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【中文期刊】 王建平 邹秉杰 等 《生物工程学报》 2011年27卷10期 1513-1520页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 利用基因工程手段表达了分子量约为24 kDa的重组大肠杆菌单链结合蛋白(r-SSBP),通过凝胶阻滞电泳与DNA熔解温度(Tm)影响实验表征了r-SSBP与单链DNA(ssDNA)结合的特性,结果表明,r-SSBP可以与ssDNA结合,并且...
【中文期刊】 贾政军 王华 等 《中国临床药理学与治疗学》 2011年16卷6期 647-651页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:建立LAMA5 rs944895基因多态性分析的焦磷酸测序方法,并分析该多态性在中国健康人群中的分布频率.方法:制备201例健康人外周血gDNA,应用PyroMarkID焦磷酸测序仪进行LAMA5 rs944895基因多态位点的焦磷酸...
【中文期刊】 李秀娟 白萍 等 《现代预防医学》 2010年37卷20期 3907-3909页 ISTICPKUCA
【摘要】 [目的]通过对沙门菌fimy基因保守片段的焦磷酸测序,达到鉴定沙门菌的目的.[方法]通过短片段基因序列测定检测沙门菌.[结果]通过焦磷酸测序法对fimy基因上的27个碱基片段进行测定,可准确检测191株沙门菌.[结论]建立的方法具有准确、快...
【中文期刊】 汪钦 郭晏海 等 《现代生物医学进展》 2011年11卷10期 1873-1876页 ISTICCA
【摘要】 目的:建立焦磷酸测序技术检测拉米夫定和阿德福韦酯治疗乙肝所致乙肝病毒基因耐药突变的定量检测方法,为临床乙肝耐药诊断和治疗提供依据.方法:针对乙肝病毒DNA聚合酶基因序列上4个常见基因突变位点的6种突变形式,分别克隆构建野生型和突变型质粒作为...
【中文期刊】 徐保红 李秀娟 等 《预防医学情报杂志》 2011年27卷1期 78-80页 ISTICCA
【摘要】 目的:通过短片段基因序列测定检测副溶血性弧菌.方法 :通过对副溶血性弧菌Pr72h基因保守片段的焦磷酸测序,达到鉴定副溶血性弧菌的目的 .结果 :通过焦磷酸测序对Pr72h基因上的18bp的保守片段进行测定可准确检测56株副溶血性弧菌.结论...
【中文期刊】 李娟 朱怡文 等 《中华围产医学杂志》 2021年24卷5期 326-334页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨6q24新生儿暂时性糖尿病（6q24-related transient neonatal diabetes mellitus, 6q24-TNDM）的临床特征和分子遗传学特点。方法:回顾性分析2017年上海市儿童医院新生儿科收治...
【中文期刊】 徐正 颜宏利 《第二军医大学学报》 2020年41卷10期 1169-1174页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 检测结直肠癌组织中PR结构域蛋白12(PRDM12)、叉头框E1(FOXE1)、β-1,3-葡糖醛转移酶2(B3GAT2)、波形蛋白(VIM)、分泌型卷曲相关蛋白2(SFRP2)基因的甲基化水平,初步评估上述基因作为结直肠癌早期筛查标...
【中文期刊】 巫丽娟 辛兆丹 等 《四川大学学报（医学版）》 2019年50卷2期 234-240页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用甲基化芯片筛选活动性结核患者DNA甲基化水平显著变化的基因.方法 ①甲基化芯片筛选:纳入9例活动性结核患者、3例潜伏性结核患者和3例健康对照(年龄与性别均匹配),分别提取人全血单个核细胞DNA并进行亚硫酸盐转化,与Illumina...
【中文期刊】 陈豪 张晶雅 等 《四川大学学报（医学版）》 2018年49卷5期 731-736,775页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选活动性结核患者DNA甲基化水平显著变化的基因并进行验证.方法 ①纳入年龄与性别匹配的9例活动性结核患者、3例潜伏性结核患者和3例健康对照,将人血中单个核细胞DNA与芯片杂交,比较结核组与健康组的甲基化差异基因,并对差异基因进行GO...
