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            1. Conserved noncoding sequences correlate with distant gene contacts in Arabidopsis and Brassica

            【中文期刊】 Lei Zhang Jian Wu  等 《植物学报（英文版）》 2023年65卷6期 1467-1478页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 Physical contact between genes distant on chro-mosomes is a potentially important way for genes to coordinate their expr...

            【关键词】 Arabidopsis； Brassica； conserved noncoding se-quences；

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            2. Systematic annotation of conservation states provides insights into regulatory regions in rice

            【中文期刊】 Xinkai Zhou Tao Zhu  等 《遗传学报》 2022年49卷12期 1127-1137页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 Plant genomes contain a large fraction of noncoding sequences.The discovery and annotation of conserved noncoding sequen...

            【关键词】 Rice； Comparative genomics； Conserved noncoding sequences(CNSs)；

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            3. Evaluating phylogenetic footprinting for human-rodent comparisons

            【外文期刊】 Sauer T ; Shelest E ; 等 《Bioinformatics》 2006年22卷4期 430-437页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 FACTOR-BINDING SITES; SPECIES SEQUENCE COMPARISONS; EMBRYONIC EPSILON-GLOBIN;

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            4. Tracking the Ancestry of a Deeply Conserved Eumetazoan SINE Domain

            【外文期刊】 Piskurek, Oliver ; Jackson, Daniel J. . ; 《Molecular biology and evolution》 2011年28卷10期 2727-2730页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 short interspersed element: SINE; transposable element; Deu-domain;

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            5. Molecular evolution of the trnT(UGU)-trnF(GAA) region in bryophytes

            【外文期刊】 Quandt D ; Stech M ; 《Plant biology》 2004年6卷5期 545-554页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 molecular evolution; non-coding chloroplast DNA; trnT-F;

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            6. Horizontal transfer of a plant transposon - art. no. e5

            【外文期刊】 Diao XM ; Freeling M ; 等 《PLoS biology》 2006年4卷1期 119-128页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 CONSERVED NONCODING SEQUENCES; GENE-TRANSFER; MITOCHONDRIAL GENES;

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            7. Promoter analysis of MADS-box genes in eudicots through phylogenetic footprinting

            【外文期刊】 De Bodt S ; Theissen G ; 等 《Molecular biology and evolution》 2006年23卷6期 1293-1303页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 phylogenetic footprinting; MADS-box genes; eudicots;

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            8. The Importance of Being Cis: Evolution of Orthologous Fish and Mammalian Enhancer Activity

            【外文期刊】 Ritter, Deborah I. ; Li, Qiang ; 等 《Molecular biology and evolution》 2010年27卷10期 2322-2332页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 genes: expression; conserved noncoding element: CNE; sequence conservation;

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            9. Analysis of hepatitis C virus RNA dimerization and core-RNA interactions

            【外文期刊】 Ivanyi-Nagy R ; Kanevsky I ; 等 《Nucleic Acids Research》 2006年34卷9期 2618-2633页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 RIBOSOME ENTRY SITE; CONSERVED 98-BASE SEQUENCE; 3' NONTRANSLATED REGION;

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            10. Evolution of non-specific lipid transfer protein (nsLTP) genes in the Poaceae family: their duplication and diversity

            【外文期刊】 Jang CS ; Yim WC ; 等 《Molecular biology reports》 2008年279卷5期 481-497页

            【关键词】 duplication; evolutionary fate; functional diversity;

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            11. Identification of distal enhancers for Six2 expression in pronephros

            【外文期刊】 Suzuki, Nanoka ; Hirano, Kodai ; 等 《The international journal of developmental biology》 2015年59卷4/6期 241-246页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Six2; conserved noncoding sequence; nephric enhancer;

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            12. Functional and comparative genomics reveals conserved noncoding sequences in the nitrogen‐fixing clade

            【外文期刊】 Wendell J. Pereira ; Sara Knaack ; 等 2022年234卷2期 634-649页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 comparative genomics; conserved noncoding sequences (CNS); Medicago truncatula;

