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【中文期刊】 Qiang He Dan Ma  等 《植物学报（英文版）》 2023年65卷6期 1423-1441页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Common buckwheat(Fagopyrum esculentum)and Tartary buckwheat(Fagopyrum tataricum),the two most widely cultivated buckwhea...

【关键词】 buckwheat； comparative genomics； flavonoid bio-synthesis；

【中文期刊】 Qiang He Yuqing Miao  等 《植物分类学报》 2024年62卷6期 1085-1102页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 Reynoutria multiflora is a widely used medicinal plant in China.Its medicinal compounds are mainly stilbenes and anthraq...

【关键词】 comparative genomics； genome assembly； Reynoutria multiflora；

【中文期刊】 Le Zhao Jiaqing Yuan  等 《动物学研究》 2024年45卷5期 1147-1160页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 Horseshoe bats(genus Rhinolophus,family Rhinolophidae)represent an important group within chiropteran phylogeny due to t...

【关键词】 Reference-quality genome； Comparative genomics； Population genomics；

【中文期刊】 苏相年 杨选文  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷8期 1340-1352页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 油棕(Elaeis guineensis)是棕榈科(Arecaceae)油棕属(Elaeis)重要的产油物种,具有较高的经济价值,在全球热带和亚热带地区被广泛栽培利用.为探究油棕线粒体基因组特征及线粒体基因组系统发育关系,本研究利用三代测序...

【关键词】 油棕； 线粒体基因组； 结构特征；

【中文期刊】 李震 黄强  等 《昆虫学报》 2024年67卷11期 1515-1524页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]油茶地蜂Andrena camellia是油茶Camellia oleifera最关键的授粉者之一.本研究旨在构建油茶地蜂全基因组图谱,并与蜜蜂科(Apidae)其他物种基因组进行比较,以探究油茶地蜂在进化上与蜜蜂科其他物种之间的近...

【关键词】 油茶地蜂； 基因组； 比较基因组；

【中文期刊】 尹以杭 原晓龙  等 《西部林业科学》 2024年53卷3期 1-11页

【摘要】 为了解高黎贡牛樟芝线粒体基因组的特征及系统发育,本研究利用高通量测序技术对高黎贡牛樟芝线粒体基因组进行测序组装、注释并对其组成特征与其他多孔菌目真菌的线粒体基因组进行比较分析.结果显示:(1)获得完整的高黎贡牛樟芝线粒体基因组,其大小为 1...

【关键词】 高黎贡牛樟芝； 线粒体基因组； 比较基因组；

【中文期刊】 罗婷 韩著  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 2154-2167页

【摘要】 旨在进一步完善牛支原体全基因组数据库,阐明其生物学功能和遗传进化关系,对西藏牦牛源牛支原体T10株进行了全基因组测序及其序列分析.使用Nanopore和Illumina PE150测序平台对T10株进行全基因组序列测定,利用生物信息学对其进...

【关键词】 牦牛； 牛支原体； 全基因组测序；

【中文期刊】 张梦洁 杨秀瑶  等 《广西植物》 2023年43卷10期 1849-1860页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 轮叶蒲桃(Syzygium grijsii)系桃金娘科(Myrtaceae)蒲桃属(Syzygium)常绿灌木,其开发前景较好,但其叶绿体基因组特征及系统发育关系尚未有相关报道.为弥补轮叶蒲桃基因组学方面的空缺,该文对轮叶蒲桃的叶绿体基因组...

【关键词】 轮叶蒲桃； 叶绿体基因组； 系统发育关系；

【中文期刊】 夏凯 刘芳美  等 《遗传》 2023年45卷10期 904-921页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 解脂亚罗酵母(Yarrowia lipolytica)是赤藓糖醇生产中使用的主要菌种,复合诱变是选育优良菌株的常用方法.然而,诱变处理所引起的基因组变化尚待探索.本研究对前期获得的高产菌株 CA20 和原始菌株 WT5进行基因组测序,并与已...

【关键词】 解脂亚罗酵母； 赤藓糖醇； 比较基因组；

【中文期刊】 Jacqueline Rehner Georges Pierre Schmartz  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷2期 405-417页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 High-quality DNA extraction is a crucial step in metagenomic studies.Bias by different isolation kits impairs the compar...

