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【中文期刊】 张凯 刘玲玲 等 《中华医学图书情报杂志》 2019年28卷6期 1-8页ISTICCA
【摘要】 目的:寻找与子宫内膜癌发生、发展相关的关键基因.方法:从医学信息检索平台Coremine Medical中筛选出与子宫内膜癌关系最为密切的几种关键基因,再利用生物医学文本挖掘工具Chilibot对从PubMed中获取的相关文献摘要进行分析,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 崔雷 《中华医学图书情报杂志》 2017年26卷3期 1-5页ISTICCA
【摘要】 介绍了生物医学领域里的文本挖掘研究的步骤及各个步骤中所采用的方法,重点介绍了各个步骤中所用的工具和案例,以期促进生物医学文本挖掘研究的开展.
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 侯丽 吴萌 等 《医学信息学杂志》 2017年38卷5期 74-79页ISTICCA
【摘要】 以2015-2016年两届国际生物医学审编会议上领域专家讨论的报告和会议论文集,以及PubMedCentral中近5年来有关Biocuration和Data Biocuration的研究文献为数据源,采用内容分析法对生物医学科学数据审编的研...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 史航 高雯珺 等 《中华医学图书情报杂志》 2016年2期 27-33页ISTICCA
【摘要】 为了解生物医学文本挖掘的研究现状和评估未来的发展方向，以美国国立图书馆 PubMed中收录的2000年1月－2015年3月发表的生物医学文本挖掘研究文献记录为样本来源，提取文献记录的主要主题词进行频次统计后截取高频主题词，形成高频主题词－论...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱祥 张云秋 等 《中华医学图书情报杂志》 2015年24卷10期 28-32页ISTICCA
【摘要】 利用COREMINE Medical寻找与白血病相关的基因,确定关系最为密切的5种基因,再通过生物医学文本挖掘工具Chilibot对从PubMed中所获相关文献的摘要进行分析,通过对相互作用的深入分析,发现了白血病和基因的相互作用关系.
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨春媛 李满生 等 《军事医学》 2015年2期 111-116页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的：中国是多种常见肝病的高发国家，肝脏疾病的研究对提高防治水平，保障人民健康有着重要的意义。为了全面收集、整理、共享和分析分散于现有数据库和文献资料中的肝脏生理病理学知识，该研究构建了人类肝脏疾病本体HuLDO并展开多方面应用。方法 Hu...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕婷 姜友好 《中华医学图书情报杂志》 2010年19卷4期 56-64页ISTICCA
【摘要】 系统介绍了生物医学文本挖掘的具体流程和文本挖掘技术在生物医学领域中的应用情况,并着重从自然语言处理和本体、命名实体识别、关系抽取、文本分类与聚类、共现分析、系统工具及评价、可视化等方面分别做了阐述.
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 吴明智 崔雷 《中华医学图书情报杂志》 2010年19卷5期 5-10页ISTICCA
【摘要】 人类基因组计划使生物医学的研究取得了前所未有的成就,在研究结果中得到了大量的生物医学实体,如基因、蛋白质、器官、疾病和药物等,但这些生物实体之间存在什么样的关系仍不完全清楚.作为生物医学研究成果载体的文献呈指数增长,已成为科研人员获取知识的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 翟兴 郭凤英 等 《医学信息》 2014年24期 22-22页
【摘要】 本研究以美国科技信息研究所出版的《科学引文索引》(SCI)为数据源检索2004~2013年生物医学领域文本挖掘文献，并从年度变化、国家/地区分布、作者等方面进行文献计量学分析。结果显示：全球生物医学文本挖掘文献总量呈上升趋势。而对其进一步的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周雪忠 吴朝晖 等 《复杂系统与复杂性科学》 2004年1卷3期 45-55页
【摘要】 采用文本挖掘技术处理海量生物医学科技文献和文本注释型数据库,从而发现创新知识如基因、蛋白质、疾病、药物及其相互关系的研究是当前人工智能和数据挖掘领域研究的热点.本文对生物医学文献知识发现的研究内容、研究成果以及基于文本挖掘的关键技术诸方面进...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李彦波 赵鑫 等 《药物评价研究》 2022年45卷1期 37-47页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 基于文本挖掘技术和生物医学数据库对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)相关文献进行数据挖掘分析,探究COVID-19及其主要症状发热、咳嗽、呼吸障碍相关基因靶点,筛选潜在有效的化学药和中药.方法 使用GenCLiP 3网站获取COVI...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 翟兴 唐燕 等 《现代生物医学进展》 2015年15卷8期 1534-1539页ISTICCA
【摘要】 目的:近年来,随着生物医学领域文献数量的急骤增长,大量隐含的规律和新知被掩埋在浩如烟海的文献之中,而将文本挖掘技术应用于生物医学领域则可以对海量生物医学文献数据进行整合、分析,从而获得有价值的信息,提高人们对生物医学现象的认识.本文就我国近...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：付诚诚 导师：蒋兴鹏 华中师范大学 软件工程 软件工程（硕士） 2020年
【摘要】 在自然界中，微生物无处不在。这些微生物尤其是细菌寄生于人体，通过相互作用调节机体平衡，影响人体的新陈代谢。近几年来，有关微生物的研究数据，随着实验条件与技术水平的迅猛发展而快速扩增，这些数据的积累催生出基因组序列分析、生物网络构建、生物医学...
