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            1. Quantitative proteomic and kinomic analysis of hepatocellular carcinoma tissues by SWATH-MS reveals complex reprogramming of cell metabolic pathways

            【会议论文】王红霞 第五届中国计算蛋白质组学研讨会 2018年

            【摘要】 Hepatocellular carcinoma(HCC)is one of the most common cancers worldwide andremains one of the most prevailing and letha...

            【关键词】 quantitative proteomics； quantitative kinomics； SWATH-MS；

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            2. Quantitative Proteomic and Phosphoproteomic Analysis of H37Ra and H37Rv Strains of Mycobacterium tuberculosis

            【外文期刊】 Verma, Renu ; Pinto, Sneha Maria ; 等 《Journal of proteome research》 2017年16卷4期 1632-1645页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 chaperones; kinome; Orbitrap Fusion Tribrid mass spectrometer;

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            3. Identification of a thienopyrimidine derivatives target by a kinome and chemical biology approach

            【外文期刊】 TranslationalResearchCenterforProteinFunctionControl,DepartmentofBiotechnology ; DepartmentofIntegratedOMICSforBiomedicalSciences,WCUProgram ; 《Archives of pharmacal research》 2015年38卷9期 1575-1581页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Chemical biology; FLT3; Fragment-based drug design;

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            4. The protein kinase MAP3K19 phosphorylates MAP2Ks and thereby activates ERK and JNK kinases and increases viability of KRAS-mutant lung cancer cells

            【外文期刊】 Hoang, Van T. ; Nyswaner, Katherine ; 等 2020年295卷25期 8470-8479页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 protein kinase; extracellular-signal-regulated kinase (ERK); c-Jun N-terminal kinase (JNK);

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            5. Systems kinomics for characterizing host responses to high-consequence pathogens at the NIH/NIAID Integrated Research Facility-Frederick

            【外文期刊】 Kindrachuk, Jason ; Falcinelli, Shane ; 等 《Pathogens and disease[electronic]》 2014年71卷2期 188-196页

            【关键词】 kinome; high-consequence pathogens; filovirus;

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            6. Integrated analysis of proteome, phosphotyrosine‐proteome, tyrosine‐kinome, and tyrosine‐phosphatome in acute myeloid leukemia

            【外文期刊】 Tong Jiefei ; Helmy Mohamed ; 等 《Proteomics》 2017年17卷6期 1600361-1600361页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 AML; Kinome; Proteome;

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            7. Whipworm kinomes reflect a unique biology and adaptation to the host animal

            【外文期刊】 Andreas J. Stroehlein ; Neil D. Young ; 等 《International Journal for Parasitology》 2017年47卷13期 857-866页 SCISCIE

            【关键词】 Kinome; Gene curation; Nematodes;

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            8. Combinatorial therapy with tamoxifen and trifluoperazine effectively inhibits malignant peripheral nerve sheath tumor growth by targeting complementary signaling cascades

            【外文期刊】 Brosius,S.N. ; Turk,A.N. ; 等 《Journal of Neuropathology and Experimental Neurology: Official Journal of the American Association of Neuropathologists, Inc》 2014年73卷11期 1078-1090页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Kinomics; Neurofibromatosis; Peripheral nervous system;

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            9. Pin1: Intimate involvement with the regulatory protein kinase networks in the global phosphorylation landscape

            【外文期刊】 Litchfield, David W. ; Shilton, Brian H. ; 等 《Biochimica et Biophysica Acta. General Subjects》 2015年1850卷10期 2077-2086页 SCISCIE

            【关键词】 Protein kinase; Kinome; Phosphoproteome;

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            10. Chemical kinomics: a powerful strategy for target deconvolution

            【外文期刊】 Kim, DH ; Sim, T ; 《BMB Reports》 2010年43卷11期 711-719页

            【关键词】 Chemical kinomics; Kinase inhibitor; Protein kinase;

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            11. Structure-guided optimization of a novel class of ASK1 inhibitors with increased sp(3) character and an exquisite selectivity profile

            【外文期刊】 Bigi-Botterill, Simone V. ; Ivetac, Anthony ; 等 2020年30卷17期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase; Kinase (MAP3K); Apoptosis Signal-Regulating Kinase-1 (ASK1);

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            12. Childhood cancers and systems medicine

