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            【中文期刊】 刘钦玲  赵余静  等 《山东第二医科大学学报》 2024年46卷5期 369-372,后插3-后插4页

            【摘要】 目的 分析人同源盒基因D8(HOXD8)在脑胶质瘤中的表达特征,探讨其与肿瘤进展、患者生存预后以及免疫微环境的关系.方法 整合TCGA数据库中的胶质瘤样本数据,进行生物信息学分析,研究HOXD8的表达模式,通过实时荧光定量PCR验证其在胶质...

            【关键词】 同源盒基因D8脑胶质瘤TCGA数据库

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            【中文期刊】 李睿哲  薛军帅  等 《肝胆胰外科杂志》 2022年34卷7期 406-413页ISTICCA

            【摘要】 目的 构建"免疫相关lncRNA基因对"模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后并分析不同组别肿瘤免疫微环境特征及药物敏感性.方法 从XENA数据库获取肝细胞肝癌样本正常肝脏样本的RNA-seq数据,筛选出未发生远处转移的原位肝癌样本,提取免疫...

            【关键词】 肝细胞肝癌肿瘤预后癌症基因组图谱数据库(TCGA)

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            【中文期刊】 马涛  陶润  等 《蚌埠医学院学报》 2022年47卷6期 811-817页ISTICCA

            【摘要】 目的:探究膀胱癌(BC)中基因的差异化表达及其预后作用.方法:从TCGA数据库中下载BC的基因表达数据,利用R软件筛选出肿瘤与正常组织间差异表达基因,并进行富集分析,评估其潜在生物学功能及信号通路.利用在线数据库STRING11.0构建了编...

            【关键词】 膀胱肿瘤TCGA数据库基因

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            【中文期刊】 李鑫  李梦玮  等 《遗传》 2019年41卷3期 234-242页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 随着二代测序技术的快速发展,数据量不断累积,肿瘤学家的目光逐渐由多物种测序转移至高通量测序数据的分析和比对.基因数据分析方法层出不穷,高通量的组学分析手段不断优化和创新,基因数据的挖掘和分析工作正处于飞速发展的时期.以肿瘤病人样本为核心的数...

            【关键词】 基因数据TCGA数据库肿瘤

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            【中文期刊】 王维杰  赵森峰  等 《肝胆胰外科杂志》 2021年33卷9期 533-538页ISTICCA

            【摘要】 目的 通过生物信息学分析LAMA3的表达对胰腺癌预后的诊断价值及其与肿瘤临床特征的相关性.方法 从TCGA和GEO数据库分别下载胰腺癌转录组及临床数据,R软件用于数据处理和分析.首先明确LAMA3的差异表达,继而Kaplan-Meier分析...

            【关键词】 胰腺癌LAMA3生物信息学分析

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            【中文期刊】 杜强  姚义勇  等 《癌变·畸变·突变》 2020年32卷6期 457-463页ISTICCA

            【摘要】 目的:探讨异常纺锤体样小头畸形相关基因(ASPM)在肺腺癌中的表达水平,及其与患者临床病理指标和预后的关系.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肺腺癌组织和癌旁组织mRNA表达水平和临床病例资料,比较ASPM mRNA在癌组织和癌旁...

            【关键词】 异常纺锤体样小头畸形相关基因肺腺癌肿瘤标志物

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            【中文期刊】 贾晓晨  贾勇圣  等 《天津医药》 2018年46卷8期 856-861页MEDLINEISTICCA

            【摘要】 目的 利用TCGA数据库建立预测乳腺癌预后的多基因预后模型,分析多基因预后模型与乳腺癌各临床病理特征之间的关系.方法 对TCGA数据库中乳腺癌患者的mRNA数据进行整理,通过R语言软件筛选出在乳腺癌样本及正常样本中差异表达的基因,采用Cox...

            【关键词】 乳腺肿瘤预后基因

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            【中文期刊】 曹晓东  项承  《精准医学杂志》 2025年40卷2期 153-157页

            【摘要】 目的 探讨血小板结合蛋白基序的解聚蛋白样金属蛋白酶-9(ADAMTS9)对甲状腺癌(thyroid can-cer,THCA)患者预后的影响及其潜在作用机制.方法 从TCGA数据库获取THCA组织中ADAMTS9表达水平及患者临床资料,HP...

