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【中文期刊】 Ya-Nan Cao Meng-Hao Wang 等 《植物分类学报》 2025年63卷1期 170-182页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Dipelta Maxim.(Caprifoliaceae)is a Tertiary relic genus endemic to China,which includes three extant species,Dipelta flo...
【关键词】 coalescent modeling；endemism；introgressive hybridization；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Juan Yang Jing Guo 等 《食品科学与人类健康（英文）》 2022年11卷6期 1573-1579页
【摘要】 γ-Glutamyl peptides can enhance basic taste sensations such as saltiness, sweetness, and umaminess, while the molecular ...
【关键词】 γ-Glutamyl peptides；Taste-enhancing effect；Molecular mechanism；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2009年7卷4期 185-193页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Ascorbate peroxidase,a haem protein (EC 1.11.1.11),efficiently scavenges hydro-gen peroxide (H_2O_2) in cytosol and chlo...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何伟 张同武 等 《生物信息学》 2009年7卷4期 320-322,325页ISTIC
【摘要】 通过同源建模得到了抗癌晶体蛋白Parasporin-4的初始三维结构,利用分子动力学的方法对初始三维结构进行优化,同时分析了模建分子的结构,最后利用Ramachandran plot,结构匹配等方法对模型进行评价.结果显示得到的Parasp...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Dali Wang Jiaxuan Li 等 《定量生物学（英文版）》 2023年11卷4期 421-433页
【摘要】 The causative pathogen of coronavirus disease 2019(COVID-19),severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)...
【关键词】 enveloped virus；molecular dynamics simulation；multiscale modeling；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何文英 孙振范 等 《药学学报》 2010年45卷5期 608-614页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 本文利用荧光增敏光谱法及紫外吸收光谱法结合计算机模拟技术研究了模拟生理条件下文多灵碱的光谱特征及它与人血清白蛋白(human serum albumin,HSA)的键合作用.同步荧光及紫外光谱图的信息表明文多灵碱对蛋白微环境有影响.荧光光谱...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王莉 孔永奎 等 《中国输血杂志》 2025年38卷1期 112-115页ISTICCA
【摘要】 目的 对 1 例ABO血型B亚型进行分子生物学研究,并对突变后的酶进行三维建模预测.方法 采用试管法及微柱凝胶法鉴定ABO表型;采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)检测ABO血型基因,并对ABO基因第 6、7 外显子序列进行测序...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 冯石卜 张婷 等 《陕西中医药大学学报》 2025年48卷3期 95-100页
【摘要】 目的 采用同源建模与分子对接技术预测南五味子中的"酸味"成分.方法 利用同源建模的方法构建酸味受体PKD2L1 的三维结构模型,通过Discovery Studio软件将南五味子中125 种化学成分与酸味受体进行对接,将对接分数较好的活性成...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 尹浩 朱将雄 等 《食品科学》 2025年46卷2期 38-49页
【摘要】 采用酶活动力学、联合抑制、荧光光谱、等温滴定量热法和分子对接等技术系统探究两种多肽(APAM和RLPA)对胰脂肪酶(pancreatic lipase,PL)和胆固醇酯酶(cholesterol esterase,CE)活性调控效果及分子结...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《生物学前沿》 2011年06卷4期 289-299页MEDLINEISTICCA
【摘要】 Computational biology methods are now firmly entrenched in the drug discovery process.These methods focus on modeling an...
【关键词】 computational biology；drug discovery；homology modeling；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 胡炽文 刘鹰翔 《中国药学（英文版）》 2010年19卷1期 34-37页ISTICCSCDCA
【摘要】 本文以鬼臼毒素为起始原料,三甲基碘硅烷为碘代试剂,采用"一锅法"成功合成了鬼臼毒素衍生物GL331.通过分子对接的方法探讨TGL331与DNA拓扑异构酶Ⅱα的结合位点及作用模式.结果表明,GL331与DNA拓扑异构酶Ⅱα的ATP结合位点紧密...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 牛文娟 周鹏 等 《医用生物力学》 2024年39卷5期 846-852页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 针对生物可降解血管支架植入后产生的晚期支柱血栓问题,建立随机有限元模型,从分子量和应力角度对聚合物血管支架降解过程进行生物力学分析.方法 建立以聚乳酸(poly lactic acid,PLA)高分子材料为例的可降解血管支架降解过程的...
【关键词】 可降解聚合物血管支架；降解模型；非均匀破碎；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 夏悦昕 邵林楠 等 《临床输血与检验》 2024年26卷6期 792-796页ISTICCA
【摘要】 目的 利用血清学及PacBio三代测序技术鉴定1例罕见cisAB亚型,利用分子对接探讨糖基转移酶氨基酸突变导致亚型的分子机制.方法 利用免疫血清学试验鉴定ABO表型,利用PacBio三代测序方法鉴定其基因型.突变后的糖基转移酶同源建模和分子...
