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【中文期刊】 古再丽努尔·穆萨 马骊 等 《植物遗传资源学报》 2024年25卷12期 2122-2135页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了解析干旱处理对白菜型油菜生理指标及DNA甲基化水平的影响,本研究对白菜型油菜陇油7号进行正常供水(对照)、干旱胁迫、干旱后复水3个处理,分析不同处理后油菜生理指标及DNA甲基化水平的变化.结果表明,与正常供水相比,当白菜型油菜受到干旱胁...
【中文期刊】 钟舒红 盛兆安 等 《中国预防兽医学报》 2023年45卷3期 253-263页
【摘要】 为探究感染大片形吸虫后不同时间水牛脊髓全基因组DNA甲基化的类型、占比及其感染后差异甲基化区域(DMR)涉及的功能及信号通路,本研究将大片形吸虫囊蚴经口灌胃感染8~10月龄水牛,分别于感染后3d(J01)、10d(J02)、28 d(J03...
【中文期刊】 陈亮 唐坚 等 《中国现代医生》 2023年61卷30期 7-10页
【摘要】 目的 研究大黄素对胰腺癌细胞Panc1 DNA甲基转移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)的影响,及其对抑癌基因前脑啡肽原(pre-proenkephalin,ppENK)启动子区 CpG 岛的去甲基化作用,探讨大...
【中文期刊】 申晓慧 《草地学报》 2022年30卷1期 46-54页
【摘要】 为了探究不同诱变处理对紫花苜蓿表观遗传学效应的影响,试验采用甲基磺酸乙酯(EM S)和60 CO-γ两种诱变方法对紫花苜蓿种子进行处理,采用重亚硫酸盐测序(BS-seq)技术,对紫花苜蓿诱变前后全基因组DNA甲基化图谱进行分析.结果表明,紫...
【中文期刊】 晏建国 付海英 等 《中国实验血液学杂志》 2016年24卷5期 1299-1304页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:应用重亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测急性早幼粒细胞白血病细胞株(NB4) Wnt信号通路抑制基因启动子区CPG岛的甲基化状态,筛选NB4细胞中高甲基化的Wnt信号通路抑制基因,并探讨B...
【关键词】 重亚硫酸氢盐测序法; Wnt信号通路抑制基因; 基因甲基化;
【中文期刊】 徐盼 仲德 等 《中国畜牧兽医》 2021年48卷8期 2889-2900页
【摘要】 本研究旨在分析不同体重苏姜猪的全基因组DNA甲基化差异,以期筛选出影响苏姜猪体重的差异甲基化基因(differentially methylated genes,DMGs).利用全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulf...
【关键词】 苏姜猪; DNA甲基化; 全基因组重亚硫酸盐测序;
【中文期刊】 叶惠闽 黄显清 等 《实验室研究与探索》 2021年40卷4期 38-42页
【摘要】 重亚硫酸盐测序(BSP)技术是一种广泛应用的DNA甲基化检测技术,其检测分辨率达到单碱基水平,可用于短片段的高精度测序.利用BSP技术对DNA水平上不存在差异的绿针假单胞菌HT66及其荧光表型突变株HT66-FLUO的同一基因片段gacS并...
【中文期刊】 何英慧 欧阳玲 《现代肿瘤医学》 2014年22卷7期 1488-1491页 ISTICCA
【摘要】 目的:检测EEN-B1在外阴鳞癌组织及外阴鳞癌细胞株中的启动子甲基化及蛋白表达情况,探讨其启动子异常甲基化在外阴鳞癌发病过程中的作用.方法:采用重亚硫酸盐测序PCR(bisulfite genomic se-quencing PCR,BSP...
【中文期刊】 王小莉 尹世学 等 《湖北医药学院学报》 2012年31卷2期 114-118页 ISTICCA
【摘要】 目的:研究大鼠Ins1(Insulin 1)基因启动子在各种组织中DNA甲基化的状态及在转化分化过程中甲基化的变化情况,为从表观遗传学方面研究Ins1基因表达调控的机制奠定基础.方法:通过RT-PCR检测大鼠胰岛、大鼠胰岛素瘤细胞(INS-...
【中文期刊】 许小涵 唐志强 等 《中草药》 2023年54卷16期 5339-5349页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析干旱胁迫下忍冬Lonicera japonica全基因组DNA甲基化水平变化、模式以及与基因表达的关系,为进一步探究忍冬响应干旱胁迫的分子机制奠定基础.方法 采用全基因组重亚硫酸盐甲基化测序法(whole-genome bisul...
【中文期刊】 薛鹏 王鲲鹏 等 《中华生殖与避孕杂志》 2021年41卷4期 327-332页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:比较正常生育男性及少弱精子症患者 DAZL基因启动子区域DNA甲基化水平的差异。 方法:采用病例对照研究,回顾性分析2018年6月至2019年6月期间于徐州医科大学附属连云港医院就诊的具有正常生育男性(对照组)15例...
【中文期刊】 张玉松 房健 等 《中华行为医学与脑科学杂志》 2018年27卷7期 598-603页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 检测热性惊厥大鼠海马白细胞介素?6(interleukin?6,IL?6)表达及启动子甲基化状态,探讨丙戊酸(valproic acid,VPA)对其DNA甲基化的影响.方法 21日龄SD大鼠24只,随机分为对照组和热性惊厥组,每组1...
【中文期刊】 邢朝斌 张妍彤 等 《中草药》 2017年48卷24期 5063-5069页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 DNA甲基化是目前研究最为广泛的一种表观遗传学现象,甲基化后的DNA可在不改变碱基序列的情况下对植物的表型进行调控.在高等植物中有CG、CHG和CHH(H代表A、C或T)3种甲基化位点,多发生于对称序列CG和重复序列中,且不同物种中的甲基化...
【中文期刊】 彭泉 张立洁 等 《南京医科大学学报(自然科学版)》 2012年32卷1期 72-76页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:检测Ras相关区域家族1A(Ras association domain family 1A,RASSF1A)在胰腺癌细胞株中的甲基化和表达状态,探讨其启动子异常甲基化在胰腺癌发病过程中的作用.方法:采用重亚硫酸盐测序PCR(bisu...
【关键词】 胰腺癌; 甲基化; Ras相关区域家族1A;
【中文期刊】 田金凤 曹培 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2010年26卷10期 962-967页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 抑癌基因p16和白血病致癌因子Ralb与白血病的发生密切相关,其启动子区CpG岛的甲基化对基因表达具有重要作用.本文旨在分析p16、Ralb基因启动子区CpG岛甲基化位点信息,并比较这两个基因在小鼠骨髓细胞和原代培养的骨髓细胞中甲基化状态的...
【关键词】 抑癌基因p16; 白血病致癌因子Ralb; CpG岛;
【中文期刊】 林德照 郑建建 等 《中国卫生检验杂志》 2014年24卷9期 1229-1231,1235页 ISTIC
【摘要】 目的 观察5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-Aza)对TGF-β1诱导的HSC-T6细胞株活化状态及miR-29b基因甲基化的影响.方法 采用MTT、qRT-PCR及Western blot技术检测5-Aza治疗组细胞活化状态及miR-29b含...
【关键词】 肝纤维化; miR-29b; 重亚硫酸盐测序PCR;
【中文期刊】 尹玉竹 章钧 等 《中华医学遗传学杂志》 2014年31卷5期 582-586页 MEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 探讨甲基化特异性多重连接依赖探针扩增技术(methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification,MS-MLPA)在胎盘甲基化研究中的可行性.方法 应...
【关键词】 甲基化特异性多重连接依赖探针扩增技术; 亚硫酸氢盐测序; 胎盘;
【中文期刊】 王理 上官少方 等 《现代生物医学进展》 2011年11卷4期 618-623页 ISTICCA
【摘要】 目的:探讨利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法.方法:通过对不同扩增条件和扩增效率及不同条件处理的质谱分析比较了MassArray平台进行甲基化分析的特点.结果:本研究通过与重亚硫酸盐测序结果比较证实,MassArray分子量阵列...
【关键词】 MassArray分子量阵列技术平台; 甲基化; 重亚硫酸盐测序;
【中文期刊】 应燕玲 陶苏丹 等 《中国卫生检验杂志》 2011年21卷1期 4-6页 ISTIC
【摘要】 目的:建立重亚硫酸盐测序法(BSP法)定量分析ABO基因启动子区CpG岛的甲基化水平.方法:提取胃癌细胞株MKN45和KatoⅢ以及人全血基因组DNA,以重亚硫酸盐转化法修饰其DNA,应用Meth Primer软件在ABO基因启动子区非Cp...
【关键词】 重亚硫酸盐直接测序法; 甲基化; CpG岛;
【学位论文】 作者: 金芬品 导师:韦相才 暨南大学 临床医学 生殖内分泌学(硕士) 2015年
【摘要】 多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome,PCOS)是指女性青春期发病,以月经紊乱、持续排卵障碍和卵巢多囊样改变,合并高雄激素血症(Hyperandrogenism,HA)和高胰岛素血症(Hyperinsuline...
【学位论文】 作者: 苏建忠 导师:Alexey A. Tuzhilin 刘胜强 哈尔滨工业大学 数学 运筹学与控制论(博士) 2012年
【摘要】 哺乳动物基因组上, DNA甲基化在基因转录、细胞分化、衰老和肿瘤的发生中发挥着重要作用。新一代测序技术和重亚硫酸盐转换法结合形成的重亚硫酸盐测序技术(BS-seq)是目前可精确检测胞嘧啶甲基化的“金标准”方法,该技术打开了在基因组水平上系统...
【中文期刊】 于子惠 徐子瑛 等 《解放军医学院学报》 2024年45卷8期 861-867页 ISTICCA
【摘要】 背景 白鲜碱是中药白鲜皮的主要成分,具有肝毒性,可诱导肝损伤.临床发现,白鲜碱致肝损伤的发病率女性高于男性.目的 绘制DNA甲基化组及转录组图谱,探索白鲜碱致肝损伤性别差异的调控机制.方法 构建白鲜碱诱导的肝损伤雌性和雄性小鼠模型,对小鼠肝...
【中文期刊】 陈亮 唐坚 等 《全科医学临床与教育》 2024年22卷2期 103-106页
【摘要】 目的 研究大黄素联合5-氮-2'脱氧胞苷(5AzA-cdR)能否增强其对胰腺癌细胞抑癌基因前脑啡肽原(ppENK)的去甲基化作用.方法 选择Panc1细胞为研究对象,首先采用细胞计数实验(CCK-8)检测不同浓度大黄素对胰腺癌细胞的生长抑制...
【中文期刊】 沈建英 梁文娜 等 《中国实验动物学报》 2023年31卷9期 1133-1139页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 从表观遗传学之基因启动子DNA甲基化角度探讨围绝经期抑郁症对大鼠海马Notch1信号通路关键基因表达及其启动子DNA甲基化的影响.方法 将12月龄雌性围绝经期SD大鼠随机分为对照组和模型组.分别采用旷场实验和糖水消耗实验进行焦虑样及抑...
【中文期刊】 徐成波 廖斌 等 《中国实验血液学杂志》 2022年30卷3期 790-796页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨DNA甲基化介导miR-203/CREB1信号途径的调控对多发性骨髓瘤细胞增殖、侵袭和凋亡等生物学行为的影响.方法:采用重亚硫酸氢盐测序法定量检测多发性骨髓瘤RPMI 8226细胞株中miR-203的甲基化水平;实时荧光定量PCR...
【关键词】 甲基化; miR-203; 环腺苷酸反应元件结合蛋白1;
【中文期刊】 刘丽梅 王家欣 等 《北华大学学报(自然科学版)》 2022年23卷6期 785-788页 ISTICCA
【摘要】 目的 探究miR-29c与miR-200a表达的相关性及其机制,为乳腺癌早期诊断及预防提供新的分子标志物及治疗靶点.方法 通过荧光定量PCR检测乳腺癌患者miR-29c、miR-200a的表达并分析其相关性;同时将人工合成的miR-29c模...
【中文期刊】 段昕妤 肖蘅 等 《生物学杂志》 2018年35卷5期 79-82,86页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 DNA甲基化在很多真核生物中是一种非常重要的表观遗传学标记,结合新一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)对哺乳动物的DNA甲基化水平进行定量测定已成为目前的研究热点.具有高通量、高覆盖率、高分辨率等优点...
【中文期刊】 沈圣 屈彦纯 等 《遗传》 2014年36卷3期 256-275页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 下一代测序技术(Next generation sequencing,NGS)的出现,极大地促进了表观遗传学的研究.将NGS技术引入表观遗传学,便形成了以NGS为基础的各种表观遗传学测序及研究方法,如:全基因组亚硫酸氢盐测序法(Whole ...
