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            1. A cost-effective tsCUT&Tag method for profiling transcription factor binding landscape FA

            【中文期刊】 Leiming Wu Zi Luo  等 《植物学报（英文版）》 2022年64卷11期 2033-2038页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 Knowledge of the transcription factor binding landscape (TFBL) is necessary to analyze gene regulatory networks for impo...

            【关键词】 binding sites； ChIP-seq； CUT&Tag；

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            2. 非编码DNA序列的功能及其鉴定

            【中文期刊】 秦丹 徐存拴  《遗传》 2013年35卷11期 1253-1264页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 非编码DNA序列是指基因组中不编码蛋白质的DNA序列.这些序列可以结合调节因子、转录为功能性RNA、单独或协同地调节生理活动和病理过程.文章围绕基因表达调控作用,总结了近几年非编码DNA序列的研究成果,对其结构、功能和可能的作用机制进行了初...

            【关键词】 非编码DNA序列； 基因表达调控； 功能元件；

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            3. 靶向转化生长因子-βⅡ型受体核酸适配子结合位点预测及相关验证研究

            【中文期刊】 王薇 黄阳玉  等 《重庆医学》 2014年9期 1034-1037页 MEDLINEISTICCA

            【摘要】 目的：预测转化生长因子-βⅡ型受体（T RβⅡ）胞外段蛋白与靶向适配子S58的结合位点，并在体外进行验证，证实S58的结构稳定性。方法通过适配子ssDNA序列建立其三维结构，在蛋白质数据库搜索受体蛋白 TRβⅡ胞外段的晶体结构，运用计算机辅...

            【关键词】 转化生长因子-βⅡ； 寡核苷酸类； 分子对接；

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            4. Identification of SNP-containing regulatory motifs in the myelodysplastic syndromes model using SNP arrays and gene expression arrays

            【中文期刊】 《癌症（英文版）》 2013年32卷4期 170-185页 MEDLINEISTICCA

            【关键词】 Association study； genetic variation and mutation； transcription factor-binding sites；

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            5. 猪NLRC5基因启动子克隆及生物信息学分析

            【中文期刊】 刘翔 尹灵丹  等 《黑龙江畜牧兽医》 2021年7期 1-5,143页

            【摘要】 为了构建猪NLR家族含CARD结构域5(NOD-like receptor family caspase recruitment domain family domain-containing 5,NLRC5)基因启动子双荧光素酶报告质粒,...

            【关键词】 启动子质粒； 双荧光素酶； NLR家族含CARD结构域5(NLRC5)基因；

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            6. Gawky modulates MTF-1-mediated transcription activation and metal discrimination

            【外文期刊】 Jia, Ruirui ; Song, Zhenxing ; 等 《Nucleic Acids Research》 2021年49卷11期 6296-6314页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 PLACENTA GROWTH-FACTOR; FACTOR-I MTF-1; DROSOPHILA-MELANOGASTER;

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            7. The Cdc42-associated kinase ACK1 is not autoinhibited but requires Src for activation

            【外文期刊】 Chan, Wing ; Sit, Soon-Tuck ; 等 《The Biochemical Journal》 2011年435卷2期 355-364页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 epidermal growth factor receptor: EGFR; integrin: 60791-49-3; Src homology 3: SH3;

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            8. IGFs, IGFBPs, IGF-Binding Sites and Biochemical Markers of Bone Metabolism during Differentiation in Human Pulp Fibroblasts.

            【外文期刊】 Elmlinger MW ; 《Hormone research》 2004年62卷1期 33-39页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 insulin like growth factor; Binding Sites; differentiation;

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            9. INSL5 is a high affinity specific agonist for GPCR142 (GPR100)

            【外文期刊】 Liu CL ; Kuei C ; 等 《The Journal of biological chemistry》 2005年280卷1期 292-300页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 RECEPTOR-BINDING SITE; INSULIN-LIKE PEPTIDE; GROWTH FACTOR-I;

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            10. Transcription of the LAT gene is regulated by multiple binding sites for Sp1 and Sp3.

