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【中文期刊】 阳文攀 刘相杰  等 《畜牧兽医学报》 2025年56卷1期 213-221页

【摘要】 旨在比较不同基因组预测模型预测准确性与运行效率,以探究支持向量机(SVM)回归与随机森林(RandomForest)回归在基因组预测中的应用价值与应用前景.本研究使用博瑞迪猪50K液相芯片,采用GBLUP、BayesB、BayesLASSO...

【关键词】 长白猪； 繁殖性状； 基因芯片；

【中文期刊】 胡玉龙 杨芳  等 《遗传》 2024年46卷7期 560-569页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 基因组预测已成为畜禽、作物遗传评估和人类疾病风险预测的主要技术,但经典的基因组预测方法在性状遗传调控机制等生物学先验信息的整合方面有一定的不足.本研究提出一种将mRNA转录本信息整合应用于复杂性状表型预测的方法.基于国际上广泛应用于数量遗传...

【关键词】 基因组选择； 基因组预测； mRNA转录本；

【中文期刊】 钟欣 张晖  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷2期 438-450页

【摘要】 我国是世界上最大的生猪生产国和猪肉消费国,但仍存在着母系猪繁殖力普遍较低的重要问题,选育具有高繁殖性状的母系猪已成为当前研究的焦点和热点.目前,已明确多个影响母猪产仔数的已知基因,包括雌激素受体(estrogen receptors,ESR...

【关键词】 母猪繁殖力； 遗传育种基因； 全基因组关联分析；

【中文期刊】 吴华煊 杜志强  《畜牧兽医学报》 2024年55卷6期 2431-2440页

【摘要】 旨在探索并评估6种不同的单核苷多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)基因型特征提取方法.本研究分析比较了 6种方法:主成分分析(principal component analysis,PCA)、基...

【关键词】 基因组选择； 特征提取； 预测准确性；

【中文期刊】 李竟 张元旭  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷6期 2281-2292页

【摘要】 机器学习方法是全基因组选择研究的重要分支,深度学习是近年来机器学习领域新的研究热点.本文介绍了机器学习以及深度学习全基因组选择研究的原理和应用发展,分别从模型框架、模型参数、特征选择等方面对深度学习全基因组育种值估计研究进展进行了阐述,探讨...

【关键词】 全基因组选择； 研究进展； 机器学习；

【中文期刊】 王进部 李佳  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷7期 2775-2785页

【摘要】 基因组选择的广泛应用大大加快了畜禽的遗传进展.随着畜禽芯片的商业化和测序成本的不断降低,可获得的畜禽基因组信息越来越丰富.基因型标记数量远远超过具有表型数据的样本个数,基因组信息之间的关系更加复杂等问题也随之出现,使得最佳线性无偏预测(be...

【关键词】 基因组选择； 畜禽； 机器学习；

【中文期刊】 Boris Lukic Ino Curik  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2024年15卷2期 546-562页

【摘要】 Background The importance of sheep breeding in the Mediterranean part of the eastern Adriatic has a long tradi-tion sinc...

【关键词】 Composite-likelihood ratio； East Adriatic sheep； Extreme ROH islands；

【中文期刊】 孙东晓 张胜利  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷10期 4028-4039页

【摘要】 基因组选择(GS)的基本原理是基于全基因组高密度标记(主要是SNPs)来评估和选择基因优良的个体.利用该技术,可以实现不依赖表型信息对青年公牛及后备母牛进行早期准确选择,将奶牛育种周期由5～6年缩短至2年左右,大幅度缩短世代间隔,从而显著降...

【关键词】 奶牛； 中国荷斯坦牛； 基因组选择；

【中文期刊】 李棉燕 王立贤  等 《中国农业科学》 2023年56卷18期 3682-3692页

【摘要】 基因组选择是指利用覆盖在全基因组范围内的分子标记信息来估计个体育种值.利用基因组信息能够避免因系谱错误带来的诸多问题,提高选择准确性并缩短育种世代间隔.根据统计模型的不同,基因组选择方法可大致分为基于BLUP(best linear unb...

【关键词】 机器学习； 深度学习； 基因组选择；

【中文期刊】 马浩然 张路培  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷10期 4174-4185页

【摘要】 旨在在系统对比分析亲缘关系不同计算方法基础上探索适合我国肉牛地方品种的亲缘关系评估方法.本研究主要以柴达木牛等10个肉牛地方品种为研究对象,使用重抽样方法获得地方品种的模拟数据,以此为基础使用PCA聚类结果为参照,分别利用预测误差方差、广义...

