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【中文期刊】 王舜泽 江丰  等 《遗传》 2023年45卷4期 279-294页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 三维基因组学在基因组序列、基因结构及其调控元件的基础上对细胞核内的染色质的三维空间结构进行研究.染色体的空间交互作用是基因表达调控的重要因素,随着高通量染色体构象捕获(high-throughput chromosome conformat...

【关键词】 Hi-C； 三维基因组学； 染色质结构；

【中文期刊】 刘东升 王金凤  《生物化学与生物物理进展》 2001年28卷6期 827-831页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 各种生物的基因组DNA测序计划的完成,将结构生物学带入了结构基因组学时代结构基因组学是对所有基因组产物结构的系统性测定,它运用高通量的选择、表达、纯化以及结构测定和计算分析手段,为基因组的每个蛋白质产物提供实验测定的结构或较好的理论模型,这...

【关键词】 结构基因组学； 基因组； 蛋白质家族；

【中文期刊】 邱格格 林胜男  等 《生物学教学》 2021年46卷10期 4-6页 PKU

【摘要】 基因组携带着生命体完整的遗传信息.人类基因组计划和DNA元件百科全书计划分别在一维和二维水平上研究了基因组序列、基因组结构及其调控组件.但是,对于基因组信息调控基因在特定时空中表达仍然知之甚少.基因组测序技术的发展催生了一门新兴学科——三维...

【关键词】 基因组； 三维基因组学； 染色质构象捕获技术；

【中文期刊】 宁椿游 何梦楠  等 《遗传》 2019年41卷3期 215-233页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 基因组DNA在细胞核中并不是呈线性的一字排列,而是以三维结构高度折叠并浓缩成染色质的方式储存于核内,具有特定的高级空间结构和构象.高通量染色体构象捕获(high-througnput chromosome conformation capt...

【关键词】 三维基因组学； 染色质空间构象； Hi-C技术；

【中文期刊】 李兰芬 南洁  等 《生物物理学报》 2007年23卷4期 246-255页 MEDLINEISTICCA

【摘要】 从50年前英国科学家解析出第一个蛋白质晶体结构以来,蛋白质晶体学历经数个里程碑式的发展,已经成为一门成熟的高科技学科,是结构生物学的主要研究手段.近年来结构生物学发展迅速并和其他学科相互渗透交叉,特别是受到结构基因组学等热点学科的极大带动....

【关键词】 X射线晶体学； 蛋白质三维结构； 结构基因组学；

【中文期刊】 张祥林 方欢  等 《生物化学与生物物理进展》 2018年45卷11期 1093-1105页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 对染色质三维结构的探究逐渐成为了解基因组功能与基因调控关系的必要手段.近年来,随着高通量染色体构象捕获(Hi-C)等技术的发展和高通量测序成本的降低,全基因组交互作用的数据量快速增长,交互作用图谱分辨率不断提高.这给三维基因组学发展带来机遇...

【关键词】 Hi-C； 三维基因组学； 基因组结构；

【中文期刊】 张玉波  《中国生物化学与分子生物学报》 2018年34卷4期 351-363页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 三维基因组学是以研究真核生物核内基因组空间构象,及其对不同基因转录调控的生物学效应为主要研究内容的一个新的学科方向;也是后基因组学时代研究的一个热门领域.它的研究重点是空间构象与基因转录调控间的关系.通过三维基因组学技术,科学家将能对基因组...

【关键词】 三维基因组学； 空间构象； 基因转录调控；

【中文期刊】 李耀庭 吕建军  等 《药物分析杂志》 2015年35卷7期 1134-1139页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 原代肝细胞的分离培养技术已有50余年的历史,由于原代肝细胞有体内的代谢酶和相应辅助因子,能维持肝脏的代谢功能,是研究药物代谢和致癌作用理想的体外模型.随着近10年来新技术的不断发展,尤其是三维培养技术的建立以及毒理基因组学的应用,使得体外原...

【关键词】 体外肝细胞模型； 三维培养； 毒理基因组学；

【中文期刊】 张以星 齐浥颖  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷8期 1293-1302页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 植物物种形成和多样化过程中,多倍化发挥着重要作用,它汇聚了新的等位基因,产生了多倍体.自然界中有许多重要作物是多倍体,相关研究发现,与二倍体植物相比,多倍体具有更强的抗逆性,能够适应更广泛的生态环境.本文简要介绍了植物多倍化及其影响,并总结...

【关键词】 多倍化与起源； 基因组组装； 甲基化修饰；

【学位论文】 作者： 王振吉 导师：李国亮  华中农业大学  生物学 生物信息学（硕士） 2024年

【摘要】 基因组的高阶染色质结构及其功能是三维基因组学的重要前沿研究方向。Pore-C技术结合Hi-C和Nanopore长读长测序技术，可以捕获全基因组范围内高阶染色质互作，兼具实验流程简易、捕获效率高等优点，应用前景广泛。然而，由于Pore-C技术...

【关键词】 高阶染色质； 交互捕获数据；

【学位论文】 作者： 徐伟泽 导师：曹罡  华中农业大学  兽医学 预防兽医学（博士） 2024年

【摘要】 结核分枝杆菌是引起结核病的主要病原体，它不仅给人类健康带来了巨大威胁,也给畜牧业生产造成了严重危害。世界卫生组织(WHO)在2023年发布的报告中提到，2022年结核病全球新发病例高达1060万，造成约130万人死亡，形势十分严峻。除了对人...

【关键词】 结核病； 结核分枝杆菌；

【学位论文】 作者： 邓亚菁 导师：李敏  新疆大学  生物学 生物信息学（硕士） 2023年

【摘要】 随着3C、4C、5C、Hi-C技术等染色质构象捕获技术的发展，人们对基因组的三维结构的研究也逐渐深入，发现了染色质的不同层次结构，包括染色质疆域、染色质区室(A/B compartments)、拓扑关联结构域 TAD(topological...

【关键词】 三维基因组学； 结构预测；

【学位论文】 作者： 周天树 导师：张志军  湖北医药学院  临床医学 妇产科学（硕士） 2023年

【摘要】 21三体综合征，又称为唐氏综合征（Down''s syndrome,DS）和“先天愚型”，发病率约为1/700，其临床症状包括不同程度的智力发育障碍（这种智力障碍随着年龄的增长越发明显）和特殊面容及身心畸形：表情呆滞、鼻梁扁平、眼距过宽、眼...

【关键词】 21三体综合征； 发病机制；

【中文期刊】 吴海燕 丁洁蔚  等 《全科医学临床与教育》 2023年21卷7期 584-587,后插1页

【摘要】 目的 分析效应蛋白在布鲁氏菌毒力和免疫保护性中的作用机制.方法 以布鲁氏菌为模板,采用PCR扩增BspC基因,后进行测序,观察布鲁氏菌的基因组学、布鲁氏菌属细菌中BspC蛋白,以及BspC蛋白是否存在免疫原性,BspC蛋白的三维结构建模,B...

【关键词】 效应蛋白； 布鲁氏菌； 毒力；

【学位论文】 作者： 张競文 导师：李国亮  华中农业大学  生物学 生物信息学（博士） 2022年

【摘要】 肺癌具有极高的发病率和死亡率，深入解析肺癌基因组是开发新的诊治方法的重要基础。全基因组重测序、转录组测序和全基因组关联研究等大大提高了人们对肺癌基因组的认识。近年来，诸多研究表明基因组三维构象在癌症中发挥着重要作用。然而，人们对肺癌基因组的...

【关键词】 非小细胞肺癌； 细胞系A549；

【学位论文】 作者： 周丽杰 导师：冯振兴  内蒙古工业大学  数学 数学（硕士） 2022年

【摘要】 在真核细胞中，不同基因在特定的细胞中呈现精准的选择性表达，并行使相关的生物学功能。其中，TFs、表观遗传学修饰、基因组的三维折叠模式等在这些基因的选择性转录表达中具有重要的作用。在三维基因组学中，顺式调控元件中增强子可以在转录因子和表观修饰...

【关键词】 三维基因组学； 高通量测序；

【学位论文】 作者： 游至宇 导师：李奇渊  厦门大学  临床医学 转化医学（硕士） 2021年

【摘要】 真核生物染色质的三维结构是细胞实现精准调控的基石，其动态调控过程决定了分化、生长等各种细胞命运，异常的调控过程可能会导致细胞的病变甚至癌变的发生，因此研究染色质的调控过程一直以来是生物学界的重大课题。三维基因组学，旨在结合各种类型的测序技术...

【关键词】 人体细胞学； 染色质；

【学位论文】 作者： 李笑 导师：张治华  中国科学院大学  生物学 生物信息学（硕士） 2020年

【摘要】 三维基因组学研究基因组三维空间结构以及其与功能的关系。在三维基因组学中，不仅研究基因组序列、基因及其调控元件在细胞核内的三维结构，还关注于其在基因转录、复制、调控和DNA修复等生物过程中的功能。随着组学技术进入单细胞时代，三维基因组学向低细...

【关键词】 单细胞； 三维基因组学；

【学位论文】 作者： 陈敬琪 导师：邹贵勉 戴勇  广西师范大学  生物学 生物学（硕士） 2020年

【摘要】 慢性肾小球肾炎（chronic glomerulonephritis,CGN）的病人发病时间不固定，早期症状不明显。患者肾脏中肾小球持续缓慢累积损伤最终发展为尿毒症(Uremic)。三维基因组学(Three-Dimensional Geno...

【关键词】 尿毒症； 外周血单核细胞；

【学位论文】 作者： 张彪 导师：张世华  中国科学院大学  数学 运筹学与控制论（硕士） 2020年

【摘要】 从人类基因组计划启动发展至今，研究人员基本确定了包括人类在内的多种生物基因组中染色体的主要基因、基因调控元件等。然而染色体并不是线性排布的，而是曲折缠绕在细胞核内，形成染色质环、拓扑关联结构域等多尺度的三维染色质结构模式。众多研究表明，基因...

【关键词】 染色质图谱； 多尺度超分辨率；

【中文期刊】 张治科 张烨  等 《环境昆虫学报》 2017年39卷3期 713-720页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 嗅觉在昆虫生命活动中起着重要的作用,气味结合蛋白(odorant binding proteins,OBPs)是昆虫嗅觉系统中发挥重要作用的蛋白之一,近年随着基因组学、转录组学的快速发展,越来越多的昆虫OBPs基因陆续被鉴定出来,部分OBP...

【关键词】 昆虫嗅觉； 气味结合蛋白； 结构特征；

【学位论文】 作者： 党大昌 导师：张世华  中国科学院大学  数学 运筹学与控制论（硕士） 2019年

【摘要】 过去十年，研究染色体三维结构的三维基因组学得到了迅速发展。在人以及其他哺乳动物的细胞核中，染色体通过折叠缠绕形成多层次的三维结构，进而使基因和调控元件在三维空间中具有不同程度的关联性。显然，这种空间关联性或可及性与基因的表达以及调控密切相关...

【关键词】 三维基因组学； 物种特异；

【学位论文】 作者： 王潇 导师：马彬广  华中农业大学  生物学 生物信息学（硕士） 2019年

【摘要】 染色质的三维结构在基因表达调控、细胞发育以及遗传疾病发生等过程中发挥着重要的作用。随着染色质构象捕获技术及其衍生技术的发展，尤其是全基因组范围内捕获染色质交互的Hi-C技术的出现，现已获得大量的染色质交互频率数据。如何利用这些数据重构出染色...

【关键词】 三维基因组学； 染色质；

【学位论文】 作者： 曹天骏 导师：陈晓亚 卢山  南京大学  生物学 生物学（博士） 2019年

【摘要】 红藻(Rhodophyta)是古老的真核藻类。其中红毛菜纲多细胞红藻(Bangiomorphapubescens)的化石证据可追溯到12亿年前。红藻与绿色植物(Viridiplantae)以及灰胞藻(Glaucophyta)共同归属于原始色...

【关键词】 海水红毛菜； 基因组学；

【学位论文】 作者： 张蕾 导师：杨庆勇  华中农业大学  生物学 生物信息学（硕士） 2019年

【摘要】 三维基因组学(Three-Dimensional Genomics，3D Genomics)是一门研究染色质的空间结构与功能的新兴学科，对于解析基因组折叠机制、基因功能、非编码DNA元件或基因挖掘等起到重要作用。In situ Hi-C是改...

【关键词】 植物三维基因组学； 高通量染色质捕获；

【中文期刊】 陈厚良  《安徽医科大学学报》 2014年49卷12期 1834-1837页 ISTICPKUCA

【摘要】 人胚胎干细胞(hESC)具有显著的增殖能力和分化潜能,已经成为研究再生医学、药物学、药理毒理学、人胚胎发育学和功能基因组学的种子细胞库.hESC在长期维持培养中保持增殖潜能和未分化状态需要饲养层细胞或基质蛋白、血清或基因敲除血清(KSR)以...

【关键词】 人胚胎干细胞； 饲养层细胞； 成分确定培养基；

【中文期刊】 方肇勤  《中国中西医结合杂志》 2002年22卷4期 250-251页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 <篇首> 40多年来,中医基础研究出现了蓬勃发展的态势,在藏象学说、证和辨证论治机理、证的动物模型、治则治法、针刺机理等方面积累起丰富的研究成果.实验研究也已从早期的验证性研究,经历了机理探索的研究,新近已经发展到后基因组学的研究,在有些领域实...

【中文期刊】 陈伟 张常华  等 《消化肿瘤杂志（电子版）》 2018年10卷3期 127-133页 ISTIC

【摘要】 胃癌是我国主要癌肿之一,发病率和死亡率均位居全部癌症第二位.受制于研究模型的缺乏,胃癌发生机制、胃癌治疗药物开发等研究进展缓慢.类器官(Organoid)是干细胞在体外三维环境中培养所形成的细胞结构;通过体外模拟细胞在体内的生存环境,类器官...

【关键词】 胃癌； 类器官； 3D培养；

【学位论文】 作者： 徐超 导师：刘海燕  中国科学技术大学  生物学 生物信息学（博士） 2008年

【摘要】 蛋白质最重要的两类生物大分子之一，是生物体几乎所有活动的承担者，如生化反应的催化酶，呼吸系统中的血红蛋白，免疫系统中的抗体等等。生物体几乎所有的活动都离不开蛋白质。要想在分子水平上解释生命现象离不开对蛋白质结构和功能的研究。多数天然蛋白质在...

【关键词】 结构基因组数据库； 蛋白质；

【中文期刊】 吴毅 张绍祥  等 《局解手术学杂志》 2007年16卷5期 342页 ISTIC

【摘要】 <篇首> 数字化人体研究是将成千上万条人体断面数据信息在计算机里整合重建成人体的三维立体结构图像,构成人体形态学信息研究的实验平台[1].建立三维数字化模型,不仅给解剖教学开辟了一个新的领域,而且为医学、影像诊断学、生命科学以及后基因组学的研究...

【关键词】 可视化人体； 数字化人体； 男性泌尿生殖系统；

【中文期刊】 杨泽松 陈建斌  《江西医学院学报》 2006年46卷1期 160-162页 ISTIC

【摘要】 <篇首> 人类基因组计划(HGP)被誉为20世纪的3大科技工程之一.其划时代的研究成果--人类基因组草图的完成宣告了一个新的纪元--"后基因组时代"的到来.其中,功能基因组学成为研究的重心,蛋白质组学则是其"中流砥柱"[1].药物是用于预防、治...

【关键词】 药物； 蛋白质组学； 研究进展；

【中文期刊】 贾欣  《大学化学》 2003年18卷1期 23-25页

【摘要】 <篇首> 随着人类基因组学(human genomes)解读引出的下一个挑战是蛋白质组学(proteomes),后者为结构生物学家提出了更大的挑战和机遇,其焦点在于如何通过对于遗传编码表达的蛋白质在原子水平上的三维结构和分子水平上的动态过程的认...

【中文期刊】 郭丽 王雪涵  等 《植物学报》 2023年58卷1期 1-5页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 高通量组学技术的快速发展使生命科学进入大数据时代.科学家们从基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多组学数据中剥茧抽丝,逐步揭示生物体内复杂而巧妙的调控网络.近日,华中农业大学李林课题组联合杨芳课题组和严建兵课题组构建了玉米(Zea mays)...

【关键词】 玉米； 多组学； 整合网络图谱；

【中文期刊】 雷文龙 雷思茹  等 《基因组学与应用生物学》 2023年42卷3期 233-241页 ISTICPKUCSCDCA

【关键词】 牛津纳米孔技术(ONT)； ONT应用； 基因组学；