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【中文期刊】 李小妹 黄士蒙 等 《药物生物技术》 2024年31卷1期 20-28页ISTICCA
【摘要】 研究旨在探寻糖尿病和心力衰竭之间可能存在的关联,并评估纤维化相关基因在其中发挥的作用.从GEO数据库中下载心力衰竭的单细胞测序和转录组测序数据;从CTD数据库中下载与糖尿病相关的基因;通过GO和KEGG通路富集分析寻找与糖尿病相关心力衰竭密...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王海军 陈秋月 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2019年35卷10期 1051-1057页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 Oncomine是目前世界上最大的癌基因芯片数据库和综合数据挖掘平台之一,该数据库整合了GEO、TCGA和已发表文献来源的RNA和DNA-seq数据.数据库目前含有715个基因表达数据集(datasheet)、86 733个人体肿瘤组织和正...
【关键词】 Oncomine数据库；癌基因；基因表达与分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 尤红俊 赵倩倩 等 《中国分子心脏病学杂志》 2021年21卷6期 4326-4334页ISTICCA
【摘要】 目的 对动脉粥样硬化(AS)基因芯片数据进行生物信息学分析,寻找疾病相关核心(Hub)基因,并探讨其在AS发生发展中的作用.方法 利用R语言包对基因表达综合数据库(GEO)中筛选出的AS芯片进行基因差异表达分析,String数据库进行蛋白相...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何阳 杨宏昊 等 《华西医学》 2021年36卷9期 1232-1238页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学分析方法筛选与玫瑰痤疮发生、发展有关的关键基因和信号转导通路.方法 截至2021年7月12日,从基因表达综合数据库中按照关键词"rosacea"进行检索,最终获得GSE65914基因芯片集.利用GEO2R平台对该数据集进...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘曦 刘卓琦 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2016年32卷3期 260-266页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 基因表达谱微阵列数据库是一类可提供存储、查询、下载分析的在线网络数据库,在肿瘤相关领域的研究中提供了大量的数据来源.由于微阵列分析对于无生物/医学信息学专业背景的研究人员仍然有较多困难,致使该数据库的使用尚未普及.本文从数据查询、下载分析和...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张厦栋 辛晓红 等 《中国分子心脏病学杂志》 2020年20卷1期 3255-3263页ISTICCA
【摘要】 目的 通过GEO数据库转录组和miRNA基因芯片数据筛选和分析动脉性肺动脉高压相关基因.方法 通过GEO数据库收集转录组数据集(GSE113439、GSE53408)和miRNA数据集(GSE21284、GSE55427).使用R3.5.2...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴茜 宋兴勃 等 《华西医学》 2019年34卷9期 1033-1041页ISTICCA
【摘要】 目的 探索结核病的发病机制,为结核病的早期诊断和治疗评估提供新思路.方法 从基因表达数据库中获取GSE54992基因表达谱,使用美国国立生物技术信息中心在线实验室筛选差异表达基因(differentially expressed gene,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 袁一顺 刘中勇 等 《中国老年学杂志》 2025年45卷11期 2561-2569页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 通过生物信息学,从铁死亡角度探讨动脉粥样硬化发病机制及相关中药筛选.方法 分别通过高通量基因表达数据库(GEO)、铁死亡数据库(FerrDb)获取动脉粥样硬化、铁死亡相关作用基因.利用"limmar"包筛选出动脉粥样硬化中与铁死亡发生...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李建雨 石欢 等 《中国老年学杂志》 2025年45卷7期 1583-1588页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 通过生物信息学和实验验证宫颈癌(CC)发生发展的核心基因,探索潜在的分子标志物.方法 从基因表达数据库(GEO)下载基因芯片数据集[基因集富集(GSE)9750、GSE127265和GSE173097],经过筛选后得到差异表达基因(D...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈瑜 邱志维 等 《中国临床药理学杂志》 2025年41卷8期 1175-1179页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 借助生物信息学技术研究细胞衰老在高血压肾病中可能发生的机制及相关信号通路.方法 查找基因表达数据库下载微阵列数据GSE37455,用R软件合并数据并去除批次效应,获取差异表达基因.从细胞衰老基因CellAge数据库获取细胞衰老基因,通...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 史随随 周剑 等 《中国老年学杂志》 2025年45卷7期 1616-1622页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探索年龄相关性黄斑变性(AMD)自噬关键基因及免疫相关性分析,为AMD的发病机制及治疗提供依据.方法 首先,从基因表达数据库(GEO)下载两组AMD相关临床数据集作为研究对象,第一组数据集为GSE125564,接着从人类自噬数据库(H...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 严诏琦 徐义峰 等 《中国老年学杂志》 2025年45卷11期 2638-2643页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 通过单细胞测序和孟德尔随机化分析研究阿尔茨海默病(AD)的生物标志物.方法 从高通量基因表达数据库(GEO)下载的外周血单核细胞的单细胞测序数据中鉴定出AD与正常人群的差异表达基因(DGEs),其次,通过表达数量性状位点联盟(eQTL...
