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            1. 枯草芽孢杆菌中人乳铁蛋白的表达与分泌

            【中文期刊】 张予婷 李洋  等 《生物工程学报》 2024年40卷6期 1895-1908页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 人源乳铁蛋白(human lactoferrin,HLF)是母乳中重要的营养成分,具有抗菌、消炎、提高机体免疫力等功能.本研究以枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)G601为宿主,对比了 3种组成型(P21、P43和 Pveg...

            【关键词】 乳铁蛋白； 枯草芽孢杆菌； 核糖体结合位点(RBS)-信号肽筛选；

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            2. 谷氨酸棒杆菌乙酰羟酸合酶的高效表达调控及应用

            【中文期刊】 乔倩倩 宁舒展  等 《生物工程学报》 2024年40卷9期 3114-3126页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 谷氨酸棒杆菌是支链氨基酸工业生产的主力菌,乙酰羟酸合酶(acetohydroxyacid synthase,AHAS)是支链氨基酸合成的关键酶,强化AHAS的表达是提高菌种水平的关键手段.然而目前还未实现高效调控AHAS,本研究首先基于前期...

            【关键词】 谷氨酸棒杆菌； 支链氨基酸； 乙酰羟酸合酶；

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            3. 理性代谢工程改造促进谷氨酸棒杆菌高效合成L-谷氨酸

            【中文期刊】 刘佳峰 乔郅钠  等 《生物工程学报》 2023年39卷8期 3273-3289页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 L-谷氨酸是世界上第一大宗氨基酸产品,广泛应用于食品医药及化工等行业.以谷氨酸高产菌谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)G01 为出发菌株,首先通过敲除主要副产物丙氨酸合成相关基因-丙氨酸氨基转移酶编码基因(...

            【关键词】 谷氨酸棒杆菌； 谷氨酸； 转录分析；

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            4. 基于sRNA的氧化葡萄糖酸杆菌基因调控的研究

            【中文期刊】 李真真 赵佳晨  等 《生物技术通报》 2018年34卷3期 59-66页 ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 在氧化葡萄糖酸杆菌中建立一种调控基因表达的工具.通过顺式/反式作用的非编码小RNA与核糖体结合位点(RBS)的相互作用,在翻译水平上对氧化葡萄糖酸杆菌中目标基因的表达进行调控.以绿色荧光蛋白作为报告基因,在所构建的顺式调控系统中,插入RBS...

            【关键词】 氧化葡萄糖酸杆菌； 非编码小RNA； 翻译调控；

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            5. Statistical prediction of single-stranded regions in RNA secondarystructure and application to predicting effective antisense target sitesand beyond

            【外文期刊】 Ding Y ; Lawrence CE ; 《Nucleic Acids Research》 2001年29卷5期 1034-1046页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 5s ribosomal-rna; Oligonucleotide arrays; Messenger-rna;

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            6. Molecular classification of coxsackie A viruses on the basis of the 5 '-UTR: Structural and evolutionary aspects

            【外文期刊】 Siafakas N ; Markoulatos P ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2002年55卷6期 638-652页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Enteroviruses; Coxsackie a viruses; Molecular classification;

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            7. The Leader Protein of Cardioviruses Inhibits Stress Granule Assembly

            【外文期刊】 Borghese, Fabian ; Michiels, Thomas . ; 《Journal of Virology》 2011年85卷18期 9614-9622页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 RNA; thapsigargin: 67526-95-8; type I interferon;

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            8. Combinatorial Fine-Tuning of Phospholipase D Expression by Bacillus subtilis WB600 for the Production of Phosphatidylserine

            【外文期刊】 Huang, Tingting ; Lv, Xueqin ; 等 《Journal of microbiology and biotechnology》 2018年28卷12期 2046-2056页 SCIEMEDLINE

            【关键词】 Phospholipase D; phosphatidylserine; ribosome-binding site calculator;

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            9. Structure, function and evolution of the signal recognition particle [Review]

            【外文期刊】 Nagai K. ; Oubridge C. ; 等 《EMBO Journal》 2003年22卷14期 3479-3485页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Membrane targeting; Ribosome nascent chain; Signal recognition particle;

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            10. Efficient Bacterial Genome Engineering throughout the Central Dogma Using the Dual-Selection Marker tetAOPT

            【外文期刊】 Bayer, Carolyn N. ; Sepulchro, Ana G. V. ; 等 《ACS Synthetic Biology》 2022年11卷10期 3440-3450页

            【关键词】 genome engineering; Escherichia coli; tetA;

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            11. Compensatory evolution of a WW domain variant lacking the strictly conserved trp residue