            【关键词】 甲状腺肿瘤ADAMTS9蛋白质基因表达

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            【中文期刊】 陶润  李文永  等 《蚌埠医学院学报》 2024年49卷3期 335-339,343页ISTICCA

            【摘要】 目的:研究前列腺癌中关键基因的差异化表达,为前列腺癌的诊疗提供新的生物治疗靶点和理论依据.方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载前列腺癌的相关基因数据,利用R软件筛选出在前列腺癌组织和癌旁组织中差异化表达的基因,并进行富集分析.利用S...

            【关键词】 前列腺肿瘤癌症基因组图谱Oncomine数据库

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            【中文期刊】 李伟  程丰  等 《现代泌尿外科杂志》 2024年29卷1期 46-50,68页ISTICCA

            【摘要】 目的 基于美国癌症肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析铜调节的细胞死亡相关基因与前列腺癌患者预后和免疫细胞浸润的关系.方法 从TCGA数据库下载所有前列腺癌患者的基因数据,其中包括前列腺癌组织 ...

            【关键词】 前列腺癌铜调节的细胞死亡肿瘤微环境

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            【中文期刊】 刘双环  马怡茗  等 《中华肿瘤杂志》 2023年45卷1期 64-73页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:探讨蛋白酶活化受体2(PAR2)在卵巢上皮性癌中的表达及意义。方法:收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库(410例卵巢上皮性癌患者)和组织基因型表达(GTEx)数据库(88例正常人)中PAR2 mRNA的表达水平。收集2009—201...

            【关键词】 卵巢恶性肿瘤蛋白酶活化受体2癌症基因组图谱数据库

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            【中文期刊】 何明阳  张旭辉  等 《精准医学杂志》 2024年39卷4期 346-351页

            【摘要】 目的 基于相关数据库分析筛选肝细胞癌(HCC)脂质代谢相关转移风险基因,并联合其他临床危险因素构建患者的预后预测模型.方法 应用R软件从GEO数据库中获得原发性和转移性HCC患者的差异表达基因(DEGs),并筛选与患者预后相关的DEGs.将...

            【关键词】 癌,肝细胞肿瘤转移脂类代谢

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            【中文期刊】 汪洋  朱娅  《中国基层医药》 2023年30卷1期 21-29页ISTICCA

            【摘要】 目的:探讨N6-甲基腺嘌呤(m 6A)在结直肠癌组织中表达及临床意义。 方法:2021年9月至2021年12月,利用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)对结直肠癌中m 6A相关调控因子的表达进...

            【关键词】 结直肠肿瘤n6-呋喃甲基腺嘌呤蛋白甲基转移酶类

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            【中文期刊】 汤乘  瞿根义  等 《国际泌尿系统杂志》 2023年43卷1期 25-30页ISTIC

            【摘要】 目的:基于TCGA数据库挖掘出肾上腺皮质腺癌(ACC)发病相关的关键基因,为以后ACC相关的基础以及临床研究提供重要参考依据。方法:从TCGA数据库获取150例ACC样本和3例癌旁正常组织样本,利用R语言软件进行差异表达分析,利用DAVID...

            【关键词】 肾上腺肿瘤TCGA数据库基因

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            【中文期刊】 冯豆  张洪  等 《生物医学工程与临床》 2023年27卷1期 97-104页ISTICCA

            【摘要】 目的 TMEM164是TMEM家族的一员,实验基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和Oncomine数据库评估了 TMEM164在肝细胞癌中表达及临床意义.方法 从GDC Data Portal网站(https://portal.gdc.canc...

            【关键词】 TMEM164肝细胞癌肿瘤基因组图谱(TCGA)

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            【中文期刊】 李彬  普元倩  等 《中华劳动卫生职业病杂志》 2022年40卷7期 487-494页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:探讨恶性胸膜间皮瘤(MPM)组织的Ⅰ型胶原蛋白α1链(COL1A1)和Ⅰ型胶原蛋白α2链(COL1A2)基因的表达水平及临床意义。方法:于2020年1月,收集26例MPM患者的MPM组织及相邻的正常胸膜组织,采用定量反转录PCR测定组...