            【外文期刊】 Stone, William L. ; Klopfenstein, Kathryn J. ; 等 《Frontiers in bioscience: a journal and virtual library》 2017年22卷Landmark 1期 1148-1161页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Omics; Systems Medicine; Cancer;

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            13. Kinome Profiling Reveals Abnormal Activity of Kinases in Skeletal Muscle From Adults With Obesity and Insulin Resistance

            【外文期刊】 Qi, Yue ; Zhang, Xiangmin ; 等 《The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism》 2020年105卷3期 644-659页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 insulin resistance; quantitative proteomics; human skeletal muscle;

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            14. Kinomic exploration of temozolomide and radiation resistance in Glioblastoma multiforme xenolines

            【外文期刊】 Anderson,J.C. ; Duarte,C.W. ; 等 《Radiotherapy and oncology: Journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology》 2014年111卷3期 468-474页 SCISCIE

            【关键词】 Array profiling; Glioblastoma; Kinomics;

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            15. High number of kinome-mutations in non-small cell lung cancer is associated with reduced immune response and poor relapse-free survival

            【外文期刊】 Helland, A. ; Brustugun, O. T. ; 等 《International Journal of Cancer =: Journal International du Cancer》 2017年141卷1期 184-190页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 lung cancer; mutations; kinome;

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            16. Profiling of the kinome of cytomegalovirus-infected cells reveals the functional importance of host kinases Aurora A, ABL and AMPK

            【外文期刊】 Hutterer,C. ; Wandinger,S.K. ; 等 《Antiviral Research》 2013年99卷2期 139-148页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Antiviral targets; Host cell kinome; Human cytomegalovirus;

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            17. In Silico Characterization of Atypical Kinase PFD0975w from Plasmodium Kinome: A Suitable Target For Drug Discovery

            【外文期刊】 Vishal Trivedi ; Swagata Nag ; 《Chemical biology and drug design》 2012年79卷4期 600-609页

            【关键词】 atypical kinase; kinome; malaria;

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            18. A peptide microarray fabricated on a non-fouling phosphatidylcholinepolymer-coated surface for a high-fidelity analysis of a cellular kinome

            【外文期刊】 Ikeda,H. ; Kamimoto,J. ; 等 《Current medicinal chemistry》 2013年20卷35期 4419-4425页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Kinome peptide; Microarray; Non-fouling;

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            19. Can kinomics and proteomics bridge the gap between pediatric cancers and newly designed kinase inhibitors?

            【外文期刊】 van der Sligte, Naomi E. ; Kampen, Kim R. ; 等 《Cellular and molecular life sciences: CMLS》 2015年72卷19期 3589-3598页

            【关键词】 Targeted therapy; Kinomics; Proteomics;

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            20. Kinome Profiling of Primary Endometrial Tumors Using Multiplexed Inhibitor Beads and Mass Spectrometry Identifies SRPK1 as Candidate Therapeutic Target

            【外文期刊】 Kurimchak, Alison M. ; Kumar, Vikas ; 等 2020年19卷12期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 kinases; cancer biomarker(s); pathway analysis;

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            21. Kinome-wide transcriptional profiling of uveal melanoma reveals new vulnerabilities to targeted therapeutics

            【外文期刊】 Fiona P. Bailey ; Kim Clarke ; 等 《Pigment cell & melanoma research》 2018年31卷2期 253-266页

            【关键词】 BI6727; JQ1; kinase inhibitor;

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            22. Cancer-associated mutations are preferentially distributed in protein kinase functional sites

            【外文期刊】 Izarzugaza,J.M.G. ; Redfern,O.C. ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2009年77卷4期 892-903页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Cancer; Driver mutation; Functional;

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            23. The Autophagy-Initiating Protein Kinase ULK1 Phosphorylates Human Cytomegalovirus Tegument Protein pp28 and Regulates Efficient Virus Release

            【外文期刊】 Koenig, Patrick ; Svrlanska, Adriana ; 等 《Journal of Virology》 2021年95卷6期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ULK1; autophagy; human cytomegalovirus;

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            24. Deciphering enzyme function using peptide arrays

            【外文期刊】 Thiele, A. ; Stangl, G.I. ; 等 《Molecular biotechnology》 2011年49卷3期 283-305页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Kinase; Peptide microarray; Phosphatase;

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            25. Microtubule-affinity regulating kinase 4: A potential drug target for cancer therapy