【关键词】 cisAB亚型；PacBio三代测序；同源建模；
- 概要：
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【中文期刊】 季晶 《临床神经外科杂志》 2024年21卷4期 361-364,370页ISTIC
【摘要】 颅脑外伤(TBI)是导致伤害相关死亡和残疾的疾病之首,其治疗和预后评估面临重大挑战.无论是从受伤性质、时间、严重程度等维度上,TBI的异质性导致诊疗策略复杂化.目前已有多个版本较为完善的指南指导着TBI的全流程诊疗,但是包括手术时机和干预方...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Run Han Zhuyifan Ye 等 《亚洲药物制剂科学（英文版）》 2023年18卷3期 104-117页
【摘要】 Liposome is one of the most widely used carriers for drug delivery because of the great biocompatibility and biodegradab...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张芝琳 陈耀 等 《食品与发酵工业》 2023年49卷13期 1-8页
【摘要】 D-塔格糖是一种稀有的具有特殊保健功能的天然食品甜味剂.目前,以D-半乳糖为底物,基于异构化途径的D-塔格糖生物合成受到基本的热力学平衡限制,底物转化率较低;而基于氧化还原途径,可通过热力学耦合辅因子避免不必要的逆反应,具有更高的理论转化率...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Gérard Vergoten Christian Bailly 《数字中医药（英文版）》 2022年5卷3期 276-285页
【摘要】 目的 Bouchardatine(1)是从植物Bouchardatia neurococca中分离得到的一种β-吲哚喹唑啉生物碱,可作为脂肪生成的一种调节剂及一种抗癌药.天然产物作为蛋白腺苷5'-单磷酸(AMP)活化蛋白激酶(AMPK)和组...
【关键词】 组蛋白去乙酰化酶1；生物碱；Bouchardatine；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《生物医学与环境科学（英文版）》 2012年25卷5期 590-596页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Objective To investigate the theoretical model of the three‐dimensional structure of mosquitocidal Cry30Ca2 and its mole...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《世界胃肠病学杂志（英文版）》 2010年16卷2期 201-209页SCIMEDLINEISTIC
【摘要】 AIM:To evaluate the suitability of rupintrivir against Enterovirus 71 (EV71) induced severe clinical symptoms using comp...
【关键词】 Rupintrivir；Hand foot and mouth disease；Molecular mechanics Poisson-Boltzmann/surface area；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《植物学报（英文版）》 2009年51卷11期 1040-1049页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Substrate selectivity of glycerol-3-phosphate acyltransferase (EC 2. 3. 1. 15) of rice (Oryza sativa L.) was explored in...
【关键词】 glycerol-3-phosphate acyl transferase；homology modeling；dce；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《中国免疫学杂志(英文版)》 2007年4卷2期 121-125页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 In this study, we discussed the necessity of human IgG1 Cγ1 domain for recombinant antibody using computeraided homology...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《中国免疫学杂志（英文版）》 2006年3卷6期 439-443页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Two novel engineered antibody fragments binding to antigen CD20 were generated by fusing a murine IgM-type anti-CD20 sin...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《细胞研究（英文版）》 2004年14卷5期 423-433页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 It is well documented that the glycosylation of E-cadherin is correlated with cancer metastasis, but whether Ecadherin c...
【关键词】 Core fucosylated E-cadherin；prognosis；cancer metastasis；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《中国药理学与毒理学杂志》 2018年32卷4期 280-281页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 OBJECTIVE To study the bioactive phytochemicals in the leaves of A.ilicifolius against Hepatocellular carcinoma (HCC) th...
