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            【中文期刊】 杜宇  付中民  等 《昆虫学报》 2020年63卷11期 1345-1357页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]利用已获得的纳米孔长读段测序数据完善现有的蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis参考基因组注释信息,并对未注释的新基因和新转录本进行鉴定和功能注释.[方法]基于已获得的纳米孔长读段测序数据,采用gffcompare软件将蜜蜂球囊...

            【关键词】 蜜蜂球囊菌测序技术转录组

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            【中文期刊】 杜宇  王杰  等 《微生物学报》 2021年61卷3期 667-682页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]蜜蜂球囊菌(Ascosphaeraapis,简称球囊菌)是一种专性侵染蜜蜂幼虫的真菌病原,导致的白垩病是严重影响养蜂生产的顽疾,每年给养蜂业造成较大损失.本研究旨在基于已获得的第三代长读段测序数据对球囊菌菌丝(Aam)和孢子(Aas...

            【关键词】 测序牛津纳米孔蜜蜂球囊菌

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            【中文期刊】 寇帅  金治平  等 《中华细胞与干细胞杂志(电子版)》 2022年12卷2期 121-126页ISTIC

            【摘要】 单管长片段读取技术(stLFR)是指在单管中将来源于同一脱氧核糖核酸(DNA)长分子的短读测序片段标记上相同分子标签的无分隔长片段读取技术。通过该技术制备的文库最终产生短读长(200 ~ 1 000 bp)片段进行测序,经过共标签分析后又能...

            【关键词】 单管基因组装染色体结构变异

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            【学位论文】 作者:李琪 导师:张艳菊   桂林电子科技大学   软件工程 软件工程(硕士) 2022年

            【摘要】 随着第三代测序技术的日益成熟以及广泛应用,长序列比对成为正在兴起的研究领域。在转录组学研究中,将RNA长读段比对定位到参考基因组中,是对第三代RNA测序数据进行分析的关键一步,其准确性对差异基因表达、RNA编辑和融合基因的检测等后续分析有着...

            【关键词】 第三代RNA测序比对算法

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            【学位论文】 作者:郭方杰 导师:苏建忠   温州医科大学   生物医学工程 生物医学工程(硕士) 2022年

            【摘要】 DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,已经被研究者证明参与了转座元件沉默、转录调控、X染色体失活和基因印记等多种生物学过程。在医学研究中,DNA甲基化能够用作预测肿瘤状态或治疗后机体反应的生物标记物,例如总体的DNA甲基化水平高低和特定基...

            【关键词】 测序三代测序

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            【中文期刊】 李梅  邱礼鸿  等 《生物化学与生物物理进展》 2008年35卷8期 940-946页SCIISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 XnBP83是从Xenorhabdus nematophila BP基因组粘粒文库中筛选出的一个对棉铃虫有较强口服杀虫活性的克隆.采用亚克隆结合primer-walking DNA测序技术对粘粒XnBP83的插入片段进行序列测定.该插入片段...

            【关键词】 序列分析Xenorhabdus粘粒DNA

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            【中文期刊】 李颖  罗娟娟  等 《赣南医学院学报》 2022年42卷4期 331-337页

            【摘要】 染色体碎裂化是指在一次细胞灾难性事件当中,染色体片段被全部打碎,然后这些片段以另一种顺序重组.经过染色体碎裂化的细胞一般会死亡,仅极少数细胞幸存下来,可能是由于大规模基因组重排让细胞有转化为癌细胞的趋势.染色体碎裂化导致的后果包括癌基因的扩...

            【关键词】 染色体碎裂化染色体外DNA肿瘤进展

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            【中文期刊】 聂会忠  薛永常  《西北植物学报》 2008年28卷5期 889-894页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 根据CYP98A3(GenBank登录号为AY064170)cDNA序列保守区设计引物,从正在分化的2年生'欧美杨107,次生木质部提取的总RNA经RT-PCR扩增出一基因片段,然后与pMD20-T载体连接.重组质粒经限制性内切酶酶切、特异...

            【关键词】 杨树木质素c3h基因

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            【中文期刊】 胡学芳  邓小昭  等 《细胞与分子免疫学杂志》 2007年23卷12期 1133-1135页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:探讨HCV-NS5A对PI3K表达的影响.方法:应用PCR技术从含有HCV全长开放阅读框的质粒中获得NS5A全长基因片段,利用基因重组技术将其克隆至真核表达载体pcDNA3.0(-)中.通过酶切、PCR及测序鉴定,NS5A基因已正确插...