【关键词】 阿尔茨海默病；淋巴细胞质蛋白(LCP)1；L-塑蛋白(plastin)；
- 概要：
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【中文期刊】 陈静芹 侯聪艳 等 《中国临床药理学杂志》 2025年41卷12期 1762-1767页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于机器学习构建肺腺癌中嘧啶代谢相关基因的预后风险模型,并探索其免疫表型特征及药物敏感性,旨在寻求新的治疗策略.方法 从癌症基因组图谱和高通量基因表达数据库下载肺腺癌患者的基因表达谱,并从GeneCards数据库获取嘧啶代谢相关基因,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 付文博 朱晓南 等 《现代生物医学进展》 2025年25卷2期 372-379页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨心肌梗死患者细胞焦亡相关基因的表达水平及临床意义.方法:从基因表达数据库GEO中下载心肌梗死相关的数据集GSE61144,进行数据预处理后,筛选差异表达基因,通过生物学功能和信号通路富集进行分析,使用STRING数据库和Cytos...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李典潞 田徐腾越 等 《中国实用口腔科杂志》 2025年18卷2期 195-201页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 研究CXC趋化因子受体7(C-X-C motif chemokine receptor 7,CXCR7)、CXC趋化因子配体(C-X-C motif chemokine ligand,CXCL)11 和CXCL12在头颈部鳞状细胞癌(...
【关键词】 CXC趋化因子受体7；CXC趋化因子配体；NIMA相关激酶1；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周粤 刘珏 等 《湖南中医杂志》 2025年41卷5期 143-150页
【摘要】 目的:基于网络药理学与分子对接研究苏黄止咳胶囊治疗支气管哮喘(bronchial asthma,BA)的作用机制.方法:运用R语言进行差异性分析;通过中药系统药理学(Traditional Chinese Medicine Systems ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张超 李朋 等 《生物化学与生物物理进展》 2024年51卷7期 1687-1696页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 本文旨在确定NF2表达阴性脑膜瘤中潜在的miRNA-mRNA轴,研究它们的靶向关系,并确定它们的生物学功能.方法 从基因表达数据库(GEO)下载包含与NF2阴性脑膜瘤相关数据的GSE17792数据集.使用R软件中的limma包确定差异...
【关键词】 2型神经纤维瘤病(NF2)；脑膜瘤；hsa-miR-650；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 牟林 张殷建 等 《中国老年学杂志》 2024年44卷14期 3392-3397页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 通过随机森林树和人工神经网络筛选出有意义的糖尿病视网膜病变(DR)生物标志物,并构建用于DR诊断的综合模型.方法 在基因表达数据库(GEO)下载GSE60436和GSE142153数据集,使用R4.1.3识别数据集中的差异表达基因(D...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 贾业贵 肖丹 等 《中国实验方剂学杂志》 2024年30卷21期 61-69页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨胃复春(WFC)抑制炎症反应、减轻胃癌前病变(GPL)的作用及分子机制.方法:使用N-甲基-N'-硝基-N-亚硝基胍(MNNG)刺激人胃黏膜上皮细胞GES-1,建立体外GPL细胞模型(MC细胞),使用胱天蛋白酶-3(Caspase...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴磊 刘日慧 等 《中国医院药学杂志》 2024年44卷22期 2586-2597页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探究慢性阻塞性肺病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)诊断生物标志物及其靶向中药,为COPD提供新的治疗方向及用药参考.方法:从高通量基因表达数据库中获取COPD相关基因表达数据集....