            【外文期刊】 Anwar S. ; Shahwan M. ; 等 《Cellular Signalling》 2022年99卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Drug discovery; Drug target; Human kinome;

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            26. Kinomic profiling of tumour xenografts derived from patients with non-small cell lung cancer confirms their fidelity and reveals potentially actionable pathways

            【外文期刊】 Tabbo, Fabrizio ; Guerrera, Francesco ; 等 《European journal of cancer: official journal for European Organization for Research and Treatment of Cancer (EORTC) [and] European Association for Cancer Research (EACR)》 2021年144卷 17-30页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Non-small cell lung cancer; Patient-derived tumour xenograft; Preclinical model;

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            27. High-Content siRNA Screen of the Kinome Identifies Kinases Involved in Git2-Induced Mesenchymal-Epithelial Transition

            【外文期刊】 Cao, M. G. ; Xu, J. ; 等 《Molecular Biology》 2017年51卷4期 614-620页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 siRNA screen; kinome; mesenchymal-epithelial transition;

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            28. Kinome Profiling of Osteoblasts on Hydroxyapatite Opens New Avenues on Biomaterial Cell Signaling

            【外文期刊】 Sara Gemini-Piperni ; Renato Milani ; 等 《Biotechnology and Bioengineering》 2014年111卷9期 1900-1905页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 bioengineering; hydroxyapatite; osteoblast;

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            29. Deep Phosphotyrosine Proteomics by Optimization of Phosphotyrosine Enrichment and MS/MS Parameters

            【外文期刊】 Abe, Yuichi ; Nagano, Maiko ; 等 《Journal of proteome research》 2017年16卷2期 1077-1086页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 phosphotyrosine; immunoprecipitation; phosphorylation signaling cancer;

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            30. Kinome profiling analysis identified Src pathway as a novel therapeutic target in combination with histone deacetylase inhibitors for cutaneous T-cell lymphoma

            【外文期刊】 Jimura, Nozomi ; Fujii, Kazuyasu ; 等 《Journal of dermatological science》 2021年101卷3期 194-201页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Histone deacetylase inhibitor; Cutaneous T-cell lymphoma; Kinome;

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            31. Quantitative Interrogation of the Human Kinome Perturbed by Two BRAF Inhibitors

            【外文期刊】 Miao, Weili ; Wang, Yinsheng ; 《Journal of proteome research》 2019年18卷6期 2624-2631页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 quantitative proteomics; parallel-reaction monitoring; multiple-reaction monitoring;

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            32. Advances in kinome research of parasitic worms - implications for fundamental research and applied biotechnological outcomes

            【外文期刊】 《Biotechnology Advances: An International Review Journal》 2018年36卷4期 915-934页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Kinases; Kinomes; Parasitic worms;

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            33. The sea urchin kinoine: A first look

            【外文期刊】 Bradham CA ; Foltz KR ; 等 《Developmental biology》 2006年300卷1期 180-193页

            【关键词】 kinase; signal transduction; genome;

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            34. Role of mTOR As an Essential Kinase in SCLC

            【外文期刊】 Kern, Jeffrey A. ; Kim, Jihye ; 等 《Journal of thoracic oncology: official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer》 2020年15卷9期 1522-1534页

            【关键词】 Functional genomics; Kinome; Kinase;

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            35. Emerging kinase inhibitors for the treatment of pancreatic ductal adenocarcinoma

            【外文期刊】 Rudloff, Udo ; 《Expert opinion on emerging drugs》 2022年27卷1/4期 345-368页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Pancreatic ductal adenocarcinoma; human kinome; actionable targets;

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            36. Human kinome drug discovery and the emerging importance of atypical allosteric inhibitors

            【外文期刊】 Richard M Eglen ; Terry Reisine ; 《Expert opinion on drug discovery》 2010年5卷3期 277-290页

            【关键词】 allosteric; allosterism; assay;

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            37. Technological advances for interrogating the human kinome

            【外文期刊】 Akanksha Baharani ; Brett Trost ; 等 《Biochemical Society Transactions》 2017年45卷1期 65-77页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 DAPPLE; kinase; kinome;

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            38. EhPPTome: Entamoeba histolytica protein phosphotome database

            【外文期刊】 Tamanna Anwar ; Samudrala Gourinath ; 《International journal of bioinformatics research and applications》 2017年13卷2期 178-183页

            【关键词】 phosphatase; phosphotome; E. histolytica;

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            39. REPERTOIRE OF PROTEIN KINASES ENCODED IN THE GENOME OF ZEBRAFISH SHOWS REMARKABLY LARGE POPULATION OF PIM KINASES

            【外文期刊】 R. RAKSHAMBIKAI ; N. SRINIVASAN ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2014年12卷1期 1350014-1-1350014-13页 MEDLINE

            【关键词】 Zebrafish; PIM kinase; oncogene;

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            40. Kinome analysis of Toll-like receptor signaling in bovine monocytes

            【外文期刊】 Ryan J. Arsenault ; Shakiba Jala ; 等 《Journal of receptor and signal transduction research》 2009年29卷6期 299-311页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Peptide array; bovine; kinome;

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            41. Advances in chemical proteomic evaluation of lipid kinases—DAG kinases as a case study

            【外文期刊】 Ware T.B. ; Hsu K.-L. ; 2021年65卷 101-108页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Activity-based protein profiling; Chemical proteomics; Diacylglycerol;

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            42. Expression analysis of TRAF2-and NCK-interacting protein kinase (TNIK) and phosphorylated TNIK in papillary thyroid carcinoma

            【外文期刊】 Li, Jiali ; Lan, Lili ; 等 2023年26卷1期 Article. 310-Article. 310页

            【关键词】 TRAF2-and NCK-interacting kinase; p-TNIK; papillary thyroid carcinoma;

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            43. Protein kinases: Role of their dysregulation in carcinogenesis, identification and inhibition

            【外文期刊】 Niloy Sarkar ; Amit Singh ; 等 《Drug research》 2023年73卷4期 189-199页

            【关键词】 Kinome; Protein kinases; Kinase oncogenic mutations;

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            44. Activity-Based Kinome Profiling Using Chemical Proteomics and ATP Acyl Phosphates

            【外文期刊】 Caroline E. Franks ; Ku-Lung Hsu ; 《Current Protocols in Chemical Biology》 2019年11卷3期 Activity-Based Kinome Profiling/1-Activ页

            【关键词】 activity-based protein profiling; chemical proteomics; chemo-proteomics;

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            45. Analyzing tyrosine kinase activity in head and neck cancer by functional kinomics: Identification of hyperactivated Src family kinases as prognostic markers and potential targets

            【外文期刊】 Lara BuBmann ; Konstantin Hoffer ; 等 《International Journal of Cancer =: Journal International du Cancer》 2021年149卷5期 1166-1180页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 aberrant kinase activity; functional kinome profiling; head and neck cancer;

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            46. Targeting Kinase Interaction Networks: A New Paradigm in PPI Based Design of Kinase Inhibitors

            【外文期刊】 Jenardhanan, Pranitha ; Panneerselvam, Manivel ; 等 《Nature reviews Cancer》 2019年19卷6期 467-485页

            【关键词】 Human kinome; Kinases; Protein-protein interactions (PPI);

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            47. Traumatic Brain Injury Induces Alterations in Cortical Glutamate Uptake without a Reduction in Glutamate Transporter-1 Protein Expression

            【外文期刊】 Dorsett, Christopher R. ; McGuire, Jennifer L. ; 等 《Journal of neurotrauma》 2017年34卷1期 220-234页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 astrocyte; GLT-1; glutamate;

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            48. Novel potent and highly selective DDR1 inhibitors from integrated lead finding

            【外文期刊】 Bernd,Kuhn ; Martin,Ritter ; 等 《Medicinal chemistry research: an international journal for rapid communications on design and mechanisms of action of biologically active agents》 2023年32卷7期 1400-1425页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Discoidin domain receptor 1 (DDR1); Fibrosis; Drug design;

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            49. Kinome-wide RNAi screening for mediators of ABT-199 resistance in breast cancer cells identifies Wee1 as a novel therapeutic target

            【外文期刊】 Yeliz Aka ; Bahriye Karakas ; 等 2021年137卷 106028-106028页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Breast cancer; BCL-2; MCL1;

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            50. Comprehensive screening of heterocyclic compound libraries to identify novel inhibitors for PfRIO-2 kinase through docking and substrate competition studies

            【外文期刊】 Swagata Nag ; Devendra Kumar Chouhan ; 等 《Medicinal chemistry research: an international journal for rapid communications on design and mechanisms of action of biologically active agents》 2013年22卷10期 4737-4744页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Malaria; Docking; ATP;

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