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            13. Differential Gene Expression in the Human Brain Is Associated with Conserved, but Not Accelerated, Noncoding Sequences

            【外文期刊】 《Molecular biology and evolution》 2017年34卷5期 1217-1229页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 conserved noncoding sequence; gene expression; brain;

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            14. Evolution of developmental traits [Review]

            【外文期刊】 Kellogg EA ; 《Current opinion in plant biology》 2004年7卷1期 92-98页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Conserved noncoding sequences; Mads-box gene; Amborella-trichopoda;

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            15. Detection of broadly expressed neuronal genes in C-elegans

            【外文期刊】 Ruvinsky I ; Ohler U ; 等 《Developmental biology》 2007年302卷2期 617-626页

            【关键词】 C elegans; gene expression; pan-neuronal genes;

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            16. HAR1: an insight into lncRNA genetic evolution

            【外文期刊】 Waters, Ella ; Pucci, Perla ; 等 2021年13卷22期 1831-1843页

            【关键词】 DNA conservation; genetic evolution; HAR1;

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            17. High-resolution HLA allele and haplotype frequencies in several unrelated populations determined by next generation sequencing: 17th International HLA and Immunogenetics Workshop joint report

            【外文期刊】 Creary, Lisa E. ; Sacchi, Nicoletta ; 等 《Human Immunology: Official Journal of the American Society for Histocompatibility and Immunogenetics》 2021年82卷7期 505-522页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Human leukocyte antigen; Next-generation sequencing; International HLA and Immunogenetics;

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            18. Phylogeny and generic limits in the Niemeyera complex of New Caledonian Sapotaceae: evidence of multiple origins of the anisomerous flower

            【外文期刊】 Swenson U ; Lowry PP ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2008年49卷3期 909-929页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Ancestral reconstruction; Anisomery; Character evolution;

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            19. History, genetic differentiation and conservation strategies for disjunct populations of Sibiraea species from Southeastern Europe and Asia

            【外文期刊】 Ballian D ; Grebenc T ; 等 《Conservation genetics》 2006年7卷6期 895-907页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 conservation through active management; cpDNA; genomic rDNA spacers;

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            20. Recent Advances in Predicting Protein-lncRNA Interactions Using Machine Learning Methods

            【外文期刊】 Yu, Han ; Shen, Zi-Ang ; 等 2022年22卷3期 228-244页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 lncRNA-protein interaction prediction; computational model; machine learning;

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            21. cis-Regulatory Elements in Plant Development, Adaptation, and Evolution

            【外文期刊】 Marand, Alexandre P. ; Eveland, Andrea L. ; 等 《Annual review of plant biology》 2023年74卷 111-137页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 cis-regulatory elements; chromatin; transcription regulation;

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            22. Evidence of function for conserved noncoding sequences in Arabidopsis thaliana

            【外文期刊】 Jacob B. Spangler ; Sabarinath Subramaniam ; 等 《The New Phytologist》 2012年193卷1期 241-252页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Arabidopsis; conserved noncoding sequences; gene expression;

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            23. A conserved noncoding sequence can function as a spermatocyte-specific enhancer and a bidirectional promoter for a ubiquitously expressed gene and a testis-specific long noncoding RNA

            【外文期刊】 Kurihara,M. ; Shiraishi,A. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2014年426卷17期 3069-3093页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 conserved noncoding sequence; enhancer; GC-2spd(ts);

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            24. Molecular evidence on the species status and phylogenetic relationships of Spiranthes parksii, an endangered orchid from Texas

            【外文期刊】 Dueck LA ; Cameron KM ; 《Conservation genetics》 2008年9卷6期 1617-1631页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Conservation policy; DNA sequencing; Endangered species;

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            25. Functional analysis of DNA sequences controlling the expression of the rice OsCDPK2 gene

            【外文期刊】 Morello L ; Bardini M ; 等 《Planta: An International Journal of Plant Biology》 2006年223卷3期 479-491页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 calcium-dependent protein kinase; gene expression; leader-intron;

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            26. dbCNS: A New Database for Conserved Noncoding Sequences. oa

            【外文期刊】 Jun,Inoue ; Naruya,Saitou ; 《Molecular biology and evolution》 2021年38卷4期 1665-1676页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 cis-regulatory elements; conserved noncoding sequences; dbCNS;

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            27. Systematic annotation of conservation states provides insights into regulatory regions in rice.