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨芳 杨伏猛 等 《热带医学杂志》 2024年24卷12期 1699-1704页ISTICCA
【摘要】 目的 结合基因表达数据库(GEO)寻找胃癌血清潜在的miRNA肿瘤标志物,并研究对胃癌的诊断和预后价值.方法 收集2023年1-6月间在连云港市第二人民医院就诊的30例胃癌患者和20名体检健康人的血清,利用GEO2R在线分析工具对GSE86...
【关键词】 胃癌；生物信息学；miR-195-5p；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 彭宝相 王云 等 《青岛大学学报（医学版）》 2024年60卷2期 227-232页ISTICCA
【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库多组学数据构建肺腺癌TP53突变人群的预后模型,探讨核内不均一核糖核蛋白A2/B1(HNRNPA2B1)与肺腺癌TP53突变之间的相关性.方法 通过生物信息学方法搜集TCGA和基因表达数据库(GEO...
【关键词】 肺腺癌；基因,p53；核不均一核糖核蛋白A-B组；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 崔悦 王宏志 等 《中国医学科学杂志（英文版）》 2024年39卷3期 173-184页MEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 利用多种基因表达数据库和公共生物信息学平台,分析出与乳腺癌预后和免疫相关的关键基因,并对关键基因在乳腺癌中的预后价值和免疫作用情况进行验证和探讨.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载乳腺癌基因芯片...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曾琴 谢榕城 等 《中国呼吸与危重监护杂志》 2024年23卷9期 617-624页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法探究铁死亡相关基因在脓毒症导致的肺损伤中发生发展中的作用,并预测与之密切相关的基因.方法 从基因表达数据库(gene expression database,GEO)中下载数据集GSE154653,包含正常组和脂多糖...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 武艾宁 托娅 等 《中国优生与遗传杂志》 2024年32卷1期 28-32页ISTIC
【摘要】 目的 阐明复发性流产患者氧化损伤的原因和分子机制对于完善疾病发病机制、临床治疗具有重要意义.方法 对17例复发性流产和11例正常早期妊娠孕妇进行外周静脉血丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、谷胱甘肽过氧化物酶(...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐朗 苏健芬 等 《中国呼吸与危重监护杂志》 2024年23卷11期 784-790页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用生物信息学与机器学习来鉴定脂多糖诱导小鼠急性肺损伤的特征基因.方法 从基因表达数据库下载小鼠急性肺损伤数据集(GSE2411、GSE111241和GSE18341).对GSE2411和GSE111241进行差异分析,随后进行功能富...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 管晓娇 陈玉娇 《中国优生与遗传杂志》 2024年32卷3期 441-446页ISTIC
【摘要】 目的 通过基因表达数据库(GEO)分析双酚A(BPA)致胎盘毒性的差异表达miRNA,寻找差异表达miRNA基因调控的功能通路.同时,基于基因表达数据库(GEO)分析结果,探讨METTL3调控BPA导致胎盘毒性的作用机制.方法 使用GEO在...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 罗程 宋忱 等 《中国煤炭工业医学杂志》 2024年27卷5期 439-447页ISTIC
【摘要】 目的 本研究旨在通过网络药理学和生物信息学方法,探究骨质疏松、自噬及衰老之间的相互关系,识别潜在的治疗靶点,并预测可能的药物及其作用靶点,为骨质疏松症的治疗提供新的思路.方法 从高通量基因表达数据库(GEO)中收集到基因富集信息(GSE)3...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 潘舟 何阳 等 《武汉大学学报（医学版）》 2024年45卷8期 891-897页ISTICCABP
【摘要】 目的:探究双特异性磷酸酶6(Dusp6)对间歇性缺氧(IH)诱导的肺动脉高压(PAH)的影响及其机制.方法:利用基因表达数据库以及体内模型分析Dusp6的差异表达.随后将15只雄性SD大鼠随机分为正常组(Normal组)、慢性间歇缺氧组(C...
【关键词】 双特异性磷酸酶6(Dusp6)；慢性间歇性缺氧；肺动脉高压；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘丽 王哲近 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2023年39卷4期 562-572页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 β-1,3-半乳糖-O-糖基-糖蛋白β-1,6-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶(β-1,3-galactosyl-O-glyco-syl-glycoprotein β-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase,GCN...
