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【中文期刊】 郭瑞铭 邱伟 等 《中华口腔医学研究杂志(电子版)》 2025年19卷2期 75-83页ISTICCA
【摘要】 单细胞RNA 测序(scRNA-seq)技术是一种能够在单细胞分辨率下解析基因表达的强大工具,近年来在牙周炎研究中广泛应用,推动了对牙周组织中细胞异质性和病理进展机制的认识。本文回顾了scRNA-seq技术的发展历程,从早期尝试到成熟与多样...
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【中文期刊】 石继开 王平 等 《中华老年病研究电子杂志》 2025年12卷1期 22-29页
【摘要】 目的分析胆固醇代谢相关基因在前列腺癌中的表达变化,并构建前列腺癌复发风险预测模型。方法从癌症基因组图谱数据库中获取前列腺癌病例样本的RNA测序数据及临床数据,从分子特征数据库中检索胆固醇代谢相关基因。通过差异表达分析和加权基因共表达网络分析...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 张改君 苗静 等 《中草药》 2021年52卷10期 3112-3120页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 组学技术的运用主要基于高通量分析检测技术,包括转录组学、蛋白质组学和代谢组学等.生物信息学的飞速发展,为探索中药治疗疾病的机制提供新的思路和方法.在过去的数十年间,组学技术广泛应用于中药作用机制的研究当中.中药具有多成分、多靶点的特点,单一...
- 概要:
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【中文期刊】 林思然 许毓贞 等 《中华传染病杂志》 2020年38卷2期 94-98页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:分析轻症和重症甲型H1N1流行性感冒(以下简称流感)患者外周血转录组的差异,评估影响患者疾病严重程度的指标。方法:纳入2018年1月至5月上海复旦大学附属华山医院确诊的10例甲型H1N1流感患者(轻症组与重症组各5例),以健康人群(5...
【关键词】 流感病毒甲型,H1N1;基质金属蛋白酶8;基质金属蛋白酶9;
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 刘一帆 沈吟 《中华实验眼科杂志》 2020年38卷8期 704-709页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组测序(scRNA-seq)是一种在细胞水平观测单个细胞之间转录组差异的新兴技术,其基本策略是捕获单细胞,经裂解得到微量mRNA,逆转录后扩增,cDNA用于制备测序文库。目前该技术已被广泛应用于多个学科领域。视觉神经系统在结构上包...
- 概要:
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【中文期刊】 覃福礼 赵亮 等 《中草药》 2020年51卷4期 1003-1015页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用二代测序技术筛选出具有显著性变化的基因,并探讨月腺大戟素A在转录组学层面上抗乳腺癌活性的作用机制.方法 从月腺大戟药材中提取乙酰间苯三酚类化合物月腺大戟素A,对MCF-7细胞(乳腺癌细胞的luminalA型)进行干扰,观察被干扰后...
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【中文期刊】 杜继聪 刘入菱 等 《中华放射医学与防护杂志》 2020年40卷8期 582-589页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:筛选Toll样受体2(Toll-like receptor 2, TLR2)通路下游与辐射防护调控相关的关键miRNA,并探讨miR-21功能。方法:以 60Co γ射线对野生型(wild type, WT)、TLR2 KO...
- 概要:
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【中文期刊】 崔凯 吴伟伟 等 《生物技术通报》 2019年35卷7期 1-9页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 转录组(Transcriptome)是指特定细胞或组织中全部转录产物,包括信使RNA,核糖体RNA、转运RNA以及非编码RNA.高通量测序技术的快速发展,为从整体水平系统地研究转录组学研究提供快捷可靠的平台.综述了当前主流的高通量测序技术及...
- 概要:
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【中文期刊】 黄广勇 相有章 等 《中华地方病学杂志》 2019年38卷5期 361-367页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 构建克山病、扩张型心肌病患者外周血血浆的lncRNA/mRNA差异性表达谱,探讨两种疾病在分子机制方面的共性及特性.方法 在山东省克山病重病区抽取10例慢型克山病患者,同时在山东省非克山病地区选取10例扩张型心肌病患者及10例健康者(...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 刘晴 董燕玲 等 《中华实验眼科杂志》 2019年37卷9期 701-706页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析致角膜溃疡的金黄色葡萄球菌和正常人结膜囊分离的金黄色葡萄球菌的差异表达基因,探讨金黄色葡萄球菌性角膜溃疡可能的发病机制.方法 收集2018年1—8月在青岛眼科医院检验科分离培养的10株金黄色葡萄球菌,其中5株来自经培养证实的细菌性...