【关键词】 Whole-genome analysis； Comparative genomics； Short-read sequencing；

【中文期刊】 郭鑫瑶 季晶焱  等 《贵州医科大学学报》 2023年48卷9期 1003-1012页 ISTIC

【摘要】 目的 探讨41株戈登菌的系统发育学及其基因组中含碳水化合物活性酶、次级代谢产物生物合成基因簇的种类及多样性.方法 以公开发表的41株戈登菌全基因组数据为研究对象,利用原核生物泛基因组学分析的自动化软件对泛基因组特征进行分析,结合直系同源蛋白...

【关键词】 基因组； 戈登菌属； 16S小亚基核糖体RNA；

【中文期刊】 许婷婷 司静  等 《食品研究与开发》 2023年44卷18期 185-192页

【摘要】 长双歧杆菌由于其具有的益生功能而备受关注,该文旨在基于全基因组分析,揭示长双歧杆菌W13(Bifi-dobacterium longum W13)的基因特性,分析其功能基因和代谢通路.结果表明,长双歧杆菌W13隶属于长亚种,通过直系同源蛋白...

【关键词】 益生菌； 长双歧杆菌； 基因组；

【中文期刊】 韩国秀 张多英  等 《黑龙江大学自然科学学报》 2023年40卷3期 300-308页

【摘要】 菌株Y39-6是从哈尔滨周边地区地下水中分离的一株假单胞菌,具有异养反硝化和自养脱氮能力,由于假单胞菌属内的菌种鉴定存在复杂性,对菌株Y39-6的具体分类仍有争议.通过获得菌株Y39-6的全基因组序列,进行比较基因组学分析,分析了菌株的碳源...

【关键词】 反硝化细菌； 假单胞菌； 基因组；

【中文期刊】 Longlong Gao Lijun Hao  等 《针灸和草药（英文）》 2023年3卷4期 323-332页

【摘要】 Objective:This work aimed to report the first complete mitochondrial genome(mitogenome)of Rheum palmatum,summarize the f...

【关键词】 Caryophyllales； Mitochondrial genome； Molecular identification；

【中文期刊】 Shi-Jian Zhang Lei Liu  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2020年18卷3期 321-332页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The dynamic activity of transposable elements (TEs) contributes to the vast diversity of genome size and architecture am...

【关键词】 Brassicaceae； Comparative genomics； Gypsy retrotransposon；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2015年1期 73-76页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Since the proposal for pangenomic study, there have been a dozen software tools actively in use for pangenomic analysis....

【关键词】 Pangenomics； Pangenome； Comparative analysis；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2012年10卷2期 58-73页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 In the realm of bioinformatics and computational biology,the most rudimentary data upon which all the analysis is built ...

【关键词】 Genome assembly； Next-generation sequencing； Comparative assembly；

【中文期刊】 《植物分类学报》 2010年48卷2期 77-93页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 More than 190 plastid genomes have been completely sequenced during the past two decades due to advances in DNA sequenci...

【关键词】 chloroplast phylogenomics； comparative genomics； gene loss；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2009年7卷3期 143-146页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Circular genomes, being the largest proportion of sequenced genomes, play an important role in genome analysis. However,...

【关键词】 three dimensional； circular map； genome browser；

【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2007年5卷1期 35-44页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 We have recently cloned a pathogen inducible blast resistance gene Pi-kh from the indica rice line Tetep using a positio...

【关键词】 comparative genomics； blast resistance gene； genome analysis；

【中文期刊】 王琦 王柏秋  等 《中华医学杂志(英文版)》 2003年116卷4期 517-523页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Objective To investigate common chromosomal changes and the LOH frequency of microsatellite loci in primary gastric canc...

【关键词】 comparative genome hybridization； loss of heterozygosity； gastric cancer；

【中文期刊】 梁艳 张晓燕  等 《中国防痨杂志》 2017年39卷2期 129-133页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 研究、比较4种结核分枝杆菌增殖期抗原基因抗小鼠结核感染的作用,为开发新型结核病免疫治疗制剂提供实验依据.方法 将70只BALB/c小鼠采用数字表法随机分为7组,每组10只.以6.4×105菌落形成单位(CFU)结核分枝杆菌标准株H37...

【关键词】 分枝杆菌,结核； 细菌素质粒； 基因组成分；

【中文期刊】 陈欣洁 宋艳琴  等 《实用医学杂志》 2016年32卷13期 2181-2183页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的：探讨全基因组扩增技术（WGA）结合微阵列比较基因组杂交技术（Array-CGH）在低 DNA浓度的产前样本中的应用价值。方法：对18例有产前诊断指征的孕妇进行侵入性产前诊断，所抽取的羊水或绒毛样本经DNA提取后因DNA浓度较低行全基因...

【关键词】 全基因组扩增技术； 微阵列比较基因组杂交技术； 产前诊断；

【中文期刊】 李雪娟 黄原  等 《遗传》 2014年36卷9期 912-920页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 海南山鹧鸪(Arborophila ardens)对生境选择比较严格,种群数量稀少,属于濒危物种.为进一步研究山鹧鸪属的进化和系统发育关系,文章利用Illumina Hiseq2000高通量测序技术获得了海南山鹧鸪线粒体全基因组序列,从比较...

【关键词】 海南山鹧鸪； 线粒体基因组； 比较基因组学；

【中文期刊】 红梅 冯陈晨  等 《中国人兽共患病学报》 2014年30卷11期 1133-1136页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 为了了解布鲁氏菌S2疫苗株全基因组结构及分子生物学功能.方法 对布鲁氏菌疫苗株S2进行全基因组测序,并与GenBank公布的6株牛羊布鲁氏菌进行比较基因组学研究.结果与结论 通过全基因组测序发现S2基因组大小为3 331 982 bp...

【关键词】 布鲁氏菌； 布鲁氏菌疫S2疫苗株； 全基因组测序；

【中文期刊】 葛运生 孔辉  等 《中华检验医学杂志》 2013年36卷1期 46-49页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 评估高分辨微阵列比较基因组杂交技术(Array CGH)在临床复杂染色体异常遗传诊断中应用的可行性.方法 选取2010年12月至201 1年12月厦门市妇幼保健院遗传咨询门诊患者2例、产前诊断门诊患者2例.2例遗传咨询患者按无菌要求、...

【关键词】 比较基因组杂交； 微阵列分析； 染色体畸变；

【中文期刊】 张冬艳 冯燕  等 《中华预防医学杂志》 2012年46卷3期 252-257页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 比较浙江省腮腺炎流行株与疫苗株S79的全基因组序列差异.方法 选择浙江省于2005-2010年分离得到的4株腮腺炎流行株进行研究,分别为ZJ05-1、J06-3、ZJ08-1和ZJ10-1.采用RT-PCR法扩增流行株全基因序列,并与...

【关键词】 流行性腮腺炎； 疫苗； 基因组,病毒；

【中文期刊】 刘娜 郭云波  等 《南方医科大学学报》 2010年30卷2期 219-223页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 开发一个基于Web的本地服务器支持的功能全面的基因组比较和可视化平台,以加快对基因组的分析.方法 构建以Apache HTTP服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,优选整合了MUMmer、LAGAN、Mauve等多个基因组...

【关键词】 比较基因组学； 基因组比对可视化； 同线性；

【中文期刊】 杨虹 马月辉  等 《遗传》 2010年32卷3期 211-218页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 各种生物都具有其独特的遗传信息,深入了解生物体的形成过程以及各种生命活动都离不开基因组的研究成果.由于在世界范围内马具有良好的健康情况记录和详细的系谱记录,使得马成为生命科学研究中极具价值的模式动物.尽管起步较晚,但在过去的几年中,马基因组...

【关键词】 马； 基因组图谱； 基因组测序；

【中文期刊】 鲁黎明  《西北植物学报》 2009年29卷12期 2385-2390页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 以AtAKT1所编码的氨基酸序列为检索序列,通过对GenBank NR数据库以及EMBL、DDBJ、PDB数据库进行检索,发现水稻、小麦、大麦、玉米、烟草等作物中具有cds全长的34个疑似K~+通道基因.其中:水稻7个,玉米6个,烟草4个,...

【关键词】 农作物； 钾离子通道； 同源性分析；

【中文期刊】 王环环 肖冰  等 《中华医学遗传学杂志》 2017年34卷4期 509-513页 MEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 目的 探讨13q33-q34微缺失患儿基因组微缺失与临床表型的关系.方法 应用常规G显带技术分析4例患儿外周血染色体,应用比较基因组杂交芯片和单核苷酸多态性芯片检测患儿的微小基因组拷贝数改变.结果 常规染色体核型分析显示例1核型为46,XY...

【关键词】 13q33-34微缺失； 智力落后； 染色体核型分析；

【中文期刊】 贺静 王蕾  等 《中华医学遗传学杂志》 2015年32卷5期 687-690页 MEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 目的 分析一个X染色体短臂部分缺失伴Duchenne进行性肌营养不良家系Dystrophin基因的突变情况,以协助遗传咨询和产前诊断.方法 综合应用染色体G显带核型分析、多重连接依赖性探针扩增、微阵列比较基因组杂交、全基因组高通量测序对该家...