【关键词】 生物医学 ； 细菌-疾病关联知识库 ；
- 概要：
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【学位论文】 作者：周开银 导师：夏静波 华中农业大学 生物学 生物信息学（硕士） 2020年
【摘要】 研究基因突变是人类认识并治疗疾病的重要途径，当某个基因发生突变时往往伴随着基因功能的变化，进而导致机体产生疾病，我们将这一连串的动作称为基因突变事件。根据基因突变对功能的影响，可以将基因突变分成两类：获得功能(Gain-Of-Functio...
- 概要：
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- 结论：
【会议论文】黄鹏 中华医学会医学信息学分会第十二届全国医学信息教育可持续发展学术研讨会暨第三届全国医学信息学研究生论坛 2017年
【摘要】 近年来,生物医学领域中的文献量和实验数据迅速增长.为及时跟踪相应领域的发展态势,高效准确地自动化分析和解读文献,研究人员开发出大量的文本挖掘方法和框架.本文从文本挖掘工具的角度对文本挖掘的内容、技术和应用进行梳理,并对生物医学领域文本挖掘的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【会议论文】隋明爽 中华医学会医学信息学分会第十二届全国医学信息教育可持续发展学术研讨会暨第三届全国医学信息学研究生论坛 2017年
【摘要】 目的:通过从两个生物医学文献集合中识别并提取基因-药物和药物-不良反应实体及关系,构建基因-药物-不良反应关系网络,进而推测基因表达与药物不良反应之间的可能关联. 方法:从PUBMED获取文献集合,采用结合多种特征的条件随机场模型进行...
【关键词】 生物医学文献集合 ； 基因-药物-不良反应 ； 关系提取 ；
- 概要：
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【会议论文】钱庆 中华医学会第二十一次全国医学信息学术会议 2015年
【摘要】 基于知识组织系统的生物医学文本挖掘取得了一定的进展，但仍然面临诸多挑战。虽然大量医学知识组织系统被用于生物医学挖掘系统中，但是当前医学知识组织系统对生物医学术语的覆盖有限，不能覆盖所有的文献中出现的术语，如UMLS叙词表中记录了超过1600...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【会议论文】冒宇清 第二届中国中医药信息大会 2015年
【摘要】 人工基因本体(Gene Ontology,GO)标注是指标注者通过阅读生物医学文献并使用GO术语来标定文中的基因功能信息,其结果在生物医学研究中扮演了非常重要的角色.基于对两届BioCreative GO任务参赛队伍性能的比较，可以得出结论...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【会议论文】钱庆 中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所/图书馆2014年学术年会 2015年
【摘要】 随着生物医学信息技术的飞速发展,生物医学文献呈"指数型"增长,单纯依靠人工阅读获取和理解所需知识变得异常困难,如何从海量生物医学文献中整合已有知识、挖掘新知识成为当前研究热点.生物医学领域的知识组织系统建设相比其他领域更加规范和完整,为生物...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【会议论文】朱祥 第十届全国医学信息教育可持续发展学术研讨会 2015年
【摘要】 利用COREMINE Medical寻找与白血病相关的基因,确定关系最为密切的5种基因,再通过生物医学文本挖掘工具Chilibot对从PubMed中所获相关文献的摘要进行分析,通过对相互作用的深入分析,发现了白血病和基因的相互作用关系.LI...