【关键词】 金黄色葡萄球菌/基因;角膜炎/微生物学;结膜囊;
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【中文期刊】 谢青 房延兵 等 《中国生物制品学杂志》 2021年34卷1期 48-53页ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 筛选甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)显著差异表达的microRNA(miRNA),分析其与PTC 发病机制的相关性.方法 选取确诊的PTC 癌组织及癌旁正常组织样本各6 份,提取总RNA...
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【中文期刊】 黄亚辉 匡卫平 等 《国际神经病学神经外科学杂志》 2021年48卷3期 249-255页ISTIC
【摘要】 目的 探究癫痫的转录组学特征,寻找癫痫诊治的潜在靶点.方法 选取雄性幼龄SD大鼠17只,采用抽签法随机将大鼠分为2组:对照组(8只)、CSRS组(9只).基于氯化锂-匹罗卡品构建的慢性自发性癫痫(CSRS)大鼠模型,取CSRS大鼠及对照组大...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 王津晗 路倩颖 等 《中华放射医学与防护杂志》 2018年38卷2期 81-86页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨致死剂量的电离辐射对小鼠空肠组织转录组动态变化.方法 小鼠经14 Gy137Cs γ射线腹部照射后,分别于6h,3.5和5d提取各组小鼠空肠总RNA进行转录组测序.表达变化倍数在2倍以上即视为显著差异,对表达差异的基因进行IPA、...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 刘玉 成飞 等 《中华肝脏病杂志》 2017年25卷4期 285-290页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 用二代转录组测序(RNA-seq)技术,结合差异基因GO分析、KEGG富集分析,探讨细胞色素(CY) P450在高脂饮食诱导的小鼠非酒精性脂肪性肝(NAFLD)中的作用. 方法 高脂饲料(D12492,60%脂肪热量)喂养C57BL/...
- 概要:
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【中文期刊】 容丹 王佳平 等 《微生物学通报》 2017年44卷5期 1038-1046页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]通过低剪切力模拟失重(Low-shear modeled microgravity,LSMMG)连续传代培养大肠杆菌,检测大肠杆菌在模拟失重条件下的表型变化及基因改变.[方法]利用旋转细胞培养系统模拟失重环境对大肠杆菌K12进行连续...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 王磊 程飞跃 等 《微生物学报》 2017年57卷2期 220-228页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]通过转录组高通量测序技术(即RNA-seq),结合生物信息学分析和分子生物学方法,在组学水平鉴定极端嗜盐菌中可能的非编码RNA (ncRNA).[方法]将培养至对数中期的地中海富盐菌在不同盐浓度下处理30分钟,提取RNA,进行链特异...
- 概要:
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- 结论:

【中文期刊】 邓飞龙 贾先波 等 《生物工程学报》 2015年31卷9期 1271-1278页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 转录本组装是基于第二代测序技术研究转录组的关键环节,其质量好坏直接影响到下游结果的可靠性,也是目前的研究热点与难点.转录本组装方法可以分为Genome-guided和de novo两类,它们在理论基础与算法实现方面各有优劣.转录本组装质量的...