【关键词】 Duchenne进行性肌营养不良； Turner综合征； 染色体G显带核型；

【中文期刊】 康怀兴 徐晓蒙  等 《生物技术通讯》 2015年26卷3期 311-315页 ISTICCA

【摘要】 目的:分离鉴定一株沙门菌的烈性噬菌体,观察其形态大小,完成全基因组测序,分析其基因组结构和进化关系,为治疗沙门菌感染提供新的策略和实验依据.方法:以沙门菌SAL95作为指示菌从医院废水中分离噬菌体,分离到的噬菌体经浓缩和纯化后采用透射电镜观...

【关键词】 沙门菌； 烈性噬菌体； 全基因组测序；

【中文期刊】 岳超敏 方丛  等 《中华医学遗传学杂志》 2014年31卷3期 302-306页 MEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 目的 了解人类早期体外发育停滞胚胎染色体整倍体性,探索早期胚胎发育停滞与染色体非整倍体的关系,为胚胎发育停滞机制的下一步研究提供方向.方法 选择行胞浆内单精子注射受精的胚胎13枚:四细胞期停滞胚胎5枚,八细胞期停滞胚胎4枚,囊胚4枚,分别进...

【关键词】 微阵列比较基因组杂交技术； 植入前遗传学筛查； 整倍体性；

【中文期刊】 谭珂 狄玉芬  等 《中华医学遗传学杂志》 2010年27卷4期 387-392页 MEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 目的 建立一种可信的单细胞全基因组扩增(whole genome amplification.WGA)技术,结合比较基因组杂交(comparative genomic hybridization,CGH)分析单细胞的染色体拷贝数变化,探讨其...

【关键词】 引物延伸预扩增； 简并寡核苷酸引物-PCR； 比较基因组杂交；

【中文期刊】 张艳亮 涂植光  等 《国际遗传学杂志》 2009年32卷2期 94-99页 ISTICCA

【摘要】 基因组DNA拷贝数变化在许多人类疾病如肿瘤、遗传性疾病的发生发展中起重要作用.经典的细胞遗传技术(如核型分析和比较基因组杂交)由于分辨率低,只能检测较大的拷贝数变化.虽然荧光定量PCR和荧光原位杂交的分辨率大大提高了,但需要预先知道拷贝数变...

【关键词】 微阵列比较基因组杂交技术； 基因组； 拷贝数变化；

【中文期刊】 沈春修  《华北农学报》 2017年32卷3期 13-20页

【摘要】 为了挖掘水稻苗期耐冷基因,基于比较转录组分析,参考公共数据库中的基因序列信息设计靶位点,对冷胁迫条件下东乡野生稻苗期下调表达耐冷相关基因 BGIOSGA032296 进行TALEN基因组编辑技术构建,克隆酶切鉴定和序列比对结果表明, BGI...

【关键词】 比较转录组； 东乡野生稻； TALEN基因组编辑技术；

【中文期刊】 朱德全 尹红  等 《安徽农业科学》 2017年45卷15期 145-146,161页

【摘要】 动物双歧杆菌是一种常用的益生双歧杆菌菌株,常以益生菌的形式添加到乳制品和其他食品中.该研究就动物双歧杆菌基因组的最新研究进展、重要功能基因和比较基因组进行了综述,以期进一步推广应用该菌株.

【关键词】 动物双歧杆菌； 基因组； 功能基因；

【中文期刊】 富伟能 尚超  等 《中华医学遗传学杂志》 2006年23卷1期 7-11页 MEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 目的筛查声门上喉癌发生、发展及转移相关的异常染色体和重要基因. 方法应用比较基因组杂交(comparative genomic hybridization, CGH)分析喉声门上鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell c...

【关键词】 比较基因组杂交； cDNA芯片； 喉鳞状细胞癌；

【中文期刊】 李俊良 梁乃国  等 《中国甜菜糖业》 2014年2期 28-35页

【摘要】 本文简要介绍了甜菜染色体组的遗传图谱与物理图谱信息,重点阐述了甜菜全基因组测序结果以及在此基础上的功能基因组学、比较基因组学和不同基因型甜菜的种间差异上最新研究进展,对基因组研究成果在甜菜育种改良上应用做了简要介绍,并对其前景进行了展望.

【关键词】 甜菜； 基因组测序； 功能基因组；

【中文期刊】 Shen Liang Tong Yanfei  等 《感染性疾病与免疫（英文）》 2025年05卷1期 36-43页

【摘要】 Background::Streptococcus suis ( S. suis) can be transmitted to humans through exposure to pigs or consumption of r...

