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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2019年17卷2期 211-218页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 As next-generation sequencing (NGS) technology has become widely used to identify genetic causal variants for various di...
【关键词】 Next-generation sequencing；Quality assessment；1000 Genomes Project；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙显赫 郭云波 等 《南方医科大学学报》 2011年31卷4期 610-614页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研制一个基于高性能计算机和Linux下运行的采用B/S模式的微阵列数据处理平台.方法 构建以Apache服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,整合R语言与Bioconductor中的微阵列数据分析软件包,满足寡核苷酸微阵列...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 甄一松 张伟丽 等 《生物信息学》 2011年09卷2期 138-141,145页ISTIC
【摘要】 R是用于统计计算和数据作图的编程语言和程序设计环境,能在多种平台下编译和运行.Bioconductor也是免费开源的程序设计环境,它主要基于统计编程语言R,用于基因组数据的分析.我们通过已发表的数据,包含斑马鱼心肌再生的生物芯片数据,分析源...
【关键词】 R；BioConductor；生物芯片；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 卢娟 郑剑锋 《实验与检验医学》 2015年6期 711-713,744页CA
【摘要】 目的：利用公共数据库挖掘肝癌发生过程的关键基因，为后续的功能验证奠定基础。方法以肝癌表达谱芯片数据GSE33006为例，采用免费开源的R/BioConductor分析工具，介绍基本分析步骤，对肝癌表达谱数据进行分析。结果芯片数据GSE330...
【关键词】 肿瘤数据库；基因表达；R/BioConductor；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴淑艳 李利清 等 《航天医学与医学工程》 2026年37卷1期 17-23页MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 以网络药理学和分子对接技术为基础,探讨加味辛夷散对变应性鼻炎(AR)的潜在治疗机制.方法 利用TCMSP数据库筛选加味辛夷散的活性成分和作用靶点.从GeneCards、OMIM数据库获得AR相关靶点,使用Venny2.1在线作图工具平...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 魏巧连 刘禹欣 等 《新中医》 2026年58卷5期 197-204页ISTICCA
【摘要】 目的:基于网络药理学及动物实验验证分析四神煎治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取四神煎药物有效成分及对应靶点,并通过Uniprot数据库获取靶点的标准化基因名.通过Genecards...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 白聪聪 周先雷 等 《吉林大学学报（医学版）》 2025年51卷2期 392-402页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨硫酸软骨素蛋白聚糖4假基因12(CSPG4P12)在小细胞肺癌(SCLC)组织中的表达、与免疫浸润的关系及其对细胞生物学功能的影响,阐明其在SCLC发生发展中的作用.方法:通过ArrayExpress数据库检索获得的SCLC的E-...
【关键词】 硫酸软骨素蛋白多糖4假基因12；免疫浸润；遗传变异；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张赫怡 张泽涵 等 《世界中医药》 2025年20卷21期 3816-3825页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:基于网络药理学和细胞实验探讨桑白皮-葶苈子配伍治疗慢性心力衰竭(CHF)可能的作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库获取桑白皮-葶苈子的化学成分,口服生物利用度(OB)≥30％和类药性(DL)≥0.18...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈方飞 刘雅玲 等 《西部中医药》 2025年38卷4期 47-52页ISTIC
【摘要】 目的:运用网络药理学方法探讨丹参-红花药对治疗糖尿病周围神经病变(diabetic pe-ripheral neuropathy,DPN)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medi...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张昊 李玲敏 等 《解剖学报》 2025年56卷1期 37-42页ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 利用网络药理学结合分子对接技术探讨岩大戟内酯B治疗胃癌的作用机制.方法 利用SwissTargetPrediction 数据库预测岩大戟内酯 B 潜在作用靶点;搜索 Genecards、OMIM、Drugbank、TTD 和 Phar...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 芦峰 覃进 等 《中国中医急症》 2025年34卷1期 6-12页ISTIC
【摘要】 目的 基于网络药理学及分子对接技术,分析参附汤治疗重症缺血性脑卒中(SIS)的作用机制.方法 通过TCMSP数据库,筛选人参、附子的主要活性成分及作用靶点;通过 TTD、PharmGKB、OMIM、Drug-Bank、GeneCards 5...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 魏莹 徐守竹 等 《中国药业》 2025年34卷17期 51-57页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨舒肝解郁胶囊治疗卒中后抑郁(PSD)的作用机制.方法 检索Batman-TCM数据库,获取药物活性成分及靶点,通过DisGeNET,Genecards数据库获取PSD疾病靶点,通过R语言"Veen"包筛选舒肝解郁胶囊与PSD的共有...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李晓宇 卢慧敏 等 《血管与腔内血管外科杂志》 2025年11卷4期 448-454页ISTIC