            【关键词】 间皮瘤恶性胸膜间皮瘤Ⅰ型胶原蛋白α1链

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            【中文期刊】 王杨淑怡  叶威  等 《检验医学》 2023年38卷9期 833-841页ISTICCA

            【摘要】 目的 基于生物信息学方法构建肺腺癌(LUAD)-细胞焦亡基因预后风险模型,探讨LUAD与细胞焦亡的关系.方法 从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载LUAD患者的转录组数据(TCGA队列)和临床资料,采用limma程序包鉴别差异表达的焦亡基...

            【关键词】 细胞焦亡基因肺腺癌肿瘤基因组图谱数据库

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            【中文期刊】 宋春红  甄娟  等 《中华肿瘤防治杂志》 2021年28卷2期 137-143页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 采用美国肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库免疫基因表达谱构建宫颈鳞状细胞癌免疫亚型,并分析各免疫亚组特征,为宫颈鳞状细胞癌预后分析及治疗提供新指标.方法 TCGA数据库共下载253例宫颈鳞状细胞癌及3例癌旁正常组织的mRNA表达谱及临床...

            【关键词】 免疫,肿瘤TCGA数据库宫颈鳞状细胞癌

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            【中文期刊】 《浙江大学学报(英文版)(B辑:生物医学和生物技术)》 2019年20卷11期 928-932页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 目的:研究肝癌细胞缺氧微环境导致miR-210表达变化与肿瘤进展、预后等相关性.创新点:首次阐明了miR-210表达与肝癌预后及缺氧相关基因的关系.方法:选取肿瘤基因数据库(TCGA)中424位肝癌患者的miR-210表达水平、临床病理参数...

            【关键词】 miR-210肿瘤基因数据库(TCGA)肝细胞癌(HCC)

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            【中文期刊】 解宸一  杨亚楠  等 《精准医学杂志》 2023年38卷1期 73-76,80页

            【摘要】 目的 探讨生长因子受体结合蛋白2(GRB2)基因在肾癌中的表达及其对患者预后的影响.方法 挖掘ONCOMINE数据库中肾癌GRB2基因相关数据进行基因表达分析,结合在TCGA数据库中挖掘的GRB2基因在肾癌组织和正常组织中的表达差异,获得G...

            【关键词】 肿瘤GRB2衔接蛋白质预后

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            【中文期刊】 张学明  王惠  等 《精准医学杂志》 2023年38卷4期 294-299页

            【摘要】 目的 制备小鼠 Lewis肺癌(Lewis lung carcinoma,LLC)全细胞疫苗,并探讨该疫苗在提高C57BL/6N 小鼠免疫系统对抗 LLC方面的作用.方法 利用TCGA数据库分析MYC扩增背景下人类肺腺癌(lung ade-...

            【关键词】 肿瘤肿瘤微环境基因,MYC

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            【中文期刊】 路惠茹  耿辉  等 《医学新知》 2025年35卷3期 319-327页ISTICCA

            【摘要】 目的 筛选膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)预后相关甲基化相关基因,并探讨其在BLCA预后中的价值.方法 从TCGA数据库下载BLCA项目的样本数据,GeneCards数据库获取相关评分大于...

            【关键词】 膀胱尿路上皮癌甲基化相关基因TCGA

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            【中文期刊】 张海佳  陈思  等 《局解手术学杂志》 2025年34卷5期 395-400页ISTIC

            【摘要】 目的 探讨MT-ND家族在泛癌中的异常表达及其预后价值.方法 从TCGA数据库下载33种癌症类型的转录组表达和临床信息数据,分析不同癌症类型中MT-ND家族在癌组织与正常组织中的表达差异.采用单因素Cox回归分析和Kaplan-Meier生...

            【关键词】 MT-ND家族泛癌TCGA

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            【中文期刊】 汤晓佳  赵文虎  等 《现代肿瘤医学》 2024年15期 2746-2752页ISTICCA

            【摘要】 目的:通过癌症基因组图谱筛选乳头状甲状腺癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)的预测标记物并通过基础实验研究标记基因,筛选出甲状腺乳头状癌预测指标,进一步指导流行病学筛查.方法:我们从The Cancer Ge...

            【关键词】 甲状腺乳头状癌TCGA基因

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            【中文期刊】 卫鑫  吴波  等 《安徽医药》 2024年28卷9期 1801-1805页ISTICCA

            【摘要】 目的 构建基于铜代谢相关基因和临床病理学特征的新型肾透明细胞癌(ccRCC)预后模型.方法 2022年6月至2023年1月从基因集数据库(MSigDB)5.1版整理出铜代谢相关基因,应用癌症基因组图谱(TCGA)中ccRCC数据对获取的铜代...

            【关键词】 肾透明细胞癌铜代谢基因

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            【中文期刊】 黄凯  郭俊峰  等 《重庆医学》 2024年53卷22期 3435-3440页MEDLINEISTICCA

            【摘要】 目的 构建并验证口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者铜死亡相关基因预后风险模型.方法 在肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中下载OSCC患者临床及转录组数据,筛选出OSCC患者铜死亡相关基因,使用共表达分析、Wilcoxon秩和检验、Cox分析和A...

            【关键词】 铜死亡口腔鳞状细胞癌TCGA数据库

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            【中文期刊】 李妮  吴文娟  《东南大学学报(医学版)》 2024年43卷4期 540-547页ISTICCA

            【摘要】 目的:分析热休克蛋白家族 H(Hsp110)成员 1[heat shock protein family H(Hsp110)member 1,HSPH1]在宫颈癌组织中的表达及其与预后的相关性.方法:收集2018年2月至2021年1月首次确...

            【关键词】 热休克相关蛋白宫颈癌预后

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            【中文期刊】 侯娟  滕长财  等 《右江医学》 2024年52卷2期 133-138页

            【摘要】 目的 研究肿瘤基因图谱(TCGA)数据库中酰基辅酶A合成酶中链家族成员 3(ACSM3)在 357 例卵巢癌患者中的表达量及其与患者生存状况的关系.方法 对TCGA数据库中 357 例卵巢癌患者的ACSM3 表达量及其与生存情况的关系进行分...

            【关键词】 酰基辅酶A合成酶中链家族成员3肿瘤基因图谱预后

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            【中文期刊】 李海昆  《首都食品与医药》 2024年31卷20期 8-11页

            【摘要】 目的 探讨FBLIM1基因在人脑胶质瘤组织中表达、相关生物学功能、信号通路及其与患者预后的相关性.方法 癌症基因组图谱数据库(TCGA)中检索FBLIM1在人脑胶质瘤组织中表达情况,分析比较胶质瘤患者肿瘤组织与正常脑组织中FBLIM1 mR...

            【关键词】 胶质瘤FBLIM1基因生物信息

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            【中文期刊】 李鹏  《首都食品与医药》 2024年31卷23期 14-17页

            【摘要】 目的 采用生物信息分析方法探讨SHP-1基因在卵巢癌中的表达、信号通路和预后关系.方法 在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中检索SHP-1基因,分析SHP-1基因在人实体肿瘤中的表达情况.应用相互作用基因/蛋白在线检索工具(STRING)建...

            【关键词】 卵巢癌TCGA数据库SHP-1基因

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            【中文期刊】 赵雅  赵楠  等 《安徽医科大学学报》 2023年58卷8期 1354-1360页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 运用癌症基因组图谱(TCGA)测序数据研究钾离子通道四聚体结构域7(KCTD7)基因在肝细胞癌(HCC)中的表达、作用机制及其临床意义.方法 TCGA数据库中下载HCC患者的RNA测序数据及临床信息.单因素和多因素Cox回归分析探究K...

            【关键词】 肝细胞癌KCTD7TCGA

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            【中文期刊】 梁金容  张雅文  等 《安徽医科大学学报》 2023年58卷1期 37-41页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 研究CD155/TIGIT在骨肉瘤患者中的表达及其意义.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析骨肉瘤远处转移患者和非转移患者肿瘤组织中CD155及TIGIT的表达差异,并收集骨肉瘤患者手术切除组织制备病理切片和组织芯片,采用H...

            【关键词】 骨肉瘤CD155/TIGITTCGA数据库

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            【中文期刊】 孙纪威  陈广进  等 《华中科技大学学报(医学版)》 2023年52卷3期 283-291页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 利用生物信息学方法探讨HPV在口咽癌发生发展中的作用及其机制.方法 将甲基化微阵列数据及转录组数据结合患者临床信息联合分析,解析口咽癌中HPV诱导的甲基化驱动基因及其生物学功能.结果 富集分析显示HPV+口咽癌患者的免疫活动明显激活,...

            【关键词】 口咽癌甲基化TCGA数据库

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            【中文期刊】 徐龙文  聂元华  等 《西安交通大学学报(医学版)》 2023年44卷5期 755-763页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 筛选和鉴定具有预测胃癌肿瘤突变负荷(TMB)分类的微小 RNA(microRNAs),从而为胃癌患者免疫治疗提供参考依据.方法 从TCGA数据库中下载胃癌肿瘤样本的 mRNA、microRNA 表达谱数据和体细胞突变数据.利用 R语言...

            【关键词】 胃癌肿瘤突变负荷微小RNA

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            【中文期刊】 赵作梁  吴奕隆  等 《重庆医科大学学报》 2023年48卷1期 71-75页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:探究生物钟相关基因在原发性肝细胞癌(简称肝癌)中的表达及意义.方法:从美国癌症和肿瘤基因图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中下载肝癌数据424例,包括374例肝癌患者样本及50例正常对照样本.运用D...

            【关键词】 原发性肝细胞癌生物钟基因TCGA

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            【中文期刊】 管波  单卫民  等 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2023年15卷4期 203-207页ISTIC

            【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)及药物基因组学(CMap)数据库筛选膀胱尿路上皮癌(BLCA)潜在的治疗药物,为BLCA的药物治疗提供新的思路.方法 提取TCGA数据库中BLCA患者和BLCA转录组的临床数据,通过 WGCNA分析,选择...

            【关键词】 膀胱尿路上皮癌TCGA数据库CMap数据库

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            【中文期刊】 胡洁  高峰  等 《现代肿瘤医学》 2023年31卷22期 4162-4166页ISTICCA

            【摘要】 目的:探讨基础转录因子 3(basic transcription factor 3,BTF3)在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)组织中的表达及其与PINCH的相关性.方法:采用免疫组织化...

            【关键词】 BTF3PINCH口腔鳞状细胞癌

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            【中文期刊】 杨晶  李玲玉  等 《北京口腔医学》 2023年31卷1期 18-22页ISTICCA

            【摘要】 目的 通过在线数据库分析鸟苷三磷酸结合蛋白4(GTP binding protein 4,GTPBP4)在头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)患者组织中的表达及临床意义....

            【关键词】 头颈部鳞状细胞癌鸟苷三磷酸结合蛋白4TCGA

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            【中文期刊】 蔡慧欣  项思博  等 《肝胆胰外科杂志》 2023年35卷6期 366-373页ISTICCA

            【摘要】 目的 探究VAVs家族基因在肝细胞癌(HCC)患者中的表达水平及其在预后中的临床价值,并基于阳性作用基因建立肝癌的预后预测模型.方法 从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中下载并提取342例HCC癌组织和50例癌旁组织中VAVs家族基因mRN...

            【关键词】 肝癌VAVs家族基因肿瘤基因组图谱(TCGA)

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            【中文期刊】 谢琛  许晨  等 《实用癌症杂志》 2023年38卷12期 1956-1962,1967页ISTIC

            【摘要】 目的 探讨肿瘤突变负荷(TMB)在评估非小细胞肺癌(NSCLC)免疫治疗预后中的价值以及TMB与免疫浸润之间的关系.方法 从TCGA数据库中分别下载肺腺癌(LUAD)及肺鳞癌(LUSC)患者体细胞基因突变数据、转录组数据及临床数据.根据突变...

            【关键词】 肺腺癌TCGA数据库肿瘤突变负荷

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            【中文期刊】 陈晓超  卜恒涛  等 《南京医科大学学报(自然科学版)》 2022年42卷7期 983-993页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:利用肿瘤基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的数据,构建m5C甲基化相关基因组成的生存预后模型,分析与肾透明细胞癌生存有关的独立预后影响因素以预测肾透明细胞癌患者的预后.方法:从TCGA数据库...

            【关键词】 肾透明细胞癌m5C-RNA甲基化生存预后模型

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            【中文期刊】 李坤  韩娜  等 《医学信息》 2023年36卷7期 1-8页

            【摘要】 目的 探讨Discs大同源物关联蛋白5(DLGAP5)表达在肾透明细胞癌(KIRC)中的作用.方法 基于癌症基因组图谱(TCGA)分析KIRC中DLGAP5的表达情况与临床参数之间的相关性.应用比例风险(Cox)回归模型和Kaplan-Me...