            【外文期刊】 《Gene: An International Journal Focusing on Gene Cloning and Gene Structure and Function》 2008年413卷1/2期 58-66页

            【关键词】 Adaptor Proteins; Signal Transducing; Animals;

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            11. Arabidopsis GLUTAMINE-RICH PROTEIN23 is essential for early embryogenesis and encodes a novel nuclear PPR motif protein that interacts with RNA polymerase II subunit III

            【外文期刊】 Ding YH ; Liu NY ; 等 《The Plant Cell》 2006年18卷4期 815-830页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Amino Acid Sequence; Arabidopsis embryology genetics metabolism; Arabidopsis Proteins genetics metabolism;

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            12. Platelet endothelial cell adhesion molecule 1 (PECAM-1) and its interactions with glycosarninoglycans: 1. Molecular modeling studies

            【外文期刊】 Gandhi NS ; Coombe DR ; 等 《Biochemistry》 2008年47卷17期 4851-4862页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 GLYCOSAMINOGLYCAN-PROTEIN INTERACTIONS; FIBROBLAST-GROWTH-FACTOR; HEPARIN-BINDING SITES;

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            13. ELONGATED HYPOCOTYL 5 regulates BRUTUS and affects iron acquisition and homeostasis in Arabidopsis thaliana

            【外文期刊】 Mankotia, Samriti ; Singh, Dhriti ; 等 《The Plant Journal》 2023年114卷6期 1267-1284页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Arabidopsis thaliana; BRUTUS; Fe-deficiency;

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            14. Intensification of growth factor receptor signalling by phorbol treatment of ligand-primed cells implies a dimer-stabilizing effect of protein kinase C-dependent juxtamembrane domain phosphorylation.

            【外文期刊】 Gulliford T ; Epstein RJ ; 等 《Cellular Signalling》 1999年11卷4期 245-252页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Animal; Binding Sites; Cell Line;

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            15. Evaluating phylogenetic footprinting for human-rodent comparisons

            【外文期刊】 Sauer T ; Shelest E ; 等 《Bioinformatics》 2006年22卷4期 430-437页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 FACTOR-BINDING SITES; SPECIES SEQUENCE COMPARISONS; EMBRYONIC EPSILON-GLOBIN;

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            16. Impaired GABAergic transmission and altered hippocampal synaptic plasticity in collybistin-deficient mice

            【外文期刊】 Papadopoulos T ; Korte M ; 等 《EMBO Journal》 2007年26卷17期 3888-3899页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 GABA(A) receptor; gephyrin; glycine receptor;

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            17. Multiscale modelling biological systems

            【外文期刊】 Liu, Zhi-Ping ; Chen, Luonan ; 《IET systems biology》 2016年10卷1期 1-1页

            【关键词】 diseases; patient diagnosis; nonlinear dynamical systems;

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            18. Ikaros SUMOylation: switching out of repression

            【外文期刊】 Gomez-del Arco P ; Koipally J ; 等 《Molecular and Cellular Biology》 2005年25卷7期 2688-2697页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Active Transport; Cell Nucleus; Animals;

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            19. F9 missense mutations impairing factor IX activation are associated with pleiotropic plasma phenotypes

            【外文期刊】 Branchini, Alessio ; Morfini, Massimo ; 等 2022年20卷1期 69-81页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 factor IX activation; hemophilia B; pharmacogenetics;

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            20. Activation domains drive nucleosome eviction by SWI/SNF

            【外文期刊】 Gutierrez JL ; Chandy M ; 等 《EMBO Journal》 2007年26卷3期 730-740页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 chromatin remodeling; histone eviction; nucleosome;

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            21. Binding of AlF-C, an Orc1-binding transcriptional regulator, enhances replicator activity of the rat aldolase B origin

            【外文期刊】 Minami H ; Takahashi J ; 等 《Molecular and Cellular Biology》 2006年26卷23期 8770-8780页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Amino Acid Sequence; Animals; Binding Sites;

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            22. A New Data Mining Approach for the Detection of Bacterial Promoters Combining Stochastic and Combinatorial Methods

            【外文期刊】 Eng, C ; Asthana, C ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2009年16卷9期 1211-1225页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 bacterial promoters; combinatorial methods; second-order hidden Markov models;

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            23. Amphipathic helices support function of blood coagulation factor IXa

            【外文期刊】 Blostein MD. ; Furie BC. ; 等 《Biochemistry》 2000年39卷39期 12000-12006页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Gamma-carboxyglutamic acid; Phospholipid-binding site; Factor-x activation;

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            24. DACH1 is a cell fate determination factor that inhibits cyclin D1 and breast tumor growth

            【外文期刊】 Wu K ; Li A ; 等 《Molecular and Cellular Biology》 2006年26卷19期 7116-7129页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Animals; Binding Sites; Breast Neoplasms pathology;

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            25. Phosphatidylinositol-(4,5)-bisphosphate regulates sorting signal recognition by the clathrin-associated adaptor complex AP2

            【外文期刊】 Honing S ; Ricotta D ; 等 《Molecular cell》 2005年18卷5期 519-531页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 GROWTH-FACTOR RECEPTOR; MEDIATED ENDOCYTOSIS; COATED VESICLES;

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            26. Microsecond time scale dynamics in the RXR DNA-binding domain from a combination of spin-echo and off-resonance rotating frame relaxation measurements.