- 概要:
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【中文期刊】 刘美兰 谭晓风 等 《植物遗传资源学报》 2014年15卷5期 1053-1059页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 油桐是我国四大木本油料植物之一,当前对油桐的研究主要集中在栽培选优及低产林改造方面,而对油桐脂肪酸延长代谢的分子机理研究尚未见报道.本研究以油桐果实膨大期、油脂转化初期和油脂转化高峰期的种子为材料,采用高通量RNA测序技术对油桐种子脂肪酸延...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 肖薪龙 张选 等 《生物工程学报》 2014年30卷11期 1763-1773页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 RNA-seq技术能够全面快速地获得物种在某一状态下的转录本序列信息,但测序并组装后的大量Unigene往往不包含完整ORF (Open reading frame).转录组库具有一定的冗余性,存在着属于同一个转录本的Unigene,这些U...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 王劲松 李春晓 等 《中国综合临床》 2020年36卷3期 217-222页ISTIC
【摘要】 目的:构建长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)表达特征的乳腺癌患者预后的预测模型。方法:分析癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库1 081例乳腺癌患者的转录组测...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 张晓琳 陈籽荣 等 《中华实验外科杂志》 2020年37卷10期 1972-1975页ISTICCA
【摘要】 胶质瘤是最常见的原发性中枢神经系统恶性肿瘤,其肿瘤异质性显著,是影响临床治疗效果的关键因素之一。单细胞转录组测序技术由普通转录组测序技术发展而来,是对单个细胞的独立测序分析,因其能更好地保留细胞间的异质性信息,近几年得到广泛应用。在单细胞水...
- 概要:
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【中文期刊】 杨晓燕 张波 等 《生物技术通报》 2013年6期 215-220页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 RNA试剂盒法是获取植物高质量RNA样品的常用技术,针对3种常见RNA提取试剂盒在红地球葡萄叶样品RNA提取效果进行评估和优化,以期找到适合红地球葡萄叶片RNA表达谱测序需求的高质量RNA提取策略.试验依据3种试剂盒推荐时间和条件进行RNA...
- 概要:
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【中文期刊】 刘金定 张赞 等 《应用昆虫学报》 2013年50卷5期 1458-1468页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 随着高通量RNA测序(RNA-Seq)技术的发展和测序成本迅速下降,RNA-Seq技术已经成为生物学研究的重要工具,为生物学家全面地了解和研究转录组提供了机遇.高通量测序具有读长短、存在一定比例的测序错误、数据量大等特点,因此RNA-Seq...
- 概要:
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【中文期刊】 李嘉嘉 陈振 等 《中华实验和临床病毒学杂志》 2018年32卷4期 403-406页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 目的 分离、纯化、培养和永生化小鼠脾脏原代网状成纤维细胞(fibroblastic reticular cells,FRCs),筛选和鉴定永生化的FRCs克隆,证明永生化FRCs可用于SFTS病毒(SFTSV)体外感染研究.方法 使用磁珠和...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 李欢 杨新杰 等 《中国口腔颌面外科杂志》 2018年16卷2期 114-119页ISTICCA
【摘要】 目的:应用RNA-Seq技术分析与施万细胞共培养前、后的唾液腺腺样囊性癌细胞(SACC)的基因表达水平变化,明确嗜神经侵袭(perineural invasion,PNI)相关基因.方法:采用腺样囊性癌与SD大鼠施万细胞共培养模型,分析共培...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 张立美 战军 等 《解剖学报》 2015年46卷5期 634-640页ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 探究转录因子HOXA5在乳腺癌进展中的作用.方法 构建过表达HOXA5的稳定转染BT549和SUM159细胞系,在稳转BT549细胞系中利用Transwell检测细胞的转移能力;Western blotting检测上皮-间质转化(EM...
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【中文期刊】 李景岗 王少元 等 《国际遗传学杂志》 2014年37卷3期 124-128,147页ISTICCA
【摘要】 转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的集合.转录组研究能够从整体水平研究基因结构以及基因功能,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机制.全转录组测序技术(RNA-Seq)利用第二代高通量测序技术对组织或...