【关键词】 Acanthus ilicifolius；phytochemical；molecular modeling；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《药物分析学报（英文）》 2016年5卷5期 300-306页SCIMEDLINECSCDCA
【摘要】 The inclusion complexes of poorly water-soluble cephalosporin, cefuroxime axetil (CFA), were prepared withβ-cyclodextrin...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《药物分析学报（英文）》 2014年4卷6期 392-398页SCIMEDLINECSCDCA
【关键词】 Flavonoids；Human serum albumin；Structure-activity relationship；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张丽娟 白兰 等 《中国药房》 2017年28卷25期 3506-3510页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:研究戊乙奎醚光学异构体对毒蕈碱型(M)受体亚型的亲和性,为揭示戊乙奎醚的作用靶点及药效选择性提供参考.方法:利用同源建模和分子对接等分子模拟技术,通过比较戊乙奎醚不同光学异构体R1(3R,2′R)、R2(3R,2′S)、S1(3S,2...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 刘保艳 李帅 等 《生物工程学报》 2025年41卷3期 917-933页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 计算模拟驱动的生物元件、代谢网络乃至细胞系统的机理解析、定向改造和按需设计,可为解决不同层次的生物学问题提供新的技术方案,已成为生物制造的核心研究内容.在蛋白元件的计算模拟方面,基于物理原理的传统方法利用计算机软件和数学模型来模拟生物体系中...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐飞 于慧 等 《南京中医药大学学报》 2016年32卷5期 451-455页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的：研究泽泻调脂效应物质泽泻醇类化合物23-乙酰泽泻醇 B、24-乙酰泽泻醇 A 对高脂小鼠调血脂作用及其分子机制。方法建立高脂小鼠模型,检测泽泻醇给药后的总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C),检测了脂代谢...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘锦 徐忠 等 《中国组织工程研究》 2013年7期 1207-1211页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:众多研究结果显示 srGAP2分子在突起生长和突触可塑性起到关键的作用,但具体机制不明.目的:检测 srGAP2在致痫大鼠模型中的表达,探讨 srGAP2与难治性癫痫发病机制的相关性.方法:选取雄性 SD 大鼠56只随机分为7组,其中...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李云双 周虹 等 《天然产物研究与开发》 2013年25卷9期 1175-1179页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是植物中类黄酮生物合成途径的关键酶,其催化对-香豆酰辅酶A和丙二酸单酰辅酶A发生缩合反应.本研究以苜蓿CHS的晶体为模板,利用同源建模构建决明CHS的三维模型.经过动力学优化后,决明...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 索慧荣 《天津医科大学学报》 2017年23卷2期 132-137页ISTIC
【摘要】 目的:研究抗感染药物作用新靶点CrtN的结构及其与抑制剂萘替芬的作用机制,为新型CrtN抑制剂的发现奠定基础.方法:采用同源模建获得CrtN的三维结构,然后用分子动力学方法优化初始结构,并用Ramachandran图评估结果,最后通过活性位...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙彬 刘敏 等 《中国真菌学杂志》 2017年12卷4期 193-197,215页ISTICCSCD
【摘要】 目的 探究白念珠菌几丁质合成酶活性位点的结构特征.方法 通过采用同源建模的方法首次构建白念珠菌几丁质合成酶的三维结构模型,模型的可靠性经Ramachandran和Profile-3D图进行验证.采用InsightⅡ-Binding site...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Shiwen Zhang Jianzhen Zou 等 《中草药（英文版）》 2025年17卷2期 307-314页MEDLINEISTICCSCD
【摘要】 Objective:To characterize a glycosyltransferase(RpUGT1)from Rheum palmatum and investigate its specificity toward flavon...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈雯雯 张锋 《生物技术》 2025年35卷2期 169-176,145页ISTICCA
【摘要】 [目的]基于微阵列数据挖掘乳腺癌的生物标志物,筛选其靶向中药.[方法]下载乳腺癌的临床微阵列数据以筛选差异表达基因,构建基因共表达网络,并基于12种算法筛选核心基因.通过卡普兰迈尔(Kaplan-Meier)和比例风险回归模型(Cox pr...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 邢家强 李佳林 等 《微生物学免疫学进展》 2016年44卷3期 23-28页ISTICCA
【摘要】 目的：同源模建轮状病毒NSP1 C末端效应区及干扰素调节因子IRF3、IRF5、IRF7结合结构域( IAD)的三维结构,应用分子对接的方法,预测NSP1与IRF的候选结合氨基酸残基。方法以ProtScale进行疏水性分析,APBS进行表观...
【关键词】 NSP1；干扰素调控因子家族(IRFs)；三维结构；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张桥石 李灌澍 等 《生物信息学》 2016年14卷3期 139-145页ISTIC
【摘要】 大肠杆菌分子伴侣蛋白DnaK氮端核苷酸结合域（ NBD， nucleotide-binding domain）的II－A和II－B子域之间的一些高度保守的扭链残基突变后（ I202A， S203A， G223A，L 227A， G228A）...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《定量生物学（英文版）》 2019年7卷2期 110-121页
【摘要】 Background:Molecular competition brings about trade-offs of shared limited resources among the cellular components,and t...