【关键词】 多品种基因组选择； 亲缘关系； 肉牛地方品种；

【中文期刊】 王万年 陈思佳  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷7期 2824-2835页

【摘要】 旨在将多层感知机(multilayer perceptron,MLP)应用于绵羊限性性状基因组选择中,并在多种情况下与其他经典基因组选择方法进行比较分析.本研究利用Qmsim软件模拟2个绵羊群体Pop1和Pop2的表型数据和基因型数据.在M...

【关键词】 多层感知机； 基因组选择； 模拟；

【中文期刊】 张瑞锋 黄珍  等 《中国畜牧杂志》 2023年59卷10期 21-29页

【摘要】 全基因组选择是通过覆盖全基因组的分子标记获取遗传信息,以目标性状基因组育种值作为个体选择依据的策略,该技术使遗传评定准确性得到明显的提升,有利于加快育种进展.随着全基因组选择技术在种猪育种实践中不断地推广应用,该技术已成为我国种猪遗传改良的...

【关键词】 全基因组选择； 猪； 遗传育种；

【中文期刊】 王亦秋 姜自琴  等 《广东畜牧兽医科技》 2023年48卷5期 1-6页

【摘要】 基因组选择技术是利用覆盖全基因组的遗传标记进行个体基因组育种值的估计.单核苷酸多态性标记(Single nucleotide polymorphisms,SNP)被广泛应用于各遗传学领域.近年来,各种全基因组SNP标记开发方法的发展使得研究...

【关键词】 单核苷酸多态性； 基因分型； 畜禽；

【中文期刊】 杨凯 卢倬达  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷12期 4943-4951页

【摘要】 旨在探究提高杜洛克猪胴体性状基因组选择准确性的方法,为提高种猪胴体性状的基因组选择准确性提供理论基础.本研究以2 796头杜洛克公猪和3 149头杜长大商品猪的校正115 kg体重日龄(AGE115)、校正115 kg背膘厚(BF115)和...

【关键词】 杜洛克猪； 杜长大猪； 基因组选择；

【中文期刊】 袁颖琳 白江松  等 《中国畜牧杂志》 2023年59卷9期 63-71页

【摘要】 丹麦养猪业技术先进、体系成熟,在各个方面都处于国际领先地位,因此丹麦是名副其实的养猪强国.随着高通量测序的日益成熟,成本逐渐降低,丹麦对丹系猪品种开展了大规模基因组选择育种,进一步加快了遗传进展,以提高其生产效益.本文主要从丹系猪品种起源与...

【关键词】 猪； 丹麦； 遗传育种；

【中文期刊】 Lei Xie Jiangtao Qin  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷6期 2345-2362页

【摘要】 Background As pre-cut and pre-packaged chilled meat becomes increasingly popular,integrating the carcass-cutting process...

【关键词】 Carcass morphology traits； Genomic selection； Genotype imputation；

【中文期刊】 Oscar González-Recio Adrián López-Catalina  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷6期 2276-2289页

【摘要】 Background Genotype-by-sequencing has been proposed as an alternative to SNP genotyping arrays in genomic selection to o...

【关键词】 Genomic selection； Genomic values； Low pass sequencing；

【中文期刊】 Fuping Zhao Pengfei Zhang  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷4期 1363-1376页

【摘要】 Background Genomic selection involves choosing as parents those elite individuals with the higher genomic estimated bree...

【关键词】 Genetic gain； Genomic mating； Genomic selection；

【中文期刊】 Jiabo Wang Zhiwu Zhang  《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2021年19卷4期 629-640页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Genome-wide association study (GWAS) and genomic prediction/selection (GP/GS) are the two essential enterprises in genom...

【关键词】 GWAS； Genomic selection； Software；

【中文期刊】 Lin Chen Fei He  等 《植物学报（英文版）》 2021年63卷11期 1937-1951页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Alfalfa (Medicago sativa L.) is an important forage crop worldwide. However, little is known about the effects of breedi...

