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【中文期刊】 乔华 Ajab Khan  等 《化学研究与应用》 2021年33卷10期 1918-1925页

【摘要】 阳离子脂质体是基因转染中最受关注的一种非病毒类载体.本文以双十二烷基二甲基溴化铵(DDAB)与聚山梨酯-80(Tween 80)复配构建阳离子脂质体,并评价其使用安全性和DNA压缩性能.结果显示,DDAB与Tween 805:5复配形成的脂...

【关键词】 阳离子脂质体； DDAB/Tween 80复配体系； 细胞毒性；

【中文期刊】 毕昆 顾万君  等 《生物信息学》 2020年18卷2期 76-85页 ISTIC

【摘要】 脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic Acid,DNA)是一种天然的信息存储介质,具有存储密度高、存储时间长、损耗率低等特点.在传统存储方式不能满足信息增长的需求时,DNA数据存储技术逐渐成为研究热点.DNA编码是用尽可能少的碱基...

【关键词】 DNA存储； 压缩编码； 纠错算法；

【中文期刊】 张淑芳 彭康  等 《计算机科学》 2019年46卷6期 21-28页

【摘要】 随着计算机技术和网络技术的飞速发展,由此产生的海量数据给传统数据存储方式带来了巨大挑战,因此研究人员开始致力于寻找新一代存储方案.脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic Acid,DNA)作为天然的遗传信息存储介质,具有存储容量大、...

【关键词】 数据存储； DNA； 压缩编码；

【中文期刊】 朱泽轩 张永朋  等 《深圳大学学报（理工版）》 2013年30卷4期 409-415页

【摘要】 针对高通量DNA测序技术发展产生的DNA测序数据量猛增,数据压缩技术是解决存储和传输高通量DNA序列数据问题的重要方法之一.评述DNA测序数据传统压缩方法包括替代法和统计法,以及基于参考基因组的高通量DNA测序数据压缩方法,介绍并比较重测序...

【关键词】 计算机应用； DNA测序； 下一代测序；

【中文期刊】 周家锐 纪震  等 《电子学报》 2013年41卷3期 513-518页

【摘要】 提出近似重复矢量(Approximate Repeat Vector,ARV)模型用于DNA序列冗余片段的描述.通过将数据生物信息学特征引入压缩预处理,并使用ARV矢量构造编码码本,提出了非对称DNA序列压缩算法BioLZMA-2.算法引入...

【关键词】 DNA序列数据压缩； 生物信息学； 近似重复矢量；

【中文期刊】 纪震 周家锐  等 《电子学报》 2011年39卷5期 991-995页

【摘要】 本文通过将生物学特征和生物学含义引入DNA序列数据的压缩处理中,提出了基于生物信息学特征的BioLZMA压缩算法.在BioLZMA算法中,DNA序列根据组成部分生物学含义的不同切分重组为四个集合:编码序列CDS集合、内含子序列集合、RNA序...

【关键词】 DNA数据压缩； 生物信息学； 序列重组；

【中文期刊】 杨兴涛 董梦瑶  等 《微生物学通报》 2021年48卷4期 1281-1291页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 RNA结合蛋白(RNA-Binding Protein)Hfq是一种重要的细菌转录后调节因子,之前对Hfq的研究大多集中在该蛋白对小分子非编码RNA(Small Non-Coding RNA,sRNA)和mRNA的作用上.Hfq最典型的功能...

【关键词】 细菌； Hfq； DNA压缩；

【中文期刊】 谢平  《生物多样性》 2016年24卷8期 966-976页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 真核生物的起源是一个根本性的、令人生畏的进化谜题,目前设想的关于“核”起源的流行情景还远谈不上清晰.关于真核生物的起源可谓众说纷纭,有共营模型、自演化模型、病毒性真核生物起源模型和外膜假说,等等.迄今为止,真核演化的动因则鲜有涉及.笔者发现...

