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【中文期刊】 《癌症（英文版）》 2011年30卷6期 363-367页 MEDLINEISTICCA

【摘要】 Cancer is a collection of complex diseases in which cell proliferation and apoptosis are dysregulated due to the acquisi...

【关键词】 Tumor genetics； whole genome profiling； pathway signature；

【中文期刊】 Qian Liu Chenglu Zhao  等 《分子植物（英文版）》 2023年3期 616-631页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 CRISPR/Cas genome-editing tools provide unprecedented opportunities for basic plant biology research and crop breeding.H...

【关键词】 genome editing； CRISPR-Cas； base editor；

【中文期刊】 Xu Zhang Haiyan Wang  等 《分子植物（英文版）》 2023年2期 432-451页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Dasypyrum villosum is one of the most valuable gene resources in wheat improvement,especially for dis-ease resistance.Th...

【关键词】 D.villosum genome； crop wild relative； genome evolution；

【中文期刊】 Xinyang Zhou Yehua Lv  等 《中国神经再生研究（英文版）》 2024年19卷8期 1812-1821页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Exosomes exhibit complex biological functions and mediate a variety of biological processes,such as promoting axonal reg...

【关键词】 ceRNA network； exosomes； fibroblast cells；

【中文期刊】 Weilin Tan Jun Ma  等 《中国神经再生研究（英文版）》 2024年19卷1期 171-179页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Recent studies have found that erythropoietin promotes the recovery of neurological function after traumatic brain injur...

【关键词】 axon guidance； bioinformatics analysis； competing endogenous RNA；

【中文期刊】 Yuewen JIANG Qihua PAN  等 《浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）》 2024年25卷12期 1083-1096,中插1-中插6页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated protein 9 (Cas9) system,belongi...

【关键词】 Staphylococcus aureus Cas9 (SaCas9)； Medaka； Transfer RNA (tRNA)；

【中文期刊】 《生物医学研究杂志（英文版）》 2010年24卷1期 33-42页 MEDLINECSCDCABP

【关键词】 small non-coding RNAs； small RNAs； Agrobacterium tumefaciens genome；

【中文期刊】 邹艳婷 胡丹心  等 《生态学报》 2024年44卷4期 1564-1574页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 条形码数据库是开展基于DNA的生物监测关键先决条件.为在珠江流域有效开展基于DNA的生物监测,迫切需要了解物种DNA条形码的覆盖或空缺状况.整理了珠江流域常见鱼类和大型底栖动物的物种清单,从National Center and Biote...

【关键词】 环境DNA； 线粒体组； COI；

【中文期刊】 徐晓鹏 范小英  《遗传》 2024年46卷10期 795-806页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTL)表示控制基因表达量的遗传变异位点.eQTL分析是后全基因组关联研究时代鉴定疾病相关遗传位点功能的重要方法,且取得了诸多重要发现.传统的eQTL...

【关键词】 表达数量性状位点； 全基因组关联研究； 单细胞转录组测序；

【中文期刊】 杨卓妍 张欣  等 《眼科新进展》 2024年44卷10期 790-795页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的 筛选自测的白内障差异表达基因与IMPC、MGI和Cat-Map、GWAS Catalog数据库中白内障相关基因,并进行生物信息学分析,从而探究白内障发病过程的潜在致病基因及信号通路.方法 收集白内障患者及对照透明晶状体前囊膜,提取总R...

【关键词】 白内障； IMPC数据库； MGI数据库；

【中文期刊】 谈鎏 叶邦策  等 《中国生物化学与分子生物学报》 2024年40卷8期 1078-1092页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 CRISPR/Cas是原核生物在进化过程中获得的一种免疫防御系统,用于抵抗外来遗传物质的入侵,近年来被开发成为高效的基因编辑、基因调控以及分子诊断工具.其可编程靶向机制揭开了利用该系统进行基因组操作的序幕,并允许在活性范围内实现动态调节和控...