【中文期刊】 钟焱 周钢 《现代预防医学》 2017年44卷8期 1494-1498页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 比较PCR-直接测序法和PCR-焦磷酸测序法检测表皮生成因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)基因突变的一致性和差异性,探寻适应于临床检测体细胞EGFR基因突变的方法,为非小细胞癌患者的...
【中文期刊】 李晓楼 《生物工程学报》 2017年33卷6期 968-975页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 土壤中的微生物主要有细菌、放线菌、真菌三大类群,微生物在石油污染的土壤中发挥着维持生态平衡和生物降解的功能.文中以四川省遂宁市射洪县某废弃油井周围不同程度石油污染土壤为供试土壤,首先对各组供试土壤的基本理化性质进行测定分析;然后采用平板菌落...
【中文期刊】 李海欣 粱爽 等 《中国儿童保健杂志》 2017年25卷7期 652-655页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 检测北方汉族孤独症谱系障碍(ASD)患儿NPR1基因启动子区的甲基化水平,并探讨其与ASD的相关性.方法 应用焦磷酸测序法检测9对同卵双生ASD样本、30例ASD患儿和30例正常儿童在NPR1基因启动子区2个位点(Chr.1:1536...
【中文期刊】 钟焱 周钢 《现代预防医学》 2017年44卷10期 1862-1866页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 建立表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)21号外显子基因突变的焦磷酸测序方法.方法 用纯野生和纯突变的EGFR21质粒DNA按比例配制7份不同突变比例的DNA样本和1份正常人血...
【中文期刊】 赵帅 周娜 等 《微生物学报》 2016年56卷6期 1000-1008页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]探讨盐角草根部内生细菌群落多样性特征,揭示内生细菌群落结构在宿主关键发育期动态变化规律.[方法]通过罗氏454高通量测序获得内生细菌16S rRNA片段,然后进行生物信息分析.[结果]共获得20363条16S rRNA基因序列.各样...
【中文期刊】 韩腾 张立猛 等 《微生物学报》 2016年56卷5期 835-845页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]利用454高通量测序技术分析生防菌株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) Tpb55对烟草根围土壤细菌群落的影响;同时测定施加Tpb55处理对烟草黑胫病的大田防效.[方法]试验设置Tpb55菌剂108 CFU/mL灌根...
【中文期刊】 赵帅 周娜 等 《微生物学报》 2016年56卷10期 1583-1594页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]揭示同一盐渍环境中不同种盐生植物根部内生细菌群落多样性特征和分布规律,结合根际土壤理化因子探讨其对内生细菌群落结构的影响.[方法]通过罗氏454高通量测序获得内生细菌16SrRNA片段,然后进行生物信息分析.[结果]研究的16种盐生...
【中文期刊】 粘学渊 许智慧 等 《解放军医学杂志》 2016年41卷3期 189-194页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立一种新的单管巢式实时荧光PCR熔解曲线法用于快速灵敏地筛检临床乙型肝炎病毒(HBV)样本核心启动子区nt1758-1777片段缺失突变.方法 通过比对分析GenBank收录的HBV基因序列,设计通用巢式PCR引物,建立优化方法体系...
【中文期刊】 刘英姿 曾飞跃 等 《中国临床药理学与治疗学》 2016年21卷6期 673-677页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:建立CTR1 rs10981694单核苷酸多态性位点的焦磷酸测序方法.方法:全血gDNA为模板,生物素标记引物,对扩增多态位点目的片段,制备生物素标记单链模板,与测序引物退火结合后行焦磷酸测序.分析结果经毛细管电泳测序验证,并进行重复...
【中文期刊】 岑蒙莎 朱宇斌 等 《中华炎性肠病杂志》 2021年05卷1期 77-83页
【摘要】 目的:观察并分析脱氧胆酸在诱导小鼠肠炎过程中对肠道菌群及胆汁酸代谢的影响。方法:将20只C57BL/6J小鼠随机均分为脱氧胆酸组和对照组，脱氧胆酸组小鼠给予含0.2%脱氧胆酸饲料，对照组给予常规饲料，连续喂养24周。采用HE染色观察肠道组织...