            【外文期刊】 Yanagida H ; Matsuura T ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2008年66卷1期 61-71页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 WW domain; conserved residue; divergent evolution;

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            12. The Insulin Receptor and Insulin like Growth Factor Receptor 5' UTRs Support Translation Initiation Independently of EIF4G1

            【外文期刊】 Clark, Nicholas K. ; Harris, Meghan T. ; 等 《Molecular and Cellular Biology》 2023年43卷10期 485-499页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 insulin receptor; IRES; EIF4G;

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            13. Peptidyi-prolyl-tRNA at the ribosomal P-site reacts poorly with puromycin

            【外文期刊】 Muto H ; Ito K ; 《Biochemical and Biophysical Research Communications》 2008年366卷4期 1043-1047页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ribosome; peptidyl transferase; puromycin;

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            14. Drug Screening for Hepatitis A Virus (HAV): Nicotinamide Inhibits c-Jun Expression and HAV Replication

            【外文期刊】 Sasaki-Tanaka, Reina ; Masuzaki, Ryota ; 等 《Journal of Virology》 2023年97卷2期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 hepatitis A virus; nicotinamide; IRES;

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            15. Structural insights into the transcriptional and translational roles of Ebp1

            【外文期刊】 Monie TP ; Perrin AJ ; 等 《EMBO Journal》 2007年26卷17期 3936-3944页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 crystal structure; Ebp1/ITAF(45)/PA2G4; IRES;

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            16. microRNA-122 stimulates translation of hepatitis C virus RNA

            【外文期刊】 Henke JI ; Goergen D ; 等 《EMBO Journal》 2008年27卷24期 3300-3310页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 5 '-UTR; HCV; IRES;

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            17. Functional interaction between bases C1049 in domain II and G2751 in domain VI of 23S rRNA in Escherichia coli ribosomes

            【外文期刊】 Miyoshi T ; Uchiumi T ; 《Nucleic Acids Research》 2008年36卷6期 1783-1791页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 POLYPEPTIDE ELONGATION-FACTORS; NUCLEAR MAGNETIC-RESONANCE; PROTEIN L7/L12;

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            18. Exploring the capacity of trigger factor to function as a shield for ribosome bound polypeptide chains

            【外文期刊】 Tomic S ; Johnson AE ; 等 《FEBS Letters: For the Rapid Publication of Short Reports in Biochemistry, Biophysics and Molecular Biology》 2006年580卷1期 72-76页

            【关键词】 trigger factor; ribosome nascent chain complex; proteinase K;

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            19. Improved cadaverine production from mutant Klebsiella oxytoca lysine decarboxylase

            【外文期刊】 Li, Naiqiang ; Chou, Howard ; 等 《Engineering in Life Sciences》 2016年16卷3期 299-305页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Cadaverine; Diamine; Error-prone PCR mutagenesis;

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            20. Inhibitory effects of archetypical nucleic acid ligands on the interactions of HIV-1 nucleocapsid protein with elements of Psi-RNA

            【外文期刊】 Turner KB ; Hagan NA ; 等 《Nucleic Acids Research》 2006年34卷5期 1305-1316页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 IONIZATION MASS-SPECTROMETRY; IMMUNODEFICIENCY-VIRUS TYPE-1; DOUBLE-STRANDED OLIGODEOXYNUCLEOTIDES;

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            21. The relationship between arninoglycosides' RNA binding proclivity and their antiplasmid effect on an IncB plasmid

            【外文期刊】 Thomas JR ; DeNap JCB ; 等 《Biochemistry》 2005年44卷18期 6800-6808页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S RIBOSOMAL-RNA; METALLO-BETA-LACTAMASE; COMPLETE NUCLEOTIDE-SEQUENCE;

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            22. Efficient expression of gene variants that harbour AGA codons next to the initiation codon

            【外文期刊】 Zamora-Romo E ; Cruz-Vera LR ; 等 《Nucleic Acids Research》 2007年35卷17期 5966-5974页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 MESSENGER-RNA DOWNSTREAM; 16S RIBOSOMAL-RNA; ESCHERICHIA-COLI;

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            23. An intricate RNA structure with two tRNA-derived motifs directs complex formation between yeast aspartyl-tRNA synthetase and its mRNA

            【外文期刊】 Ryckelynck M ; Masquida B ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2005年354卷3期 614-629页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 aspartyl-tRNA synthetase regulation; messenger RNA; tRNA mimicry;

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            24. Two RNA-binding sites in plant fibrillarin provide interactions with various RNA substrates

            【外文期刊】 Rakitina, D. V. ; Taliansky, Michael ; 等 《Nucleic Acids Research》 2011年39卷20期 8869-8880页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ribosomal RNA: rRNA; small interfering RNA: siRNA; snoRNA;

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            25. Regulatory elements of stx2 gene and the expression level of Shiga-like toxin 2 in Escherichia coli O157:H7

            【外文期刊】 Suardana, I. Wayan ; Pinatih, Komang Januartha Putra ; 等 《Journal of microbiology, immunology, and infection: Wei mian yu gan ran za zhi》 2018年51卷1期 132-140页 SCIEMEDLINE

            【关键词】 Escherichia coli O157:H7; promoter; q gene;

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            26. Structural basis for the interaction of Shiga toxin 2a with a C-terminal peptide of ribosomal P stalk proteins

            【外文期刊】 Rudolph, Michael J. ; Davis, Simon A. ; 等 2020年295卷46期 15588-15596页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 toxin; Shiga toxin; ribosome;

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            27. Synthetic access to spacer-linked 3,6-diamino-2,3,6-trideoxy-alpha-D-glucopyranosides - potential aminoglycoside mimics for the inhibition of the HIV-1 TAR-RNA/Tat-peptide complex

            【外文期刊】 Joge T ; Jesberger M ; 等 《Carbohydrate research》 2007年342卷12/13期 1704-1714页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 olefin metathesis; aminoglycosides; antibiotics;

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            28. A target-unrelated peptide in an M13 phage display library traced to an advantageous mutation in the gene II ribosome-binding site

            【外文期刊】 Brammer LA ; Bolduc B ; 等 《Analytical Biochemistry: An International Journal of Analytical and Preparative Methods》 2008年373卷1期 88-98页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 phage display; phage-displayed peptides; target-unrelated peptide;

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            29. ANALYSIS OF THE RIBOSOME LARGE SUBUNIT ASSEMBLY AND 23 S RRNA STABILITY IN VIVO

            【外文期刊】 Liiv A. ; Remme J. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 1996年263卷3期 396-410页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Ribosome; 23s rrna; L-proteins;

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            30. Foot-and-mouth disease virus infection induces proteolytic cleavage of PTB, eIF3a,b, and PABP RNA-binding proteins

            【外文期刊】 Pulido MR ; Serrano P ; 等 《Virology》 2007年364卷2期 466-474页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 FMDV; RNA-binding proteins; IRES;

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            31. Complementary sets of noncanonical base pairs mediate RNA helix packing in the group intron active site

            【外文期刊】 Strobel SA. ; Ryder SP. ; 等 《Nature structural biology》 1998年5卷1期 60-66页 MEDLINE

            【关键词】 Center-dot-u; Group-i intron; Tetrahymena ribozyme;

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            32. COOPERATIVE ASSEMBLY OF SIGNAL RECOGNITION PARTICLE RNA WITH PROTEIN SRP19

            【外文期刊】 Walker KP ; Black SD ; 等 《Biochemistry》 1995年34卷37期 11989-11997页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Secondary structure; 7sl rna; Escherichia-coli;

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            33. High activity expression of d-amino acid oxidase in Escherichia coli by the protein expression rate optimization

            【外文期刊】 Hou, J. ; Liu, Y. ; 等 《Protein Expression and Purification》 2013年88卷1期 120-126页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 d-amino acid oxidase; Protein expression rate; Ribosome binding site region;

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            34. Crystal structure of an RNA duplex r(gug(u)under-barcgcac)(2) with uridine bulges

            【外文期刊】 Xiong Y ; Deng JP ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2001年313卷3期 573-582页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Uridine bulge; Rna duplex; A-form conformation;

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            35. Screening for engineered neomycin riboswitches that control translation initiation

            【外文期刊】 Weigand JE ; Sanchez M ; 等 《RNA》 2008年14卷1期 89-97页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 aptamer; riboswitch; neomycin;

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            36. ФРАГМЕНТЫ БЕЛКА S3, СОСЕДСТВУЮЩИЕ С мРНК В РИБОСОМЕ ЧЕЛОВЕКА ПРИ ЭЛОНГАЦИИ И ТЕРМИНАЦИИ ТРАНСЛЯЦИИ

            【外文期刊】 Ю. С. Хайрулина ; М. В. Молотков ; 等 《Биоорганическая химия》 2008年34卷6期 773-780页 MEDLINE

            【关键词】 рибосома; фотоаффинная модификация; эукариоты;

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            37. Protein S3 fragments neighboring mRNA during elongation and termination of translation on the human ribosome

            【外文期刊】 Yu. S. Khairulina ; M. V. Molotkov ; 等 《Russian journal of bioorganic chemistry》 2008年34卷6期 691-697页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ribosome; photoaffinity cross-linking; eukaryotes;

