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【外文期刊】 Tewari, S.G. ; 《Journal of biological systems》 2011年19卷4期 551-560页SCISCIE
- 概要：
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【外文期刊】 H.H. Haeri ; S.M. Hashemianzadeh ; 等 《Computational biology and chemistry》 2007年31卷2期 99-109页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Debraj Ghosh ; Rajat K. De ; 《BioSystems》 2017年162卷 135-146页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Gillespie algorithm;B cell receptor signaling network;Fc?RI signaling network;
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【外文期刊】 Burrage K ; Tian TH ; 等 《Progress in Biophysics and Molecular Biology: An International Review Journal》 2004年85卷2/3期 217-234页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Stochastic simulation methods;Poisson runge-kutta methods;Chemical;
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【外文期刊】 Anderson, David F. ; Yuan, Chaojie ; 《Bulletin of Mathematical Biology: An International Journal》 2019年81卷8期 2902-2930页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Stochastic chemical kinetics;Variance reduction;Gillespie algorithm;
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【外文期刊】 Fournier, T. ; Gabriel, J.-P. ; 等 《Bulletin of Mathematical Biology: An International Journal》 2009年71卷6期 1394-1431页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Michael J. Byrne ; 《Journal of computational neuroscience》 2009年27卷3期 621-638页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 calmodulin;CaMKII;synaptic plasticity;
- 概要：
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【外文期刊】 Christian,N. ; Skupin,A. ; 等 《Journal of Theoretical Biology》 2014年343卷 102-112页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Calcium signaling;Emergent properties of mesostates;Gillespie algorithm;
- 概要：
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【外文期刊】 Ribeiro A ; Zhu R ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2006年13卷9期 1630-1639页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 gene regulatory networks (GRNs);genetic toggle switch;Gillespie algorithm;
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【外文期刊】 Allen, GE ; Dytham, C ; 《BioSystems》 2009年98卷1期 37-42页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Individual-based model;Continuous-time model;Efficient simulation;
- 概要：
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【外文期刊】 Forouzannia, Farinaz ; Shahrezaei, Vahid ; 等 《Journal of Theoretical Biology》 2021年509卷 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Stochastic model;Gillespie algorithm;Tumor control probability;
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【外文期刊】 Roh, Min K. ; 《Bulletin of Mathematical Biology: An International Journal》 2019年81卷8期 3097-3120页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Stochastic simulation;Rare event probability estimation;SSA;
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【外文期刊】 C.P. Chandran ; 《International journal of nano and biomaterials》 2016年6卷3/4期 162-177页
- 概要：
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【外文期刊】 ANDRE S. RIBEIRO ; RUI ZHU ; 等 《WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine》 2006年3卷3期 261-263页
【关键词】 Gene Regulatory Networks;Stochastic Dynamics;Random Boolean Networks;
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【外文期刊】 James M.McCollum ; Gregory D.Peterson ; 等 《Computational biology and chemistry》 2006年30卷1期 39-49页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Stochastic simulation;Modeling biochemical systems;Gillespie algorithm;
- 概要：
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【外文期刊】 Pahle J ; 《Briefings in bioinformatics》 2009年10卷1期 53-64页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 CHEMICALLY REACTING SYSTEMS;MONTE-CARLO SIMULATION;KINETIC SIMULATIONS;
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【外文期刊】 Tan Chee Meng ; Sandeep Somani ; 等 《In silico biology: An international on computational biology》 2004年4卷3期 293-309页MEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Twarock, Reidun ; Stockley, Peter G. ; 《Annual review of biophysics》 2019年48卷 495-514页
【关键词】 virus assembly;RNA packaging signals;genome organization;
- 概要：
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【外文期刊】 Kang, Hye-Won ; Erban, Radek ; 《Bulletin of Mathematical Biology: An International Journal》 2019年81卷8期 3185-3213页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Stochastic reaction-diffusion systems;Chemical reaction networks;Markov chain;
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【外文期刊】 VonWegner,F. ; Wieder,N. ; 等 《Advances in Experimental Medicine and Biology》 2012年740卷 553-567页SCIEMEDLINE
【关键词】 binomial leap;Calcium;Calcium channel;
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【外文期刊】 Arnold,C. ; Stadler,P.F. ; 等 《Journal of Theoretical Biology》 2013年336卷 61-74页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Chromatin complexity;Chromatin computation;Epigenetic inheritance;
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【外文期刊】 Lester, Christopher ; Baker, Ruth E. ; 等 《Bulletin of Mathematical Biology: An International Journal》 2016年78卷8期 1640-1677页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Stochastic simulation;Gene regulatory networks;Multi-level;
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【外文期刊】 Haeri, HH ; Hashemianzadeh, SM ; 等 《Journal of biological systems》 2009年17卷4期 817-852页SCISCIE
- 概要：
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【外文期刊】 Yates, Christian A. ; Ford, Matthew J. ; 等 《Bulletin of Mathematical Biology: An International Journal》 2017年79卷12期 2905-2928页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Cell cycle;Markovian representation;Stochastic simulation;
