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          【学位论文】 作者:庞尔丽导师:林魁   北京师范大学   生态学 生态学(硕士) 2008年

          【摘要】 随着计算机技术与测序技术的发展,越来越多的物种已经被测序,但是由于测序与注释的不同步性,使得对蛋白质的分类越来越重要,而现有的蛋白质分类数据库大部分是基于序列相似性基础上的,这种分类方法对于多结构域的蛋白质分类会存在一定的缺陷,因为研究发现...

          【关键词】 蛋白质分类结构架构

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          【学位论文】 作者:邓立宗导师:蒋太交   中国科学院大学   生物学 生物信息学(博士) 2014年

          【摘要】 蛋白质的结构域是蛋白质结构、功能和进化的基本单元,因此,深刻的理解蛋白质结构域是如何组织的,对于我们认识蛋白质非常关键。之前已经一系列的工作尝试着去寻找在蛋白质结构域中起到关键作用的残基。但我们知道,蛋白质架构的一个重要特征就是二级结构元件...

          【关键词】 结构架构堆积簇

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          【学位论文】 作者:孙清岚导师:林魁   北京师范大学   生物学 生物信息学(硕士) 2005年

          【摘要】 生物体中绝大多数蛋白是多结构域蛋白。结构域是一个蛋白质中结构、功能和进化的基本单位。结构域之间的不同排列组合形成结构域架构,架构的变化基本反映了多结构域蛋白质的进化过程。本研究通过结构域架构查询系统(PDART)找到5组不同结构域架构的Rh...

          【关键词】 蛋白结构结构架构

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          【学位论文】 作者:朱蕾导师:林魁   北京师范大学   生态学 生态学(博士) 2008年

          【摘要】 蛋白质的相似性比对方法通常被用于蛋白质的比较和分类,以此注释和理解功能未知的蛋白质。然而自然界中大量的多结构域蛋白质往往降低了这些传统比较方法的有效性,因为由于某些广泛存在的结构域,在比对过程中经常将许多非同源关系的蛋白质连接起来或者产生信...

          【关键词】 蛋白质结构信息过剩

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