advanced gastric carcinoma].

            【外文期刊】 Wataru,Arai ; Yoshinori,Hosoya ; 等 《Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy》 2002年29卷9期 1651-5页 MEDLINE

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            42. Altered structural hippocampal intra-networks in a general elderly Japanese population with mild cognitive impairment.

            【外文期刊】 Sera,Kasai ; Keita,Watanabe ; 等 《Scientific reports》 2023年13卷1期 13330页

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            43. Dynamic changes in gene-to-gene regulatory networks in response to SARS-CoV-2 infection.

            【外文期刊】 Yoshihisa,Tanaka ; Kako,Higashihara ; 等 《Scientific reports》 2021年11卷1期 11241页

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            44. Understanding endothelial cell apoptosis: what can the transcriptome, glycome and proteome reveal? oa

            【外文期刊】 Muna,Affara ; Benjamin,Dunmore ; 等 《Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences》 2007年362卷1484期 1469-87页 SCIMEDLINEBP

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            45. Variant analysis of prostate cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological pathways.

            【外文期刊】 Rika,Kasajima ; Rui,Yamaguchi ; 等 《Oncology reports》 2020年43卷3期 943-952页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 prostate; cancer; Japanese;

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            46. Vasohibin-1 is identified as a master-regulator of endothelial cell apoptosis using gene network analysis. oa

            【外文期刊】 Muna,Affara ; Debbie,Sanders ; 等 《BMC genomics》 2013年14卷 23页 SCIMEDLINEBP

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            47. Inhibition of the bone morphogenetic protein pathway suppresses tumor growth through downregulation of epidermal growth factor receptor in MEK/ERK-dependent colorectal cancer. oa

            【外文期刊】 Shota,Shimizu ; Jumpei,Kondo ; 等 《Cancer science》 2023年114卷9期 3636-3648页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 BMP; EGFR; LRIG1;

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            48. Electrical communication between glucose oxidase and electrodes mediated by phenothiazine-labeled poly(ethylene oxide) bonded to lysine residues on the enzyme surface.

            【外文期刊】 Kazumichi,Ban ; Takeshi,Ueki ; 等 《Analytical chemistry》 2003年75卷4期 910-7页 SCIMEDLINECA

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            49. Classification of glomerular pathological findings using deep learning and nephrologist-AI collective intelligence approach.

            【外文期刊】 Eiichiro,Uchino ; Kanata,Suzuki ; 等 《International journal of medical informatics》 2020年141卷 104231页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Artificial intelligence; Collective intelligence; Deep learning;

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            50. Effect of gut microbial composition and diversity on major inhaled allergen sensitization and onset of allergic rhinitis.

            【外文期刊】 Taimu,Yamaguchi ; Ayami,Nomura ; 等 《Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology》 2023年72卷1期 135-142页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Allergens; Bacteroidales; Dysbiosis;

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