            【关键词】 HCV NS5AHepG2细胞基因表达

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            【中文期刊】 张晓舟  闫新  等 《微生物学报》 2006年46卷4期 526-530页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 以短短小芽孢杆菌B15的总DNA为模板,利用PCR技术克隆到其细胞壁蛋白基因串联启动子和信号肽编码序列,测序分析后提交GenBank,登录号为AY956423.重新设计引物扩增该片段并在PCR产物两侧引入BamHⅠ和PstⅠ酶切位点,将PG...

            【关键词】 短短小芽孢杆菌启动子信号肽

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            【中文期刊】 于丽  管英俊  等 《神经解剖学杂志》 2006年22卷1期 33-37页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 本文通过构建金黄地鼠神经管cDNA文库,筛选了RPL30基因,并探讨了其与神经管发育的关系.提取胚胎(E)8.5 d的金黄地鼠神经管总RNA,用SMART技术构建神经管cDNA的噬菌体表达文库.利用分部分排除技术(SSS法),结合PCR法逐...

            【关键词】 cDNA文库神经管RPL30

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            【中文期刊】 杨小骏  叶林柏  等 《病毒学报》 2005年21卷5期 349-352页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 应用PCR技术从含有丙型肝炎病毒(HCV)全长开放阅读框的质粒pBRTM/HCV 1~3 011中获得NS5A全长基因片段,利用基因重组技术将其克隆至真核表达载体pcDNA3.1(-)中.通过酶切、PCR及测序鉴定证实,NS5A基因已正确插...

            【关键词】 丙型肝炎病毒NS5A蛋白细胞周期

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            【中文期刊】 彭鸿娟  陈晓光  等 《第一军医大学学报》 2004年24卷8期 869-872页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的克隆日本血吸虫8k CaBP(Sj8CaBP)基因启动子区并对该序列进行分析.方法提取日本血吸虫基因组DNA,并按ClontechUniversal Genome WalkerTM Kit的操作手册说明,建立日本血吸虫基因组DNA文库....

            【关键词】 日本血吸虫钙结合蛋白启动子区

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            【中文期刊】 杨劲松  郑新民  等 《中国生物化学与分子生物学报》 2003年19卷2期 173-181页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 利用已建立的蛋白质酪氨酸磷酸酶α(PTPα)诱导表达模型寻找与PTPα高表达导致NIH3T3细胞恶变早期相关的新基因,探索肿瘤早期形成的机理.诱导PTPα表达24 h,用差异显示逆转录PCR获得65条差异片段,利用生物信息学方法分析这些差异...

            【关键词】 蛋白质酪氨酸磷酸酶α生物信息学新基因

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            【中文期刊】 周琳华  郑文岭  等 《医学分子生物学杂志》 2010年07卷4期 296-299页ISTICCA

            【摘要】 目的 克隆扩增APC11开放阅读框基因片段,构建其真核表达重组质粒,为后续研究其功能做准备.方法 按照GenBank中人APC11序列设计引物,以HeLa细胞cDNA为模板,扩增出基因片段.该片段与真核表达载体pEGFP-C1连接,得到的重...

            【关键词】 APC11基因基因表达与构建pEGFP-C1载体

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            【中文期刊】 储春丽  邓小昭  等 《药物生物技术》 2008年15卷4期 235-238页ISTICCA

            【摘要】 探讨丙型肝炎病毒(HCV)F基因对PI3K表达的影响.应用PCR技术从含有HCV全长开放阅读框的质粒中获得HCV-F基因片段,利用基因重组技术将其克隆至真核表达载体pcDNA3.0(-)中.通过酶切、PCR及测序鉴定,HCV-F基因已正确插...

            【关键词】 丙型肝炎病毒F蛋白HepG2细胞磷脂酰肌醇-3激酶

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            【中文期刊】 刘卫星  孟祥坤  等 《江苏农业科学》 2011年1期 19-23页

            【摘要】 为了探讨呼肠孤病毒科依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RDRP)基因的遗传与变异,通过RT-PCR对家蚕质型多角体病毒(Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosi...

            【关键词】 家蚕质型多角体病毒S2片RDRP

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            【中文期刊】 朱海侠  万春和  等 《福建农业学报》 2011年26卷4期 523-527页

            【摘要】 采用RT-PCR方法从番鸭肺脏器官中扩增IFN-α基因片段,将扩增产物经胶回收后克隆到pMD18-T 载体上,经PCR和双酶切鉴定为阳性后进行序列测定,并用Lasergene v7.1DNAStar软件对测序结果进行分析.结果表明,所扩增的...

            【关键词】 番鸭α干扰素序列分析

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            【中文期刊】 施少华  傅光华  等 《中国预防兽医学报》 2010年32卷3期 235-237页

            【摘要】 本研究采用PCR方法从临床健康的番鸭法氏囊组织中分段扩增获得鸭圆环病毒(DuCV)PT07全长基因组,将扩增片段分别克隆,获得重组质粒,测序结果表明,DuCV基因组全长为1 988 nt.经基因组结构分析发现,DuCV PT07的基因组有3...

            【关键词】 鸭圆环病毒基因组序列分析

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            【中文期刊】 田小艳  孙华  等 《广东畜牧兽医科技》 2010年35卷1期 29-31页

            【摘要】 参考GenBank中发表的PRV OSU毒株VP7基因核苷酸序列ORF两端保守区序列,设计1对特异引物,以PRV GD1株反转录cDNA为模板,通过PCR方法扩增出长约1 kb的基因片段,并克隆到pMD18-T载体中进行序列测定.测序结果表...

            【关键词】 猪轮状病毒VP7基因克隆

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            【中文期刊】 戴建军  常缨  等 《中国农业科学》 2005年38卷9期 1856-1862页

            【摘要】 以代表性差异分析cDNA-RDA(representational difference analysis of cDNA)方法获得在低温和长日照诱导甜菜(Beta vulgaris L)幼苗茎尖中差异表达的基因片段DP3,并进行了cDNA...

            【关键词】 甜菜(Beta vulgaris L)低温和日照诱导代表性差异分析

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            【中文期刊】 岳春华  张初梅  等 《中草药》 2018年49卷17期 4118-4124页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 克隆布渣叶查耳酮合酶基因(MpCHS)全长cDNA,并对其在不同部位和不同生长阶段叶片中的表达模式进行分析.方法 以布渣叶叶片总RNA逆转录合成cDNA为模板,根据其转录组数据设计特异引物序列,PCR扩增MpCHS基因全长cDNA,经...

            【关键词】 布渣叶查耳酮合酶基因克隆

            OA
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            【中文期刊】 刘薇  王阿娜  等 《时珍国医国药》 2017年28卷3期 756-757页PKUCSCDCA

            【摘要】 目的 克隆桑叶f3h基因并进行测序分析.方法 选定了该基因的PCR扩增的上游引物为GTC-CGAGACGAAGACGAG,下游引物为CTTGTACATCTCGGTGTA,PCR反应体系为95℃顸变性2min →变性95℃ 15sec、退火5...

            【关键词】 桑叶f3hPCR

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            【中文期刊】 李文芹  韩云  等 《北京医科大学学报》 1999年31卷5期 403页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 <篇首> 啤酒酵母是人类基因组计划的重要模式生物,其全基因组序列测定通过国际合作已于1996年完成.我们继先前(1993年)克隆出RAD24基因区域DNA大片段后,对照全基因组测序结果进行比较,发现在我们曾预测的RAD24基因编码区存在一个移码...

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            【中文期刊】 雷炳喜  赵义营  等 《中国微侵袭神经外科杂志》 2011年16卷1期 38-41页ISTICCA

            【摘要】 目的 构建携带生长抑制因子4(ING4)基因的真核表达载体pEGFP-ING4并转染人脐静脉内皮细胞(HUVEC),为进一步研究ING4对胶质瘤血管生成影响提供基础.方法 提取人胎盘细胞中总RNA,RT-PCR扩增 ING4并克隆至pEGF...

            【关键词】 抑制因子4内皮细胞转染

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            【中文期刊】 王环宇  潘晓玲  等 《中华实验和临床病毒学杂志》 2006年20卷3期 203-208页MEDLINEISTICCSCDCA

            【摘要】 目的 对我国新分离乙脑病毒02-76株进行全基因序列测定和分析,了解乙脑病毒基因组结构及毒力特性.方法 设计乙脑病毒全基因组扩增引物,RT-PCR扩增片段,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因序列.通过Clustal X(1.8)、DNAS...

            【关键词】 脑炎病毒,日本基因种系发生

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            【中文期刊】 代晓霞  张全福  等 《中华实验和临床病毒学杂志》 2006年20卷2期 56-59页MEDLINEISTICCSCDCA

            【摘要】 目的测定汉坦病毒Q32株L、M片段的全长序列,了解其分子基础.方法设计特异的PGR引物,用RT-PCR技术分段扩增Q32株全长L、M片段,PCR产物纯化后直接测序,或用T-A克隆方法进行PCR产物克隆,然后进行遗传进化分析.结果Q32株L片...

            【关键词】 汉坦病毒M基因片L基因片

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