【中文期刊】 周霞辉 吴成就 等 《中国临床药理学与治疗学》 2015年20卷4期 430-434页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:建立k-ras基因突变的焦磷酸测序方法,并分析该基因在结直肠癌中的突变率.方法:制备10份卫生部临床检验中心2013年全国k-ras基因突变检测室间质评模板DNA,对焦磷酸测序技术检测k-ras基因突变方法进行验证;制备230例结直肠...
【中文期刊】 牟瑛 宋添添 等 《中国热带医学》 2015年15卷6期 664-667页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 使用焦磷酸测序技术检测GSTP1、E-cadherin、RARβ、P16基因启动子区域在肝癌组织中的甲基化状态,为临床早期诊断肝癌奠定基础.方法 取肝癌组织及肝硬化组织石蜡切片标本,使用焦磷酸测序仪检测GSTP1、E-cadherin...
【中文期刊】 翟向红 王岸聪 《中华肿瘤防治杂志》 2015年22卷17期 1388-1392页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨谷胱甘肽S-转移酶P1(glutathione S-transferase P1,GSTP1)和谷胱甘肽S-转移酶M1 (glutathione S-transferase M1,GSTM1)基因单核苷酸多态性对化疗治疗卵巢浆液性...
【中文期刊】 陈勇 李晓可 等 《中华风湿病学杂志》 2020年24卷10期 676-680页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:初探BCAR1、PDE1C、OPRD1以及NRXN1基因启动子区甲基化水平的改变与原发性痛风及高尿酸血症的相关性。方法:在中国科学院大学宁波华美医院门诊及体检中心同期随机选取原发性痛风患者50例、高尿酸血症患者30例和健康对照体检者5...
【中文期刊】 黄卫强 张和平 《微生物学通报》 2014年41卷6期 1195-1202页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 人的肠道中栖息着大量微生物,这些微生物与宿主形成一个相互依赖且相互制约的微生态系统.肠道菌群结构与遗传、饮食、疾病、环境等因素存在千丝万缕的联系,其地位与作用相当于一个后天获得的“器官”,对人体的消化、营养吸收、能量供应、脂肪代谢、免疫调节...
【关键词】 肠道菌群； 荧光原位杂交； 基于聚合酶链式反应的变性梯度凝胶电泳；
【中文期刊】 唐霁旭 王志伟 等 《微生物学通报》 2014年41卷2期 391-398页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]对诱发膜-生物反应器(Membrane bioreactors,MBR)膜污染的优势菌种进行研究. [方法]利用454高通量焦磷酸测序法对MBR污泥混合液样品与膜污染物样品中微生物信息进行统计,并对两组样品的Chao丰度指数与Sha...
【中文期刊】 邢睿 高庆波 等 《微生物学报》 2014年54卷9期 1045-1052页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]本研究利用454焦磷酸测序技术,对青藏高原黄绿蜜环菌(Armillaria luteo-virens)转录组进行测序,从获得的Expressed sequence tags(EST)序列中开发EST-SSR引物.[方法]利用高通量测...
【中文期刊】 袁小凤 彭三妹 等 《中国中药杂志》 2014年39卷22期 4304-4310页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 探讨不同种源浙贝母根际真菌群落多样性差异,以了解浙贝母的土壤微生态机制.利用变性凝胶梯度电泳(DGGE)和454焦磷酸测序技术检测不同种源浙贝在同一块地种植其根际真菌的多样性及组成.DGGE结果表明,本地种源(宁波种)根际真菌Shannon...
【中文期刊】 卢熠川 徐杨 等 《中国公共卫生》 2014年30卷6期 835-838页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 沙门菌包括肠道沙门菌与邦戈尔沙门菌,前者血清型种类极为丰富,约有2600余种血清型,包扩肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、副伤寒沙门菌等若干种传播途径广泛、侵染宿主繁多、感染症状严重的强致病性血清型.肠道沙门菌(Salmonella e...
【中文期刊】 李学琴 张露萍 等 《解放军医学杂志》 2014年39卷3期 202-205页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立改良的酶切富集PCR-焦磷酸测序技术,检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织与血浆中K-ras基因的突变情况.方法 配对提取43例NSCLC患者的癌组织和血浆DNA,采用酶切富集PCR-焦磷酸测序技术检测K-ras基因第2外显子...