【关键词】 CRISPR/Cas系统； gRNA工程化； 基因编辑；

【中文期刊】 吴昊 张文桃  等 《中国生物化学与分子生物学报》 2024年40卷7期 976-986页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 长非编码 RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)PART1 可作为竞争性内源 RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA),在多种肿瘤的发生发展中发挥关键作用,然而PART1在喉鳞癌(l...

【关键词】 喉鳞癌； PART1； TCGA数据库；

【中文期刊】 张丹丽 陈小艳  等 《昆虫学报》 2024年67卷10期 1416-1427页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]测定和分析半翅目(Hemiptera)异翅亚目(Heteroptera)榈蝽科(Thaumastocoridae)两种榈蝽Thaumastocoris peregrinus与Onymocoris hackeri的线粒体全基因组序列,...

【关键词】 半翅目； 榈蝽科； 线粒体基因组；

【中文期刊】 许一丹 谢成彬  等 《检验医学与临床》 2024年21卷9期 1224-1228,1234页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、16 S rRNA序列分析和全基因组测序(WGS)对从临床标本中分离的 1 株疑似盐单胞菌进行菌种鉴定,比较 3 种方法的鉴定结果.方法 采用MALDI-TOF MS对...

【关键词】 细菌鉴定； 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱； 16S rRNA序列；

【中文期刊】 蒿花 王馨笛  等 《中国循证心血管医学杂志》 2024年16卷2期 144-148页 ISTIC

【摘要】 随着21世纪分子生物学技术蓬勃发展,高通量测序技术识别了大量的癌症突变基因和分子标志物.面对庞大数量级基因的相互作用,各种非编码RNA及其复杂调控功能,使现代医学从分子角度揭示癌症潜在的作用方式和发生发展过程,难以准确阐述目标癌症的分子机制...

【关键词】 癌症； 国际癌症基因组联盟； 基因突变；

【中文期刊】 朱鑫杰 包德荣  等 《浙江临床医学》 2024年26卷1期 4-8页 ISTIC

【摘要】 目的 应用ATIRE建立预后模型预测LUAD患者的总生存期(OS),并根据ATIRE风险评分和临床病理特征构建预测LUAD患者OS的列线图.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载LUAD患者的RNA编辑数据、转录组数据及相应的临床资...

【关键词】 肺腺癌； 癌症基因组图谱； A-to-I RNA编辑；

【中文期刊】 朱鑫超 陆定其  等 《浙江中医药大学学报》 2024年48卷5期 530-540页 ISTIC

【摘要】 [目的]评价益气养阴祛瘀方治疗原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)的疗效,并通过全基因组甲基化测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术研究中医药疗效...

【关键词】 原发性干燥综合征； 益气养阴祛瘀方； 全基因组甲基化测序；

【中文期刊】 Jin-Ze Li Bao-You Fan  等 《中国神经再生研究（英文版）》 2023年18卷3期 626-633页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Ferroptosis plays a key role in aggravating the progression of spinal cord injury(SCI),but the specific mechanism remain...

【关键词】 bioinformatics； drug； ferroptosis；

【中文期刊】 Zhanmin Sun Sanjie Jiang  等 《植物学报（英文版）》 2023年65卷5期 1147-1152页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The roots of legume plant play a crucial role in nitrogen fixation.However,the transcriptomes of different cell types of...

【关键词】 genome； legume； Lotus japonicus；

【中文期刊】 刘娜 陈静  等 《新疆医学》 2024年54卷1期 24-29页

【摘要】 目的 探讨核糖核酸结合基序蛋白45(RNA-binding motif protein 45,RBM45)在肝癌中的表达及其临床应用价值.方法 应用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析RNA结...

【关键词】 癌症基因组图谱(TCGA)； 原发性肝癌； RBM45；

【中文期刊】 李继桐 朱彤  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷7期 3075-3084页

【摘要】 分离新型鸭源微RNA病毒进行全基因组测序并进行遗传进化分析.对本实验室2021年不同来源的种鸭和肉鸭病料进行PCR检测,初步确定存在一种未知分类的新型微RNA病毒感染.取病死鸭病料组织处理后接种SPF鸡胚分离病毒,设计引物对分离到的病毒进行...

【关键词】 新型微RNA病毒； 分离鉴定； 基因组测序；

【中文期刊】 方霞 孙江云  等 《赣南医学院学报》 2024年44卷1期 27-34页

【摘要】 目的:评估双硫死亡相关LncRNA在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)患者中作为预后指标的潜在价值.方法:从TCGA数据库中获取HCC的RNA-Seq和临床信息数据,从相关文献中获得10个双硫死亡相关基因,...

【关键词】 肝细胞癌； 癌症基因组图谱； 双硫死亡；

【中文期刊】 徐可欣 李国壮  等 《罕见病研究》 2024年3卷3期 295-303页

【摘要】 Ehlers-Danlos综合征(EDS)是一组罕见的遗传性结缔组织疾病,以关节过度活动、皮肤过度伸展和组织脆弱为主要特征.EDS的临床和遗传异质性较强,误诊、漏诊均较为常见,基因检测是明确诊断的重要方式.EDS部分亚型已有初步的基因型-表...

【关键词】 Ehlers-Danlos综合征； 临床遗传学； 基因型-表型关联；

【中文期刊】 张玉琳 王乐  等 《肿瘤基础与临床》 2024年37卷5期 533-539页

【摘要】 目的 探究头颈部鳞癌(HNSCC)中微小RNAs(miRNAs)表达情况与无复发生存期之间的相关性,并构建预后预测模型.方法 利用TCGA数据库获取头颈部鳞癌的miRNAs表达谱与临床信息,通过单因素和多因素COX分析筛选出与无复发生存期相...

【关键词】 头颈部鳞癌； 微小RNAs； 预后；

【中文期刊】 杨慧娟 陈婷  等 《生物学杂志》 2023年40卷4期 48-53,75页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为了解中气门亚目物种线粒体 16S rRNA基因全序列信息及系统发育关系,采用PCR方法对粪堆寄螨(Parasitus fimetorum)的线粒体基因组进行测序,并结合NCBI数据库中中气门亚目多数类群的序列信息.利用生物信息学软件对中气...

【关键词】 中气门亚目； DNA条形码； 线粒体基因组；

【中文期刊】 陈君 张宁  《中国临床药理学杂志》 2023年39卷24期 3656-3659页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 构建溶酶体相关基因的肝细胞癌预后预测模型并验证.方法 从癌基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库下载肝癌RNA-seq数据及临床数据.从Misdgb网站下载了 121个溶酶体相关基因.使用差异分析和单因素比例风险...

【关键词】 肝细胞癌； 溶酶体相关基因； 癌基因组图谱；

【中文期刊】 徐龙文 聂元华  等 《西安交通大学学报（医学版）》 2023年44卷5期 755-763页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 筛选和鉴定具有预测胃癌肿瘤突变负荷(TMB)分类的微小 RNA(microRNAs),从而为胃癌患者免疫治疗提供参考依据.方法 从TCGA数据库中下载胃癌肿瘤样本的 mRNA、microRNA 表达谱数据和体细胞突变数据.利用 R语言...

【关键词】 胃癌； 肿瘤突变负荷； 微小RNA；

【中文期刊】 Yushan Zheng Deming Yang  等 《植物学报（英文版）》 2022年64卷3期 649-670页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Dendrocalamus latiflorus Munro is a woody clumping bamboo with rapid shoot growth. Both genetic transformation and clust...

【关键词】 alternative splicing； bamboo shoots； chromosome conformation capture sequencing；

【中文期刊】 Wei Liu Jin-Cheng Tao  等 《中国神经再生研究（英文版）》 2022年17卷10期 2300-2304页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Long noncoding RNAs (lncRNAs) participate in a variety of biological processes and diseases. However, the expression and...

【关键词】 bioinformatic analysis； biological process； gene ontology analysis；

【中文期刊】 Khaista Rahman Muhammad Jamal  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年6期 1180-1196页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Mycobacterium tuberculosis is the causative agent of tuberculosis(TB),which is still the leading cause of mortality from...

【关键词】 Mycobacterium tuberculosis； Type Ⅲ-A CRISPR system； Gene editing；

【中文期刊】 Maurizio Junior Chiurazzi Anton Frisgaard N?rrevang  等 《植物学报（英文版）》 2022年64卷2期 205-214页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Breeding plants with polyploid genomes is challenging because functional redundancy hampers the identification of loss-o...