            【外文期刊】 Mulder FA ; Kaptein R ; 等 《Journal of Biomolecular NMR》 1999年13卷3期 275-288页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Amino Acid Sequence; Binding Sites; Dimerization;

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            27. Novel Bioinformatics Approach Identifies Transcriptional Profiles of Lineage-Specific Transposable Elements at Distinct Loci in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex

            【外文期刊】 Guffanti, Guia ; Bartlett, Andrew ; 等 《Molecular biology and evolution》 2018年35卷10期 2435-2453页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 transposable elements; dorsolateral prefrontal cortex; comparative genomics;

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            28. The phosphatase system in Saccharomyces cerevisiae

            【外文期刊】 Oshima Y ; 《Genes & Genetic Systems》 1997年72卷6期 323-334页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Amino Acid Sequence; Base Sequence; Binding Sites genetics;

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            29. Structural basis of Na plus activation mimicry in murine thrombin

            【外文期刊】 Marino F ; Chen ZW ; 等 《The Journal of biological chemistry》 2007年282卷22期 16355-16361页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 MONOVALENT CATION SPECIFICITY; HUMAN ALPHA-THROMBIN; SODIUM-BINDING-SITE;

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            30. Induction of IL-6 gene expression in a CF bronchial epithelial cell line by Pseudomonas aeruginosa is dependent on transcription factors belonging to the Sp1 superfamily

            【外文期刊】 Borgatti M ; Bezzerri V ; 等 《Biochemical and Biophysical Research Communications》 2007年357卷4期 977-983页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 cystic fibrosis; transcription factors; transcription;

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            31. Unnatural amino acid replacement in a yeast G protein-coupled receptor in its native environment

            【外文期刊】 Huang LY ; Umanah G ; 等 《Biochemistry》 2008年47卷20期 5638-5648页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ALPHA-FACTOR RECEPTOR; SITE-SPECIFIC INCORPORATION; 1ST EXTRACELLULAR LOOP;

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            32. Identification of human parainfluenza virus type 2 (HPIV-2) V protein amino acid residues that reduce binding of V to MDA5 and attenuate HPIV-2 replication in nonhuman primates.

            【外文期刊】 Schaap-Nutt A ; Higgins C ; 等 《Journal of Virology》 2011年85卷8期 4007-4019页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Amino Acid Substitution; Amino Acids; Animals;

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            33. Transcription from the P2 promoter of the growth hormone receptor gene involves members of the Sp transcription factor family.

            【外文期刊】 Adams TE ; 《The Biochemical Journal》 1999年344卷Pt.3期 867-872页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Animal; Binding Sites; CHO Cells;

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            34. Arabidopsis SHORT HYPOCOTYL UNDER BLUE1 contains SPX and EXS domains and acts in cryptochrome signaling

            【外文期刊】 Kang X ; Ni M ; 《The Plant Cell》 2006年18卷4期 921-934页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Arabidopsis genetics metabolism; Arabidopsis Proteins genetics metabolism; Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factors genetics metabolism;

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            35. Adding sequence context to a Markov background model improves the identification of regulatory elements

            【外文期刊】 Kim NK ; Tharakaraman K ; 等 《Bioinformatics》 2006年22卷23期 2870-2875页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 FACTOR-BINDING SITES; DISCOVERY; ALIGNMENT;

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            36. Effect of environmental temperature on rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) innate immunity

            【外文期刊】 Nikoskelainen S. ; Bylund G. ; 等 《Developmental and Comparative Immunology: Ontogeny, Phylogeny, Aging: The Official Journal of the International Society of Developmental and Comparative Immunology》 2004年28卷6期 581-592页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Phagocytosis; Respiratory burst; Chemiluminescence;

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            37. The zinc metalloregulatory protein Synechococcus PCC7942 SmtB binds a single zinc ion per monomer with high affinity in a tetrahedral coordination geometry

            【外文期刊】 VanZile ML. ; Scott RA. ; 等 《Biochemistry》 2000年39卷38期 11818-11829页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Cyanobacterial transcriptional factor; Ray-absorption spectroscopy; X-ray;

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            38. The AraC/XylS Family Activator RhaS Negatively Autoregulates rhaSR Expression by Preventing Cyclic AMP Receptor Protein Activation

            【外文期刊】 Wickstrum, Jason R. ; Skredenske, Jeff M. ; 等 《Journal of bacteriology》 2010年192卷1期 225-232页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 AraC Transcription Factor/ge [Genetics]; AraC Transcription Factor/me [Metabolism]; Binding Sites/ge [Genetics];