【关键词】 真核的起源； DNA； 染色体；

【学位论文】 作者： 李登超 导师：庄奕琪 蒋可  西安电子科技大学  电子科学与技术 集成电路工程（硕士） 2022年

【摘要】 DNA作为生物遗传信息的载体，在生命科学以及当代医学研究领域扮演着非常重要的角色。自上世纪七十年代以来，DNA测序经过多次的技术迭代，已逐渐从传统生物化学检测方法发展至利用其物理特性来进行检测。第四代DNA测序技术是基于碱基分子的电学特性不...

【关键词】 DNA测序； 压缩感知；

【中文期刊】 张臻峰 于佳  等 《生物化学与生物物理进展》 2007年34卷3期 306-311页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 超凝集DNA是质粒DNA的一种特殊拓扑结构形式,最初在大肠杆菌SD108(topA+gyrB225)细胞中被发现.现在大肠杆菌DM800(topA-gyrB225)细胞中也发现了这种结构,这说明超凝集DNA的形成与细胞内旋转酶活性降低有直接...

【关键词】 超凝集DNA； 大肠杆菌DM800； 原子力显微镜；

【学位论文】 作者： 彭棋 导师：申铁  贵州师范大学  计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2021年

【摘要】 茶作为世界上三大类饮料（咖啡、茶、可可）之一，其具有多种对人体健康的有益成分，因而有防癌、降血脂、抗衰老等功效，具有优越的经济和社会价值。同时茶产业是贵州省十二大特色农业产业之一。因此，从科学角度，特别是从基因科学角度对贵州茶树资源进行深入...

【关键词】 茶组植物； 基因数据压缩；

【学位论文】 作者： 张继滔 导师：杨焕明  中国科学院大学  生物学 生物信息学（硕士） 2021年

【摘要】 随着信息技术的发展，人类产生信息的能力越来越强，未来可能将面临存储能力不足的问题。在众多新兴的存储技术中，DNA存储技术凭借极高的数据存储密度以及低廉的维护成本备受期待。然而，作为DNA存储的两项使能技术，当前的DNA合成与测序技术在许多方...

【关键词】 DNA存储； 模糊匹配；

【学位论文】 作者： 王倩倩 导师：腊红桂  南京农业大学  生物学 生物化学与分子生物学（博士） 2018年

【摘要】 DNA甲基化(DNAmethylation)通常是指由甲基转移酶催化的胞嘧啶环上的甲基修饰，形成5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine，5-meC)。大量研究表明，DNA甲基化修饰在胚乳基因印记、转座子运动、转基因沉默以及mRNA...

【关键词】 植物基因； DNA去甲基化；

【中文期刊】 汤恒松 孟玮烈  等 《医用生物力学》 2014年29卷5期 459-464页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 研究吸附于微悬臂梁基底上双链DNA生物膜的弹性模量.方法 采用基于中观连续介质液晶理论的Parsegian经验势,描述粗粒化DNA圆柱之间相互作用能;采用蒙特卡罗法模拟加载前后DNA链的微观分布模式;采用思想实验法和宏观连续介质压缩弹...

【关键词】 双链DNA； 生物膜； 弹性模量；

【学位论文】 作者： 张义军 导师：陈国良 罗秋明  深圳大学  计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2017年

【摘要】 随着基因测序费用的降低以及精准医疗和基因深度学习等新兴技术对基因大数据的需要,目前已进入一个基因数据爆发的时代.面对如此海量的基因数据,如何存储和传输这些数据成为当前研究的一个热点,基于参考基因组的压缩算法以其压缩率高的特点被广泛应用于各大...

【关键词】 基于参考基因组压缩； DNA数据压缩；

【中文期刊】 杨强 彭江  等 《中华医学杂志》 2011年91卷17期 1161-1166页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 探讨关节软骨脱细胞基质多孔支架(CEDIS)与骨髓基质干细胞(BMSCs)体外培养组织工程软骨的可行性.方法 粉碎人关节软骨,脱细胞处理后差速离心法收集细胞外基质悬液,采用冷冻干燥技术制备三维多孔支架.扫描电镜观察其微观结构,并进行组...