【关键词】 flowering time； genome-engineering； Medicago sativa；

【中文期刊】 张冉 逄瑷博  等 《标记免疫分析与临床》 2023年30卷8期 1402-1406页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨急性髓系白血病(AML)患者miR-363表达与其临床特征及靶基因的关系.方法 下载TCGA数据库中AML患者的miRNA、RNA表达谱及临床数据,按照miR-363表达水平由高到低排序,将前50％设为高表达组(n=81),后50...

【关键词】 癌症基因组图谱； 急性髓系白血病； 微小RNA-363；

【中文期刊】 郭鑫瑶 季晶焱  等 《贵州医科大学学报》 2023年48卷9期 1003-1012页 ISTIC

【摘要】 目的 探讨41株戈登菌的系统发育学及其基因组中含碳水化合物活性酶、次级代谢产物生物合成基因簇的种类及多样性.方法 以公开发表的41株戈登菌全基因组数据为研究对象,利用原核生物泛基因组学分析的自动化软件对泛基因组特征进行分析,结合直系同源蛋白...

【关键词】 基因组； 戈登菌属； 16S小亚基核糖体RNA；

【中文期刊】 孙飞 周家权  等 《临床外科杂志》 2023年31卷8期 763-767页 ISTIC

【摘要】 目的 研究RNA聚合酶Ⅲ亚基G(POLR3G)在肌层浸润性膀胱癌(MIBC)组织中的表达及其与病人辅助化疗(ACT)反应和预后的关系.方法 2016 年 3 月～2022 年 1 月连续招募42 例在我院就诊的 MIBC 病人,均采用根治性...

【关键词】 RNA聚合酶Ⅲ亚基G； 肌层浸润性膀胱癌； 辅助化疗反应；

【中文期刊】 徐靖泽 朱成鑫  等 《蚌埠医学院学报》 2023年48卷12期 1670-1675页 ISTICCA

【摘要】 目的:研究血清外泌体来源microRNA(miRNA)作为预测绝经期女性骨质疏松症的潜在生物标志物.方法:检测65 岁以上骨质疏松症女性病人和健康对照者血清中的miRNA.RNA测序用于鉴定差异表达的miRNA.使用TargetScan、P...

【关键词】 骨质疏松症； 二代测序； microRNA；

【中文期刊】 包德荣 朱鑫杰  等 《浙江临床医学》 2023年25卷11期 1584-1588页 ISTIC

【摘要】 目的 应用癌症基因组图谱(TCGA)建立预测模型预测STAD患者总生存期(OS),并根据ATIRE风险评分和临床病理特征构建预测STAD OS的列线图.方法 从TCGA数据库中下载STAD患者的RNA编辑数据、转录组数据及相应的临床资料,分...

【关键词】 胃腺癌； 癌症基因组图谱； A-to-I RNA编辑；

【中文期刊】 孙谦 杨明  等 《贵州医科大学学报》 2023年48卷8期 881-887页 ISTIC

【摘要】 目的 测定和注释装饰短蚋(Simulium ornatum)线粒体全基因组序列,并在线粒体基因组水平上分析短蚋亚属与蚋亚属、纺蚋亚属之间的系统发育关系.方法 采用长PCR扩增加引物步移法和总DNA测序法对装饰短蚋线粒体全基因组序列进行扩增测...

【关键词】 装饰短蚋； 线粒体基因组； 密码子；

【中文期刊】 Li XU Cheng YU  等 《当代医学科学（英文）》 2022年42卷4期 841-846页 SCIMEDLINE

【摘要】 Objective:This study aimed to examine a novel method for prognostic evaluation of patients with oral squamous cell carci...