            【外文期刊】 Xinkai,Zhou ; Tao,Zhu ; 等 《Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao》 2022年49卷12期 1127-1137页

            【关键词】 Comparative genomics; Conservation states (CSs); Conserved noncoding sequences (CNSs);

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            28. A MITE transposon insertion is associated with differential methylation at the maize flowering time QTL Vgt1. oa

            【外文期刊】 Sara,Castelletti ; Roberto,Tuberosa ; 等 《G3 (Bethesda, Md.)》 2014年4卷5期 805-12页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 DNA methylation; Zea mays; conserved noncoding sequences;

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            29. Functional and comparative genomics reveals conserved noncoding sequences in the nitrogen-fixing clade. oa

            【外文期刊】 Wendell J,Pereira ; Sara,Knaack ; 等 《The New phytologist》 2022年234卷2期 634-649页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Medicago truncatula ; MtCRE1 ; comparative genomics;

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            30. Emergence and Evolution of Hominidae-Specific Coding and Noncoding Genomic Sequences. oa

            【外文期刊】 Morteza Mahmoudi,Saber ; Isaac,Adeyemi Babarinde ; 等 《Genome biology and evolution》 2016年8卷7期 2076-92页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 DSCR4; Hominidae; accelerated evolution;

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            31. Heterogeneous tempo and mode of conserved noncoding sequence evolution among four mammalian orders. oa

            【外文期刊】 Isaac Adeyemi,Babarinde ; Naruya,Saitou ; 《Genome biology and evolution》 2013年5卷12期 2330-43页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 carnivores; cetartiodactyls; conserved noncoding sequences;

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            32. Conserved noncoding sequences correlate with distant gene contacts in Arabidopsis and Brassica.

            【外文期刊】 Lei,Zhang ; Jian,Wu ; 等 《Journal of integrative plant biology》 2023年65卷6期 1467-1478页

            【关键词】 Arabidopsis; Brassica; Hi-C;

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            33. Synergistic Effect between 3 '-Terminal Noncoding and Adjacent Coding Regions of the Influenza A Virus Hemagglutinin Segment on Template Preference

            【外文期刊】 Xiao, Yue ; Zhang, Wenyu ; 等 《Journal of Virology》 2021年95卷18期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 influenza A virus; HA segment-specific noncoding nucleotides; transcription;

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            34. Comparison of splice sites reveals that long noncoding RNAs are evolutionarily well conserved

            【外文期刊】 Nitsche, Anne ; Rose, Dominic ; 等 《RNA》 2015年21卷5期 801-812页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 long noncoding RNAs; IncRNA; splice sites;

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            35. Insights from human/mouse genome comparisons [Review]

            【外文期刊】 Pennacchio LA ; 《Mammalian genome: official journal of the International Mammalian Genome Society》 2003年14卷7期 429-436页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Conserved noncoding sequences; Vertebrate scl loci; Regulatory elements;

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            36. Comparative sequence analysis of the Phytochrome C gene and its upstream region in allohexaploid wheat reveals new data on the evolution of its three constituent genomes

            【外文期刊】 Devos KM ; Beales J ; 等 《Plant Molecular Biology》 2005年58卷5期 625-641页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 comparative sequence analysis; evolution; Phytochrome C;

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            37. High-resolution HLA allele and haplotype frequencies in several unrelated populations determined by next generation sequencing: 17th International HLA and Immunogenetics Workshop joint report

            【外文期刊】 Creary, Lisa E. ; Sacchi, Nicoletta ; 等 2021年82卷7期 505-522页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Human leukocyte antigen; Next-generation sequencing; International HLA and Immunogenetics;

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            38. Distinct biogenesis pathways may have led to functional divergence of the human and Drosophila Arglu1 sisRNA