【摘要】 目的 采用生物信息学方法筛选下肢深静脉血栓(DVT)相关的差异表达基因(DEG),探讨下肢DVT形成的病理机制.方法 从基因表达数据库(GEO)下载GSE48000数据集进行样本分析,样本来源为GSE48000数据集中的132个样本,包括D...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李亚晶 邓洪儒 等 《血管与腔内血管外科杂志》 2025年11卷2期 191-196页ISTIC
【摘要】 目的 通过采用集成的生物信息学工具探索新的静脉血栓栓塞症(VTE)生物标志物和潜在的治疗靶点.方法 利用基因表达综合数据库(GEO)获取VTE患者和非VTE患者的基因数据.应用R4.2.0软件中的limma程序包筛选差异表达基因(DEG),...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 魏鹏程 王荣洁 等 《中国医药导刊》 2025年27卷8期 840-846页ISTIC
【摘要】 目的:基于网络药理学的理论框架,深入探讨三七治疗骨质疏松性骨折发挥作用的机制.方法:利用TCMSP数据库对三七主要活性成分和作用靶点进行筛选,应用GeneCards和OMIM数据库对骨质疏松性骨折相关靶点进行预测,使用微生信在线平台制作维恩...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 吴佳俊 张曾 等 《现代中西医结合杂志》 2025年34卷5期 624-631页ISTICCA
【摘要】 目的 基于网络药理学与分子对接方法探析"仙茅-淫羊藿"药对治疗 2 型糖尿病性骨质疏松(T2DOP)的核心靶点与作用机制.方法 借助TCMSP数据库搜寻"仙茅-淫羊藿"药对的有效活性成分,利用GeneCards数据库查找T2DOP相关基因,...
【关键词】 仙茅-淫羊藿；2型糖尿病性骨质疏松；网络药理学；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱芳丽 马晓莹 等 《安徽医药》 2025年29卷8期 1618-1622,后插8页ISTICCA
【摘要】 目的 基于基因表达综合数据库(GEO)分析急性胰腺炎(AP)病人基因表达差异,并进行验证.方法 2023年9-12月从GEO数据库下载基因表达综合系列(GSE)24279基因数据,使用Bioconductor中的Limma包筛选差异表达基因...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘金响 张艳婷 等 《现代中西医结合杂志》 2025年34卷2期 197-203页ISTICCA
【摘要】 目的 基于网络药理学探讨麝香治疗脑出血(ICH)的分子机制,为进一步实验研究提供依据.方法 首先检索BATMAN-TCM数据库得到麝香的有效成分及靶基因;再检索Gene-Cards、数据库OMIM数据库以及DisGeNET数据库等疾病数据库...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 武国浩 付波 等 《中国口腔颌面外科杂志》 2025年23卷4期 340-346页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨Nemo样激酶(Nemo-like kinase,NLK)以及磷酸酶和张力蛋白同源物(phosphatase and tensin ho-molog deleted on chromosome ten,PTEN)在头颈部鳞癌(he...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王贺勇 熊兰月 等 《中医临床研究》 2025年17卷21期 1-10页
【摘要】 目的:用网络药理学和分子对接技术探究鱼腥草治疗肾病综合征的作用机制,以期发现其分子层面的疗效证据,为临床应用提供理论基础.方法:用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN等数据库结合文献,以口服生物利用度≥30%、类药性≥...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 彭靓 曹保娣 等 《黑龙江医学》 2025年49卷4期 391-394页
【摘要】 目的:基于生物信息学评价CERK基因在上皮性卵巢癌中的预后意义.方法:通过GEO数据库和TCGA数据库下载并整理上皮性卵巢癌的基因表达谱数据及临床信息,使用R/Bioconductor中的limma包筛选GSE26712数据集中的差异表达基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 莫荣华 罗宏礼 《中国处方药》 2025年23卷12期 5-9页
【摘要】 目的 运用网络药理学的方法,研究化橘红治疗支气管炎的药理作用机制.方法 通过TCMSP数据库及BATMAN两个数据库获取化橘红的主要活性化学成分,收集化橘红的主要活性成分和支气管炎所对应的疾病靶点;通过GeneCards和Home-OMIM...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈欣 陈雪 等 《妇儿健康导刊》 2025年4卷14期 191-198页
【摘要】 目的 对辛夷-苍耳子药对治疗小儿哮喘机制进行网络药理学研究.方法 基于中药系统药理学数据库与分析平台、GeneCards、在线人类孟德尔遗传等数据库,筛选辛夷-苍耳子药对以及哮喘的靶点基因,应用Venny软件获取两种药物活性成分与疾病的靶点...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈四茹 王辉 《中医临床研究》 2025年17卷17期 104-110页
