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【中文期刊】 阳文攀 刘相杰 等 《畜牧兽医学报》 2025年56卷1期 213-221页
【摘要】 旨在比较不同基因组预测模型预测准确性与运行效率,以探究支持向量机(SVM)回归与随机森林(RandomForest)回归在基因组预测中的应用价值与应用前景.本研究使用博瑞迪猪50K液相芯片,采用GBLUP、BayesB、BayesLASSO...
【中文期刊】 胡玉龙 杨芳 等 《遗传》 2024年46卷7期 560-569页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 基因组预测已成为畜禽、作物遗传评估和人类疾病风险预测的主要技术,但经典的基因组预测方法在性状遗传调控机制等生物学先验信息的整合方面有一定的不足.本研究提出一种将mRNA转录本信息整合应用于复杂性状表型预测的方法.基于国际上广泛应用于数量遗传...
【中文期刊】 钟欣 张晖 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷2期 438-450页
【摘要】 我国是世界上最大的生猪生产国和猪肉消费国,但仍存在着母系猪繁殖力普遍较低的重要问题,选育具有高繁殖性状的母系猪已成为当前研究的焦点和热点.目前,已明确多个影响母猪产仔数的已知基因,包括雌激素受体(estrogen receptors,ESR...
【中文期刊】 吴华煊 杜志强 《畜牧兽医学报》 2024年55卷6期 2431-2440页
【摘要】 旨在探索并评估6种不同的单核苷多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)基因型特征提取方法.本研究分析比较了 6种方法:主成分分析(principal component analysis,PCA)、基...
【中文期刊】 李竟 张元旭 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷6期 2281-2292页
【摘要】 机器学习方法是全基因组选择研究的重要分支,深度学习是近年来机器学习领域新的研究热点.本文介绍了机器学习以及深度学习全基因组选择研究的原理和应用发展,分别从模型框架、模型参数、特征选择等方面对深度学习全基因组育种值估计研究进展进行了阐述,探讨...
【中文期刊】 王进部 李佳 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷7期 2775-2785页
【摘要】 基因组选择的广泛应用大大加快了畜禽的遗传进展.随着畜禽芯片的商业化和测序成本的不断降低,可获得的畜禽基因组信息越来越丰富.基因型标记数量远远超过具有表型数据的样本个数,基因组信息之间的关系更加复杂等问题也随之出现,使得最佳线性无偏预测(be...
【中文期刊】 Boris Lukic Ino Curik 等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2024年15卷2期 546-562页
【摘要】 Background The importance of sheep breeding in the Mediterranean part of the eastern Adriatic has a long tradi-tion sinc...
【关键词】 Composite-likelihood ratio； East Adriatic sheep； Extreme ROH islands；
【中文期刊】 孙东晓 张胜利 等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷10期 4028-4039页
【摘要】 基因组选择(GS)的基本原理是基于全基因组高密度标记(主要是SNPs)来评估和选择基因优良的个体.利用该技术,可以实现不依赖表型信息对青年公牛及后备母牛进行早期准确选择,将奶牛育种周期由5～6年缩短至2年左右,大幅度缩短世代间隔,从而显著降...
【中文期刊】 李棉燕 王立贤 等 《中国农业科学》 2023年56卷18期 3682-3692页
【摘要】 基因组选择是指利用覆盖在全基因组范围内的分子标记信息来估计个体育种值.利用基因组信息能够避免因系谱错误带来的诸多问题,提高选择准确性并缩短育种世代间隔.根据统计模型的不同,基因组选择方法可大致分为基于BLUP(best linear unb...
【中文期刊】 马浩然 张路培 等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷10期 4174-4185页
【摘要】 旨在在系统对比分析亲缘关系不同计算方法基础上探索适合我国肉牛地方品种的亲缘关系评估方法.本研究主要以柴达木牛等10个肉牛地方品种为研究对象,使用重抽样方法获得地方品种的模拟数据,以此为基础使用PCA聚类结果为参照,分别利用预测误差方差、广义...
【中文期刊】 王万年 陈思佳 等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷7期 2824-2835页
【摘要】 旨在将多层感知机(multilayer perceptron,MLP)应用于绵羊限性性状基因组选择中,并在多种情况下与其他经典基因组选择方法进行比较分析.本研究利用Qmsim软件模拟2个绵羊群体Pop1和Pop2的表型数据和基因型数据.在M...
【中文期刊】 张瑞锋 黄珍 等 《中国畜牧杂志》 2023年59卷10期 21-29页
【摘要】 全基因组选择是通过覆盖全基因组的分子标记获取遗传信息,以目标性状基因组育种值作为个体选择依据的策略,该技术使遗传评定准确性得到明显的提升,有利于加快育种进展.随着全基因组选择技术在种猪育种实践中不断地推广应用,该技术已成为我国种猪遗传改良的...