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【外文期刊】 Manninen T ; Linne ML ; 等 《Computational biology and chemistry》 2006年30卷4期 280-291页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Ito stochastic differential equation;chemical Langevin equation;Gillespie stochastic simulation algorithm;
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【外文期刊】 Go,R. ; Hirose,S. ; 等 《Cancer science》 2010年101卷6期 1347-1353页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Hamster Christian ; van Heijster Peter ; 《Bulletin of Mathematical Biology: An International Journal》 2023年85卷8期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Gillespie algorithms;Cell motility;Mesoscopic patterns;
- 概要：
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【外文期刊】 Auwal,Abdullahi ; Shamarina,Shohaimi ; 等 《Entropy (Basel, Switzerland)》 2019年22卷1期
【关键词】 Gillespie algorithm;basic reproduction number;branching process;
- 概要：
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【外文期刊】 Sergey,Pavlov ; Vitaly V,Gursky ; 等 《Life (Basel, Switzerland)》 2021年11卷11期
【关键词】 Gillespie algorithm;cellular resources;mobile genetic elements;
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【外文期刊】 Frederic,von Wegner ; Nicolas,Wieder ; 等 《Frontiers in genetics》 2014年5卷 376页
【关键词】 Gillespie algorithm;Ornstein-Uhlenbeck process;calcium microdomains;
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【外文期刊】 Krishna,Rijal ; Pankaj,Mehta ; 《eLife》 2025年14卷
【关键词】 cell biology;differentiable Gillespie algorithm;gene regulatory networks;
- 概要：
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【外文期刊】 Debraj,Ghosh ; Rajat K,De ; 《Bio Systems》 2017年162卷 135-146页SCIMEDLINEBP
【关键词】 B cell receptor signaling network;Fc?RI signaling network;Gillespie algorithm;
- 概要：
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【外文期刊】 Alfonso,Landeros ; Timothy,Stutz ; 等 《Computer methods and programs in biomedicine》 2018年167卷 23-35页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Gillespie algorithm;Julia language;Stochastic simulation;
- 概要：
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【外文期刊】 John P,DeLong ; Clayton E,Cressler ; 《Ecology》 2023年104卷1期 e3873页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Gillespie algorithm;Gillespie eco-evolutionary model;eco-evolutionary dynamics;
- 概要：
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【外文期刊】 Christian,Hamster ; Peter,van Heijster ; 《Bulletin of mathematical biology》 2023年85卷8期 70页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Cell motility;Chemical Langevin equation;Gillespie algorithms;
- 概要：
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【外文期刊】 John P,DeLong ; Jean P,Gibert ; 《Ecology and evolution》 2016年6卷4期 935-45页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Body size;Eco‐evolutionary dynamics;Gillespie algorithm;
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【外文期刊】 Michael J,Hallock ; John E,Stone ; 等 《Parallel computing》 2014年40卷5-6期 86-99页
- 概要：
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【外文期刊】 Min K,Roh ; 《Bulletin of mathematical biology》 2019年81卷8期 3097-3120页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Gillespie algorithm;Importance sampling;Rare event probability estimation;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Farinaz,Forouzannia ; Vahid,Shahrezaei ; 等 《Journal of theoretical biology》 2021年509卷 110494页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Gillespie algorithm;Random fluctuations;Stochastic model;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Hye-Won,Kang ; Radek,Erban ; 《Bulletin of mathematical biology》 2019年81卷8期 3185-3213页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Chemical reaction networks;Gillespie algorithm;Markov chain;
- 概要：
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【外文期刊】 Wim,Hordijk ; Nilesh,Vaidya ; 等 《Journal of systems chemistry》 2014年5卷 4页
【关键词】 Autocatalytic set;Gillespie algorithm;Origins of life;
- 概要：
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【外文期刊】 Celeste,Vallejo ; James,Keesling ; 等 《Infectious Disease Modelling》 2018年3卷 136-138页
【关键词】 Acute flaccid paralysis surveillance;Gillespie algorithm;Microsimulation model;
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【外文期刊】 Richard M,Jiang ; Fredrik,Wrede ; 等 《BMC bioinformatics》 2021年22卷1期 339页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Approximate Bayesian Computation;Biochemical reaction systems;Discrete stochastic reaction systems;
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【外文期刊】 Christian A,Yates ; Matthew J,Ford ; 等 《Bulletin of mathematical biology》 2017年79卷12期 2905-2928页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Cell cycle;Exponentially modified Erlang;Gillespie algorithm;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Reidun,Twarock ; Peter G,Stockley ; 《Annual review of biophysics》 2019年48卷 495-514页SCIMEDLINECA
【关键词】 Gillespie algorithms;Hamiltonian paths;RNA packaging signals;
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【外文期刊】 Nils,Christian ; Alexander,Skupin ; 等 《Journal of theoretical biology》 2014年343卷 102-12页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Calcium signaling;Emergent properties of mesostates;Gillespie algorithm;
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【外文期刊】 Marcell,Miski ; Áron,Weber ; 等 《BMC neuroscience》 2024年25卷1期 32页SCIMEDLINECABP
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【外文期刊】 Giselle,McCallum ; Laurent,Potvin-Trottier ; 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2021年2229卷 91-118页
【关键词】 Biological oscillations;Dynamical gene network;Gillespie algorithm;
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【外文期刊】 Arwen,Meister ; Chao,Du ; 等 《Quantitative biology (Beijing, China)》 2014年2卷1期 1-29页
【关键词】 Gillespie algorithm;Langevin equation;Master equation;
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