【关键词】 systems biology；computational modeling；molecular competition regulation；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杜迎翔 严智 《西北药学杂志》 2015年6期 766-768页ISTICCA
【摘要】 目的：阐述近年来毛细管电泳手性拆分的机理研究进展。方法归纳国内外最新的文献报道，对目前主流的三类毛细管电泳手性识别机理研究方法进行综述。结果采用计算机分子模拟，结合毛细管电泳分析法和光谱分析法，可以从分子水平上研究毛细管电泳拆分体系的手性识...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 肖文君 胡帅 等 《激光生物学报》 2014年23卷2期 147-154页ISTICCA
【摘要】 高丝氨酸激酶(EC 2.7.1.39)是拟南芥中合成甲硫氨酸和苏氨酸的关键酶之一.作者利用DNAMAN软件分析高丝氨酸激酶的氨基酸组成和等电点;利用生物信息学在线网站预测分析其疏水性、二级结构、跨膜结构域、信号肽区域、PEST序列、化学修饰...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郑敏婧 李晓云 等 《生物信息学》 2013年11卷4期 287-292页ISTIC
【摘要】 本文对PIUGTs进行同源建模,并分析其与底物结合的构象及活性位点.通过SWISS-MODEL在线对PlUGTs进行模板预测和选择,运用Swiss-PdbViewer软件显示和优化,利用ACDLABS绘制糖基供体小分子(酶结合底物),最后通...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱梦丽 朱乾坤 等 《生物信息学》 2013年11卷4期 243-249页ISTIC
【摘要】 本文通过序列分析获得了铁皮石斛甘露糖结合凝聚素(Dendrobium officinale mannose-binding lectin,DOL)成熟肽和甘露糖结合位点(50-58AA,81-89AA,116-124AA).通过同源建模建立...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘志刚 邓贝 等 《生物信息学》 2013年11卷2期 130-135页ISTIC
【摘要】 运用同源模建的方法构建了pACY1三维结构模型,并在能量最小化后对模型进行分子动力学模拟和结构合理性评估.同源模建生成了50个原始模型,经过PROCHECK评测后,筛选出模型A、B进行能量最小化,并得到模型A1、B1.分子动力学模拟结果表明...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 光翠娥 桑尚源 等 《食品与生物技术学报》 2018年37卷1期 15-19页
【摘要】 采用内源荧光光谱、圆二色光谱以及分子模拟表征了大豆皂苷Ⅱ与牛血清白蛋白(BSA)之间的相互作用.内源荧光光谱显示,大豆皂苷Ⅱ使BSA最大发射波长略微蓝移且出现荧光猝灭,色氨酸残基的微环境疏水性增加,蛋白质分子构象发生改变;大豆皂苷Ⅱ也使BS...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵倩男 程雅迪 等 《湖南师范大学自然科学学报》 2018年41卷1期 41-47页
【摘要】 利用同源模建的方法构建GPR119蛋白三维结构,经多种方法优化并用Profiles-3D和拉氏图评估后,得到最优蛋白模型,计算分析得到5个可能的活性位点,分析其活性位点氨基酸组成情况,发现了潜在保守序列.构建并优化了吡唑并嘧啶类药物小分子,...
【关键词】 G蛋白偶联受体GPR119；同源模建；活性位点；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李任峰 田香勤 等 《生物信息学》 2010年8卷1期 47-51页ISTIC
【摘要】 为了深入研究猪胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacillus pleuropneumonie,App)转铁结合蛋白基因(Transferrin Binding Proteins,Tbp)的生物学特性,采用生物信息学方法,对GenBank中的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘元东 刘楚干 等 《现代生物医学进展》 2008年8卷6期 1057-1060页ISTICCA
【摘要】 为考察来源于极端高温酸性环境中的超氧化物歧化酶,建立了一个由嗜酸热原体茵的sod基因编码的蛋白质的可靠三维分子结构,并对这个蛋白质进行进化踪迹分析识别出了11个踪迹残基?其中,残基Asn39,Gly105和Glu162的位置随机遍布整个结构...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周仲华 张达 等 《华南师范大学学报（自然科学版）》 2017年49卷3期 59-67页
【摘要】 利用生物信息学方法从天然植物中筛选天然PPO酶源.用PPO保守序列从Uniport中检索到529条植物源PPO,除去重复的和不完整的序列后,得到178条PPO序列.用同源建模法,以甘薯PPO晶体结构(1BUG)为模板,构建各PPO的三维结构...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王永刚 杨光瑞 等 《光谱学与光谱分析》 2017年37卷8期 2474-2479页
【摘要】 采用多种光谱技术结合圆二色谱技术研究了考马斯亮蓝G-250(CBBG-250)相互作用于牛血清白蛋白(BSA),探究了两者之间的作用机理.荧光光谱结果表明BSA与CBBG-250结合形式是静态猝灭,随CBBG-250浓度增加,其形成常数随温...
【关键词】 光谱法；分子模拟；考马斯亮蓝G-250；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴玲 何佩勋 等 《化学研究与应用》 2017年29卷6期 841-846页
【摘要】 G蛋白偶联受体81(GPR81)激动剂不仅可以发挥出GPR109A激动剂治疗血脂障碍的功效,还可降低副作用,但GPR81属于膜蛋白且三维结构未知,其与药物作用情况仍难以解析.本文基于已知的GPR81一级序列,采用同源模建的方法构建GPR81...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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