【中文期刊】 王庭璋 单杲 等 《遗传》 2013年35卷6期 685-694页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 鉴定DNA 甲基化胞嘧啶(mC)并能制作基因组规模甲基化图谱的新方法--BS-Seq,最近已被开发,它是基于新一代高通量测序结合DNA 亚硫酸氢盐转换技术,不仅可以从基因组规模洞察不同生物之间在DNA 甲基化水平和模式上的差异,也能从不同基...
【中文期刊】 李辉 徐红梅 等 《法医学杂志》 2013年29卷2期 103-106,115页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术与焦磷酸测序技术对小核核糖核蛋白多肽N(small nuclear ribonucleoprotein polypep...
【中文期刊】 刘莹 程鹏 等 《中国实验血液学杂志》 2012年20卷3期 642-645页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究旨在通过对广西省重型β地中海贫血患者和正常人外周血中γ珠蛋白基因启动子区CpG岛的甲基化位点的确认和对各个CPC位点甲基化率在重型β地中海贫血患者与正常人之间的差异性分析,初步筛选出可能影响γ珠蛋白表达的主要甲基化位点.采用重亚硫酸盐...
【中文期刊】 汤绍辉 张良鹏 等 《中国病理生理杂志》 2012年28卷9期 1633-1638页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:构建稳定表达乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)的肝癌细胞株HepG2-HBx,探讨HBx对胰岛素样生长因子 II(IGF-II)基因P4启动子甲基化水平及转录表达的影响.方法:应用基因重组技术,构建含HBx基因的重组逆转录病毒载体pBABE...
【关键词】 乙型肝炎病毒X蛋白; 胰岛素样生长因子II; 启动子;
【中文期刊】 赵贵森 郑海燕 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2007年23卷10期 876-880页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 DNA甲基化分析是认识生理、病理条件下基因表达变化的重要途径.亚硫酸氢盐转化是DNA甲基化分析的瓶颈.本文旨在改进琼脂糖-亚硫酸氢盐DNA处理方案(agarose bisulfite method),建立一种简便稳定、适合常规甲基化分析的亚...
【中文期刊】 樊卫 郑羽 等 《医学临床研究》 2019年36卷1期 35-37页 ISTICCA
【摘要】 [目的]探讨毛细血管扩张性共济失调症突变基因ATM甲基化在食管鳞癌中的表达及其意义.[方法]以正常食管组织作对照,采用重亚硫酸盐测序(BSP)联合TA克隆测序法检测40例食管鳞癌组织中ATM基因CpG岛甲基化状态;采用免疫组化(SP)法检测...
【关键词】 食管肿瘤/病理生理学; 基因;
【中文期刊】 王心宇 许颖出 等 《生物信息学》 2014年12卷1期 72-76页 ISTIC
【摘要】 DNA甲基化作为一种表观遗传学修饰,在调控基因表达、X染色体失活、印记基因等方面都发挥着重要的作用.不同的DNA甲基化的预处理方法结合二代测序产生了大量的高通量甲基化数据,这些数据的存储、处理和分析是当前亟需解决的问题.在本文中,总结了目前...
【中文期刊】 刘丹 王芳 等 《中华临床医师杂志(电子版)》 2014年5期 839-843页 ISTICCA
【摘要】 目的:探讨抗氧化基因NRF2启动子上游CpG岛内408~994 bp位置处的甲基化水平与男性不育之间的关系。方法酚氯仿法手提精子DNA,建立重亚硫酸盐修饰精子DNA后克隆测序法(即 BSP-克隆测序法),选择正常男性及不育中少、弱、畸精症男...
【中文期刊】 宗飒 张绪超 等 《临床肿瘤学杂志》 2010年15卷11期 961-965页 ISTICCA
【摘要】 目的 检测早期非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织与癌旁组织hsa-mir-34b(mir-34b)基因启动子甲基化水平的差异.方法 采用重亚硫酸盐还原技术、降落巢式PCR扩增27例Ⅰ期NSCLC患者癌组织和癌旁组织配对样本中mir-34b...
【中文期刊】 张华 府伟灵 等 《重庆医学》 2006年35卷3期 222-223页 MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的建立稳定的重亚硫酸盐直接测序技术,检测p16基因甲基化状况.方法提取正常人全血基因组DNA,建立起稳定的重亚硫酸盐直接测序平台,利用该技术检测结直肠癌细胞株p16基因甲基化状况.结果应用列联表的Fisher,Exact Test比较3种...
【关键词】 双脱氧测序法; 虾碱性磷酸酶(SAP); 核酸外切酶I(EXONI);