- 概要：
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- 结论：
【学位论文】 作者：卜铭远 导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（硕士） 2014年
【摘要】 面对不断指数增长的生物医学文献，生物医学研究者如何从相关的文献中自动挖掘出有价值的生物医学知识，这是目前生物信息的热点工作。在生命科学中，蛋白质相互作用关系起着非常特殊的作用，因此蛋白质相互作用关系抽取是生物医学文本挖掘领域的热点任务之一。...
- 概要：
- 方法：
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【学位论文】 作者：王艳华 导师：杨志豪 大连理工大学 计算机科学与技术 计算机应用技术（硕士） 2013年
【摘要】 生物医学文献的数量正爆炸式地增长。如此海量的数据给研究者们带来丰富的信息，但研究者们通宵达旦阅读文献也不及文献的增长速度。因此自动从生物医学文献中提取和组织信息的系统变得越来越重要。抽取的这些信息能帮助研究者处理信息、系统地阐述生物模型、提...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：杨黎 导师：周艳红 华中科技大学 计算机科学与技术 计算机应用技术（博士） 2013年
【摘要】 生物医学领域的文献记录展现了该领域内的大量成果和实验发现。生物医学文本挖掘技术作为研究热点之一,可以快速有效地在海量的文献中获取相关知识。生物医学文本挖掘技术包括信息检索、文本分类、命名实体识别、关系抽取、假设生成等。随着基因技术的飞速发展...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【会议论文】王秀艳 中华医学会第十七次全国医学信息学术会议 2011年
【摘要】 随着生物医学领域研究的飞速发展，生物医学文献正在以指数增长。截止到2011年5月国际上生物医学领域的权威数据库MEDLINE已经含有2000多万条记录，并且每年仍以约60万条记录的速度增长。但是，人们对生物医学数据处理和分析的进度却远远落后...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：吴明智 导师：崔雷 中国医科大学 图书馆、情报与档案管理 情报学（硕士） 2010年
【摘要】
目的：
生物医学研究的快速发展以及电子型数据的出现，使人们陷入了数据的海洋之中，这成为人们探索生物医学实体之间关系的瓶颈。同时，在临床上，药物不良反应导致的死亡和用药不当导致的住院和门诊费急剧升高也成为临床安全合理用药面临的主...
- 概要：
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【会议论文】张庆 中华医学会第十五次全国医学信息学术会议 2009年
【摘要】 随着基因组学、蛋白组学、代谢组学的研究发展，生物医学文献的数量迅猛增长。如何在如此数量庞杂的文献中找到我们需要的信息？这为生物医学信息工作者提出了机遇和挑战。文本挖掘的出现为准确快捷的发现我们需要的信息提供了有效途径。本文的主要目标就是尝试...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：张庆 导师：崔雷 中国医科大学 公共卫生与预防医学 流行病与卫生统计学（硕士） 2009年
【摘要】 目的：随着基因组学、蛋白组学、代谢组学的研究发展，生物医学文献数量迅猛增长，如何在如此数量庞杂的文献中准确快捷得找到我们需要的信息？文本挖掘的出现为我们提供了这种可能。如何对文本挖掘得到的语义信息(如规则等)进行合理的表示和有效的组织，并为...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：张浩 导师：崔雷 中国医科大学 公共卫生与预防医学 流行病与卫生统计学（硕士） 2008年
【摘要】 目的: 生物医学文献数量的爆炸式增长为文本挖掘提出了问题和挑战，期刊网络版及网络数据库的出现为文本挖掘提供了广阔的舞台。文本挖掘就是从非结构化文本信息中获取用户感兴趣或者有用的知识或模式的过程，它涵盖了信息技术、文本分析、统计学、...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：黄凯峰 导师：何洁月 东南大学 计算机科学与技术 计算机应用（硕士） 2008年
【摘要】 随着生物医学领域的快速发展，积累了海量的文本数据。为了对这些信息进行有效地知识发现，文本挖掘技术越来越受到人们的关注。然而，传统的文本挖掘方法应用在生物医学文本数据中存在着很多的不足，例如传统关联规则挖掘算法无法识别文本中共现词之间的重要联...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：张丹 导师：孙啸 东南大学 生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2008年
【摘要】 近年来关于基因功能、基因和疾病关系的生物医学文献大量涌现,但因其数量之多、涉及范围之广,很难靠人力完成全部的阅读来发现其中丰富的生物学知识。同时,从事基因疾病课题的研究人员,要通过大量的实验和临床数据分析才能得到出课题结论或预测,研究周期长...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：刘春艳 导师：胡铁军 中国协和医科大学;中国医学科学院 北京协和医学院;清华大学医学部 公共管理 医学信息资源管理与利用（硕士） 2005年
【摘要】 生物医学工程学，是20世纪50年代以来，随着电子学、材料学、信息科学和电子计算机等多种学科的进步并广泛应用于医学和生物学领域而逐渐形成和发展的，是生物学、工程学和医学紧密相结合的一个交叉学科。其为医学创造出来的新技术、新方法、新材料、新.....
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 肖欣怡 吴诚堃 等 《中南药学》 2022年20卷12期 2722-2728页ISTICCA
【摘要】 目的 对海量文献进行智能挖掘分析,从非结构化文本中提取微生物与药物相互作用关系.方法 首先,通过命名实体识别方法,定位生物医学文献中的微生物与药物实体,在此基础上,通过专家标注构建微生物-药物相互作用的金标准数据集;其次,构建基于大规模预训...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张志华 郑光 等 《中成药》 2014年36卷1期 52-55页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用文本挖掘总结痰热清注射液临床应用特点.方法 从中国生物医学文献服务系统中收集痰热清注射液文献,采用基于敏感关键词频数统计的数据分层算法,挖掘数据集中相关症状、证候、疾病,并形成网络图.结果 临床痰热清注射液多联合使用;痰热清注射液...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郭洪涛 郑光 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2013年3期 535-538页ISTICPKUCSCD
【摘要】 六味地黄丸是中医临床经典用药，对于总结及拓展其适应症具有重要意义。本研究从中国生物医学文献服务系统中收集六味地黄丸文献数据，采用基于敏感关键词频数统计的数据分层算法，挖掘数据集中相关症状。结果发现，六味地黄丸除传统认识的适应症外，潜在适应症...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张琳琳 郭洪涛 等 《中国中西医结合杂志》 2013年33卷7期 883-889页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探索参麦注射液临床应用规律.方法 应用文献检索方法检索(1980年1月-2012年5月)中国生物医学文献数据库收集参麦注射液文献数据,采用基于关键词频数统计的数据分层算法,挖掘数据集中证型、疾病、症状、中成药、西药等方面.挖掘结果通过...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周奇 陈威妮 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2012年14卷1期 1288-1293页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的:利用文本挖掘技术,探索中、西医治疗骨质疏松症的用药规律,以及中成药与西药联合应用情况.方法:在中国生物医学文献数据库(CBM)中收集治疗骨质疏松症的相关文献,建立Microsoft Access(R)数据库,运用Microsoft S...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕诚 王永炎 等 《北京中医药大学学报》 2012年35卷5期 297-302页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究手足口病中西医治疗规律.方法 在中国生物医学文献服务系统中收集治疗手足口病文献数据,采用基于敏感关键词频数统计的数据分层算法,挖掘数据集中证候、症状、中药,以及中成药和西药联用规律.这些结果通过一维频次及构建网络图进行展示.结果 ...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 郭洪涛 吕爱平 等 《北京中医药大学学报》 2012年35卷1期 29-32页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用文本挖掘技术探索西药、中成药治疗再生障碍性贫血的规律.方法 在中国生物医学文献数据库中收集治疗再生障碍性贫血的相关文献,建立Access数据库,运用SQL数据平台处理数据,并结合人工降噪,分析西药、中成药的用药规律.结果 司坦唑醇...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王妍 郑光 等 《中国实验方剂学杂志》 2012年18卷9期 286-289页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用文本挖掘技术探索西药、中成药对慢性盆腔炎(chronic pelvic inflammation,CP1)的治疗规律.方法:在中国生物医学文献数据库(CBM)中收集治疗CPI的相关文献,运用大型数据库(SQL)对数据进行处理,结合...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郭洪涛 郑光 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2011年13卷5期 772-776页ISTICPKUCSCD
【摘要】 从中国生物医学文献数据库(CBM)中检索治疗甲型H1N1流感的文献数据,针对半格式化的原始数据,进行格式化转换,存储于大型关系型数据库；针对格式化的数据,采用基于敏感关键词频数统计的离散导数算法,对文献数据进行挖掘处理；针对文本挖掘的结果,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李立 周奇 等 《中国实验方剂学杂志》 2011年17卷24期 228-231页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用文本挖掘技术探索中成药、西药对慢性胃炎的治疗规律.方法:在中国生物医学文献数据库(CBM)中收集治疗慢性胃炎的相关文献,建立Access数据库,运用SQL对数据进行处理,结合人工降噪,分析中成药、西药对再障的治疗用药规律.结果:四...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄允瑜 陈慕芝 等 《中国实验方剂学杂志》 2011年17卷9期 236-238页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用数据挖掘技术探索肥胖和高脂血症的中药用药规律.方法:在中国生物医学文献数据库中收集中医药治疗"肥胖"和"高脂血症"的文献,建立Access数据库,运用SQL对数据进行处理,Cytoscape 2.7软件对数据分析结果进行可视化,分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈威妮 姜淼 等 《中国实验方剂学杂志》 2011年17卷21期 299-302页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用文本挖掘技术,探索中成药、西药治疗2型糖尿病的用药规律以及中成药与西药联合应用情况.方法:在中国生物医学文献数据库(CBM)中收集治疗2型糖尿病的相关文献,建立Access数据库,运用SQL对数据进行处理,结合人工降噪后,分析中成...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕毅斌 李立 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2010年12卷5期 833-836页ISTICPKUCSCD
【摘要】 本研究以中国生物医学文献数据库为载体,类风湿性关节炎、痛风及骨性关节炎为研究对象,采用数学和统计的方法,获取高频率、协同出现的关键药对,探寻中医治疗这3种疾病的用药规律.结果显示,当归、黄芪、桂枝、芍药等为中药治疗类风湿性关节炎核心药物.牛...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张智 张正国 《中国生物医学工程学报》 2010年29卷5期 704-709页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 生物学实体映射就是要实现对基因、蛋白质、小分子物质、化合物和药物等实体的不同标识符和名称之间的相互转换.生物学实体映射可以帮助生物医学研究者将实验结果关联到海量的在线生物医学数据资源,并为生物医学文本挖掘和信息检索的研究者在命名实体识别和查...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 丁晓蓉 吕毅斌 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2010年12卷5期 828-832页ISTICPKUCSCD
【摘要】 方剂可以概括为中医辨证论治体系的数据集合,文本挖掘技术可将隐含在数据中的配伍规律以可理解方式进行表述.本研究选择中国生物医学文献数据库为载体,类风湿性关节炎(RA)、强直性脊柱炎(AS)、溃疡性结肠炎(UC)和哮喘(Asthma)4种自身免...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李毅 余锦凤 等 《北京大学学报（医学版）》 2009年41卷2期 230-234页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过构建神经信息学本体,为神经信息学研究提供良好的信息整合、知识表示、文本挖掘、智能教育和数据共享服务.方法:分析生物医学领域已有的统一医学语言系统、基因本体、癌症本体、解剖学本体、疾病本体和药物本体的结构和内容,对神经信息学领域专业...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郭德海 郑光 等 《中国中医药信息杂志》 2019年26卷10期 101-104页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用文本挖掘技术总结慢性咳嗽的中医诊治规律.方法 收集中国知识资源总库(CNKI)、中文科技期刊数据库(维普网)、中国学术期刊数据库(万方数据)、中国生物医学文献数据库(CBM)中治疗慢性咳嗽的文献,建立数据库,运用结构化查询语言处理...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨静 谭勇 等 《时珍国医国药》 2013年24卷10期 2545-2547页PKUCSCDCA
【摘要】 目的 使用文本挖掘方法分析治疗哮喘的临床用药规律.方法 在中国生物医学文献数据库中采集治疗哮喘的相关文献,建立Access数据库,运用SQL对数据进行处理,结合人工降噪,分析中药、中成药、西药及中西药联用治疗哮喘的用药规律.结果 检索到文献...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周永称 崔雷 《中华医学图书情报杂志》 2017年26卷3期 15-19页ISTICCA
【摘要】 为了解生物医学文本挖掘技术在基因组注释方面的基本应用,以Web of Science(WOS)数据库中收录的关于生物医学文本挖掘技术在基因组注释方面的基本应用的文献作为来源文献,利用书目共现分析软件提取文献中的高被引论文,形成来源文献——高...
- 概要：
- 方法：
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