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【中文期刊】 吴丹 高耀 等 《中草药》 2019年50卷8期 1818-1827页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 构建逍遥散单味药-成分-共有靶点网络、蛋白相互作用网络,探究逍遥散“异病同治”抑郁症和糖尿病的共同作用机制.方法 通过TCM database@Taiwan、TCMID、Batman-TCM数据库结合文献挖掘获取逍遥散的化学成分和作用...
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【中文期刊】 韦晓兰 《生物化学与生物物理进展》 2011年38卷4期 347-352页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 借助网络分析可对基因调控、蛋白质瓦作和信号转导等细胞活动进行全局和局部性质分析.以细胞黏附的蛋白质相互作用为对象,通过数据挖掘和可视化软件构建了整合蛋白介导的黏附分子互作网络,该分子互作网络由156种蛋白质通过690种相互作用相连,其平均节...
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【中文期刊】 杨倩 吕莉莉 等 《中草药》 2018年49卷11期 2606-2613页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨丹参川芎嗪注射液的药理作用机制.方法 预测丹参川芎嗪注射液中已知化学成分的作用靶点,构建丹参川芎嗪注射液化合物-靶点网络,并对网络进行拓扑分析;对丹参川芎嗪作用靶点构建蛋白互作网络(PPI),进行基因GO功能注释和KEGG通路富集...
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【中文期刊】 汪洋 夏亮 等 《中国口腔颌面外科杂志》 2019年17卷5期 397-402页ISTICCA
【摘要】 目的:筛选多形性腺瘤(pleomorphic adenoma,PA)与瘤旁唾液腺腺体间的差异表达基因,挖掘PA形成过程中的核心基因及通路.方法:采用RNA-Seq技术,检测5例PA患者的配对肿瘤与瘤旁唾液腺腺体,筛选2组间差异基因.运用蛋白...
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【中文期刊】 樊凌暄 田彩云 等 《中国医院药学杂志》 2024年44卷7期 802-809页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:运用网络药理学预测蒙药扎冲十三味丸抗缺血性脑卒中潜在作用机制,通过分子对接和动物实验进行初步验证.方法:运用TCMSP等数据库筛选扎冲十三味丸活性化学成分进行靶点预测和收集;运用OMIM等数据库获得疾病靶点,Venny获得交集靶点,构...
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【中文期刊】 李欠 尹转霖 等 《中草药》 2024年55卷4期 1167-1177页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立独活Angelicae Pubescentis Radix挥发油的高效提取方法,并预测其质量标志物(quality markers,Q-Marker).方法 采用水蒸气蒸馏法(steam distillation,SD)、微波辅助...
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【中文期刊】 史俊祖 王雪峰 等 《中国医院药学杂志》 2024年44卷19期 2195-2204页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探讨小儿定喘颗粒治疗支气管哮喘的药效物质基础与潜在作用机制.方法:采用超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOFMS)对小儿定喘颗粒中的化学成分及入血成分进行分析,结合PubChem、TCMSP、SwissTargetP...
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【中文期刊】 周箫 万雯 等 《环境与职业医学》 2024年41卷1期 34-40页ISTICPKUCSCD
【摘要】 [背景]慢性过量氟暴露会导致中枢神经系统出现损伤,造成一定程度的学习记忆功能损害,然而其损伤机制尚不明确,仍需进一步探究.[目的]应用 4D非标记定量蛋白质组学技术探究慢性过量氟暴露致大脑损伤的差异表达蛋白及其潜在的作用机制.[方法]选取S...
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【中文期刊】 舒莹莹 李海针 等 《中国医院药学杂志》 2023年43卷6期 644-650页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:通过UPLC-Q-TOF-MS技术检测在传统煎煮方法下参附汤的主要溶出成分,并结合网络药理学探究参附汤治疗慢性心力衰竭的作用靶点及机制.方法:采用UPLC-Q-TOF-MS技术对参附汤的主要溶出成分进行定性分析,并运用SwissTar...