【关键词】 转录组测序(RNA-Seq);白血病;淋巴瘤;
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【学位论文】 作者:高汝健 导师:高宇飞 吉林大学 临床医学 外科学(硕士) 2015年
【摘要】 目的:肺癌是我国比较常见的恶性肿瘤之一,局部复发和远道转移是肺癌患者预后不良的最严重原因,脑部是肺癌远道转移较为常见的部位之一,约占各种恶性肿瘤的45%~65%.恶性肿瘤在发生转移的过程中,出现了基因突变谱的改变.因此对原发肿瘤以及转移病灶...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:杨志强 导师:于录 吉林大学 兽医 兽医(专业学位)(硕士) 2015年
【摘要】 结核病是世界上最严重的致死性传染性疾病之一.结核分枝杆菌作为引起人类结核病的病原微生物,从新石器时代伴随人类至今,直到目前仍然导致每年约900万人发病以及接近150万患者死亡.由于结核分枝杆菌有很强的抗药性和逃避机体免疫的能力,结核病的感染...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【会议论文】陈建欢 遗传学与表观遗传学前沿暨第三届中国青年遗传学家论坛 2014年
【摘要】 目的:激光诱导脉络膜新生血管(CNV)的小鼠模型是研究年龄相关性黄斑变性的重要工具之一,但该模型中视网膜的早期分子改变尚未明确.我们用RNA测序(RNA-seq)的方法对研究了该CNV模型小鼠中视网膜的转录组及表观遗传学改变.方法:对三只成...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:吴松青 导师:邹双全 关雄 福建农林大学 生物学 微生物学(博士) 2014年
【摘要】 蚊虫是多种重要传染病的传播媒介,全球每年有上百万人因感染蚊媒病而死亡.由于目前尚无疫苗和有效的预防药物来防治登革热,因此,须通过控制媒介蚊虫的数量以阻断蚊媒病的爆发流行.苏云金杆菌以色列亚种(Bacillus thuringiensis s...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:陈梅丽 导师:于军 吴佳妍 中国科学院北京基因组研究所 生物学 生物信息学(博士) 2013年
【摘要】 基因表达调控是促使细胞分化和器官形成,最终在多细胞生物中产生不同细胞类型的关键,是真核生物各种细胞或组织行使不同功能所必需的.通过转录组数据分析可以在转录水平上研究基因表达调控.RNA-Sequencing (RNA-Seq)是当前非常有效...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【会议论文】秦婷婷 2012年浙江省检验医学学术年会 2012年
【摘要】 目的探讨前列腺癌雄激素非依赖性转化过程中差异甲基化基因.方法采用全基因组DNA甲基化芯片(Human Methylation27 Beadchip)杂交技术以及转录组RNA测序技术,检测并筛选出前列腺癌细胞雄激素非依赖性转化过程中的差异甲基...
【关键词】 雄激素非依赖性前列腺癌 ; 甲基化芯片 ; 转录组RNA测序 ;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 朱容慧 李巍 《中华皮肤科杂志》 2019年52卷7期 506-509页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞RNA测序是指在单细胞水平上对转录组进行测序的方法,是目前生物学研究领域的一项热点技术.与普通高通量RNA测序相比,单细胞RNA测序可以分辨单个细胞间的生物学差异,识别出易被忽视的罕见细胞群体和细胞亚群.本文主要介绍单细胞RNA测序的...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 唐贤 丁祥 等 《生物技术通报》 2019年35卷10期 119-129页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 旨为研究棒瑚菌子实体幼菇期(CP-1)和成熟期(CP-2)基因表达的差异,探索棒瑚菌在生长发育过程中的关键基因和关键代谢通路.采用RNA-Seq测序技术对棒瑚菌子实体进行测序并进行生物信息学分析.测序结果显示,共获得8.78 G(CP-1)...
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 王得运 罗光明 等 《生物技术通报》 2019年35卷7期 156-161页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 转录组测序技术,能够从mRNA水平研究物种基因功能以及特定的生理学过程,采用该项技术可研究植物在淹涝胁迫下所有的基因表达水平情况,有利于揭示植物对淹涝的应答机理.综述了采用转录组测序技术揭示的淹涝胁迫下植物体内信号传导、内源激素、光合作用、...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 蒋可人 马峥 等 《生物技术通报》 2018年34卷12期 50-55页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 在一个有机生物体中,基因表达的主要环节包括转录和蛋白质合成,mRNA是基因表达的中间体,蛋白质是基因功能的执行体.要了解具体的基因表达调控过程,需要对mRNA和蛋白进行同步监测,通过比较蛋白质组学和转录组学的数据,在转录水平和蛋白水平上整合...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 高元峰 李珊 等 《中国临床药理学与治疗学》 2018年23卷5期 586-591页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 随着全基因组和转录组测序技术的进步,越来越多的长链非编码RNA(lncRNAs)被发现.研究表明lncRNAs对胶质瘤的诊断、治疗和化疗预后具有重要意义.截至目前共有20多个异常表达的lncRNAs被证实与胶质瘤的发生发展密切相关.本文主要...
- 概要:
- 方法:
- 结论:

【中文期刊】 李和平 姚运法 等 《生物技术通报》 2018年34卷3期 121-127页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了研究黄秋葵果实转录组中功能基因的表达情况,采用RNA-Seq技术对3份黄秋葵果实进行测序分析.结果显示,3份测序材料组装后共获得了77 476个Unigene序列,有61 891个Unigene在4大数据库中得到注释,占79.88%;以...
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 张群 陈鹏程 等 《微生物学报》 2018年58卷7期 1255-1265页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]通过琥珀酸放线杆菌Actinobacillus succinogenes CGMCC1593对酸胁迫的生理应答和转录组学分析,探究琥珀酸放线杆菌酸胁迫的机制.[方法]测定不同pH对细胞生长、H+-ATPase、细胞内pH的影响;测定...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 李依民 胡本祥 等 《中草药》 2018年49卷21期 4967-4974页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 获得银线草Chloranthus japonicus根茎转录组信息特征.方法 用高通量测序平台Illumina HiSeqTM 2000150PE进行银线草根茎转录组测序分析.结果 转录组测序共获得68 458 750条高质量序列(c...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 刘文荣 丁若凡 等 《生物技术通报》 2017年33卷7期 210-215页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 旨在探索多肽9R-P201处理肝癌HepG2细胞后基因融合、单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)突变、可变剪接等事件,并分析差异表达基因所参与的生物学进程与信号通路,以期解析多肽9R-P20...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 白瑞璞 潘卫庆 《中国热带医学》 2017年17卷4期 344-349页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 筛选并验证日本血吸虫感染后,肝脏枯否细胞(Kupffer cells,KCs)内差异表达microRNAs(miRNAs)及基因.方法 实验小鼠随机分为对照组、感染日本血吸虫组.用密度梯度离心和流式分选相结合的方法,分离肝脏F4/80...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 严俊杰 张磊 等 《菌物学报》 2017年36卷5期 618-624页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 可变剪接是引起蛋白多样性的主要机制之一,而转录组reads的重新定位是获取可变剪接位点的有效方法,适合在基因组较小的真菌中应用.ZOOM软件是一款可在window系统下运行的reads可视化定位软件,被广泛用于下一代基因组测序(NGS)的r...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 曹萌 孙凤梅 等 《环境与职业医学》 2017年34卷7期 577-585页ISTICPKUCSCD
【摘要】 [目的]应用转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术,研究苯对小鼠骨髓细胞转录组表达和信号通路的影响,为苯对小鼠骨髓细胞毒性的可能作用机制提供科学线索.[方法]将C3H/He小鼠随机分为苯暴露组[160mg/(kg·d...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 张争 高志晖 等 《药学学报》 2012年47卷8期 1106-1110页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 国产沉香为瑞香科(Thymelaeaceae)植物白木香(Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg)含有树脂的木材.白木香树体只有在受到伤害等胁迫,才在伤口周围的木材内产生倍半萜等沉香类物质,但是伤害如何诱导沉香倍半萜...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 孙鹏 权继传 等 《国际遗传学杂志》 2019年41卷2期 136-142页ISTICCA
【摘要】 结直肠癌( colorectal cancer , CRC )是全球目前最常见的癌症类型之一,其发生发展的明确机制尚未完全了解.近年来随着全基因组和转录组测序技术的发展,长链非编码RNA ( long noncoding RNA , lnc...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 杜璐 王少军 等 《现代生物医学进展》 2018年18卷1期 155-159页ISTICCA
【摘要】 细胞的转录组决定其生理状态,每个细胞的转录组都是唯一的.借助单细胞转录组测序可分析单个干细胞的转录组特征,通过进一步的运算方法可以根据转录组特征对细胞进行细胞状态测定以及系谱分化特征的重建,在干细胞及组织发育研究中发挥了强大的作用,推动了其...
- 概要:
- 方法:
- 结论: