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【中文期刊】 董晓斌 张静 等 《中华结直肠疾病电子杂志》 2024年13卷6期 499-509页 ISTIC
【摘要】 目的利用高通量测序和生物信息学技术,分析溃疡性结肠炎(UC)中环状RNA(circRNA)表达特征。方法选取医院确诊的8 例UC 患者为观察组,根据其病情和结肠镜下黏膜表现分为活动期组和缓解期组,每组各4 例,另选4 名健康体检者纳入对照组...
【关键词】 溃疡性结肠炎(UC); 环状RNA(CircRNA); 差异表达谱;
【中文期刊】 林桦 秦超 等 《中华危重症医学杂志(电子版)》 2023年16卷6期 448-452页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 通过基因表达综合(GEO)数据库分析,筛选烧伤大鼠肝组织新的标志物,为其治疗提供理论基础.方法 采用GEO数据库GSE1860和GSE802数据集,分析24 h烧伤后肝组织的差异基因及共同表达的差异基因.选择3只健康成年雄性Sprag...
【中文期刊】 陈升东 孔令明 等 《中华行为医学与脑科学杂志》 2021年30卷3期 238-243页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨癫痫患者人格改变及其与外周血中异常表达的lncRNA水平的关系。方法:以方便取样法选取58例癫痫患者(研究组)采用人格诊断问卷进行人格改变筛查;以qRT-PCR筛查研究组和58例健康体检人员(对照组)外周血lncRNA表达水平,对...
【中文期刊】 张泽鑫 吴汶丰 等 《中华消化杂志》 2021年41卷5期 336-343页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:结合应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异基因表达分析2种方法筛选结肠癌mRNA表达谱中的差异共表达基因,并分析差异共表达基因与预后的关系。方法:基于生物信息学方法从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库分别...
【关键词】 结肠肿瘤; 加权基因共表达网络分析; 差异基因表达分析;
【中文期刊】 《分子植物(英文版)》 2019年12卷3期 410-425页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Gene expression variation is a key component underlying phenotypic variation and heterosis.Transcriptome profiling was p...
【关键词】 maize; gene expression; heterosis;
【中文期刊】 《植物多样性(英文)》 2019年41卷4期 275-283页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 The heavy metal ATPase (HMA) subfamily is mainly involved in heavy metal (HM) tolerance and transport in plants, but an ...
【关键词】 Heavy metal ATPase; Cadmium; Turnip;
【中文期刊】 《遗传学报》 2018年45卷9期 489-504页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Gene set enrichment (GSE) analyses play an important role in the interpretation of large-scale transcriptome datasets.Mu...
【关键词】 Gene expression; Differential expression; Gene set enrichment;
【中文期刊】 《植物多样性(英文)》 2016年38卷3期 163-170页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Paris polyphylla Smith var. yunnanensis (Franch.) Hand.-Mazz. is a rhizomatous, herbaceous, perennial plant that has bee...
【关键词】 P. polyphyl a var. yunnanensis; Saponin pathway; Differential expression;
【中文期刊】 《遗传学报》 2016年43卷8期 503-511页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【关键词】 Intraclonal heterogeneity; Epigenetic regulation; DNA methylation;
【中文期刊】 魏一丁 熊超 等 《中国中药杂志》 2019年44卷6期 1135-1144页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 七叶树是七叶树科七叶树属高大乔木,集药用与观赏于一身.七叶树种子是其主要的药用部位,主要有效成分为齐墩果烷型三萜皂苷类化合物七叶皂苷.为了解七叶树三萜化合物生物合成的分子基础,该研究采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序获得...
【中文期刊】 齐兴柱 刘磊 等 《微生物学报》 2019年59卷5期 891-906页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 尖孢镰刀菌古巴专化型4号小种 (Fusarium oxysporum f. sp. cubense race 4, Foc4) 是香蕉枯萎病的强致病性病原菌.Foc4在侵染香蕉植株早期必须面对寄主的活性氧迸发.[目的]了解Foc4应对外源氧...
【关键词】 尖孢镰刀菌古巴转化型4号小种; 氧化胁迫; 差异表达基因;
【中文期刊】 《生物化学与生物物理学报(英文版)》 2010年42卷8期 522-529页 SCISCIEMEDLINEISTICCSCDBP
【关键词】 chicken; miRNAs; gonadal development;
【中文期刊】 《遗传学报》 2009年36卷8期 455-466页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 TaPHT1.2 is a functional, root predominantly expressed and low phosphate (Pi) inducible high-affmity Pi transporter in w...
【关键词】 high-affinity phosphate transporter; TaPHT1.2; promoter;
【中文期刊】 《浙大学报(英文版)(B辑:生物医学和生物技术)》 2009年10卷11期 847-851页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 We examined salt tolerance responsive genes in Pak-choi under salt stress and analyze their potential function. The mRNA...
【关键词】 Brassica campestris L. ssp. chinensis (L.) Makino var. communis Tsen et Lee; Salinity tolerance; Gene differential expression;
【中文期刊】 《分子植物(英文版)》 2009年2卷1期 120-137页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【关键词】 Mitogen-activated protein kinases; MEKK1; MKK1;
【中文期刊】 《生物化学与生物物理学报(英文版)》 2006年38卷11期 753-758页 SCISCIEMEDLINEISTICCSCDBP
【关键词】 skeletal muscle protein; pig; mRNA differential display;
【中文期刊】 《生物化学与生物物理学报(英文版)》 2006年38卷7期 450-456页 SCISCIEMEDLINEISTICCSCDBP
【关键词】 differential gene expression; pig; heterosis;
【中文期刊】 《生物化学与生物物理学报(英文版)》 2005年37卷10期 680-687页 SCISCIEMEDLINEISTICCSCDBP
【中文期刊】 《生物化学与生物物理学报(英文版)》 2004年36卷7期 467-476页 SCISCIEMEDLINEISTICCSCDBP
【关键词】 wheat (Triticum aestivum L.); pollen-specific cDNA; suppression subtractive hybridization;
【中文期刊】 廖钦洪 邹勇 等 《中国中药杂志》 2018年43卷3期 493-501页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 NAC家族是植物特有的转录因子,广泛参与植物生长发育、信号传导和逆境应答等过程.该研究基于生姜RNA-seq数据,利用生物信息学方法对生姜NAC家族成员、亚族分类、理化性质、蛋白质结构和表达模式进行预测和分析,结果显示:在271.1Mb生姜...
【中文期刊】 范凯 王栋 等 《微生物学通报》 2018年45卷1期 29-41页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [背景]作为发酵工业中一类重要的生产菌株,丝状真菌目的产物的形成与菌体形态有着紧密的联系.华根霉(Rhizopus chinensis) CCTCC M201021是从我国传统酿造浓香型白酒大曲中筛选到的一株丝状真菌,其生成的包括脂肪酶在内...
【中文期刊】 朱健铭 翁幸鐾 等 《中草药》 2017年48卷9期 1791-1801页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨黄芩水煎剂抑制尿道致病性大肠埃希菌的分子机制.方法 采用RNA-seq技术分析黄芩水煎剂对尿道致病性大肠埃希菌临床分离株(NB8)转录组的影响.设黄芩组和阴性对照组2个组,黄芩组用10倍MIC浓度的黄芩水煎剂(62.5 mg/mL...
【关键词】 黄芩; 尿道致病性大肠埃希菌; 转录组;
【中文期刊】 眭维国 甘晴 等 《中华肿瘤防治杂志》 2017年24卷20期 1451-1455页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 由酒精性肝硬化(alcoholic liver cirrhosis,ALC)引发原发性肝癌(primary liver cancer,PLC)的发展和形成极其复杂,这给PLC的诊断和治疗带来了的难题.本研究采用环状RNA(circul...
【中文期刊】 曹萌 孙凤梅 等 《环境与职业医学》 2017年34卷7期 577-585页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 [目的]应用转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术,研究苯对小鼠骨髓细胞转录组表达和信号通路的影响,为苯对小鼠骨髓细胞毒性的可能作用机制提供科学线索.[方法]将C3H/He小鼠随机分为苯暴露组[160mg/(kg·d...
【中文期刊】 周昊 王启燕 等 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 2017年35卷3期 274-279页 MEDLINEISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨棕尾别麻蝇(Boettcherisca peregrine)蛹3个时期转录组的差异表达,为进一步探究棕尾别麻蝇蛹各个时期转录组变化提供实验数据.方法 提取棕尾别麻蝇蛹3个时期第1 (MY1)、5(MY2)和10天(MY3)的蝇蛹总...
【中文期刊】 王茜茜 宋雪飞 等 《微生物学报》 2017年57卷10期 1461-1470页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]对大酱中耐盐性较好的植物乳杆菌进行蛋白质组学研究,为植物乳杆菌盐胁迫应激机制的研究提供实验数据.[方法]本项研究以筛选自东北传统农家大酱的耐盐性较好的植物乳杆菌FS5-5为研究对象,绘制了其在0%、6.0%、7.0%和8.0%(W/...
【关键词】 植物乳杆菌FS5-5; 盐胁迫; iTRAQ;
【中文期刊】 陈刚 董彦彦 等 《中草药》 2017年48卷24期 5230-5241页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 拟利用藤石松Lycopodiastrum casuarinoides生药与饮片中微小RNA (miRNA)表达谱,鉴定其中热稳定存在的miRNA,为今后藤石松miRNA生物药效研究奠定基础.方法 选取藤石松的2种加工形态生药与饮片全株...
【中文期刊】 梁碧玉 林密 等 《中国公共卫生》 2017年33卷8期 1273-1277页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 MicroRNAs (miRNAs)是一类长度约为19~22个核苷酸的非编码小分子RNA,近年研究表明,2型糖尿病患者不同组织中的microRNAs呈现差异性表达,并通过其对靶基因的调控作用,广泛参与了糖尿病的发生发展,在胰岛素分泌、胰岛β...
【中文期刊】 王燕 张莎莎 等 《生物工程学报》 2016年32卷9期 1194-1203页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为揭示肥大细胞抗口蹄疫病毒VP1-VP4蛋白的天然免疫作用,以重组口蹄疫病毒VP 1-VP4蛋白刺激小鼠腹腔肥大细胞(Peritoneal mast cells,PMCs),用高通量ELISA芯片检测PMCs的蛋白质表达谱.结果显示,VP1...
【中文期刊】 崔艳伟 李文龙 等 《植物遗传资源学报》 2016年17卷4期 719-725页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 大豆异黄酮是一种应用广泛、具有医用和保健功能的活性物质.为揭示异黄酮合成途径相关基因表达差异,本研究采用实时定量PCR技术分析相关基因在不同大豆品种、发育时期及组织部位的表达.结果发现,苯丙氨酸解氨酶基因PAL、肉桂酸羟化酶基因C4H、香豆...
【中文期刊】 彭勇 陈尚武 等 《生物技术通报》 2016年32卷11期 144-151页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 对黑果枸杞(Lycium ruthenicum Murr.)3个不同发育时期的果实进行转录组测序,分析对比黑果枸杞果实不同发育时期相关基因表达谱的变化。提取果实 RNA 进行 Illumina 高通量测序,利用 GO、KEGG 等公共数据库...
【中文期刊】 钱斓兰 郭亮 等 《第三军医大学学报》 2016年38卷24期 2571-2575页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用基因芯片技术筛选LPS诱导的急性肺损伤小鼠肺组织中与活化转录因子3(acting transcription factor 3,ATF3)相关的差异基因表达,以发现与ATF3可能相互作用的基因.方法 采用基因芯片技术筛选野生型C5...
【中文期刊】 刘金亮 姜彬慧 等 《生态学杂志》 2016年35卷11期 2999-3004页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 研究了高效絮凝菌A9在普通培养基、葡萄糖培养基和甘露糖培养基的培养条件下蛋白质组表达的差异.从这3种不同培养基培养的菌体中提取蛋白,进行蛋白质双向电泳,胶图分析后选取差异蛋白进行质谱鉴定.胶图分析结果表明:絮凝菌A9在不同碳源培养条件下蛋白...
【中文期刊】 龙治坚 范理璋 等 《植物遗传资源学报》 2015年16卷2期 336-343页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 SCoT是一种新型的目的基因分子标记,该标记不仅能获得与性状联系紧密的目的基因,而且能对性状进行跟踪,已被广泛应用于多种植物的研究.本文概述了SCoT标记的原理、引物设计方法及特点,并从PCR反应体系建立与优化、种质资源遗传多样性与亲缘关系...