【关键词】 参附汤;慢性心力衰竭;UPLC-Q-TOF-MS技术;
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【中文期刊】 王庭俊 肖根发 等 《中华高血压杂志》 2023年31卷4期 338-346页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用蛋白组学研究成年自发性高血压大鼠(SHR)肠系膜动脉血管重塑过程中的蛋白表达情况.方法 20周龄雄性Wistar-Kyoto(WKY)大鼠和SHR各15只,各随机选取6只进行三级肠系膜动脉的形态学检测,剩余各9只进行肠系膜三级动脉...
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【中文期刊】 杨柳 张王宁 等 《中草药》 2019年50卷8期 1828-1837页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 运用网络药理学的方法探讨黄芪治疗肾病综合征(NS)的分子作用机制.方法 通过TCMSP数据库和文献挖掘获取黄芪主要活性成分,利用PharmMapper服务器、GeneCards和CoolGeN数据库预测和筛选黄芪活性成分的作用靶点.采...
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【中文期刊】 徐文华 郑景辉 等 《中草药》 2019年50卷5期 1131-1140页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学和生物信息学方法分析丹参酮ⅡA治疗冠心病(CHD)的分子生物学机制.方法 利用PharmMapper数据库筛选出丹参酮ⅡA的作用靶点,利用OMIM、GeneCards、CTD数据库筛选CHD疾病作用相关靶点.利用STRI...
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【中文期刊】 高耀 吴丹 等 《中草药》 2018年49卷15期 3483-3492页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用网络药理学的方法,研究逍遥散与开心散的活性成分、作用靶点及生物学意义,探讨其“同病异治”抑郁症的作用机制.方法 采用TCMID、Batman-TCM、TCM database@Taiwan分别获取逍遥散和开心散的成分和靶点,通过T...
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【中文期刊】 吴丹 高耀 等 《中草药》 2018年49卷7期 1594-1602页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立活性成分-作用靶点、蛋白相互作用、靶点相应的生物功能和通路网络,探讨栀子豉汤的抗抑郁作用机制.方法 通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库并结合文献挖掘和整理获取栀子豉汤的主要活性成分.依据反向药效团匹配(PharmMap...
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【中文期刊】 孙娜 刘启玲 等 《中华疾病控制杂志》 2018年22卷7期 677-681页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用生物信息学研究方法分析大气污染物对成人和儿童外周血基因表达谱的影响,为后期开展有针对性的预防、诊断及治疗提供理论依据.方法 从基因芯片公共数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载一组来自不同大气污染暴...
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【中文期刊】 李强 杜晨晖 等 《中草药》 2017年48卷10期 1936-1943页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究酸枣仁的血清移行成分,并构建入血成分-失眠靶点网络的效应物质研究模式.方法 应用RSLC-QExactive Orbitrap-HRMS技术建立大鼠口服酸枣仁水提物后含药血清样品的分析方法.通过对比空白血清与含药血清色谱图异同,扣...
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【中文期刊】 林艳丽 陶泽华 等 《环境与职业医学》 2025年42卷2期 238-244页ISTICPKUCSCD
【摘要】 随着社会的不断发展,大量新型化学品持续涌现,由此对于化学品的风险评估以及安全性管理提出了更为严格的要求.传统的毒理学研究方法在快速、高效、准确评估众多化学品毒性方面存在一定局限性,难以满足实际需求.在此背景下,通过应用数学和计算机模型来实现...
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【中文期刊】 鲍宁 陈子超 等 《中草药》 2024年55卷1期 114-126页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 整合生物信息学、网络药理学及分子对接技术预测黄芪-莪术药对抗肝癌配伍机制,并进行细胞实验验证.方法 利用R软件包Limma分析GEO数据库中肝癌基因表达数据,筛选肝癌靶点;通过TCMSP数据库结合文献报道,筛选潜在活性成分;采用TCM...
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【中文期刊】 刘树森 王敏 等 《中草药》 2024年55卷1期 205-216页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过数据挖掘、网络药理学及分子对接技术分析含三七的保健食品的组方规律并对其潜在的机制进行研究.方法 通过检索国家市场监督管理总局及药智网含三七的保健食品,采用频数统计和关联规则等方法分析基本信息及组方规律.通过检索TCMSP等数据库、...
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【中文期刊】 陈姣 王继森 等 《中草药》 2024年55卷17期 5875-5886页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学和实验验证探究青龙白虎汤改善急性咽炎的作用机制.方法 通过网络药理学预测青龙白虎汤改善急性咽炎的生物调控过程和信号通路,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络和"...
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【中文期刊】 黄玉玲 王寅 等 《中草药》 2024年55卷21期 7347-7358页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学和动物实验探究落花生Arachis hypogaea枝叶(PSL)治疗失眠症的作用机制.方法 借助数据库和在线平台筛选PSL活性成分及其靶点,以及失眠症相关靶点,利用Venny2.1.工具获取PSL与失眠症交集靶点,并通...
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【中文期刊】 孙小玉 陈丽 等 《环境与职业医学》 2024年41卷12期 1384-1392页ISTICPKUCSCD
【摘要】 [背景]环境污染和特定职业暴露加剧了肺纤维化问题,肺纤维化发病机制复杂且缺乏有效治疗药物.香青兰提取物可通过抗炎抗焦亡途径缓解肺纤维化,但其对肺纤维化的防治机制尚不明确.[目的]结合网络药理学和动物实验分析香青兰提取物抗肺纤维化的作用靶点及...
【关键词】 肺纤维化;香青兰提取物;磷脂酰肌醇 3-激酶/蛋白激酶B;
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【中文期刊】 何长颖 韦雨婷 等 《中华疾病控制杂志》 2024年28卷9期 1096-1103页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究基于肠道菌群对人群未来患帕金森症(parkinson's disease,PD)的早期预测模型进行构建与评价,并对肠道菌群宏基因KO组进行功能分析,探讨PD的潜在治疗靶点.方法 基于Zenodo数据库,一方面对肠道菌群相对丰度数据...
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【中文期刊】 刘盼盼 任伟宏 等 《中国医院药学杂志》 2024年44卷7期 772-780页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:预测并验证参术白胡颗粒甲基化调控位点,探讨其治疗胃癌的作用机制.方法:采用NSG裸鼠胃癌模型验证参术白胡颗粒(下称"参术")的抗肿瘤作用.通过TCMSP、DrugBank、UniProt及PubChem数据库检索参术中的有效化学成分和...
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【中文期刊】 赵谭军 付可沁 等 《中草药》 2024年55卷11期 3716-3725页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 运用网络药理学结合实验验证探讨雷公藤红素调控肠上皮细胞胆固醇代谢的潜在靶点及作用机制.方法 应用网络药理学筛选雷公藤红素调控肠上皮细胞胆固醇代谢的关键靶点和通路.运用Autodock Vina软件进行分子对接验证.通过构建体外肠上皮细...
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【中文期刊】 宛博 单玲玲 等 《中国医院药学杂志》 2024年44卷22期 2557-2562页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:利用网络药理学和体外细胞实验验证的方法探讨长春布宁治疗肝纤维化的潜在作用机制.方法:通过检索Super-PRED、Similarity ensemble approach(SEA)、BindingDB、ChEMBL、PharmMapp...
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【中文期刊】 王龙昊 吕恒梁 等 《疾病监测》 2024年39卷10期 1308-1313页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选用于区分人类免疫缺陷病毒(HIV)感染和HIV/结核分枝杆菌(MTB)共感染的外周血潜在的基因表达特征.方法 首先从基因表达总览(GEO)数据库下载数据集GSE50834,分为HIV感染患者和HIV/MTB共感染患者两组进行差异分...