【中文期刊】 李莉 鲁英 等 《现代预防医学》 2014年41卷18期 3340-3343页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨RASSF1A基因在乳腺癌患者血浆中的异常甲基化情况.方法 按照1∶1配比的病例对照研究,采用聚合酶链式反应(PCR)对72例乳腺癌患者和72例健康者外周血中的抑癌基因RASSF1A进行扩增,并进行焦磷酸测序,检测该基因的甲基化情...
【中文期刊】 康超颖 张旭 等 《中国微生态学杂志》 2013年25卷10期 1117-1122页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究小檗碱在体外对高脂饮食诱导的肥胖、胰岛素抵抗大鼠(HFD)肠道菌群和正常饮食对照大鼠(NCD)肠道菌群结构的体外影响.方法 采用体外厌氧培养、PCR-DGGE和454焦磷酸测序技术研究小檗碱对肠道菌群结构和多样性的影响.结果 DG...
【中文期刊】 王国洋 王景 等 《中国微生态学杂志》 2013年25卷9期 1005-1009页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 目前基于新一代测序技术开展的人类肠道元基因组学研究已成为微生物学乃至整个生物学中最活跃和最有潜力的学科方向.现阶段绝大部分以肠道菌群为靶标的研究主要基于16S rRNA基因可变区测序.本研究关注的是测序技术发展使得序列的读长能力延长后...
【关键词】 454焦磷酸测序； 16S rRNA基因； V1-V3可变区；
【中文期刊】 许龙岩 袁慕云 等 《中国食品卫生杂志》 2013年25卷3期 201-205页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立结合PCR-焦磷酸测序检测单核细胞增生李斯特氏菌的方法.方法 根据单核细胞增生李斯特氏菌的hly基因设计扩增引物和测序引物,特异地扩增目的片段,再制备单链模板,在测序引物引导下进行焦磷酸测序,通过测序结果与GenBank中的hly...
【关键词】 PCR-焦磷酸测序； 单核细胞增生李斯特氏菌； DNA碱基序列；
【中文期刊】 万子睿 谢海棠 等 《中国临床药理学与治疗学》 2012年17卷5期 543-548页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:建立SLCO1B1 A388G和T521C单核苷酸多态位点的焦磷酸测序方法,分析中国健康人群中分布频率.方法:制备300例健康人外周血gDNA,应用PyroMark ID焦磷酸测序仪进行多态位点分型分析.并通过重复性检验和毛细管电泳测...
【中文期刊】 孙树梅 周浩 等 《中华医院感染学杂志》 2012年22卷14期 2991-2993页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过与PCR产物直接测序比较,评价焦磷酸测序法在乙型肝炎病毒耐药基因检测中的应用价值.方法 选取临床使用拉米夫定抗病毒治疗慢性乙型肝炎患者,分别采用巢式PCR焦磷酸测序法与巢式PCR产物直接测序法检测拉米夫定相关耐药位点rtl80变异...
【中文期刊】 徐澍 邹秉杰 等 《生物工程学报》 2012年28卷6期 763-771页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 焦磷酸测序是一种基于生物发光反应的实时DNA序列测定技术,其反应体系中的荧光素酶决定测序反应的灵敏度.传统焦测序反应使用的是野生型北美荧光素酶Photinus pyralis luciferase (PpL),该酶热稳定性较差,因此由该酶配...
【中文期刊】 万子睿 谢海棠 等 《中国临床药理学与治疗学》 2012年17卷7期 779-784页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:建立ABCG2 34G＞A和421C＞A单核苷酸多态性位点的焦磷酸测序方法.方法:抽取志愿者静脉血入EDTA抗凝管,常规苯酚/氯仿法制备全血gDNA,生物素标记引物对扩增多态位点目的片段,制备生物素标记单链模板,与测序引物退火结合后行...