【中文期刊】 王亦秋 姜自琴 等 《广东畜牧兽医科技》 2023年48卷5期 1-6页
【摘要】 基因组选择技术是利用覆盖全基因组的遗传标记进行个体基因组育种值的估计.单核苷酸多态性标记(Single nucleotide polymorphisms,SNP)被广泛应用于各遗传学领域.近年来,各种全基因组SNP标记开发方法的发展使得研究...
【中文期刊】 杨凯 卢倬达 等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷12期 4943-4951页
【摘要】 旨在探究提高杜洛克猪胴体性状基因组选择准确性的方法,为提高种猪胴体性状的基因组选择准确性提供理论基础.本研究以2 796头杜洛克公猪和3 149头杜长大商品猪的校正115 kg体重日龄(AGE115)、校正115 kg背膘厚(BF115)和...
【中文期刊】 袁颖琳 白江松 等 《中国畜牧杂志》 2023年59卷9期 63-71页
【摘要】 丹麦养猪业技术先进、体系成熟,在各个方面都处于国际领先地位,因此丹麦是名副其实的养猪强国.随着高通量测序的日益成熟,成本逐渐降低,丹麦对丹系猪品种开展了大规模基因组选择育种,进一步加快了遗传进展,以提高其生产效益.本文主要从丹系猪品种起源与...
【中文期刊】 Lei Xie Jiangtao Qin 等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷6期 2345-2362页
【摘要】 Background As pre-cut and pre-packaged chilled meat becomes increasingly popular,integrating the carcass-cutting process...
【关键词】 Carcass morphology traits； Genomic selection； Genotype imputation；
【中文期刊】 Oscar González-Recio Adrián López-Catalina 等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷6期 2276-2289页
【摘要】 Background Genotype-by-sequencing has been proposed as an alternative to SNP genotyping arrays in genomic selection to o...
【关键词】 Genomic selection； Genomic values； Low pass sequencing；
【中文期刊】 Fuping Zhao Pengfei Zhang 等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷4期 1363-1376页
【摘要】 Background Genomic selection involves choosing as parents those elite individuals with the higher genomic estimated bree...
【关键词】 Genetic gain； Genomic mating； Genomic selection；
【中文期刊】 Jiabo Wang Zhiwu Zhang 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2021年19卷4期 629-640页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Genome-wide association study (GWAS) and genomic prediction/selection (GP/GS) are the two essential enterprises in genom...
【关键词】 GWAS； Genomic selection； Software；
【中文期刊】 Lin Chen Fei He 等 《植物学报（英文版）》 2021年63卷11期 1937-1951页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Alfalfa (Medicago sativa L.) is an important forage crop worldwide. However, little is known about the effects of breedi...
【关键词】 alfalfa,genome-wide association studies,genomic selection,geographical origin,population structure,root ； development；
【中文期刊】 《中国癌症研究（英文版）》 2013年25卷6期 623-636页 SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【关键词】 Colorectal cancer metastasis； integrated analysis； comparative genomic hybridization (CGH)；
【中文期刊】 《植物学报（英文版）》 2012年54卷5期 312-320页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Genomic selection (GS) and high-throughput phenotyping have recently been captivating the interest of the crop breeding ...
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2008年6卷2期 91-97页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 In considering key events of genomic disorders in the development and progression of cancer, the correlation between gen...
【关键词】 array comparative genomic hybridization； breast cancer； cancer evolution model；
【中文期刊】 李宏伟 王瑞军 等 《遗传》 2017年39卷5期 377-387页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 近年来,随着基因芯片技术的发展与育种技术的进步,动植物的基因组选择成为研究热点.在家畜育种中,基因组选择凭借其准确性高、世代间隔短和育种成本低等优势被应用于各种经济动物的种畜选择中.本文详细介绍了基因分型技术和基因组育种值估计方法(最小二乘...
【关键词】 基因组选择； 基因分型技术； 基因组育种值估计方法；
【中文期刊】 孙琦 李文兰 等 《西北植物学报》 2016年36卷6期 1269-1277页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 全基因组选择技术通过全基因组中大量的单核苷酸多态性标记(SNP)和参照群体的表型数据建立 BLUP模型估计出每一标记的育种值，称为估计育种值(GEBV)，然后仅利用同样的分子标记估计出后代个体育种值并进行选择。该文就近年来国内外有关影响基因...
【中文期刊】 王重龙 丁向东 等 《遗传》 2014年36卷2期 111-118页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 基因组育种值估计是基因组选择的重要环节,基因组育种值的准确性是基因组选择成功应用的关键,而其准确性在很大程度上取决于估计方法.目前研究和应用最多的基因组育种值估计方法是贝叶斯(Bayes)和最佳线性无偏预测(BLUP)两大类方法.文章系统介...
【中文期刊】 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2019年10卷1期 1-11页
【摘要】 Meat and milk production needs to increase ～ 70-80％ relative to its current levels for satisfying the human needs in 205...
