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【中文期刊】 王天宇 高诗铠 等 《生理科学进展》 2025年56卷3期 226-234页ISTICPKUCA
【摘要】 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing)是一种在单细胞水平上对全基因组基因表达进行高通量测序的技术,能有效解析细胞群体异质性,目前广泛应用于发育、疾病等研究领域.由于单细胞转录组数据通常存在高噪声、高维度和高...
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【中文期刊】 刘洋 池晴佳 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2025年46卷1期 169-177页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8+T细胞相关的生物标志物并建立预后模型.方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组...
- 概要：
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【中文期刊】 胡非凡 占强 等 《南京医科大学学报（自然科学版）》 2025年45卷2期 285-290页ISTICPKUCA
【摘要】 胃癌发病和肿瘤微环境重编程密切相关,但肿瘤微环境的复杂性与异质性限制了胃癌的个体化精准诊疗.单细胞转录组测序技术从探讨肿瘤微环境重编程过程出发,可在单细胞水平"描绘"胃癌中肿瘤微环境的"景观",深入探索肿瘤微环境各细胞亚型间的相互作用,揭示...
- 概要：
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【中文期刊】 戈琼 胡佳康 等 《中国全科医学》 2025年28卷12期 1473-1478,1493页ISTICPKUCA
【摘要】 背景 近年来,转录组测序技术(RNA-seq)在肝癌领域的大量应用为肝癌的基因组学和生物学研究提供了帮助,对近二十年RNA-seq应用于肝癌研究的文献进行总结分析,有助于研究者全面了解该领域的研究热点与最新进展,为后续研究提供参考.目的 通...
- 概要：
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【中文期刊】 石红雨 张国良 等 《中国防痨杂志》 2025年47卷3期 362-368页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 结核病是结核分枝杆菌感染引起的全球死亡率最高的传染病之一,严重威胁公共卫生.目前,对于结核分枝杆菌感染宿主后引起的细胞免疫应答机制还不是很清晰.单细胞转录组测序技术能在单个细胞的分辨率上揭示病理过程中的细胞异质性,可以帮助研究人员更好地理解...
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【中文期刊】 杨迎 陈邵旻 等 《中国糖尿病杂志》 2025年33卷7期 506-511页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨腺苷三磷酸结合转运蛋白C4(ABCC4)在T2DM合并大血管病变(MD)中表达和调控的作用.方法 选取 2015 年 3 月至 2017 年 3 月武汉大学中南医院就诊的T2DM患者137 例,根据有无MD分为单纯T2DM组(n=...
【关键词】 糖尿病,2型；大血管病变；腺苷三磷酸结合转运蛋白C4；
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【中文期刊】 白一鹏 徐登球 等 《安徽医科大学学报》 2025年60卷5期 869-876页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探究线粒体Lon蛋白酶1(LONP1)在肝细胞癌(HCC)中的表达水平及其对HCC发生发展的影响.方法 利用实时定量PCR(qPCR)和免疫印迹实验检测人体肝癌组织中LONP1表达情况.构建LONP1稳定敲降Hep3B和HCCLM3细...
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【中文期刊】 孙熠伟 徐淑坦 《基因组学与应用生物学》 2025年44卷6期 561-577页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)在揭示细胞异质性方面具有重要意义,但现有细胞类型注释方法存在着跨物种适应性、泛化性、类别不平衡等问题.本文提出了一种基于图注意力网络(graph a...
【关键词】 图注意力网络(GAT)；单细胞转录组测序(scRNA-seq)；细胞类型注释；
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【中文期刊】 田岳凤 熊罗节 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 978-988页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:免疫抑制会导致机体免疫功能受损,加重病情.隔药饼灸能有效调节机体免疫功能,提高机体免疫力,但其调节机制目前仍不清楚.目的:基于转录组学的生物信息学技术对隔药饼灸干预的免疫抑制模型大鼠进行测序,探究隔药饼灸调控免疫的机制.方法:将24只...
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【中文期刊】 李明娇 唐成林 等 《重庆医科大学学报》 2025年50卷3期 311-321页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:本研究旨在建立脊髓损伤小鼠模型探讨电针(electroacupuncture,EA)干预小鼠急性脊髓损伤(spinal cord in-jury,SCI)后细胞凋亡的作用和机制.方法:采用雌性C 57 BL/6小鼠进行SCI造模,造模...