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            39. BOTH VIRAL E2 PROTEIN AND THE CELLULAR FACTOR PEBP2 REGULATE TRANSCRIPTION VIA E2 CONSENSUS SITES WITHIN THE BOVINE PAPILLOMAVIRUS TYPE 4 LONG CONTROL REGION

            【外文期刊】 Jackson ME. ; Campo MS. ; 《Journal of Virology》 1995年69卷10期 6038-6046页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Acute myeloid-leukemia; Polyomavirus enhancer; Gene-product;

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            40. Functional and HRE motifs count analysis of induction of selected hypoxia-responsive genes by HIF-1 and HIF-2 in human umbilical endothelial cells

            【外文期刊】 Cabaj, Aleksandra ; Moszynska, Adrianna ; 等 2022年90卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Hypoxia; Hypoxia-inducible factor; HUVEC;

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            41. Liver-specific hepatocyte nuclear factor-4 alpha deficiency: Greater impact on gene expression in male than in female mouse liver

            【外文期刊】 Holloway MG ; Miles GD ; 等 《Molecular Endocrinology》 2008年22卷5期 1274-1286页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 GROWTH-HORMONE; RAT-LIVER; TRANSCRIPTIONAL REGULATION;

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            42. Analysis of a nucleotide-binding site of 5-lipoxygenase by affinity labelling: binding characteristics and amino acid sequences

            【外文期刊】 Zhang YY. ; Radmark O. ; 等 《The Biochemical Journal》 2000年351卷Pt.3期 697-707页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Atp-binding site; Azido-atp; Fluorosulphonylbenzoyladenosine;

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            43. Effects of vaccine strain mutations in domain V of the internal ribosome entry segment compared in the wild type poliovirus type 1 context

            【外文期刊】 Malnou CE. ; Werner A. ; 等 《The Journal of biological chemistry》 2004年279卷11期 10261-10269页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Translation initiation-factor; Rna secondary structure; Tract-binding protein;

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            44. Predicting methylation status of CpG islands in the human brain

            【外文期刊】 Fang F ; Fan SC ; 等 《Bioinformatics》 2006年22卷18期 2204-2209页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 FACTOR-BINDING SITES; DNA METHYLATION; VERTEBRATE GENOMES;

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            45. КОНСЕНСУС САЙТА СВЯЗЫВАНИЯ ТРАНСКРИПЦИОННОГО ФАКТОРА SF-1 И ЕГО ПОТЕНЦИАЛЬНЫЕ САЙТЫ В 5'-ФЛАНКИРУЮЩИХ РАЙОНАХ ГЕНОВ ФЕРМЕНТОВ СТЕРОИДОГЕ

            【外文期刊】 Т.В Бусыгина ; Е.В. Игнатьева ; 等 《Биохимия》 2003年68卷4期 467-476页 MEDLINE

            【关键词】 SF-1 (steroidogenic factor 1); консенсус сайта связывания; ферменты стероидогенеза;

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            46. Phospholipase Cgamma/diacylglycerol-dependent activation of beta2-chimaerin restricts EGF-induced Rac signaling

            【外文期刊】 Wang H ; Yang C ; 等 《EMBO Journal》 2006年25卷10期 2062-2074页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Animals; COS Cells; Cercopithecus aethiops;

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            47. CTCF mediates insulator function at the CFTR locus

            【外文期刊】 Blackledge NP ; Carter EJ ; 等 《The Biochemical Journal》 2007年408卷2期 267-275页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 CCCTC-binding factor (CTCF); chromatin structure; cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR);

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            48. Mass spectrometric proteomics profiles of in vivo tumor secretomes: Capillary ultrafiltration sampling of regressive tumor masses

            【外文期刊】 Huang CM ; Ananthaswamy HN ; 等 《Proteomics》 2006年6卷22期 6107-6116页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 capillary ultrafiltration sampling; MS; regressive tumors;

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            49. Sequence based structural characterization and genetic diversity analysis across coding and promoter regions of goat Toll-like receptor 5 gene

            【外文期刊】 Goyal,S. ; Dubey,P.K. ; 等 《Gene: An International Journal Focusing on Gene Cloning and Gene Structure and Function》 2014年540卷2期 238-245页

            【关键词】 Goat; Toll-like receptor 5; Leucine-rich repeats (LRR);

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            50. PHYSICOCHEMICAL CHARACTERIZATION OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR AND EVIDENCE FOR CONFORMATIONAL CHANGES ASSOCIATED WITH ITS ACTIVATION BY AMMONIUM SULPHATE

            【外文期刊】 Gregoriou M ; Jones PF ; 等 《The Biochemical Journal》 1995年306卷Pt.3期 667-678页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Protein-tyrosine kinase; Ligand-binding affinity; Factor egf receptor;

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