【关键词】 Animal breeding； Embryos； Genomic selection；
【中文期刊】 唐金梅 陈建国 《贵州农业科学》 2016年44卷8期 1-5页
【摘要】 育种值的估计是品种选育核心,在农业生产中占有十分重要的地位.全基因组选择通过估计全基因组所有标记或单倍型的效应,从而得到基因组估计的育种值,是分子标记辅助选择的一种新方法.随着高通量基因分型技术的发展及高密度全基因组SNP标记的开发应用,全...
【中文期刊】 姜格格 宋丽莉 等 《草业学报》 2013年22卷4期 170-178页
【摘要】 铝毒害是酸性土壤耕种的主要限制因素,每年造成大量作物减产.蒺藜苜蓿是紫花苜蓿的一年生近缘种,广泛分布于世界各地,是紫花苜蓿遗传改良的重要基因资源.本研究利用蒺藜苜蓿群体的耐酸铝性状差异,进行全基因组关联分析,筛选蒺藜苜蓿耐酸铝性状相关的遗传...
【中文期刊】 《畜牧与生物技术杂志(英文版)》 2012年03卷1期 16-20页
【摘要】 Missing genotypes are a common feature of high density SNP datasets obtained using SNP chip technology and this is likel...
【关键词】 Chinese Holstein Cows； dairy cattle； genomic selection；
【中文期刊】 Admas Alemu Johanna ?strand 等 《分子植物（英文版）》 2024年17卷4期 552-578页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Genomic selection,the application of genomic prediction(GP)models to select candidate individuals,has significantly adva...
【关键词】 genomic selection； genetic gain； genomic prediction optimization；
【中文期刊】 Yong Shi Biao-Feng Zhou 等 《植物分类学报》 2024年62卷3期 505-519页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 A fundamental question in speciation genomics is how evolutionary processes shape the genomic landscape of differentiati...
【关键词】 genomic island； linked selection； Quercus；
【中文期刊】 王欣 徐一亿 等 《生物技术通报》 2024年40卷3期 1-13页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 全基因组选择(GS)育种是根据训练群体全基因组上的分子标记基因型和表型之间的关联构建遗传模型,进而对基因型已知的待选群体进行育种值估计或表型预测,以实现对育种群体高效和精确的选择.相比于常用的分子标记辅助选择育种,GS育种无需进行标记显著性...
【中文期刊】 Kelin Wang Muhammad Ali Abid 等 《分子植物（英文版）》 2023年1期 279-293页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Genomic prediction is an effective way to accelerate the rate of agronomic trait improvement in plants.Traditional metho...
【中文期刊】 Yuefan Huang Zhengyang Qi 等 《遗传学报》 2023年50卷12期 971-982页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Phenotypic plasticity,or the ability to adapt to and thrive in changing climates and variable environments,is essential ...
【关键词】 Cotton； Phenotype plasticity； Genotype-environment interaction；
【中文期刊】 Yunbi Xu Xingping Zhang 等 《分子植物（英文版）》 2022年15卷11期 1664-1695页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The first paradigm of plant breeding involves direct selection-based phenotypic observation,followed by predictive breed...
【关键词】 smart breeding； genomic selection； integrated genomic-enviromic selection；
【中文期刊】 Xianran Li Tingting Guo 等 《分子植物（英文版）》 2021年14卷6期 874-887页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Identifying mechanisms and pathways involved in gene-environment interplay and phenotypic plasticity is a long-standing ...
【关键词】 phenotypic plasticity； genotype by environment interaction； gene-environment interplay；
【中文期刊】 《分子植物（英文版）》 2019年12卷3期 390-401页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Improved capacity of genomics and biotechnology has greatly enhanced genetic studies in different areas.Genomic selectio...
【关键词】 data mining； molecular breeding； genomic relationship；
【中文期刊】 《分子植物（英文版）》 2016年9卷8期 1132-1141页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【关键词】 oil palm； whole-genome SNP array； genome-wide association study；
【中文期刊】 《遗传学报》 2009年36卷11期 645-651页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Genome sequencing opened the flood gate of "-omics" studies, among which the research about correlations between genomic...
【关键词】 genomic variable； phenomic variable； expression pattern；
【中文期刊】 牛一凡 杨柏高 等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷11期 4449-4457页
【摘要】 牛胚胎基因组选择(embryonic genome selection,EGS)是指活检牛早期胚胎中部分滋养层细胞,通过微量胚胎细胞全基因组扩增,进行遗传育种值评估,筛选出优质早期胚胎.该项技术的基本步骤是:对第6天左右的早期牛囊胚进行活检...
【中文期刊】 Yun-Mei Wang Saber Khederzadeh 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2021年19卷5期 787-799页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Piao chicken,a rare Chinese native poultry breed,lacks primary tail structures,such as pygostyle,caudal vertebra,uropygi...
【关键词】 Comparative transcrip-tomics； Population genomics； Rumplessness；
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