【关键词】 Streptococcus suis； Endophthalmitis； Meningitis；

【中文期刊】 艾对元  《兰州大学学报（自然科学版）》 2009年45卷z1期 34-38页

【摘要】 病毒基因组中的重复序列比率很低,因为其核酸序列大都是编码区域.如果出现一段同向对称或者是反向对称序列在病毒基因组中,它往往代表一个调控元件,或者是一个信号因子.我们总结了病毒中的一些对称序列,并阐明它的特点,分布及功能.

【关键词】 重复序列； 病毒基因组； 比较基因组学；

【中文期刊】 徐莹 兰肖敏  等 《微生物学报》 2024年64卷6期 1691-1703页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]阐述阿拉伯海假交替单胞菌(Pseudoalteromonas arabiensis)的分子进化与生态适应策略.[方法]借助Illumina HiSeq X Ten和Oxford Nanopore PromethION测序平台对一株分...

【关键词】 太平洋； 假交替单胞菌； 全基因组测序；

【中文期刊】 席飞 汤静  等 《微生物学报》 2024年64卷1期 303-322页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]探究生防菌贝莱斯芽胞杆菌(Bacillus velezensis)XRD006 对青皮核桃采后病害的生防能力及其贮藏保鲜效果,解析菌株的基因特性和次级代谢产物,了解菌株的抑菌机制.[方法]通过抑菌试验确定XRD006 对青皮核桃采后...

【关键词】 生防菌； 贮藏品质； 全基因组；

【中文期刊】 俞添天 徐莹  等 《微生物学报》 2024年64卷4期 1274-1288页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]开展具有硫氧化能力的嗜酸硫杆菌属(Acidithiobacillus)的分离及其比较基因组学分析,不仅可以丰富硫氧化细菌菌种资源,而且有助于加深理解嗜酸硫杆菌的分子进化与生态适应机制.[方法]利用以硫代硫酸钠为唯一能源的培养基分离具...

【关键词】 硫氧化细菌； 嗜酸硫杆菌； 基因组测序；

【中文期刊】 常晓云 汪婷  等 《微生物学通报》 2024年51卷8期 3103-3118页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 [背景]蜡蚧刺束梗孢(Akanthomyces lecanii)是重要的生防类虫生真菌,其线粒体基因组详细信息未见报道.[目的]系统研究蜡蚧刺束梗孢线粒体基因组信息,有助于明确该菌准确的系统发育地位,并为虫草科(Cordycipitacea...

【关键词】 蜡蚧刺束梗孢； 线粒体基因组； 虫草科；

【中文期刊】 张琪琪 李会荣  等 《微生物学通报》 2024年51卷1期 77-95页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 [背景]类诺卡氏菌(Nocardioides sp.)InS609-2是一株分离自南极洲罗斯海特拉诺瓦湾的恩克斯堡岛土壤中潜在的极地放线菌新种.尚无研究报道Nocardioides sp.InS609-2的全基因组序列,缺少对其功能基因、代...

【关键词】 类诺卡氏菌； 全基因组测序； 次级代谢产物；

【中文期刊】 周池 周诗晶  等 《微生物学报》 2024年64卷12期 4882-4901页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]评估辣椒内生菌贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)XY40-1的生防能力和促生效果,了解菌株的抑菌机制,为辣椒疫病的生物防治菌剂研发提供优良菌种及技术理论支撑.[方法]采用平板对峙、活体接种及显微镜观察法评估贝莱...

【关键词】 生防菌； 辣椒疫病； 内生菌；

【中文期刊】 吕薇 付瀚森  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷1期 63-77页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 白花除虫菊(Tanacetum cinerariifolium)是全球唯一集约化种植的杀虫园艺作物,从其头状花序提取的天然除虫菊酯广泛应用于有机农业和家居害虫防控,具有极高的商业价值.本研究通过Illumina HiSeq 2500测序平台...

【关键词】 除虫菊酯； 叶绿体基因组； 基因组比较分析；

【中文期刊】 刘坤 孙文松  等 《微生物学通报》 2024年51卷11期 4667-4686页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 [背景]细菌性软腐病是植物根部主要病害之一,可在作物生长期和储藏期造成巨大损失.2023 年本团队首次发现并报道了由Pseudomonas glycinae引起的人参细菌性软腐病.[目的]探索Pseudomonas glycinae XJF...

【关键词】 基因组； 比较基因组学分析； 效应因子；