【关键词】 oral squamous cell carcinoma； m6A methylation regulators,RNA modification； prognostic prediction；

【中文期刊】 王淑娟 朱冉  等 《中国药品标准》 2023年24卷6期 579-584页 CA

【摘要】 目的:为满足基于风险评估的微生物控制体系及药品质量全过程控制的要求,建立更加完善的药品微生物鉴定溯源标准化分子生物学技术体系.方法:总结各国药典中分子生物学标准体系的构成,并分析《中国药典》中收载的分子生物学技术及该技术在药品微生物鉴定溯源...

【关键词】 分子生物学技术； 核酸扩增技术； 16SrRNA；

【中文期刊】 Penghui Fu Du Zhang  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷6期 2411-2427页

【摘要】 Background During mammalian pre-implantation embryonic development(PED),the process of maternal-to-zygote transition(MZT...

【关键词】 Buffalo； DNA methylome； Embryonic genome activation；

【中文期刊】 Jiankui Wang Guoying Hua  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷6期 2316-2331页

【摘要】 Background Wool fibers are valuable materials for textile industry.Typical wool fibers are divided into medullated and n...

【关键词】 Primary wool follicle； RNA-seq； SOSTDC1；

【中文期刊】 崔甜琦 张田田  等 《中国高原医学与生物学杂志》 2023年44卷3期 185-194页 CA

【摘要】 目的 为挖掘青藏高原超盐盐湖中的嗜盐微生物新种资源,对从青海茶卡盐湖水样和底泥混合物中分离到的一株细菌CH40T进行新种鉴定.方法 对提取菌株的 16S rRNA基因进行扩增测序,并在GenBank、EzBiocloud网站上进行BLAST...

【关键词】 盐单胞菌； 新种鉴定； 16S rRNA；

【中文期刊】 刘展艳 李芷悦  等 《数字中医药（英文版）》 2023年6卷2期 160-169页

【摘要】 目的 研究黄腻苔人群的舌苔和肠道微生物菌群结构和代谢特征,探讨黄腻苔人群舌苔和肠道菌群代表性的代谢标志物和代谢通路.方法 于 2021年 12月 1日至 2022年 10月 30日采集黄腻苔及薄白苔受试者的舌苔及大便样本.16S rRNA及...

【关键词】 肠道菌群； 黄腻苔； 微观辨证；

【中文期刊】 Erkui YUE Hua TAO  等 《浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）》 2021年22卷5期 366-382页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 MicroRNAs (miRNAs) are endogenous small non-coding RNAs that play an important role in post-transcriptional gene regulat...

【关键词】 MicroRNA156 (miR156)； SQUAMOSA promoter-binding protein-like (SPL) gene； DNA methylation；

【中文期刊】 Jian Sang Dong Zou  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2020年18卷2期 161-172页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Genome reannotation aims for complete and accurate characterization of gene models and thus is of critical significance ...

【关键词】 Genome reannotation； IC4R； Rice；

【中文期刊】 李莹 雷煜宇  等 《昆虫学报》 2021年64卷11期 1244-1251页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]优化柞蚕Antheraea pernyi基因组注释,更好地扩展其在比较基因组学及品种改良研究中的应用.[方法]对柞蚕进行全长转录组测序分析;经全长转录本与参考基因组比对,鉴定新基因及新转录本,并对这些新基因和新转录本进行功能注释及长...

【关键词】 柞蚕； 基因组注释； 全长转录组；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2019年17卷5期 546-549页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Novel genomes are today often annotated by small consortia or individuals whose back-ground is not from bioinformatics. ...

【关键词】 Genome annotation； Annotation visualization； RNA-seq；

【中文期刊】 《中国神经再生研究（英文版）》 2018年13卷7期 1253-1262页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 While the peripheral nervous system has regenerative ability,restoration of sufficient function remains a challenge.Vime...

【关键词】 non-coding RNA； neural regeneration； nerve guide；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2018年16卷5期 310-319页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 We report an important but long-overlooked manifestation of low-resolution power of 16S rRNA sequence analysis at the sp...

【关键词】 Archaea and bacteria taxon-omy； Phylogeny； CVTree；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2015年3期 177-182页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The Cancer Genome Atlas (TCGA) (http://cancergenome.nih.gov) is a valuable data resource focused on an increasing number...

【关键词】 The Cancer Genome Atlas； Bladder cancer； MicroRNA；