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            【中文期刊】 陆翼  葛成  等 《现代计算机》 2023年29卷4期 18-24,48页

            【摘要】 从头测序技术是应用于蛋白质组学的测序方法.与其他测序技术相比,从头测序技术的优势是在不依赖数据库搜索和无需PCR扩增的基础上对DNA或者蛋白质进行测序.目前,从头测序技术也广泛应用于蛋白质组学领域.研究人员为了将测序技术所得的短序列read...

            【关键词】 从头测序序列组装算法de Bruijn图

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            【中文期刊】 陈平  李水明  等 《中国生物化学与分子生物学报》 2006年22卷7期 591-598页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 利用MALDI-TOF质谱结合磺基异硫氰酸苯酯(SPTTC)化学辅助的从头测序(de novo sequencing)方法,将用固相金属离子亲和色谱(immobilized metal affinity chromatography,IMA...

            【关键词】 SPITC磷酸化位点从头测序

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            【中文期刊】 王中胜  朱云平  等 《军事医学科学院院刊》 2006年30卷5期 465-467页ISTICCSCDCA

            【摘要】 从头测序为蛋白质组研究提供了一种不用借助于任何蛋白质序列数据库信息,直接解读串联质谱数据的方法.其基本算法主要由4个部分组成:质谱图的构建,离子类型的确定,测序算法以及打分算法.质谱图的构建和离子类型的确定是从头测序算法的基础.测序算法是从...

            【关键词】 肽类序列分析算法

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            【中文期刊】 刘清萍  刘中华  等 《生命科学研究》 2004年8卷2期 112-116页ISTICCA

            【摘要】 采用纳升喷雾(Nano)技术和碰撞诱导解离(CIDcollisioninducddissociation)方法,在电喷雾四极杆飞行时间质谱(ESI-Q-TOFelectrspectrometryionization-quadrupole-t...

            【关键词】 电喷雾四极杆飞行时间质谱从头测序Edman降解

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            【中文期刊】 王勇  高升  等 《质谱学报》 2015年36卷4期 302-309页

            【摘要】 研究肽段从头测序需要解决的问题之一是区分亮氨酸和异亮氨酸残基,利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)所产生的w型离子区分这两种氨基酸残基是目前最常用的方法.本研究以6对合成的同分异构肽段(由7~15个氨基酸...

            【关键词】 从头测序串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)亮氨酸

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            【中文期刊】 朱泽轩  张永朋  等 《深圳大学学报(理工版)》 2013年30卷4期 409-415页

            【摘要】 针对高通量DNA测序技术发展产生的DNA测序数据量猛增,数据压缩技术是解决存储和传输高通量DNA序列数据问题的重要方法之一.评述DNA测序数据传统压缩方法包括替代法和统计法,以及基于参考基因组的高通量DNA测序数据压缩方法,介绍并比较重测序...

            【关键词】 计算机应用DNA测序下一代测序

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            【中文期刊】 周新文  严钦  等 《高等学校化学学报》 2009年30卷4期 706-711页

            【摘要】 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间(MALDI-TOF-TOF)质谱结合磺基异硫氰酸苯酯化学辅助的方法对一种从拟青霉(Paecilomyces bainier)分离纯化到的新人参皂苷Rb1水解酶的部分肽段进行了从头测序. 共获得了这个新...

            【关键词】 磺基异硫氰酸苯酯基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱新蛋白质

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            【中文期刊】 范春明  王贤纯  等 《质谱学报》 2005年26卷2期 65-70页

            【摘要】 虎纹捕鸟蛛毒素-Ⅵ(HWTX-Ⅵ)和敬钊缨毛蛛毒素-Ⅷ(JZTX-Ⅷ)是两种蜘蛛多肽类神经毒素.它们的大部分氨基酸序列已由Edman降解法测出,但仍有部分序列由于某些原因未能确定.为了鉴定未知部分的序列,利用电喷雾电离-四极杆-飞行时间质谱...

            【关键词】 多肽毒素电喷雾电离-四极杆-飞行时间质谱(ESI-Qq-TOF-MS)虎纹捕鸟蛛毒素-VI

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            【中文期刊】 孙汉昌  张纪阳  等 《生物化学与生物物理进展》 2010年37卷12期 1278-1288页SCIISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 近年来,基于质谱技术的高通量蛋白质组学研究发展迅速,利用串联质谱图谱鉴定蛋白质是其数据处理中一个基础而又重要的环节.由于不需要利用蛋白质序列数据库,从头测序方法能够分析新物种或者基因组未测序物种的串联质谱数据,具有数据库搜索方法不可替代的优...

            【关键词】 肽段串联质谱从头测序

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            【中文期刊】 吴靖娜  洪乔茜  等 《食品科学》 2024年45卷2期 188-194页

            【摘要】 本实验以红毛藻为原料,利用酶解法及超滤分级制备获得不同分子质量的肽组分,经高效液相色谱法测定体外血管紧张素转化酶(angiotensin-converting enzyme,ACE)抑制活性发现F2组分(800~2 000 Da)的ACE抑...

            【关键词】 红毛藻de novo从头测序虚拟筛选

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            【中文期刊】 邱璐  王播勇  等 《楚雄师范学院学报》 2024年39卷3期 38-49页

            【摘要】 通过DNA从头测序分析人胸膜间皮瘤发生的高关联度突变基因.提取恶性胸膜间皮瘤(MPM)组织和正常胸膜组织DNA,构建基因文库,用Illumina HiSeqX Ten PE 150平台测序,将测序结果与人类基因组数据库的参考序列进行比对、注...

            【关键词】 人胸膜间皮瘤从头测序单核苷酸多态性

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            【中文期刊】 张玲  徐东  等 《中国生物化学与分子生物学报》 2006年22卷8期 672-680页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 未知基因组及蛋白质序列数据库有限的物种的蛋白质组学分析是当前一些非模式生物物种蛋白质组学研究领域的瓶颈之一.基于同源性搜索的BLAST方法(MS BLAST),是近年新发展起来的一种用于未知基因组的蛋白质鉴定的搜索工具,已成功应用于许多未知...

            【关键词】 基质辅助激光解吸飞行时间串联质谱从头测序磺基异硫氰酸苯酯

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            【中文期刊】 刘粉香  杨文国  等 《安徽农业科学》 2018年46卷31期 88-91,100页

            【摘要】 随着二代测序技术的快速发展,转录组测序在越来越多的动植物中完成,人们获得了大批量的转录组数据序列.如何从这些海量的序列数据中挖掘具有生物意义的信息已成为很多研究的关键所在,对未知基因的功能进行预测和注释就是其中一个重要的问题.转录组序列的功...

            【关键词】 二代测序转录组从头拼接

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            【中文期刊】 朱大强  李存  等 《生物信息学》 2011年09卷2期 106-112页ISTIC

            【摘要】 新一代测序平台的诞生推动了对全基因组鸟枪法测序数据的拼接算法和软件的研究,自2005年以来多种用于高通量测序的序列拼接软件已经被开发出来,并且在不断地进行改进以提高拼接效果.本文利用目前广泛使用的高通量测序拼接软件Velvet、AbySS、...

            【关键词】 第二代测序从头拼接Velvet

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            【中文期刊】 张冬梅  刘红霞  等 《分析测试学报》 2010年29卷9期 900-905页

            【摘要】 该文建立了一种利用磷酰化修饰结合电喷雾质谱(ESI-Q-TOF)测定多肽氨基酸序列的有效方法.利用Atherton-Todd反应,以二丙基亚磷酰酯(DPP)为磷酰化试剂,应用生物质谱技术,对磷酰化修饰后的5种模型肽的磷酰化反应情况进行了系统...

            【关键词】 二丙基亚磷酰酯磷酰化修饰从头测序

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            【中文期刊】 刘尚义  蔡耘  等 《质谱学报》 2007年28卷2期 87-91页

            【摘要】 cr5a是从中国南海软体动物芋螺的毒液中分离出的一种新的芋螺毒素.为了验证已得到的氨基酸序列分析结果,利用纳升电喷雾四极杆飞行时间串联质谱对cr5a的碘代乙酰胺(IAM)衍生物进行了串联质谱从头测序分析,采用MassLynx 3.5系统进行...

            【关键词】 电喷雾飞行时间串联质谱芋螺毒素从头测序

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            【中文期刊】 王红霞  李萍  等 《分析化学》 2006年34卷7期 915-918页

            【摘要】 肿瘤细胞表面的抗原多肽能够被细胞毒T淋巴细胞特异性识别而引起免疫应答,因此有可能用于研制基于多肽的抗肿瘤疫苗.用弱酸将人肝癌细胞系HLE 细胞表面抗原多肽和人正常肝细胞表面多肽洗脱后,经RP-HPLC分离,选择HLE细胞表面特异性多肽进行纳...

            【关键词】 HLE细胞细胞表面抗原多肽电喷雾串联质谱

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            【中文期刊】 王琳琳  丘银彬  等 《兽类学报》 2020年40卷6期 615-622页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 现生的鼹科动物分布于欧亚大陆和北美大陆,包括54种已知物种.鼹科动物有丰富的生态类型,是研究适应性进化的较好模型.本研究通过二代测序的方法分别获得了长吻鼩鼹和库氏长吻鼹两个物种心脏和肺脏以及脾脏和肺脏的转录组数据.这两个物种分别代表了分布于...

            【关键词】 长吻鼩鼹库氏长吻鼹转录组测序

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            【中文期刊】 《浙江大学学报(英文版)(B辑:生物医学和生物技术)》 2017年18卷11期 1002-1021,1031,1032页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 目的:以高耐盐碱多年生沙漠经济灌木黑果枸杞为研究材料,对其在盐碱胁迫处理下的生理指标进行测定,确定转录组测试的时间.通过转录组分析挖掘潜在抗逆基因,并挖掘全转录组水平的分子标记.旨在为黑果枸杞的优良基因资源利用、野生品种保护和新品种培育提供...

            【关键词】 从头测序遗传多样性黑果枸杞

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            【中文期刊】 赵磊  Zachary LARSON-RABIN  等 《植物分类与资源学报》 2012年34卷5期 487-501页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 利用公共数据库中果蝇F1代和栽培水稻基于高通量Illumina测序平台的RNA-Seq短序列数据,比较了8个(ABySS,Velvet,SOAPdenovo,Oases,Trinity,Multiple-k,T-IDBA and Trans...

            【关键词】 高通量二代测序转录组

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            【中文期刊】 张红艳  罗杰  《植物学报》 2018年53卷3期 289-292页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 博落回(Macleaya cordata)是罂粟属的一种传统中药,因其富含具有抗菌功能的血根碱(SAN)和白屈菜红碱(CHE),可以作为牲畜抗菌生长促进剂的安全来源植物.中国科学家以博落回为材料,利用从头测序手段测定了首个罂粟属植物全基因组...

            【关键词】 博落回血根碱白屈菜红碱

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            【中文期刊】 舒江平  刘莉  等 《生物多样性》 2017年25卷6期 675-682页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 植物由水生走向陆生的进化过程中经历了非常复杂的演化,期间产生的大量基因的进化路线可能互不相同,因此仅仅使用系统发育树无法呈现真实的演化关系.系统发育网络图能够清楚地展示包括垂直演化和水平演化在内的复杂网状进化关系.本文选取莱茵衣藻(Chla...

            【关键词】 网状进化基因树冲突系统发育基因组学

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            【中文期刊】 Naoual Oukkache  Rachid ElJaoudi  等 《生理学报》 2015年67卷3期 295-304页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 本研究主要分离和鉴定了一种源自北非蝎被称为Am IT的新毒素.详细分析了Am IT对昆虫神经索钠电流的调节效应.Am IT经凝胶过滤纯化后通过C18反相高效液相色谱法纯化.采用雄性德国蟑螂(德国小蠊)的幼虫和C57/BL6小鼠进行AmIT体...

            【关键词】 北非蝎毒蝎毒素Am IT

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            【中文期刊】 邢月婷  管峰  等 《水产学报》 2020年44卷5期 754-766页

            【摘要】 为了探究饥饿胁迫对日本医蛭唾液腺基因表达水平的影响,本实验通过Illumina Hiseq 2500高通量测序平台分别对饥饿30 d处理组(D30)和饥饿0 d(D0)对照组的日本医蛭的唾液腺组织进行双端测序,对获得的原始数据进行质量控制及...

            【关键词】 日本医蛭唾液腺饥饿胁迫

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            【学位论文】 作者:杨超导师:张丽华   张玉奎   中国科学院大学   化学 分析化学(博士) 2021年

            【摘要】 对多肽和单克隆抗体氨基酸序列的测定是生物药表征和质控中的关键环节。本论文针对肽段与蛋白质从头测序方法存在的测序准确度低、覆盖度低和无法准确区分蛋白质序列中亮氨酸与异亮氨酸的问题,发展了基于质谱的肽段与蛋白质从头测序新方法,并将其应用于多肽药...

            【关键词】 肽段蛋白质

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            【学位论文】 作者:杨皓导师:贺思敏   迟浩   中国科学院大学   计算机科学与技术 计算机应用技术(博士) 2018年

            【摘要】 随着高精度质谱技术的飞速发展,基于生物质谱分析的蛋白质、肽段鉴定已经成为蛋白质组学的核心技术。蛋白质、肽段鉴定方法主要分为两大类:数据库搜索和肽段从头测序。数据库搜索在指定的蛋白质数据库中根据母离子质量查找候选肽段;而肽段从头测序则不依赖数...

            【关键词】 蛋白质肽段鉴定

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            【学位论文】 作者:李林导师:李肯立   高晓飞   湖南大学   计算机科学与技术 计算机技术(硕士) 2016年

            【摘要】 随着人类基因组测序的完成,生命科学研究步入了后基因组时代,蛋白质组学则成为了后基因组时代生命科学研究的热点之一。在蛋白质组学中,利用串联质谱对蛋白质序列进行分析鉴定是一个基础又重要的研究环节。然而,质谱技术的快速发展带来的海量数据使得现行的...

            【关键词】 蛋白质组学串联质谱

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            【学位论文】 作者:迟浩导师:贺思敏   中国科学院大学   计算机科学与技术 计算机应用技术(博士) 2013年

            【摘要】 蛋白质组学是指在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平、翻译后修饰、相互作用等,并由此获得蛋白质水平上关于疾病发生、细胞代谢等过程的全面认识。目前,蛋白质组学已经成为本世纪生命科学的研究重点。其中,人们主要使用质谱技术对生物样品...

            【关键词】 蛋白质组学质谱数据

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            【学位论文】 作者:陈海丰导师:贺思敏   中国科学院研究生院   中国科学院大学   计算机科学与技术 计算机应用技术(硕士) 2012年

            【摘要】 利用串联质谱进行肽段和蛋白质鉴定已经成为蛋白质组学的核心技术。目前,基于串联质谱技术的蛋白质鉴定主要有两条技术路线:数据库搜索(Database Searching)和肽段从头测序(De novo Peptide Sequencing)。肽...

            【关键词】 串联质谱肽段从头测序

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            【学位论文】 作者:赵玮导师:权光日   哈尔滨工业大学   计算机科学与技术 计算机科学与技术(硕士) 2011年

            【摘要】 进入二十一世纪以来,新一代测序技术的出现使得到全基因组的拼接组装算法备受关注。以Roche公司454,Illumina公司Solexa,ABI公司SOLiD为代表的新一代测序技术产生的数据存在测序片段短、错误率高等缺点,使得传统的拼接组装软...

            【关键词】 配对信息DNA从头测序

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            【学位论文】 作者:毕鹏程导师:王亚东   哈尔滨工业大学   计算机科学与技术 计算机科学与技术(硕士) 2011年

            【摘要】 随着遗传学研究的深入,特别是人类基因组计划完成之后,人们认识到取得各个物种的完整基因组序列对于生命本质的探索有着非常重要的作用。如今新一代DNA测序技术已经发展成熟并被广泛的使用,其前所未有的测序速度逐渐的促进了基于序列研究的基因组学的研究...

            【关键词】 DNA从头测序重叠群生成

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            【中文期刊】 柳延虎  王璐  等 《遗传》 2015年3期 259-268页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 单分子 DNA 测序技术是近10年发展起来的新一代测序技术,也称为第三代测序技术,包括单分子实时测序、真正单分子测序、单分子纳米孔测序等技术。文章介绍了单分子实时(Single-molecule real-time,SMRT)测序技术的基本...

            【关键词】 单分子测序PacBioSMRT测序

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            【中文期刊】 樊绮诗  吴蓓颖  《检验医学》 2017年32卷4期 245-249页ISTICCA

            【摘要】 测序技术从第1代发展至今的第4代,读长从长到短,又再由短至长.每一次技术进步都有力地促进了生命科学和临床医学研究的发展.其中高通量测序又称下一代测序(next generation sequencing,NGS)技术即二代测序技术因其通量大...

            【关键词】 高通量测序肿瘤Next generation sequencing

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            【中文期刊】 孙岩岩  李卉  《内蒙古医学杂志》 2019年51卷2期 144-146页

            【摘要】 肿瘤分子检测是实现靶向治疗和个体化治疗的前题.对于大肠癌患者而言,指南指出在使用抗表皮生长因子受体治疗前要进行RAS基因状态的检测.而且目前关于分子生物标志物在诊断、治疗和预后方面应用价值的研究较多,为实施和改进多模式的治疗策略和临床试验提...

            【关键词】 二代测序大肠癌

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            【中文期刊】 孙亦挺  张娣  等 《精准医学杂志》 2018年33卷1期 81-85,91页

            【摘要】 高通量测序又称下一代测序(NGS)技术,即第二代测序技术.其主要特点是通量高、灵敏度高、信息量丰富、成本低等.NGS技术在基因组从头测序、重测序、转录组学测序及表观遗传学研究中发挥了重要作用.近年来,NGS技术逐渐被应用于研究肿瘤的发病机制...

            【关键词】 肿瘤高通量测序精准医学

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            【中文期刊】 陈黎  Xing-Wang Xie  等 《世界华人消化杂志》 2008年16卷21期 2343-2348页ISTICCA

            【摘要】 目的:分离并鉴定整合表达HBV的人肝癌细胞系HepG2.2.15及其母细胞系HepG2的差异HLA Ⅰ类分子结合肽,寻找与HBV感染相关的HLA结合肽.方法:洗涤法得到HepG2和HepG2.2.15细胞表面的HLA Ⅰ类分子及与其结合的肽...

            【关键词】 HepG2细胞HepG2.2.15细胞乙型肝炎病毒

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            【中文期刊】 王勇  李水明  等 《分析化学》 2014年7期 1010-1016页

            【摘要】 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱( MALDI-TOF/TOF)产生的亚胺离子可以提供丰富的肽段组成信息,该方法通常用于基于数据库搜索的蛋白质鉴定,或者结合化学衍生法用于从头测序,因而在一定程度上限制了对亚胺离子的认识及应用。本研究利...

            【关键词】 亚胺离子基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱蛋白质鉴定

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            【中文期刊】 李水明  何曼文  等 《质谱学报》 2014年35卷3期 256-261页

            【摘要】 完全从头测序要求区分肽段中的同量异序氨基酸谷氨酰胺和赖氨酸,而这通常需要借助高分辨质谱.谷氨酰胺和赖氨酸都可以产生m/z 101亚胺离子和m/z 84亚胺相关离子,尽管已知赖氨酸亚胺离子m/z 101有时强度较弱,以及m/z 84离子可预示...

            【关键词】 亚胺离子基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱赖氨酸

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            【中文期刊】 王勇  李水明  等 《质谱学报》 2013年34卷5期 257-262页

            【摘要】 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白.实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因,同时...

            【关键词】 硒结合蛋白基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)蛋白质鉴定

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            【中文期刊】 赵丽艳  周春喜  等 《质谱学报》 2007年28卷3期 185-192页

            【摘要】 对近几年报道的磺化修饰策略及其应用进行了评述.通过磺化修饰在肽段上引入带负电荷的磺酸基,不仅可以诱导肽段离子的质谱裂解,得到以y系列离子为主的序列信息丰富的串联质谱图,有利于肽段从头测序,还可以改变被修饰肽段的电荷分布,通过离子交换色谱法分...

            【关键词】 磺酸化化学修饰蛋白质组学

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            【中文期刊】 周春喜  张养军  等 《质谱学报》 2004年25卷z1期 141-142页

            【摘要】 <篇首> 蛋白质的序列测定对于蛋白质的鉴定具有重要意义.传统的Edman降解测序法对样品纯度有很高的要求,而且操作比较繁琐.在蛋白质组研究中广泛采用串联质谱法测定蛋白质水解肽段的部分氨基酸序列(肽序列标签),通过数据库检索来鉴定蛋白质[1,2]...

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            【中文期刊】 任易  张云封  等 《中国中药杂志》 2018年43卷12期 2557-2562页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 利用C4300(A),Sephadex G-50和半制备HPLC等色谱技术对鹿瓜多肽注射液组方成分梅花鹿骨提取物的多肽类化学成分进行研究,分离纯化得到2个多肽类化合物,其精确相对分子质量分别为m/z1 489.868 5和m/z2 113....

            【关键词】 鹿瓜多肽注射液鹿骨多肽

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            【中文期刊】 刘珍  刘永壮  《生物信息学》 2024年22卷1期 11-18页ISTIC

            【摘要】 拷贝数变异是指基因组中发生大片段的DNA序列的拷贝数增加或者减少.根据现有的研究可知,拷贝数变异是多种人类疾病的成因,与其发生与发展机制密切相关.高通量测序技术的出现为拷贝数变异检测提供了技术支持,在人类疾病研究、临床诊疗等领域,高通量测序...

            【关键词】 高通量测序数据基因组变异拷贝数变异检测

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            【学位论文】 作者:方兴导师:徐麟   中国科学院大学   基础医学 遗传学(博士) 2021年

            【摘要】 离体的拟南芥叶片能够再生出不定根,这一体系对进行不定根的从头再生研究提供了一个良好的研究平台。鉴于不定根从头再生中的转录调节和细胞水平的谱系框架仍然没能得到阐明,我们采用实时和单细胞RNA测序结合遗传验证的方法得到了不定根从头再生过程中从早...

            【关键词】 植物模型单细胞测序

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            【中文期刊】 匡卫民  于黎  《遗传》 2019年41卷11期 979-993页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 随着测序技术的不断发展,越来越多物种的全基因组数据被测定和广泛应用.在二代基因组数据爆发式增长的同时,除了核基因组数据,线粒体基因组数据也非常重要.高通量测序的全基因组序列中除了核基因组序列也包括线粒体基因组序列,如何从海量的全基因组数据中...

            【关键词】 全基因组线粒体基因组有参考序列拼装方法

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            【学位论文】 作者:马云云导师:权光日   哈尔滨工业大学   计算机科学与技术 计算机技术(硕士) 2016年

            【摘要】 二十一世纪以来,新一代测序技术高通量、低成本的优点,极大地促进了生物信息学领域的发展。为了获取测序数据所包含的信息,基因组拼接组装算法成为了该领域研究的核心,许多优秀的基因组拼接组装算法应运而生。近几年,测序技术在原来的基础上不断改革创新,...

            【关键词】 基因组从头测序

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            【学位论文】 作者:高远导师:赵方庆   中国科学院大学   基础医学 遗传学(博士) 2016年

            【摘要】 环形RNA是一类结构特殊的非编码RNA。近两年的研究发现,环形RNA在动物细胞内广泛存在,且大多位于基因的外显子区域。另有研究表明,一些环形RNA承担着重要的生物学功能,例如充当microRNA的“海绵”在转录后水平对基因表达进行调控。然而...

            【关键词】 环形RNA转录组测序

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            【中文期刊】 张以琳  丁克越  等 《中国医学科学院学报》 2002年24卷3期 259-263页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的对我国承担的人类基因组测序项目中的3p24-p25 478kb完全基因组序列进行注释.方法采用从头预测、数据库相似性比较和全长或部分mRNA序列与基因组序列的比对等手段,识别基因组序列中的编码蛋白质的基因,并采用EMBOSS软件包分析基...

            【关键词】 人类基因组计划基因组注释

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            【学位论文】 作者:李智导师:高立志   昆明理工大学   控制科学与工程 模式识别与智能系统(硕士) 2015年

            【摘要】 生物信息学是一门交叉学科,它是利用数学,统计学和计算机科学的方法来研究生物学问题.当前转录组学研究在生物信息学研究中发挥着巨大的作用,转录组的从头拼接又转录组学中一重要内容.在目前,转录组的拼接算法主要是基于参考基因组的拼接方法与从头拼接方...

            【关键词】 生物信息从头拼接算法

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            【学位论文】 作者:孙晓斐导师:徐永东   哈尔滨工业大学   计算机科学与技术 计算机技术(硕士) 2014年

            【摘要】 基因组序列拼接是生物信息学的核心问题之一,目的是将当前测序技术测出的较短的DNA序列拼接成完整的DNA片段。耗费十年时间的“人类基因组计划”就是使用第一代测序技术测出了第一个人类全基因组草图。近些年来,随着测序技术的不断革新,第二代测序技术...

            【关键词】 基因组序列从头测序拼接系统

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