【关键词】 生物医学工程； 软骨； 细胞支架；

【中文期刊】 师黎 赵云  等 《中国组织工程研究与临床康复》 2010年14卷39期 7353-7357页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:目前对心律失常的诊断大多是由医生人工完成,费时费力,诊断结果依赖于医生的个人业务水平和责任心.心律失常的自动识别对于心脏病患者的救护和早期治疗具有非常重要的意义.目的:实现临床心律失常的自动识别和诊断.方法:首先从心电图中动态提取完整...

【关键词】 心电图； 心律失常； 自动识别；

【中文期刊】 徐明堂 何春年  等 《中华病理学杂志》 2010年39卷7期 478-479页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 <篇首> 近些年,在研究精子非整倍体与流产、畸形、不育及环境化学物质对人类生殖功能等影响时,荧光原位杂交(FISH)方法因适合大量间期核精子的检测得到广泛应用.因为精细胞变形成蝌蚪状时,核组蛋白被精蛋白替代,DNA以一种特殊方式被压缩、凝聚,正...

【中文期刊】 刘阳 杨淑霞  等 《生物学杂志》 2009年26卷2期 70-72页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 在不同的电压与载样量下,分别使用溴化乙锭（EB）与新型核酸染料GoldViewna II及GoldView对凝胶中的DNA进行染色,观察电泳条带扭曲程度,了解电压、载样量与核酸染料对琼脂糖凝胶电泳条带扭曲程度的影响.使用GoldViewna...

【关键词】 核酸染料； 琼脂糖凝胶电泳； 扭曲；

【中文期刊】 王恩旺 杨小龙  《中国肺癌杂志》 2009年12卷8期 926-930页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 <篇首> 细胞核内DNA绝大多数时间缠绕并结合在组蛋白上,储藏在高度压缩的染色质中,处于非激活状态.细胞如需要激活一些基因,转录因子则协同将相关基因(DNA片段)从组蛋白上解离下来.

【学位论文】 作者： 郑华杰 导师：张佩珩  中国科学院大学  计算机科学与技术 计算机技术（硕士） 2015年

【摘要】 随着高通量测序技术的发展，DNA序列数据量呈现爆炸式增长。这会带来两方面的严重问题，即数据存储和管理的成本越来越高，数据传输和数据分析消耗的时间越来越长。数据压缩技术在一定程度上能够有效地缓解数据的高速增长，然而面对日益增长的海量DNA序列...

【关键词】 DNA序列； 数据压缩；

【会议论文】徐路 中国化学会第十五届胶体与界面化学会议 2015年

【摘要】 设计合成具有刺激响应如pH、CO2、氧化还原、光照等的表面活性剂已经被广泛报道,Julian等人于2012年报道了磁响应表面活性剂[1],该方法是将商业化季铵盐阳离子表面活性剂与磁性金属氯化物如FeCl3和GdCl3等在甲醇反应,合成具有磁...

【关键词】 表面活性剂,DNA,压缩； 迁移,组装；

【会议论文】王玲 中国化学会第十五届胶体与界面化学会议 2015年

【摘要】 基因治疗是指将治疗外源基因导入到靶向细胞并且表达的过程,是治疗癌症及遗传病非常有效的方法[1].DNA分子的负电性和刚性使之无法单独穿过细胞膜而进入靶向细胞,因此,利用压缩剂的正电荷中和DNA磷酸骨架上的负电进而改变DNA构象及尺寸成为基因...

【关键词】 非离子表面活性剂； DNA； 压缩；

【学位论文】 作者： 仝雪珂 导师：孙季丰  华南理工大学  信息与通信工程 信号与信息处理（硕士） 2015年

【摘要】 DNA存储生命的遗传信息,是生命生存、发展、进化的物质基础.针对DNA序列的研究具有重要的社会以及科学意义.作为研究对象的DNA序列数量庞大,进行信息的交换研究需求也逐步提高,为进行有效存储和传输,需要发展DNA序列压缩技术.近年来,针对D...

【关键词】 DNA序列压缩； 混合概率分布算子；

【学位论文】 作者： 王景如 导师：沈建冰 戴林  北京理工大学  生物医学工程 生物医学工程（硕士） 2015年

【摘要】 生物测序技术是分子生物学研究中的基础技术,用来测定生物基因序列组成.测序工程中产生海量的生物数据,数据规模呈指数级地快速增长.如何存储,处理和分析这些生物数据是大数据时代生物学家面临的主要问题.数据压缩技术可以有效缩减数据存储量,高效利用现...

【关键词】 DNA序列压缩； Huffman；

【学位论文】 作者： 张永朋 导师：朱泽轩  深圳大学  控制科学与工程 模式识别与智能系统（硕士） 2015年

【摘要】 下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS)技术的发展极大地促进了基因组分析、遗传病诊断、食品安全等领域的研究.NGS数据的增长速度远远超过了存储成本降低和网络带宽增加的速度,存储和传输NGS数据面临巨大挑战....

【关键词】 下一代测序； DNA序列压缩；

【学位论文】 作者： 陈祥祥 导师：王长缨  福建农林大学  生物工程 生物信息科学与技术（硕士） 2012年

【摘要】 随着生物测序技术的发展,生物序列数据迅速增长,数据占用的存储空间加速增加.如何利用有限的存储空间存储更多的生物序列数据成为必须面临的问题.对于DNA序列数据,可使用数据压缩方法解决大量DNA序列数据的存储问题.本文在研究传统压缩算法和现有的...

【关键词】 数据压缩； DNA序列数据；

【学位论文】 作者： 胡苗苗 导师：蔡骅  南京理工大学  控制科学与工程 控制理论与控制工程（硕士） 2012年

【摘要】 自20世纪末以来,生物测序技术不断的发展,随之产生的各类生物数据,迅速形成了庞大的生物信息数据库。如何有效的分析,管理这些海量的数据,是生物学家和计算机专家们必须着力解决的棘手问题。数据压缩技术是解决这一问题的有效方法。DNA序列数据是一类...

【关键词】 DNA序列数据； 数据压缩算法；

【学位论文】 作者： 邓寿年 导师：邱文元  兰州大学  数学 数学 应用数学（硕士） 2006年

【摘要】 生物信息学作为一门由计算机科学、生命科学、物理学、化学、数学、统计学等很多学科互相渗透形成的交叉学科，它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。而随着人类基因组计划的进一步深入，生命科学已经步入...

【关键词】 Y染色体； DNA回文序列；

【学位论文】 作者： 林毅申 导师：林丕源  华南农业大学  管理科学与工程 管理科学与工程（硕士） 2005年

【摘要】 在研究现有的DNA序列数据压缩算法的基础上，本文以DNA序列数据的存储效率与直接检索速度综合考虑，设计并实现了称为DNACS(DNACompressionandSearch)的算法。它包括了DNA数据压缩(含解压缩)算法和非解压直接检索.....

【关键词】 数据压缩； 模式匹配；

【学位论文】 作者： 贺平安 导师：王军  大连理工大学  数学 计算数学（博士） 2003年

【摘要】 本文的主要工作包括以下几个方面:在第一章,利用代数中同态的思想和物理学中的"粗粒化"思想,根据DNA序列中四种核苷酸A、G、C和T的化学结构分类,提出DNA序列的特征序列的概念.一个DNA序列的特征序列是一组(0,1)序列,它们中的每一个都...

【关键词】 生物信息学； DNA序列；

【学位论文】 作者： 陈新 导师：石青云  北京大学  数学 应用数学（博士） 2001年

【摘要】 DNA序列的数据压缩是一项非常艰苦且极具挑战性的任务.它对基因序列的数据储存、DNA的序列分析以及研究基因组的进化关系等方面都有着非常重要的意义.基于颜色信息的渐进编码是一种新的高效率的伪彩色图像压缩方式.它可以适合于那些需要快速浏览和渐进...

【关键词】 生物信息学； DNA序列；

【中文期刊】 刘云 刘晓芬  等 《重庆医学》 2017年46卷23期 3238-3240,3244页 MEDLINEISTICCA

【摘要】 目的 考察新型抗体靶向性核酸转移系统的关键组分葡萄球菌A蛋白-聚乙烯亚胺交联物(SPA-PEI)的生物学功能,即结合IgG与压缩、复合DNA的能力.方法 采用酶联免疫吸附试验和中和抑制实验测定SPA-PEI交联物与多种来源IgG的结合能力;...

【关键词】 葡萄球菌A蛋白-聚乙烯亚胺交联物； 核酸转移系统； 免疫球蛋白G结合；

【中文期刊】 李媛媛 张斌  等 《国际肿瘤学杂志》 2011年38卷6期 424-427页 ISTICCA

【摘要】 组蛋白的乙酰化状态调控DNA转录从而影响基因的表达水平.组蛋白脱乙酰基酶(HDAC)可降低组蛋白乙酰化,引起DNA-组蛋白复合物压缩.这种压缩可以阻碍基因转录,抑制细胞分化.HDAC抑制剂可以解除DNA-组蛋白复合物压缩,从而促进肿瘤细胞生...

【关键词】 肿瘤； 组蛋白脱乙酰基酶类； 生物学标记；

【中文期刊】 薛开先  《国际遗传学杂志》 2009年32卷4期 316-320页 ISTICCA

【摘要】 <篇首> 人类基因组长约2 m的DNA,通过与组蛋白构成染色质,而压缩进直径约6μm的细胞核内.高密度的染色质保护了脆弱的DNA不易受损伤,同时也成为需要DNA参与相关生物学过程,如转录、复制、修复和重组等的障碍.此时要使这些过程适时、定向和有...

【中文期刊】 孙洁 周安方  《中华男科学杂志》 2006年12卷7期 639-642,646页 MEDLINEISTICCSCDCA

【摘要】 精子DNA损伤是引起不育的重要原因,携有DNA损伤的幸存精子可能逃避体内精子选择机制而成熟并将遗传缺陷传递于后代.因此对精子DNA损伤的研究已成为生殖医学的热点之一.损伤精子DNA的因素主要包括氧化应激、微量元素、精子毒性物质、放射线等,而...

【关键词】 精子； DNA； 损伤；

【中文期刊】 刘大渔 梁广铁  等 《分析化学》 2010年38卷8期 1100-1104页

【摘要】 利用芯片电泳方法考察瞬间等速电泳-筛分电泳偶联分析的结果,比较了自由溶液和筛分介质中DNA瞬间等速电泳的预浓缩效果.结果显示,相比较于筛分介质条件,自由溶液瞬间等速电泳有利于改善预浓缩和后续筛分电泳分离效果.对此结果的解释是:自由溶液条件下...

【关键词】 芯片电泳； 等速电泳； 预浓缩；

【中文期刊】 周星飞 安红杰  等 《科学通报》 2005年50卷14期 1434-1437页

【摘要】 介绍了一种基于振动模式扫描极化力显微镜在小力区(< 0.5 nN)测量柔软的生物分子压弹性的方法, 并利用此方法研究了DNA分子在直径方向(垂直于双螺旋方向)的压缩性质. 实验结果表明固定在云母表面的DNA分子具有很好的弹性, 在外力作用下...

【关键词】 原子力显微镜(AFM)； DNA分子； 压弹性；