【摘要】 目的:基于网络药理学分析龙葵治疗宫颈癌的潜在作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),根据药代动力学参数筛选龙葵的主要活性成分及相关作用靶点,采用CytoScape软件构建龙葵的有效成分-靶点网络图.在GeneCar...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王卓溪 周亚滨 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2024年26卷2期 543-556页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 基于网络药理学与分子对接探讨真武汤治疗慢性心力衰竭(Chronic heart failure,CHF)的作用机制并进行实验验证.方法 通过TCMSP数据库检索真武汤的活性成分与作用靶点;通过OMIM、TTD与GeneCards数据库...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 蔡世揿 毛雷鸣 等 《中国药理学通报》 2024年40卷5期 945-954页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 研究党参-茯苓治疗酒精性肝病的潜在机制.方法 利用TCMSP、Swiss Target Prediction获得党参茯苓有效成分及作用靶点;OMMI、DisGeNET、GeneCards数据库获取酒精性肝病(alcoholic liv...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 芦文娟 张禄璐 等 《中药药理与临床》 2024年40卷6期 25-32页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:运用网络药理学及实验验证的方法探讨小补肝汤干预运动性疲劳的有效成分及可能作用机制.方法:在中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索小补肝汤的活性成分;通过人类基因组数据库(Genecards)、药物数据库(Drugbank)、在线人类...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 熊敏 张小波 等 《中药药理与临床》 2024年40卷9期 48-54页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用网络药理学和动物实验探究戊己丸治疗代谢性炎症的作用机制.方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索戊己丸中黄连、吴茱萸的化学成分和作用靶点;通过GeneCards、OMIM等数据库查询靶点对应的基因,Cytoscape 3...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐俊 张彦红 等 《河南中医》 2024年44卷4期 542-548页ISTIC
【摘要】 目的:基于网络药理学与细胞实验探讨加味黄芪桂枝五物汤治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Syste...
【关键词】 类风湿关节炎；加味黄芪桂枝五物汤；PI3K/AKT信号通路；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 彭景 陈星 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年22卷2期 231-238页ISTIC
【摘要】 目的:采用网络药理学探讨醒脑静注射液"异病同治"急性脑梗死(ACI)与急性脑出血(ACH)的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)与中医药综合数据库(TCMID)获得醒脑静注射液的有效成分及其作用靶点,同时利用人类...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕智豪 刘华熙 等 《沈阳药科大学学报》 2024年41卷12期 1562-1574页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 运用网络药理学结合实验验证探讨白头翁汤治疗结直肠癌的作用机制.方法 在中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysi...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 宋泽龙 吉旭彬 等 《山西医药杂志》 2024年53卷5期 346-350,封3页ISTICCA
【摘要】 目的 通过网络药理学探究三妙丸对强直性脊柱炎的作用机制,并使用分子对接技术进一步分析相关有效成份及核心靶点.方法 中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索三妙丸有效成份及作用靶点,使用人类基因数据库(GeneCards)、在线人类孟...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘雅玲 唐勇华 等 《西部中医药》 2024年37卷11期 44-49页ISTIC
【摘要】 目的:基于网络药理学方法探讨蒲黄治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的作用机制.方法:运用中药系统药理分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacolo...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄倩 张瀚涛 等 《中医药导报》 2024年30卷6期 1-9,28页ISTIC
【摘要】 目的:通过网络药理学和体外实验探讨西黄丸抑制肺癌A549细胞侵袭转移的药效学作用及机制.方法:通过检索TCMSP、TCMID、PubChem数据库筛选西黄丸有效成分及其靶点;搜索GeneCard数据库、OMIM数据库和DrugBank数据库...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李林 孙小慧 等 《西部中医药》 2024年37卷11期 75-81页ISTIC
【摘要】 目的:基于网络药理学和分子对接技术,探究虎杖治疗桥本氏甲状腺炎(Hashimoto's thyroiditis,HT)的作用机制.方法:从传统中医药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine sys...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 宿家铭 彭景 等 《中国中西医结合肾病杂志》 2024年25卷8期 707-710,后插5-后插6页ISTIC
【摘要】 目的:基于生物信息学方法识别和构建与糖尿病肾病(DN)相关的miRNA-mRNA调控网络和关键基因.方法:从GEO数据库获取DN相关miRNA和mRNA表达数据集.通过R软件"limma"包筛选差异表达基因;从miRDB、Tar-getSc...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 宋云升 白湘玉 等 《中国中西医结合外科杂志》 2024年30卷4期 536-542页ISTICCA
【摘要】 目的:探索食管鳞状细胞癌(ESCC)可能的作用靶点及其发病机制,并利用生物信息学技术预测潜在治疗ESCC的中药.方法:通过检索GEO数据库获取ESCC的基因芯片,从中筛选出差异基因.利用R软件包"ColorsESCCE、Stringi、GG...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 于倩 赵琳琳 等 《中国实验诊断学》 2024年28卷11期 1344-1350页ISTIC