【中文期刊】 刘芳 宗超 等 《应用昆虫学报》 2015年52卷2期 300-307页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的] 深入了解蜜蜂哺育蜂与采集蜂行为转变机制,寻找与之相关的调控因子.[方法] 我们随机选取了5群意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica,分别采集相应的哺育蜂和采集蜂.利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对哺育蜂...
【中文期刊】 王威 丑天胜 等 《菌物学报》 2015年34卷4期 683-693页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 对金针菇Flammulina velutipes单核菌丝W23的菌丝体以及与L11质配后的双核菌丝H1123菌丝体进行了转录组测序,以本实验室已获得的W23基因组为参考基因组研究两样本间差异基因,并对这些差异基因进行了GO功能和Pathwa...
【中文期刊】 姚元枝 黎晓英 等 《中草药》 2015年46卷1期 107-111页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过克隆鱼腥草乙酰辅酶A酰基转移酶(acetyl-CoA C-acetyltransferase,AACT)基因cDNA全长,并展开生物信息学分析和表达分析,为解析鱼腥草萜类次生代谢产物的生物合成机制奠定基础.方法 采用RT-PCR方...
【关键词】 鱼腥草; 乙酰辅酶A酰基转移酶; RT-PCR;
【中文期刊】 薛菲 吴鹏杰 等 《昆虫学报》 2015年58卷10期 1072-1080页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]探究中华蜜蜂Apis cerana cerana Male abnomal 21(mab-21)基因在不同发育阶段的表达特性及染螨条件下mab-21基因表达变化规律.[方法]本研究利用RT-PCR方法,克隆了中华蜜蜂mab-21的基...
【中文期刊】 左海洋 陈晓丽 等 《中国生物工程杂志》 2015年35卷5期 96-102页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 基因的差异表达与组织、细胞的生物学性状和功能密切相关,随着对组织、器官分化及细胞、生物个体生长发育等的深入研究,大量差异转录基因的验证分析变得越来越重要.为此,该领域基于核酸互补配对和PCR原理建立了Northern blot和荧光定量PC...
【中文期刊】 王启燕 周昊 等 《中国公共卫生》 2015年31卷5期 617-619页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨巨尾阿丽蝇(Aldrichina grahami)卵不同发育时间的形态变化与基因表达差异规律.方法 从巨尾阿丽蝇成虫产完卵开始记为0h,每隔4h取1次卵,直至幼虫孵出,用扫描电镜观察不同发育时期形态学变化特点;提取0、4、8、12...
【中文期刊】 余德立 鲍朗 《四川大学学报(医学版)》 2015年46卷1期 11-15页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过对连续动物传代和试管培养的赖型钩端螺旋体部分致病基因表达差异性的检测,分析赖型钩端螺旋体特异性基因表达与毒力改变之间的联系,了解赖型钩端螺旋体致病过程和发病机制.方法 将27只豚鼠分为3组(n=9),分别经腹部皮下接种1 mL体内...
【中文期刊】 史晋宇 乔军 等 《中华风湿病学杂志》 2020年24卷11期 743-749,C11-1-C11-2页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:通过生物信息学的方法分析健康者和RA患者滑膜组织的差异基因,从转录组学水平上探讨RA可能的发病机制及潜在治疗作用靶点。方法:从美国国家生物技术信息中心(NCBI)的子数据库基因芯片公共数据库(GEO)下载符合筛选标准的健康人群和RA患...
【中文期刊】 宗超 刘芳 等 《应用昆虫学报》 2014年51卷2期 440-447页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]文章旨在寻找中华蜜蜂Apis cerana cerana哺育蜂与采集蜂行为转变相关的重要基因.[方法]选取了8群中华蜜蜂,分别采集哺育蜂和采集蜂,然后通过实时荧光定量PCR对哺育蜂和采集蜂头部中mrjps、Ache、CSP3等22个...
【中文期刊】 夏冰 刘玉铭 等 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 2014年32卷4期 295-298页 MEDLINEISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 研究大头金蝇(Chrysomyame gacephala)卵不同发育时间的形态变化和基因表达差异规律.方法 从大头金蝇成虫产完卵后,取出卵块,记时为0h,每隔2h取卵10枚,直至有幼虫孵出,分别用体视显微镜和扫描电镜观察其不同发育时间...
【中文期刊】 王健 王恩成 等 《中国中西医结合杂志》 2014年34卷11期 1324-1328页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA