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【中文期刊】 Mingwei Li Guanglin Chen 等 《定量生物学（英文版）》 2023年11卷1期 72-81页
【摘要】 Background:N6-methyladenosine(m6A)modifications of mRNA and long non-coding RNA(lncRNAs)are known to play a significant ...
【关键词】 RNA methylation； YTH-m6A3 RNA； principal component analysis(PCA)；
【外文期刊】 Lucas FS ; Bertru G ; 等 《Aquatic Microbial Ecology》 2003年32卷2期 165-174页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Salt marsh; Sediment; Bioturbation;
【外文期刊】 Zhao Y ; Kormos BL ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2006年81卷4期 256-269页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 RNA-binding protein; U1A; RNA recognition motif;
【外文期刊】 Kurisaki I ; Watanabe H ; 等 《Protein and peptide letters》 2010年17卷12期 1547-1552页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 K homology (KH) domain; molecular dynamics (MD); neuro-oncological ventral antigen (NOVA);
【外文期刊】 Wild, Klemens ; Becker, Matthias M. M. ; 等 《Biological chemistry》 2020年401卷1期 63-80页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 co-translational targeting of ribosome-nascent chain complexes (RNCs); dynamics of macromolecular complexes; protein-RNA and RNA-RNA interactions;
【外文期刊】 Blanch EW. ; Hecht L. ; 等 《The Journal of General Virology: A Federation of European Miorobiological Societies Journal》 2002年83卷10期 2593-2600页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Tobacco mosaic-virus; Refined structure; Protein;
【外文期刊】 Qin PZ ; Feigon J ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2005年351卷1期 1-8页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 site-directed spin labeling; RNA conformational change; dynamics;
【外文期刊】 Musselman C ; Pitt SW ; 等 《Journal of Biomolecular NMR》 2006年36卷4期 235-249页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 adaptive recognition; alignment tensor error; idealized A-form helix;
【外文期刊】 Caulfield,T. ; Devkota,B. ; 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2012年80卷11期 2489-2500页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 A/T transfer RNA; Docking; Maxwell's demon molecular dynamics;
【外文期刊】 Korostelev A ; Noller HF ; 《Journal of Molecular Biology》 2007年373卷4期 1058-1070页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 XIU-FENG WAN ; GUOHUI LIN ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2006年4卷5期 1015-1031页 MEDLINE
【关键词】 Local RNA secondary structure; symmetric mapping; dynamic programming;
【外文期刊】 Wuchty Stefan ; Hofacker Ivo L. ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 1999年49卷2期 145-165页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 RNA; Free energy; Algorithms;
【外文期刊】 Allen TD. ; Bagley S. ; 等 《Journal of Cell Science》 2000年113卷10期 1651-1659页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Nuclear pore complex (npc); Nucleocytoplasmic transport; Npc structure;
【外文期刊】 Balleza E ; Lopez-Bojorquez LN ; 等 《FEMS Microbiology Reviews》 2009年33卷1期 133-151页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 regulatory network inference; regulatory network plasticity; chromosome structure;
【外文期刊】 Znosko BM. ; Burkard ME. ; 等 《Biochemistry》 2002年41卷50期 14969-14977页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Center-dot-a; Restrained molecular-dynamics; Group-i intron;
【外文期刊】 Hamilton RS ; Davis I ; 《Seminars in cell and developmental biology》 2007年18卷2期 178-185页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Klose, Daniel ; Holla, Andrea ; 等 2021年120卷21期 4842-4858页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 ELECTRON-ELECTRON RESONANCE; BINDING-PROTEIN 1; INTEGRATIVE STRUCTURE;
【外文期刊】 Munro JB ; Vaiana A ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2008年89卷7期 565-577页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 single-molecule; FRET; ribosome;
【外文期刊】 Myong S ; Stevens BC ; 等 《Structure》 2006年14卷4期 633-643页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 RESONANCE ENERGY-TRANSFER; COLI REP HELICASE; TRANSFER-RNA SELECTION;
【外文期刊】 Holmes CE ; Abraham AT ; 等 《Nucleic Acids Research》 1996年24卷17期 3399-3406页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Phenylalanine transfer rna; Yeast transfer rnaasp; Molecular dynamics;
【外文期刊】 Law MJ ; Chambers EJ ; 等 《Nucleic Acids Research》 2005年33卷9期 2917-2928页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 RNA-BINDING DOMAIN; SMALL NUCLEAR-RNA; C-TERMINAL TAIL;
【外文期刊】 You, Jiajia ; Pan, Xuewei ; 等 《Metabolic engineering》 2021年68卷 46-58页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Riboflavin; Bacillus subtilis; Ashbya gossypii;
【外文期刊】 Burkard ME. ; Turner DH. ; 《Biochemistry》 2000年39卷38期 11748-11762页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Center-dot-g; Nuclear-magnetic-resonance; Nearest-neighbor model;
【外文期刊】 Tong-tong Liu ; Hong Yang ; 《FEMS Microbiology Ecology》 2020年96卷5期 fiaa059-1-fiaa059-11页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 freshwater sediment; DNA and RNA levels; spatiotemporal dynamic changes;
【外文期刊】 Haijun Liu ; Dong Xu ; 等 《Computational biology and chemistry》 2006年30卷1期 72-76页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 RNA secondary structure; Pseudoknots; Dynamic weighted matching;
【外文期刊】 Ghosh M ; Elsby LM ; 等 《The Biochemical Journal》 2004年378卷Pt.2期 317-324页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Dynamics; General transcription factor; Nmr;
【外文期刊】 LUDMILA V. DANILOVA ; DMITRI D. PERVOUCHINE ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2006年4卷2期 589-596页 MEDLINE
【关键词】 RNA secondary structure; kinetics; dynamics;
【外文期刊】 Enokizono Y ; Konishi Y ; 等 《The Journal of biological chemistry》 2005年280卷19期 18862-18870页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 RNA-BINDING DOMAIN; TRIPLET REPEAT DNA; G-RICH STRAND;
【外文期刊】 Hollmann, Nele Merret ; Jagtap, Pravin Kumar Ankush ; 等 《Nucleic Acids Research》 2023年51卷4期 1895-1913页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 TRANSLATIONAL CONTROL ELEMENT; AUTOMATED NOE ASSIGNMENT; SMALL-ANGLE SCATTERING;
【外文期刊】 Vlachodimitropoulou,E. ; Costello,J. ; 《Emergency medicine journal: EMJ》 2014年31卷5期 389-389页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Coarse-graining; Elastic network model; Experimental dynamics;
【外文期刊】 Sinthyia,Ahmed ; Rumana,Mahtarin ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2022年40卷21期 11111-11124页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 RNA-dependent RNA polymerase; SARS-CoV-2; molecular docking;
【外文期刊】 Peter F. Stadler ; 2021年11卷4期 rsfs.2020.0066-1-rsfs.2020.0066-9页
【关键词】 graph comparison; super-structure; RNA secondary structure;
【外文期刊】 Wu, Liandong ; Yang, Zhenggang ; 等 《Journal of viral hepatitis.》 2024年31卷5期 255-265页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 biomarker; cccDNA; chronic hepatitis B;
【外文期刊】 Ebrahimi, Parisa ; Kaur, Simi ; 等 《Methods: A Companion to Methods in Enzymology》 2019年162/163卷 96-107页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 RNA folding; Molecular dynamics simulations; Replica-exchange;
【外文期刊】 Giege R ; 《Nature structural & molecular biology》 2008年15卷10期 1007-1014页 MEDLINE
【关键词】 MITOCHONDRIAL TRANSFER-RNAS; GLUTAMYL-TRANSFER-RNA; MESSENGER-RNA;
【外文期刊】 Dutheil, Julien Y. ; Jossinet, Fabrice ; 等 《Molecular biology and evolution》 2010年27卷8期 1868-1876页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 ribosomal RNA; substitution rate; high-resolution structure;
【外文期刊】 Bottaro, Sandro ; Bussi, Giovanni ; 等 《RNA》 2019年25卷2期 219-231页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 MD trajectories; molecular dynamics; RNA 3D structure;
【外文期刊】 Coudevylle N ; Rokas D ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2006年84卷4期 368-382页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 H-1 nuclear magnetic resonance spectroscopy; molecular dynamics simulation; nuclear Overhauser enhancement spectroscopy;
【外文期刊】 Choi, Yu J. ; Gibala, Krzysztof S. ; 等 2017年45卷4期 2099-2111页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 POLYNUCLEOTIDE PHOSPHORYLASE PROTEIN; BASE-PAIRING PROPERTIES; OXIDIZED MESSENGER-RNA;
【外文期刊】 Dawson, Wayne K. ; Maciejczyk, Maciej ; 等 《Methods: A Companion to Methods in Enzymology》 2016年103卷 138-156页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Almeida MS ; Johnson MA ; 等 《Journal of Virology》 2007年81卷7期 3151-3161页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; NMR STRUCTURE DETERMINATION; TORSION ANGLE DYNAMICS;
【外文期刊】 Bardiaux B ; Malliavin TE ; 等 《Journal of Biomolecular NMR》 2006年34卷3期 153-166页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 BMRB; cis peptides; CNS;
【外文期刊】 Reymond C ; Ouellet J ; 等 《RNA》 2007年13卷1期 44-54页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 ribozyme; hepatitis delta virus; cross-linking;
【外文期刊】 Poolsap, U. ; Kato, Y. ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2011年9卷6期 697-713页 MEDLINE
【关键词】 dynamic programming; RNA secondary structure; RNARNA interaction;
【外文期刊】 Skibinska L. ; Banachowicz E. ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2004年73卷3期 316-325页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 5s rrna; Structure; Dynamic light scattering;
【外文期刊】 Zilberstein CBZ ; Ziv-Ukelson M ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2006年13卷2期 245-266页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 microRNA; RNA folding; RNA secondary structure;
【外文期刊】 Pitici F. ; Beveridge DL. ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2002年65卷6期 424-435页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Rna-binding protein; U1a; Rna recognition motif;
【外文期刊】 Alenaizan, Asem ; Barnett, Joshua L. ; 等 《Nucleic Acids Research》 2021年49卷1期 79-89页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; SYNTHETIC GENETIC POLYMERS; CENTER-DOT-DNA;
【外文期刊】 Kim, T. ; Barchi Jr., J.J. ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2010年29卷5期 624-634页
【关键词】 Molecular dynamics simulations; North constrained sugar; RNA;
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