            【外文期刊】 Chan, Seow Neng ; Pek, Jun Wei ; 《EMBO reports》 2023年24卷2期

            【关键词】 Arglu1; autoregulation; orthologous intron;

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            39. A conserved noncoding sequence can function as a spermatocyte-specific enhancer and a bidirectional promoter for a ubiquitously expressed gene and a testis-specific long noncoding RNA

            【外文期刊】 Kurihara,M. ; Shiraishi,A. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2014年426卷17期 3069-3093页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 conserved noncoding sequence; enhancer; GC-2spd(ts);

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            40. Phylogeography of the tree Hymenaea stigonocarpa (Fabaceae : Caesalpinioideae) and the influence of quaternary climate changes in the Brazilian cerrado

            【外文期刊】 Ramos ACS ; Lemos-Filho JP ; 等 《Annals of Botany》 2007年100卷6期 1219-1228页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 biogeography; cerrado; genetic structure;

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            41. Functional elements residing within satellite DNAs

            【外文期刊】 Ugarkovic D ; 《EMBO Journal》 2005年6卷11期 1035-1039页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 CENP-B box; gene regulation; heterochromatin;

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            42. Protein polymorphism is negatively correlated with conservation of intronic sequences and complexity of expression patterns in Drosophila melanogaster

            【外文期刊】 Petit N ; Casillas S ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2007年64卷5期 511-518页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 coding nucleotide polymorphism; gene expression pattern; protein evolution;

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            43. Evidence for a preferential targeting of 3 '-UTRs by cis-encoded natural antisense transcripts

            【外文期刊】 Sun M ; Hurst LD ; 等 《Nucleic Acids Research》 2005年33卷17期 5533-5543页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 EUKARYOTIC MESSENGER-RNAS; HUMAN GENOME; GENE-EXPRESSION;

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            44. Consensus folding of aligned sequences as a new measure for the detection of functional RNAs by comparative genomics

            【外文期刊】 Washietl S ; Hofacker IL ; 《Journal of Molecular Biology》 2004年342卷1期 19-30页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 conserved secondary structure; consensus structure prediction; non-coding RNAs;

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            45. Large-scale appearance of ultraconserved elements in tetrapod genomes and slowdown of the molecular clock

            【外文期刊】 Stephen S ; Pheasant M ; 等 《Molecular biology and evolution》 2008年25卷2期 402-408页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ultraconserved elements; exaptation; molecular clock;

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            46. Regulatory DNAs and the evolution of human development

            【外文期刊】 Noonan, James P. ; 《Current Opinion in Genetics & Development》 2009年19卷6期 557-564页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 genetic difference; conserved noncoding sequence;

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            47. STAG-CNS: An Order-Aware Conserved Noncoding Sequences Discovery Tool for Arbitrary Numbers of Species

            【外文期刊】 Xianjun Lai ; Sairam Behera ; 等 2017年10卷7期 990-999页

            【关键词】 conserved noncoding sequence; comparative genomics; suffix tree;

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            48. Cis-regulatory control of mammalian Trps1 gene expression

            【外文期刊】 Abrar, Muhammad ; Ali, Shahid ; 等 《Journal of experimental zoology, Part B. Molecular and developmental evolution》 2024年342B卷2期 85-100页 SCIEMEDLINE

            【关键词】 conserved noncoding elements; craniofacial development; enhancers;

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            49. Finding and Comparing Syntenic Regions among Arabidopsis and the Outgroups Papaya, Poplar, and Grape: CoGe with Rosids

            【外文期刊】 Lyons E ; Pedersen B ; 等 《Plant physiology》 2008年148卷4期 1772-1781页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 CONSERVED NONCODING SEQUENCES; DUPLICATED GENES; COMPARATIVE GENOMICS;

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            50. Splicing conservation signals in plant long noncoding RNAs

            【外文期刊】 Antonio Corona-Gomez, J. ; Jair Garcia-Lopez, Irving ; 等 《RNA》 2020年26卷7期 784-793页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 long noncoding RNAs; lncRNA; splice sites;

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