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            38. The structure of helix III in Xenopus oocyte 5 S rRNA: An RNA stem containing a two-nucleotide bulge

            【外文期刊】 Huber PW ; Rife JP ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2001年312卷4期 823-832页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 5 s rrna; Ribosomal protein l5; Bulged nucleotides;

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            39. The identification of novel RNA structural motifs using COMPADRES: an automated approach to structural discovery

            【外文期刊】 Wadley LM ; Pyle AM ; 《Nucleic Acids Research》 2004年32卷22期 6650-6659页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ESCHERICHIA-COLI RIBOSOMES; PHENYLALANINE TRANSFER-RNA; CRYSTAL-STRUCTURE;

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            40. In vivo functional analysis of the Dicistroviridae intergenic region internal ribosome entry sites

            【外文期刊】 Hertz, Marla I. ; Thompson, Sunnie R. . ; 《Nucleic Acids Research》 2011年39卷16期 7276-7288页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 codons; alanine: 302-72-7; intergenic region;

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            41. Improvement of Bacilysin Production in Bacillus subtilis by CRISPR/Cas9-Mediated Editing of the 5?-Untranslated Region of the bac Operon

            【外文期刊】 Abdulmalek, Hadeel Waleed ; Yazgan-Karatas, Ayten ; 《Journal of microbiology and biotechnology》 2023年33卷3期 410-418页 SCIEMEDLINE

            【关键词】 Bacillus subtilis; bacilysin; bacABCDEF;

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            42. Potential new antibiotic sites in the ribosome revealed by deleterious mutations in RNA of the large ribosomal subunit.

            【外文期刊】 Yassin A ; Mankin AS ; 《The Journal of biological chemistry》 2007年282卷33期 24329-24342页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Anti-Bacterial Agents; Binding Sites; Escherichia coli;

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            43. Analysis of hepatitis C virus RNA dimerization and core-RNA interactions

            【外文期刊】 Ivanyi-Nagy R ; Kanevsky I ; 等 《Nucleic Acids Research》 2006年34卷9期 2618-2633页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 RIBOSOME ENTRY SITE; CONSERVED 98-BASE SEQUENCE; 3' NONTRANSLATED REGION;

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            44. Effect of 5 '-proximal elements on decay of a model mRNA in Bacillus subtilis

            【外文期刊】 Sharp JS ; Bechhofer DH ; 《Molecular Microbiology》 2005年57卷2期 484-495页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 RIBOSOME-BINDING-SITE; 5' STEM-LOOP; ESCHERICHIA-COLI;

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            45. Analysis of the cloverleaf element in a human rhinovirus type 14 poliovirus chimera: correlation of subdomain D structure, ternary protein complex formation and virus replication

            【外文期刊】 Rieder E. ; Xiang WK. ; 等 《The Journal of General Virology: A Federation of European Miorobiological Societies Journal》 2003年84卷8期 2203-2216页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Poly(rc) binding-protein; Strand rna-synthesis; Ribosomal entry site;

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            46. An analysis of G-U base pair occurrence in eukaryotic 5S rRNAs

            【外文期刊】 Szymanski M. ; Barciszewska MZ. ; 等 《Molecular biology and evolution》 2000年17卷8期 1194-1198页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 5s ribosomal rna; Wobble pairs; Rna secondary structure;

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            47. Exploring the Interaction of Human Ribosomal Protein uS3 with Single-Stranded DNAs Having Different Sequences

            【外文期刊】 《Russian journal of bioorganic chemistry》 2019年45卷6期 619-624页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ribosomal uS3 protein; single-stranded DNA; protein binding to DNA;

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            48. Ectopic expression of eIF4E-transporter triggers the movement of eIF4E into P-bodies, inhibiting steady-state translation but not the pioneer round of translation

            【外文期刊】 Lee HC ; Cho H ; 等 《Biochemical and Biophysical Research Communications》 2008年369卷4期 1160-1165页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 eIF4E-T; eIF4E; CBP80;

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            49. Improvement of DNA minicircle production by optimization of the secondary structure of the 5 '-UTR of ParA resolvase

            【外文期刊】 Simcikova, Michaela ; Alves, Cludia P. A. ; 等 《Applied Microbiology and Biotechnology》 2016年100卷15期 6725-6737页

            【关键词】 Minicircle; parA resolvase; 5 '-UTR;

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            50. A fluorescence-based screen for ribosome binding antibiotics

            【外文期刊】 Watkins, D. ; Norris, F.A. ; 等 《Analytical Biochemistry: An International Journal of Analytical and Preparative Methods》 2013年434卷2期 300-307页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 A-site; Aminoglycoside; F-neo;

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