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【中文期刊】 韩世盛 王怡 《中国药学(英文版)》 2024年33卷6期 511-524页ISTICCSCDCA
【摘要】 动静脉内瘘(AVF)失功与血液透析患者的临床预后呈负相关.本研究旨在通过网络药理学探索桃红四物汤改善AVF通畅性的潜在机制,并通过分子对接及分子动力学模拟技术进行验证.通过TCMSP、TCMIP以及SwissTargetPrediction...
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【中文期刊】 刘芳琳 张春娟 等 《中国药学(英文版)》 2024年33卷4期 339-351页ISTICCSCDCA
【摘要】 参芪扶正注射液(SFI)是一种由黄芪(黄芪,HQ)和党参(党参,DS)组成的传统中药注射液,我们通过网络药理学和分子对接分析研究了SFI治疗慢性阻塞性肺病(COPD)的潜在机制和分子靶点.首先,我们在多个数据库中检索和筛选了SFI的潜在生物...
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【中文期刊】 杜克群 江华娟 等 《中国医院药学杂志》 2023年43卷6期 633-643,668页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探究桃红四物汤促进骨折愈合的潜在药效物质及作用靶点和通路.方法:采用UPLC-Q-Exactive Orbitrap/MS技术,结合对照品比对与文献数据,对桃红四物汤化学成分进行鉴定.通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)及...
【关键词】 桃红四物汤;骨折愈合;UPLC-Q-Exactive Orbitrap/MS;
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【中文期刊】 蒋勇 钟淑欣 等 《中草药》 2023年54卷17期 5601-5618页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过以网络药理学为基础的策略研究防风治疗类风湿关节炎(rheumatoidarthritis,RA)的分子生物学机制.方法 采用网络药理学方法收集防风活性成分和治疗RA的潜在靶点,并评估活性成分的药理和毒理学等相关参数;构建蛋白质相互...
- 概要:
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【中文期刊】 邓光辉 叶梦娟 等 《中草药》 2023年54卷16期 5244-5256页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学、分子对接及体内实验验证探讨霍山石斛对非酒精性脂肪肝(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)的疗效及作用机制.方法 利用文献检索霍山石斛活性成分,采用SwissTargetPre...
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【中文期刊】 刘洋 曹赛雅 等 《中草药》 2023年54卷19期 6386-6399页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用公共数据库挖掘结直肠癌"炎癌转化"过程的关键基因,结合机器学习和神经网络模型的算法优势进行基因筛选,验证关键基因作为预测指标的可行性及免疫相关性,进而预测潜在防治中药.方法 利用基因表达数据库(Gene Expression Om...
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【中文期刊】 徐宏宏 昌潇 等 《中草药》 2023年54卷4期 1138-1148页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨新疆紫草Lithospermum erythrorhizon代表成分阿卡宁对急性髓系白血病细胞HL-60的抑制作用及机制.方法 取对数生长期HL-60细胞,采用台盼蓝法检测阿卡宁、紫草素处理后的细胞增殖抑制率;Hoechst 33...
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【中文期刊】 闫向英 毛霞 等 《中草药》 2023年54卷6期 1814-1824页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究青蒿琥酯干预胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)的药效及其潜在分子机制.方法 采用Cell Titer-Blue 检测青蒿琥酯对U87和U251 2种人源胶质母细胞瘤细胞活性和增殖的影响;流式细胞术检测青蒿琥酯对2种细...
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- 方法:
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【中文期刊】 李元增 赵济 等 《中国医院药学杂志》 2023年43卷23期 2630-2640页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:基于UPLC-QE-MS分析地板藤化学成分以及通过网络药理学探讨地板藤治疗原发性痛经的作用机制.方法:通过UPLC-QE-MS分析所得地板藤化学成分,利用Swiss ADME和Swiss Target Prediction筛选出药物化...
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【中文期刊】 李新 卜睿臻 等 《中草药》 2023年54卷23期 7618-7629页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于Ⅱ型胶原诱导的类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)大鼠模型和网络药理学方法探讨痹祺胶囊的药效作用及作用机制.方法 SD大鼠采用Ⅱ型胶原蛋白造模,造模成功大鼠随机分为模型组,痹祺胶囊(0.05、0.10、...