            【关键词】 DLGAP5CD8+T细胞KIRC

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            【中文期刊】 高红叶  陈永霞  等 《中国医药科学》 2023年13卷3期 4-8页

            【摘要】 目的 研究FDCSP通过调节肿瘤微环境(TME)中免疫细胞的浸润进而影响晚期肺鳞癌预后.方法 本研究数据来源于TCGA数据库肺鳞癌数据集,下载时间为2022年4月.主要分析FDCSP表达与晚期肺鳞癌预后的相关性.利用基因集富集分析(GSEA...

            【关键词】 TCGA晚期肺鳞癌FDCSP

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            【中文期刊】 卜培龙  曹灵光  等 《河南大学学报(医学版)》 2023年42卷1期 28-33页CA

            【摘要】 目的:检测纺锤体极体组件 25 同族体(SPC25)在肝细胞癌(HCC)中的表达及预后价值.方法:下载癌症基因组图谱(TCGA)中肝细胞癌组织和正常肝组织样本的基因表达谱数据和临床数据,比较SPC25 在肝细胞癌组织和正常肝组织中的表达,并...

            【关键词】 肝细胞癌TCGASPC25

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            【中文期刊】 李语琦  李云  《智慧健康》 2023年9卷19期 31-35页

            【摘要】 肝癌是常见的消化系统恶性肿瘤,是世界第三及我国第二大死亡原因;然而,肝癌的发病机制尚未被完全解析.本研究基于各类癌症基因组学图谱数据(即TCGA数据库)分析筛选肝癌相关标记基因,共获取肝癌及正常样品mRNAgenome信息26条;包含XX个...

            【关键词】 肝癌TCGA数据库CDK1基因

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            【中文期刊】 蒋逆立  张蝶  等 《数理医药学杂志》 2023年36卷9期 641-649页CA

            【摘要】 目的 探索结核通路相关基因表达差异与肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)预后及肿瘤免疫微环境的关系,判别结核合并LUSC的预测基因和免疫因子,寻找新的治疗靶点.方法 基于京都基因与基因组百科全书...

            【关键词】 结核肺鳞状细胞癌基因

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            【中文期刊】 占天鹏  张勐  等 《现代医药卫生》 2023年39卷13期 2174-2180页

            【摘要】 目的 探讨胃癌肿瘤微环境中差异表达基因与胃癌预后的关系.方法 基于TCGA数据库中胃癌基因数据,筛选与基质细胞和免疫细胞相关的差异表达基因,对差异表达基因进行基因本体论富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,分析差异表达基因与胃癌预后的关...

            【关键词】 胃癌肿瘤微环境预后

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            【中文期刊】 黄恒彬  《医学理论与实践》 2023年36卷13期 2166-2170页

            【摘要】 目的:采用生物信息学数据库癌症基因组图谱(TCGA)分析miRNA-151a-3p在食管癌(ESCA)中的表达情况及临床意义,研究miRNA-151a-3p在ESCA中与免疫细胞浸润的相关性.方法:样本下载:从TCGA数据库下载 182 例...

            【关键词】 miRNA-151a-3p食管癌癌症基因组图谱

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            【中文期刊】 阳建超  程兆瑞  等 《南昌大学学报(医学版)》 2022年62卷3期 11-17,28页ISTIC

            【摘要】 目的 探索DNA聚合酶α亚基B(POLA2)在肝癌中的表达,分析POLA2表达与肝癌患者临床病理特征和预后的关系.方法 利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库和qRT-PCR技术分析POLA2在肝癌组织及肝癌细胞中的表达水平,利用人类蛋白表达...

            【关键词】 肝癌DNA聚合酶α亚基B表达TCGA数据库

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            【中文期刊】 罗雪颜  王光明  《海南医学》 2022年33卷7期 837-844页ISTICCA

            【摘要】 目的 从TCGA数据库中探究肿瘤突变负荷(TMB)与膀胱癌的相关性,有助于膀胱癌免疫机制的深入研究,为膀胱癌的免疫治疗提供更多的预测信息和机会.方法 对从TCGA数据库获取的共443例膀胱癌样本进行突变分析、依据TMB表达高低进行分组,并分...

            【关键词】 膀胱癌TCGA数据库肿瘤突变负荷

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