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【中文期刊】 高芳琳 阮海涛 等 《中华医院感染学杂志》 2025年35卷12期 1765-1769页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究大蒜素对耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)体外抑制作用机制.方法 采用标准微量肉汤稀释法,确定大蒜素对实验使用CRKP的最低抑菌浓度(MIC).绘制生长曲线,验证大蒜素浓度与抑菌作用的关系.对大蒜素处理的CRKP和正常对照组进行...
【关键词】 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌；大蒜素；转录组测序；
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【中文期刊】 杨童焜 彭红梅 等 《陆军军医大学学报》 2025年47卷6期 571-580页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨人工周期条件下宫颈脱落细胞基因表达特征与子宫内膜容受性的潜在关联,以筛选与子宫内膜容受期相关的特异性生物标志物.方法 2024年2-10月在解放军总医院第一医学中心生殖中心就诊的准备进行冻融胚胎移植(frozen embryo t...
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【中文期刊】 陈子贤 周家伟 等 《南方医科大学学报》 2025年45卷8期 1643-1653页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 鉴定前列腺癌(PCa)患者免疫抑制性中性粒细胞亚群并构建基于中性粒细胞亚群相关的免疫预后风险模型.方法 从基因表达综合数据库及癌症基因组图谱数据库收集PCa患者单细胞、转录组数据,通过无监督聚类鉴定前列腺癌中性粒细胞亚群,通过功能富集...
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【中文期刊】 刘兆峰 杨学军 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4351-4360页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:椎间盘退变是下腰痛最常见的原因,然而其发病机制尚不完全清楚,因此探索预防和治疗椎间盘退变的新策略势在必行.单细胞转录组测序技术可以在单个细胞水平对mRNA进行高通量测序,揭示细胞的异质性和特定亚群,深入了解椎间盘退变发生发展的调控机制...
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【中文期刊】 德吉 索朗达 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷7期 1429-1436页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:藏西北绒山羊子宫内膜容受性是胚胎植入的关键因素,目前对于藏西北绒山羊子宫内膜容受性相关基因表达及可变剪接的认识还未明确.目的:分析并挖掘藏西北绒山羊子宫内膜容受性相关的基因和可变剪接事件.方法:在妊娠第5天和第15天(分别代表容受前子...
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【中文期刊】 徐淑雅 武晓丽 等 《昆虫学报》 2025年68卷4期 375-385页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]探究乳杆菌Lactobacillus对家蚕Bombyx mori抗菌肽基因转录水平的影响.[方法]用 2 × 108 CFU/mL 植物乳杆菌 Lactobacillus plantarum FLPL028、鼠李糖乳杆菌 L.rha...
- 概要：
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【中文期刊】 孙澳 孙佳辰 等 《中国皮肤性病学杂志》 2025年39卷7期 757-767页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究大黄素脂质体(LE)对咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠的治疗作用及其调节T细胞亚群的机制.方法 采用咪喹莫特(IMQ)诱导银屑病样小鼠模型,将BALB/c小鼠随机分为4组(凡士林组、IMQ模型组、IMQ+空脂质体组、IMQ+LE组),造...
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【中文期刊】 徐丽 陈秀娇 等 《中国药理学通报》 2025年41卷1期 163-170页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 全转录组测序检测神经胶质瘤细胞非编码RNA(ncRNA)表达谱并构建ceRNA网络,揭示ncRNA参与褪黑素抑制神经胶质瘤细胞增殖的分子机制.方法 0、2、4、6、8 mmol·L-1褪黑素干预神经胶质瘤细胞24、48、72 h,CC...
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【中文期刊】 阮珍 寇久社 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3767-3774页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:医用臭氧局部注射作为一种新的治疗方法,对损伤的骨骼肌组织具有抗炎、镇痛及免疫调节等作用,但其作用机制尚缺乏系统的研究.目的:观察医用臭氧对兔骨骼肌挤压伤模型的干预效应,通过转录组测序与标记定量蛋白技术分析损伤的兔胫骨前肌在经过臭氧治疗...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 寇若彬 刘丹 等 《动物学杂志》 2025年60卷1期 69-79页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用单细胞转录组测序技术在细胞水平探究花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)肾、肝和脾三种造血器官中的细胞组成类型,系统描绘花斑裸鲤这三种造血器官的细胞图谱,为进一步研究花斑裸鲤造血系统发育,尤其是红细胞发育积累科学数据.研究方...
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【中文期刊】 李林颖 蔡晓东 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2025年45卷4期 387-403页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·利用人胚胎干细胞(human embryonic stem cell,hESC)体外分化模型和高通量多组学测序技术研究hESC分化成神经前体细胞(neural progenitor cell,NPC)过程中转录组和染色质可及性的变化情...
- 概要：
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【中文期刊】 崔家康 朱泽林 等 《天然产物研究与开发》 2025年37卷5期 957-964页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究探索了雷公藤甲素(triptolide,TP)治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的分子机制,并揭示了其治疗作用与毒副作用的辨证统一性.通过转录组测序(transcriptome sequencing,R...
- 概要：
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【中文期刊】 王培耿 叶冬平 《中国组织工程研究》 2025年29卷13期 2822-2831页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:近年来,单细胞转录组测序技术在脊髓损伤的研究为创伤后中枢神经系统的细胞和分子异质性以及结构变化提供了新的见解.目的:就单细胞转录组测序技术在脊髓损伤的研究进展进行综述,更加全面、深入地阐述单细胞转录组测序技术在脊髓损伤领域的应用.方法...
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【中文期刊】 罗琴琴 雷锦志 《生物信息学》 2025年23卷1期 1-27页ISTIC
【摘要】 近年来,高通量单细胞测序技术为生物学研究带来了深刻的新发现,单细胞 RNA 测序技术的快速发展使得人们能够以单个细胞的分辨率定量研究细胞全基因组的转录水平.如何从高维的单细胞 RNA 测序数据中获取关于细胞和基因组的有用信息,是单细胞 RN...
【关键词】 单细胞转录组测序数据；数据预处理；聚类分析；
- 概要：
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【中文期刊】 蔡玉莹 马佳艺 等 《肿瘤预防与治疗》 2025年38卷6期 457-463页ISTIC
【摘要】 目的:探讨全反式维甲酸(all-trans retinoic acid,ATRA)对乳腺上皮细胞系HBL-100基因表达的影响,以揭示ATRA在乳腺生理和病理过程中的潜在作用机制.方法:采用RNA-seq技术分析ATRA处理前后HBL-10...
- 概要：
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【中文期刊】 章景 李永宁 等 《成都中医药大学学报》 2025年48卷1期 20-27页ISTIC
【摘要】 目的:基于附子栽培基地中出现的须根成结现象,探究其形成的分子机制.方法:本研究针对附子须根成结现象,利用高通量测序技术对附子、须根及根结转录组进行分析,探究附子须根成结的分子机制.结果:本研究共获得119.15 Gb Clean Data,...
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【中文期刊】 周世繁 张书铭 等 《广西医科大学学报》 2025年42卷3期 342-350页ISTICCA
【摘要】 目的:研究hsa-miR-146b-3p对内皮细胞的影响及其在动脉粥样硬化中的潜在作用和机制.方法:通过慢病毒构建EA.hy926内皮细胞干预模型,将细胞分为4组,(1)过表达组:OE_hsa-miR-146b-3p组和OE_control...
【关键词】 hsa-miR-146b-3p；冠心病；转录组测序；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 杨丽 杨静 等 《中国性科学》 2025年34卷1期 72-76页ISTIC
【摘要】 目的 分析不明原因复发性流产(URSA)患者绒毛组织的可变剪接(AS)位点,探讨枢纽基因与免疫浸润细胞的关系.方法 收集2022年3月新疆医科大学第一附属医院收治的4例URSA患者(URSA组)和4例选择性终止妊娠(ETP)孕妇(ETP组)...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵洪辉 张子玉 等 《兰州大学学报（医学版）》 2025年51卷6期 79-86,94页ISTIC
【摘要】 单细胞RNA测序在癌症研究中发挥重要作用,尤其在揭示肿瘤异质性、研究肿瘤免疫微环境和探索肿瘤治疗新靶点等方面展现出显著优势.单细胞RNA测序能够在单个细胞层面精准分析基因表达及突变特征,揭示肿瘤内部的分子多样性.此外,空间转录组学结合基因表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王潇凡 张墨涵 等 《中国中医药信息杂志》 2025年32卷5期 74-82页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 基于全转录组学研究冷冻消融联合养肺方对Lewis肺癌荷瘤小鼠的疗效及作用机制.方法 采用超高效液相色谱-质谱联用技术对养肺方主要活成分进行鉴定.将30只SPF级C57BL/6小鼠建立Lewis肺癌模型后,按随机数字表法分为模型组、冷冻...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 宁家昕 罗书航 等 《中华男科学杂志》 2025年31卷5期 403-411页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 目的:利用单细胞转录组和孟德尔随机化,从多组学角度研究脂质代谢相关基因固醇载体蛋白2(SCP2)与前列腺癌(PCa)之间的关系.方法:从GSE120716、GSE157703和GSE141445数据集分别获得良恶性前列腺组织的单细胞转录组数...
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【中文期刊】 李春雨 何思宇 等 《同济大学学报（医学版）》 2025年46卷2期 174-184页ISTIC
【摘要】 目的 通过心脏免疫细胞的单细胞转录组测序(single cell RNA-sequencing,scRNA-seq)和批量转录组测序(bulk RNA-sequencing,RNA-seq)数据联合分析,探究不同类型心肌病的细胞异质性和免疫...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高琳 吴智春 《山东中医药大学学报》 2025年49卷1期 135-139页ISTIC
【摘要】 单细胞转录组测序(scRNA-seq)可获取单个细胞水平的转录组信息,为中医药研究提供了新的视角.综述了单细胞转录组在中药单体和方剂作用机制、中医外治作用原理、中药质量控制及中医证候研究中的应用,这些研究不仅为理解中医治疗作用的整体效应和作...
- 概要：
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【中文期刊】 吕笑地 魏颖 等 《老年医学与保健》 2025年31卷2期 454-459页ISTICCA
【摘要】 目的 哮喘作为全球性重大公共卫生问题,其防治策略亟待优化.老年哮喘患者因多病共存导致临床管理难度显著增加,而现有药物疗法的不良反应问题促使研究者积极探索新型治疗靶点与干预模式.基于针刺疗法在老年哮喘临床实践中展现的疗效优势,本研究拟通过单细...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 钟艺 冯悦 等 《实用老年医学》 2025年39卷8期 857-861页ISTICCA
【摘要】 AD是老年病人常见的神经退行性疾病之一,其特征是病人认知能力逐渐下降和病变神经元的累积.随着人口老龄化进程加剧,AD的发病率逐年升高,深入探讨其发病机制有助于发现潜在预测与治疗靶点.单细胞转录组测序(single-cell RNA sequ...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 耿逸凡 孔健达 等 《食品与药品》 2025年27卷3期 204-212页ISTICCA
【摘要】 目的 探究人脐带间充质干细胞(hUC-MSC)对帕金森病(PD)模型中少突胶质细胞(oligodendrocyte,OL)谱系的调控作用.方法 构建1-甲基-4苯基-1,2,3,6四氢吡啶(MPTP)诱导的PD小鼠模型,经尾静脉多次注射hU...
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- 方法：
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【中文期刊】 孟秋月 袁一帆 等 《医学新知》 2025年35卷3期 289-302,前插3-前插7页ISTICCA
【摘要】 目的 探究中性粒细胞胞外陷阱(neutrophil extracellular traps,NETs)在溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)中的作用机制.方法 从GEO数据库下载UC患者和正常对照的RNA数据,筛选差异...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郝成飞 陈国杉 等 《天津医药》 2025年53卷1期 108-112页MEDLINEISTICCA
【摘要】 在肿瘤微环境中,肿瘤相关巨噬细胞通过高度可塑性构建复杂交互网络,促进癌症生态系统动态演变.随着单细胞测序技术的革新,肿瘤相关巨噬细胞的异质性、功能多样性及其与肿瘤微环境的相互作用机制得以揭示.这预示着肿瘤相关巨噬细胞或成为肿瘤靶向治疗新靶标...
- 概要：
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【中文期刊】 姜洁 任真奎 等 《贵州医药》 2025年49卷2期 171-176页ISTICCA
【摘要】 目的 RNA-seq转录组测序分析青少年重度抑郁症(major depression disease,MDD)患者外周血差异表达的lncRNA、miRNA、mRNA,为阐明青少年MDD发病机制提供理论补充.方法 随机收集样本库4例青少年女性...
【关键词】 青少年MDD；RNA-seq转录组测序；LncRNA；
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【中文期刊】 贾纯琰 孙燕勇 等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷7期 3165-3177页
【摘要】 [目的]分析转录后水平绒山羊皮肤中被外源褪黑素诱导参与调控绒生长发生可变剪接(alternative splicing,AS)的mRNA和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),为探究AS调节对褪黑素促山羊...
- 概要：
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【中文期刊】 沈阳阳 安振江 等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷2期 522-533页
【摘要】 [目的]探究徐州牛不同嫩度背最长肌间的基因表达差异,挖掘相关调控基因和信号通路,为进一步研究徐州牛肌肉生长调控的作用机制提供理论依据.[方法]本研究以江苏地方特色牛种——徐州牛为研究对象,屠宰后对背最长肌进行剪切力测定,依据剪切力值大小分为...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 冯倩 《医学信息》 2025年38卷10期 31-36页
【摘要】 目的 采用网络药理学和单细胞转录组生物信息挖掘思路,探讨桑白皮-紫苏子药对治疗慢性阻塞性肺疾病的潜在机制.方法 检索基因表达综合数据库获取慢性阻塞性肺疾病患者肺组织的单细胞转录组芯片GSE173896数据集,鉴定样本的细胞类型并提取不同类型...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 张陈 詹为易 等 《医学信息》 2025年38卷4期 1-9页
【摘要】 目的 探讨cpsG基因对神经胶质瘤细胞U87MG转录组学影响.方法 将慢病毒rLV-cpsG感染人胶质瘤细胞U87MG,筛选稳定细胞系.提取细胞总RNA,进行高通量RNA测序分析.包括差异基因分析、GO分析、KEGG分析、Reactome分...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 余昕雅 何海健 等 《畜牧兽医学报》 2025年56卷3期 1366-1375页
【摘要】 长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200 bp且缺乏蛋白质编码能力的RNA,已有研究表明lncRNA在病毒复制过程中具有重要的生物学作用.本研究分析了猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染细胞的lncRNA表达变化及其对PEDV复制的...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 邵丹 瞿源 等 《动物营养学报》 2025年37卷2期 1221-1233页
【摘要】 本研究通过比较高、低质量蛋壳力学特性、超微结构和蛋鸡的子宫组织形态、基因表达差异,挖掘调控产蛋后期蛋壳质量的重要候选基因和信号通路.选用80周龄海兰褐蛋鸡12只,6只产鸡蛋蛋壳质量相对好[蛋壳强度为(3.54±0.11)kg/cm2,蛋壳厚...
- 概要：
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【中文期刊】 张凯歌 杨倩 《空军军医大学学报》 2025年46卷2期 214-221页
【摘要】 目的 通过分析公共数据库测序数据,探究肝脏组织中节律基因在卡路里限制(CR)延缓衰老中的作用.方法 从GEO数据库中下载来自小鼠肝脏组织4月龄年轻组、24月龄衰老组和24月龄CR衰老组样本的转录组测序(RNA-seq)和染色质可及性测序(A...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 任灏 朱怡轩 等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷6期 2494-2505页
【摘要】 [目的]筛选快、慢生长速度撒坝猪背最长肌组织中的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),并探讨其在猪生长发育过程中的重要作用.[方法]选择322日龄体重最大和最小的撒坝猪各6头(公、母各3头),分为快长组(...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李志毅 李洁 等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷4期 1681-1693页
【摘要】 [目的]探索藏鸡胚胎期与骨骼肌生长发育相关的微小RNA(miRNA),对其进行差异表达分析并构建miRNA-mRNA调控网络,为进一步了解miRNA在鸡肌肉生长发育过程中的调控机制提供理论基础.[方法]采集藏鸡胚胎期第10(E10)、14(...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 黄佳佳 王楚雯 等 《中国病理生理杂志》 2024年40卷5期 950-955页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 Pulmonary infection by pathogenic microorganisms is a common disease of the respiratory system with high mortality and p...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 赵雅洁 李国庆 等 《水生生物学报》 2024年48卷1期 176-184页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了筛选与中华拟同形溞(Daphnia sinensis)生殖相关的基因,选择4个生长阶段的中华拟同形溞(雌性幼溞JF、成熟前1龄雌溞BM、第1成龄雌溞MA和第4成龄雌溞RF)进行转录组测序.在BM vs.JF、MAvs.JF、RFvs.J...
- 概要：
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