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【中文期刊】 袁会成 万学娜 等 《中国热带医学》 2023年23卷8期 863-869页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用网络药理学和分子对接技术阐明金丹健肝胶囊治疗肝纤维化可能的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库分析平台(http://tcmspw.com/tcmsp.php)和HERB数据库(http://herb.ac.cn)检索金丹健肝...
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- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 曾慧 江花香 等 《中国口腔颌面外科杂志》 2023年21卷5期 452-460页ISTICCA
【摘要】 目的:利用生物信息学方法筛选舌癌的关键基因,探讨其与舌癌进展相关的潜在功能和通路机制.方法:分析微阵列数据集GSE13601,筛选出差异表达基因.利用注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)进行基因本体论(GO)及京都基因和基因组百科全书...
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- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 田文国 陈金鹏 等 《中草药》 2022年53卷22期 7135-7147页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 运用网络药理学和分子对接方法探究肠炎宁颗粒治疗功能性腹泻(functional diarrhea,FD)和腹泻型肠易激综合征(diarrhea irritable bowel syndrome,IBS-D)的作用机制.方法 通过TCM...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 黄博宁 林娟 等 《中草药》 2022年53卷6期 1652-1662页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学方法探讨丹红化瘀口服液治疗深静脉血栓(deep vein thrombosis,DVT)的作用机制.方法 利用中药系统药理学技术平台数据库(TCMSP)获取丹红化瘀口服液的主要化学成分及作用靶点,利用Uniprot数据库...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 谭永聪 王启军 等 《生物化学与生物物理进展》 2011年38卷3期 197-203页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 蛋白质翻译后修饰是调节蛋白质生物学功能的关键步骤之一,是蛋自质动态反应和相互作用的一个重要分子基础,同时,它也是细胞信号网络调控的重要靶点.目前,蛋白质翻译后修饰已经成为国际上蛋自质研究的一个极其重要的热点.在原核生物生命活动中,蛋自质的翻...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 严立成 苏计国 等 《生物化学与生物物理进展》 2010年37卷7期 762-768页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 理论和实验研究表明,蛋白质天然拓扑结构对其折叠过程具有重要的影响.采用复杂网络的方法分析蛋白质天然结构的拓扑特征,并探索蛋白质结构特征与折叠速率之间的内在联系.分别构建了蛋白质氨基酸网络、疏水网、亲水网、亲水一疏水网以及相应的长程网络,研究...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 宗阳 董宏利 等 《中草药》 2019年50卷4期 888-894页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨黄芩-黄连药对治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制.方法 借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索黄芩、黄连的化学成分和作用靶点,通过OMIM、TTD、Drugbank、Digsee等多个数据库查询与T2DM相关的基因.通过U...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 黄幸 丁峰 等 《生物技术通报》 2019年35卷12期 129-143页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 WRKY转录因子是植物中最大的转录调控因子家族之一,是调控植物许多生物过程信号网络的组成部分.WKRY转录因子具有多种生物学功能,在植物的生长发育和衰老、非生物和生物胁迫等过程中发挥着重要的作用.在DNA水平上,WRKY转录因子可与靶基因启...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 张瑞 曹庆伟 等 《中草药》 2019年50卷8期 1880-1889页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学方法探讨黄芪抗疲劳可能的作用机制.方法 根据课题组前期研究并结合中医药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)指认黄芪中的活性成分,采用PharmMapper网络服务器预测其作用靶点;在GeneCards、OMIM数据库...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 陈文娜 朱爱松 等 《中草药》 2019年50卷2期 441-448页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用网络药理学研究二陈汤治疗冠心病的作用靶点、代谢物、信号通路等,从而揭示其从痰瘀论治冠心病的分子机制.方法 应用中药系统药理学技术平台(TCMSP)、中药潜在靶点数据库(TCM-PTD)、中药综合数据库(TCMID),找到二陈汤的主...
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