【中文期刊】 赵钢涛 杨凡 等 《中国临床药理学与治疗学》 2011年16卷4期 407-411页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨加味逍遥丸对CYP2C19活性的影响,为临床指导联合用药提供依据.方法:将20名受试者按照CYP2C19 2基因型进行分类,野生型纯合子(WW)及突变型纯合子(MM)各10名.以奥美拉唑作为CYP2C19的探针药,研究服用加味道遥...
【中文期刊】 李秀娟 徐保红 等 《现代预防医学》 2011年38卷1期 144-145,153页 ISTICPKUCA
【摘要】 [目的]对单增李斯特菌鉴定方法进行研究.[方法]分别用API检测方法、16S rRNA序列分析法和焦磷酸测序法对17株单核细胞增生李斯特菌进行检测.[结果]3种方法均能准确鉴定单增李斯特菌.[结论]焦磷酸测序方法检测单增李斯特菌特异性强、经...
【中文期刊】 吕江峰 虞闰六 等 《中华医院感染学杂志》 2011年21卷15期 3117-3121页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探索采用焦磷酸测序技术进行幽门螺杆菌(Hp)鉴定与耐药以及宿主胃癌易感相关基因多态性分析的可行性,为临床提供一种快速的分析手段和诊疗依据.方法 提取60例胃黏膜活检标本DNA(Hp阳性、阴性各30例),PCR扩增Hp 16S rDNA...
【中文期刊】 郑金梅 赵龙凤 等 《解放军医学杂志》 2010年35卷10期 1199-1200,1204页 ISTICPKUCSCDCA
【中文期刊】 刘华雷 吕艳 等 《微生物学报》 2010年50卷3期 395-399页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]本研究旨在通过焦磷酸测序技术对我国分离的H1N1、H3N2、H9N2等3种基因型的10株猪流感病毒分离株进行金刚烷胺耐药性鉴定.[方法]流感病毒M2蛋白5个关键位点氨基酸残基(第26、27、30、31和34位)中的任何一个发生突变会...
【中文期刊】 杜卫东 许洪升 等 《中华疾病控制杂志》 2010年14卷3期 187-191页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨Mμ阿片受体基因(OPRM1)基因A118G多态性对散发原发性帕金森病(parkinson's disease,PD)发病的潜在影响.方法 利用Pyrosequencing技术对114例PD患者和133例健康对照进行OPRM1 A...
【中文期刊】 丁媛媛 杨凡 等 《中国临床药理学与治疗学》 2010年15卷11期 1267-1272页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨多药耐药基因(MDR1)C1236T、C3435T、G26677T/A 3个SNP位点单倍型对中国汉族癫痫患者丙戊酸钠血药浓度的影响.方法:实验选择单药服用丙戊酸钠的汉族癫痫患者143例,根据临床资料分为耐药组(n=68)和控制组...
【中文期刊】 赵钢涛 丁媛媛 等 《中国临床药理学与治疗学》 2009年14卷7期 799-803页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:建立基于焦磷酸测序技术(Pvrosequencing)的高通量的CYP2C9~*3突变检测方法.方法:应用带有生物素标记的扩增引物,经PCR扩增及Beads分离,制备该突变位点焦磷酸测序单链模板,并在PvroMark ID焦磷酸测序仪...
【中文期刊】 丁小明 许嵘 等 《解剖学报》 2019年50卷5期 608-612页 ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 探讨膀胱尿路上皮癌中候选生物标志物转录因子21(TCF21)甲基化的意义.方法 选择2016年10月～2017年10月间疑似膀胱癌患者142例,其中经病理学检测确诊为膀胱癌80例为研究组,经病理学检测确诊为非膀胱癌共62例为对照组.另...
【中文期刊】 陈晓光 董梅 等 《热带医学杂志》 2018年18卷3期 354-357,361页 ISTICCA
【摘要】 目的 利用焦磷酸测序技术分析青岛地区结核分枝杆菌embB306基因突变规律,评价其作为诊断耐多药结核杆菌分子标记物的临床应用价值.方法 随机抽取青岛市疾病预防控制中心提供的结核分枝杆菌临床分离株,包括耐多药株23株,非耐多药株46株,对一线...
【关键词】 耐多药结核分枝杆菌； embB306基因突变； 焦磷酸测序；
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