【关键词】 β-1,3-半乳糖-O-糖基-糖蛋白β-1,6-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶(GCNT3)；肝癌(HCC)；PI3K/Akt/mTOR；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 唐欣 赵洪波 《基因组学与应用生物学》 2022年41卷5期 1112-1119页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究运用生物信息学方法筛选宫颈癌中高表达的蛋白激酶及其抑制剂,为宫颈癌的分子靶向治疗提供参考.从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载宫颈癌表达谱芯片数据GSE63514,筛选高表达激酶基因;使用cl...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 余雨 成军 等 《中国血吸虫病防治杂志》 2022年34卷5期 507-513页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探索与乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌(HCC)发生发展相关的核心基因,为进一步揭示HBV相关HCC发病机制提供参考.方法 从高通量基因表达数据库(GEO)中下载GSE55092、GSE121248两个数据集,采用R语言筛选HCC组...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 夏媛媛 苏松柏 等 《贵州中医药大学学报》 2023年45卷2期 66-74页
【摘要】 目的:基于网络药理学联合基因表达数据库(GEO)芯片分析的方法,研究心衰宁合剂治疗由缺血性心肌病(ICM)和扩张型心肌病(DCM)导致心力衰竭的靶点和分子机制.方法:借助中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)及文献补充筛选出心衰宁合剂的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙东旭 朱文静 等 《青岛大学学报（医学版）》 2022年58卷2期 205-212页ISTICCA
【摘要】 目的 基于细胞周期调控相关基因构建新的肝癌预后模型,为预测肝癌的预后及肿瘤治疗提供新的思路和方向.方法 肝癌病人的mRNA表达谱和临床数据收集于TCGA肿瘤数据库、GEO基因表达数据库和ICGC肿瘤基因数据库.通过R软件分析筛选肝癌的差异表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张旭东 崔海康 等 《免疫学杂志》 2022年38卷11期 950-963页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 筛选出胃癌(GC)免疫治疗敏感的免疫分型,为进一步研究GC的个体化免疫治疗提供新思路.方法 收集分析石河子大学医学院第一附属医院2004年1月至2016年12月169例GC患者术后石蜡组织标本及其对应的癌旁组织;从癌症基因组图谱(TC...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Ringwald M ; Eppig JT ; 等 《Nucleic Acids Research》 2000年28卷1期 115-119页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Databases;Factual;Gene Expression;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Abba MC ; Sun H ; 等 《Molecular cancer research: MCR》 2007年5卷9期 881-890页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Breast Neoplasms;DNA Primers;Databases;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Salgado H ; Santos Zavaleta-A ; 等 《Nucleic Acids Research》 2000年28卷1期 65-67页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Databases;Factual;Escherichia coli;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Kel Margoulis-OV ; Romashchenko AG ; 等 《Nucleic Acids Research》 2000年28卷1期 311-315页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Lin SM ; McConnell P ; 等 《Bioinformatics》 2004年20卷18期 3659-3661页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Database Management Systems;Gene Expression Regulation;Information Storage and Retrieval;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Marc P iologie.ens.fr ; Devaux F ; 等 《Nucleic Acids Research》 2001年29卷13期 E63-63页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Databases;Gene Expression Profiling;Gene Expression Regulation;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Davies JA ; 《Developmental genetics》 1999年24卷3/4期 194-198页MEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Hishiki T ; Kawamoto S ; 等 《Nucleic Acids Research》 2000年28卷1期 136-138页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Databases;Factual;Gene Expression;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Heinemeyer T ; Wingender E ; 等 《Nucleic Acids Research》 1998年26卷1期 362-367页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 van Steensel-MA ; Celli J ; 等 《European journal of human genetics: EJHG》 1999年7卷8期 910-919页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Abnormalities;Multiple;Databases;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Horiba N ; Masuda S ; 等 《Kidney International: Official Journal of the International Society of Nephrology》 2004年66卷1期 29-45页SCISCIE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Corton JC ; Stauber AJ ; 《Toxicological sciences: An official journal of the Society of Toxicology》 2000年58卷2期 217-219页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Carcinoma;Hepatocellular;Databases;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Kawashima T ; Kawashima S ; 等 《Nucleic Acids Research》 2000年28卷1期 133-135页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Magrane M ; Apweiler R ; 《Genesis: the journal of genetics and development》 2000年26卷1期 1-4页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Dysvik B ; Jonassen I ; 《Bioinformatics》 2001年17卷4期 369-370页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Databases;Factual;Gene Expression;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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