【摘要】 目的 利用表观基因组学数据探究阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)中差异基因的表达.方法 从GEO(gene expression omnibus,GEO)数据库中下载mRNA表达微阵列数据集GSE1297和GSE4...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 隋秀林 徐晓彤 等 《中国中西医结合皮肤性病学杂志》 2024年23卷2期 132-137页ISTICCA
【摘要】 目的 基于网络药理学研究外用派特灵治疗尖锐湿疣(CA)的作用机制.方法 基于网络药理学的方法,经研究表明派特灵是主要由金银花、苦参、白花蛇舌草、鸦胆子、五倍子、蛇床子和大青叶等组成的中药复方制剂,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMS...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曲欣妮 李文标 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2023年25卷5期 1689-1701页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 应用网络药理学方法 预测和分析甘草苷治疗帕金森病的作用机制,并选取凋亡信号通路进行细胞水平实验验证.方法 从BATMAN-TCM、PharmMapper、SEA、SuperPred、SwissTargetPrediction等数据库获...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王飞 徐莉莉 等 《中成药》 2023年45卷7期 2398-2402页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学和动物实验探讨小续命汤治疗缺血性卒中的作用机制.方法 采用网络数据库获取小续命汤的成分及其对应的作用靶点、缺血性卒中的疾病靶点,Venny 2.1.0 软件获取成分-疾病靶点交集,STRING数据库进行蛋白互作(PPI)...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周玲 唐梅文 等 《实用中医内科杂志》 2024年38卷9期 63-68,中插10-中插12页
【摘要】 目的 通过运用网络药理学和分子对接技术,初步探讨七方胃痛颗粒治疗慢性萎缩性胃火(chronicatrophic gas-tritis,CAG)的潜在作用机制.方法 通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库获取七方胃痛颗粒的活性成分和潜在作...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 林文杰 吴慧萍 《创伤与急诊电子杂志》 2024年12卷1期 40-52页
【摘要】 目的 本研究通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)和多种机器学习方法识别脓毒症免疫抑制特征基因,并预测其靶向中药活性成分.方法 从美国国家生物技术信...
【关键词】 脓毒症；免疫抑制；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张丽娟 汤新乐 等 《新疆医学》 2024年54卷1期 12-16,29页
【摘要】 目的 采用网络药理学方法和分子对接技术探究大黄素治疗骨质疏松的作用机制.方法 利用Pubchem数据库获取大黄素的化学代表结构,借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索获得大黄素的分子靶点,利用DisGenNet数据库获取...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王静 李璐璐 等 《神经药理学报》 2024年14卷3期 27-35,46页
【摘要】 目的:通过网络药理学预测蒲公英抗胃癌的活性成分和主要靶点,探析其治疗胃癌的作用机制.方法:采用TCMID、PubChem以及Swiss Target Prediction等数据库检索蒲公英的潜在活性成分,预测蒲公英潜在的作用靶点.利用OMI...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张文正 李纯璞 等 《中国当代医药》 2024年31卷33期 14-19页CA
【摘要】 目的 利用网络药理学研究续断治疗骨质疏松性骨折的分子作用机制.方法 通过中药系统药理学平台(TCMSP)数据库筛选续断主要活性成分及作用靶点,应用GeneCards数据库预测骨质疏松性骨折的相关靶点,制作维恩图获取续断与骨质疏松性骨折的共同...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王星星 王欣 等 《临床医学研究与实践》 2024年9卷4期 36-39,44页
【摘要】 目的 基于网络药理学探讨止痛消炎膏治疗慢性湿疹的分子作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、PubChem数据库筛选止痛消炎膏的潜在活性成分[口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 靳紫翔 吴汶轩 等 《中医临床研究》 2024年16卷30期 1-9页
【摘要】 目的:基于网络药理学的方法筛选石志乔主任常用药组黄芩-白术-茯苓中的活性成分,构建核心成分-疾病-靶点网络,探讨其治疗糖尿病的分子作用机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),筛选得到黄芩-白术-茯苓中的活性化合物成分及...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 魏惠平 李淑玲 等 《实用中医内科杂志》 2024年38卷8期 89-92,后插3-后插6页
【摘要】 目的 基于网络药理学和动物实验探讨当归红芪超滤物(RAS-RH)防治放射性心脏病(RIHD)的潜在机制.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库遴选"当归-红芪"的活性成分及预测干预靶点.在Gen-eCards、人类孟德...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘姣 刘卿辉 等 《中国药物经济学》 2024年19卷2期 69-75页
【摘要】 目的 运用网络药理学和分子对接探讨颠倒泻心汤治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制.方法 用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选颠倒泻心汤药物靶点基因;GeneCards、OMIM数据库查找CAG靶点;韦恩在线绘图工具获得共同靶...
- 概要：
- 方法：
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