【关键词】 alfalfa,genome-wide association studies,genomic selection,geographical origin,population structure,root ； development；

【中文期刊】 《中国癌症研究（英文版）》 2013年25卷6期 623-636页 SCIMEDLINEISTICCSCDCA

【关键词】 Colorectal cancer metastasis； integrated analysis； comparative genomic hybridization (CGH)；

【中文期刊】 《植物学报（英文版）》 2012年54卷5期 312-320页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Genomic selection (GS) and high-throughput phenotyping have recently been captivating the interest of the crop breeding ...

【关键词】 Genomic selection； high-throughput phenotyping； NIRS；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2008年6卷2期 91-97页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 In considering key events of genomic disorders in the development and progression of cancer, the correlation between gen...

【关键词】 array comparative genomic hybridization； breast cancer； cancer evolution model；

【中文期刊】 李宏伟 王瑞军  等 《遗传》 2017年39卷5期 377-387页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 近年来,随着基因芯片技术的发展与育种技术的进步,动植物的基因组选择成为研究热点.在家畜育种中,基因组选择凭借其准确性高、世代间隔短和育种成本低等优势被应用于各种经济动物的种畜选择中.本文详细介绍了基因分型技术和基因组育种值估计方法(最小二乘...

【关键词】 基因组选择； 基因分型技术； 基因组育种值估计方法；

【中文期刊】 孙琦 李文兰  等 《西北植物学报》 2016年36卷6期 1269-1277页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 全基因组选择技术通过全基因组中大量的单核苷酸多态性标记(SNP)和参照群体的表型数据建立 BLUP模型估计出每一标记的育种值，称为估计育种值(GEBV)，然后仅利用同样的分子标记估计出后代个体育种值并进行选择。该文就近年来国内外有关影响基因...

【关键词】 全基因组选择； 玉米； 估计育种值；

【中文期刊】 郝丹 苏国生  等 《黑龙江畜牧兽医》 2021年4期 43-47页

【摘要】 水貂是最重要的毛皮动物,但其遗传育种的研究进展较其他家畜慢.发达国家尤其是丹麦也只是开展了基于系谱的传统选择育种,尚未完成全基因组选择育种.我国是水貂养殖量最大的国家,因此选择育种对于加快遗传进展、提高生产效益和优化种质资源有着重大意义.文...

【关键词】 水貂； 遗传育种； 遗传机制；

【中文期刊】 王重龙 丁向东  等 《遗传》 2014年36卷2期 111-118页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 基因组育种值估计是基因组选择的重要环节,基因组育种值的准确性是基因组选择成功应用的关键,而其准确性在很大程度上取决于估计方法.目前研究和应用最多的基因组育种值估计方法是贝叶斯(Bayes)和最佳线性无偏预测(BLUP)两大类方法.文章系统介...

【关键词】 基因组选择； 基因组育种值； 贝叶斯方法；

【中文期刊】 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2019年10卷1期 1-11页

【摘要】 Meat and milk production needs to increase ～ 70-80％ relative to its current levels for satisfying the human needs in 205...

【关键词】 Animal breeding； Embryos； Genomic selection；

【中文期刊】 唐金梅 陈建国  《贵州农业科学》 2016年44卷8期 1-5页

【摘要】 育种值的估计是品种选育核心,在农业生产中占有十分重要的地位.全基因组选择通过估计全基因组所有标记或单倍型的效应,从而得到基因组估计的育种值,是分子标记辅助选择的一种新方法.随着高通量基因分型技术的发展及高密度全基因组SNP标记的开发应用,全...

【关键词】 全基因组选择； 植物育种； 研究进展；

【中文期刊】 康俊梅 张铁军  等 《草业学报》 2014年6期 304-312页

【摘要】 四倍体紫花苜蓿是重要的豆科牧草之一，由于其复杂的遗传背景与二倍体作物相比遗传作图与重要性状数量性状位点（quantitative trait locus，QTL）定位研究相对滞后。然而，二倍体苜蓿的相关研究起步较早，已经建立了高密度遗传图谱...

【关键词】 苜蓿； 遗传连锁图谱； QTL；

【中文期刊】 姜格格 宋丽莉  等 《草业学报》 2013年22卷4期 170-178页

【摘要】 铝毒害是酸性土壤耕种的主要限制因素,每年造成大量作物减产.蒺藜苜蓿是紫花苜蓿的一年生近缘种,广泛分布于世界各地,是紫花苜蓿遗传改良的重要基因资源.本研究利用蒺藜苜蓿群体的耐酸铝性状差异,进行全基因组关联分析,筛选蒺藜苜蓿耐酸铝性状相关的遗传...

【关键词】 蒺藜苜蓿； 全基因组关联分析； EMMA；

【中文期刊】 《畜牧与生物技术杂志(英文版)》 2012年03卷1期 16-20页

【摘要】 Missing genotypes are a common feature of high density SNP datasets obtained using SNP chip technology and this is likel...

【关键词】 Chinese Holstein Cows； dairy cattle； genomic selection；

【中文期刊】 牛一凡 杨柏高  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷11期 4449-4457页

【摘要】 牛胚胎基因组选择(embryonic genome selection,EGS)是指活检牛早期胚胎中部分滋养层细胞,通过微量胚胎细胞全基因组扩增,进行遗传育种值评估,筛选出优质早期胚胎.该项技术的基本步骤是:对第6天左右的早期牛囊胚进行活检...

【关键词】 胚胎基因组选择； 活检方法； 扩增方法；

【中文期刊】 Yun-Mei Wang Saber Khederzadeh  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2021年19卷5期 787-799页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Piao chicken,a rare Chinese native poultry breed,lacks primary tail structures,such as pygostyle,caudal vertebra,uropygi...

【关键词】 Comparative transcrip-tomics； Population genomics； Rumplessness；

【中文期刊】 李洪杰 李义文  等 《遗传学报》 2000年27卷7期 608-613页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 对175株普通小麦与6D/6V代换系杂种当代幼胚培养再生植株进行谷草转氨酶同工酶分析，其中来自杂交组合遗4095×RW15（6D／6V代换系）的2个植株（编号分别为98R149和98R159）GOT—V2编码的6VL特异酶带缺失，SCAR标...

【关键词】 Pm21； 组织培养； 易位；

【中文期刊】 何俊 钱长嵩  等 《遗传》 2018年40卷4期 305-314页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 自然和人工选择、地理隔离和遗传漂移等原因使动物基因组中许多位点的等位基因频率在群体间会产生差异.源于不同品种(祖先)杂交(交配)的动物个体,其基因组与这些品种(祖先)的基因频率(基因型)会存在一定的相关性.因此采用合适的统计模型和分析方法,...

【关键词】 基因组品种构成； 回归模型； 混合分布模型；

【中文期刊】 韦焕苹 闫妍  等 《寄生虫与医学昆虫学报》 2019年26卷1期 7-12页 ISTICCABP

【摘要】 为明确缅甸流行区间日疟原虫红内期疫苗候选抗原Duffy结合蛋白 ( DBP) 的基因多态性特点, 提取20例缅甸流行区 ( Bilin 和 Paletwa) 间日疟原虫基因组 DNA, 通过 PCR 扩增和测序检测, 参考Mandalay流...

【关键词】 间日疟原虫； pvdbp-Ⅱ； 基因多态性；

【中文期刊】 张学龙 孙海明  等 《国际遗传学杂志》 2008年31卷6期 417-421页 ISTICCA

【摘要】 本综述拟介绍有关自然选择的一些基本概念.在人类进化过程中,自然选择会在基因组中留下一些分子信号,我们重点分析如何利用这些信号来识别自然选择尤其是正向选择,因为发生正向选择作用的基因组区域一定具有重要的功能.

【关键词】 自然选择； 正向选择； 中性检验；

【中文期刊】 刘羽 赵传志  等 《山东农业科学》 2014年5期 1-6页

【摘要】 过敏性反应是植物抗病机制中最常见的形式之一。过敏性诱导反应（Hypersensitive-induced re-action）基因HIR是与过敏反应相关的一类基因，属于PID家族成员，参与许多细胞生理过程，并与细胞程序化死亡有密切关系。本研...

【关键词】 花生； HIR； 基因表达；

【中文期刊】 Ying Gong Yefang Li  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷5期 1815-1833页

【摘要】 As large-scale genomic studies have progressed,it has been revealed that a single reference genome pattern cannot repres...

【关键词】 Breeding； Domestic animals； Pangenome；

【中文期刊】 《世界胃肠病学杂志(英文版)》 2008年14卷4期 617-621页 SCIMEDLINEISTIC

【摘要】 AIM: To correlate the polymorphisms in the 5'-untranslated region with thymidylate synthase (TS) protein expression in H...

【关键词】 Colonic neoplasms； Thymidylate synthase； Polymorphism Genetic；

【中文期刊】 《世界胃肠病学杂志(英文版)》 2008年14卷22期 3490-3496页 SCIMEDLINEISTIC

【摘要】 AIM: To establish a cell model harboring replicative clinical hepatitis B virus (HBV) isolates and evaluate its applicat...

【关键词】 Hepatitis B virus； Chronic hepatitis B； Hepatitis B virus isolate；

【中文期刊】 《世界胃肠病学杂志（英文版）》 2007年13卷1期 8-13页 SCIMEDLINEISTIC

【摘要】 More than 30 years after the discovery of human hepatitis B virus (HBV) this virus remains to be one of the major global...

【关键词】 Hepatitis B virus； Molecular biology； Viral life cycle；

【中文期刊】 陶勇 金虹  等 《遗传学报》 2006年33卷11期 1037-1046页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Chi58是Sanguibacter sp.strain C4产生的一种胞外几丁质酶.通过chiA的特异性PCR引物探测到菌株C4中存在几丁质酶,并将扩增到的几丁质酶基因片段(chiA-F)克隆、测序后,提交GenBank数据库进行同源性搜...

【关键词】 几丁质酶； 克隆； 表达；

【中文期刊】 任小丹 陈玲  等 《广西植物》 2016年36卷3期 253-260页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 玉米雄穗通常较发达,散粉量大于授粉需要,过量消耗能量会影响光合产物向果穗的分配,过于发达的雄穗还会影响群体透光性、降低光合效率。生产实践和育种研究证明,由于雄穗大小与玉米籽粒产量负相关,因此成为品种选育的间接选择指标。该研究根据前人的报道,...

【关键词】 差异表达； 角蛋白伴侣基因； 玉米；

【中文期刊】 黄艳欣 严勤  等 《哈尔滨医科大学学报》 2015年6期 498-503页 ISTICCA

【摘要】 目的：探讨脐血来源的CD34＋造血干细胞对乙型肝炎病毒（ HBV）的易感性。方法留取健康产妇的脐血，分离纯化CD34＋造血干细胞，加入细胞因子和高载量HBV阳性血清（107 IU／mL）共同培养。于培养12天时提取细胞进行免疫组化、免疫荧光...

【关键词】 肝炎病毒,乙型； 造血干细胞； 脐带血；

【中文期刊】 高志香 李立艳  等 《中华临床医师杂志（电子版）》 2013年23期 10607-10610页 ISTICCA

【摘要】 目的：筛选刺激机体产生抗体的铜绿假单胞菌优势抗原表位，分析铜绿假单胞菌抗原基因的定位。方法收集健康人和铜绿假单胞菌感染患者血清，应用噬菌体展示十二肽库进行1轮阴性选择淘选和3轮生物淘选，对阳性克隆单噬菌体进行测序，与PAO1基因组序列比对分...

【关键词】 假单胞菌,铜绿； 抗原； 基因；

【中文期刊】 陆玉建 吴信明  等 《华北农学报》 2016年31卷2期 45-51页

【摘要】 为了提高 MDCK 细胞表面禽流感病毒（AIV）受体的水平，以12日龄的 SPF 鸡胚为试材，通过反转录 PCR扩增唾液酸转移酶Ⅰ基因（St3galⅠ），并将回收的片段插入到 pMD18-T 载体中。酶切 pMD18-T-St3galⅠ和 ...

【关键词】 唾液酸； St3galⅠ 基因； MDCK；

【中文期刊】 《亚太生殖杂志（英文版）》 2014年2期 85-89页

【摘要】 Objective: To analyze the correlation between embryo morphology and the chromosomal status using the array comparative g...

【关键词】 Aneuploidy； Blastomere biopsy Cleavage rate； Chromosomal abnormalities；

【中文期刊】 华慧颖 王芳  等 《农业科学与技术（英文版）》 2011年12卷2期 188-190页

【摘要】 [目的]探讨了高简并性引物扩增庞大基因家族基因的特殊方法.[方法]采用常规高简并引物对鲤鱼基因组DNA分析进行了常规PCR扩增、常规降落PCR扩增以及优化后的小温度范围不规则跳跃降落PCR扩增.[结果]采用PCR仅得1条明显条带,得到的基因...

【关键词】 高简并性引物； 不规则降落PCR； 基因家族；