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【外文期刊】 Betts GN ; van der Geer P ; 等 《The Journal of biological chemistry》 2008年283卷23期 15656-15664页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 RECEPTOR-RELATED PROTEIN; AMYLOID PRECURSOR PROTEIN; LIPOPROTEIN-RECEPTOR;
【外文期刊】 Mohammad ; T. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2019年37卷7/8期 1813-1829页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 ADMET; binding affinity; drug design & discovery;
【外文期刊】 Anand GS. ; Hughes CA. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2002年323卷2期 377-386页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Maldi-tof; H/h-2 exchange; Protein kinase;
【外文期刊】 Rollin, J.A. ; Zhu, Z. ; 等 《Biotechnology and Bioengineering》 2011年108卷1期 22-30页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Biofuels; Biomass pretreatment; Cellulose accessibility to cellulase;
【外文期刊】 Martins,J.M. ; Ramos,R.M. ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2014年82卷3期 479-490页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Computational alanine scanning mutagenesis; Feature based algorithms; Hot-spot;
【外文期刊】 Rutkowska-Wlodarczyk I ; Stepinski J ; 等 《Biochemistry》 2008年47卷9期 2710-2720页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 INITIATION-FACTOR 4E; IONIZATION MASS-SPECTROMETRY; AMINO-ACID-SEQUENCE;
【外文期刊】 Gianese G. ; Bossa F. ; 等 《Protein Engineering》 2003年16卷12期 987-992页 MEDLINE
【关键词】 Exposure category; Prediction accuracy comparison; Probability profiles;
【外文期刊】 Lukasz Kurgan ; Fatemeh Miri Disfani ; 《Current Protein and Peptide Science》 2011年12卷6期 470-489页
【关键词】 protein structure; protein structure prediction; structural descriptors;
【外文期刊】 Anbarasu A ; Anand S ; 等 《International Journal of Biological Macromolecules: Structure, Function and Interactions》 2007年41卷3期 251-259页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 C-H center dot center dot center dot pi interactions; solvent accessibility; long-range interactions;
【外文期刊】 Ho FM ; Styring S ; 《Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics》 2008年1777卷2期 140-153页 SCISCIE
【关键词】 photosystem II; channel; solvent contact surface;
【外文期刊】 Allan Christopher ; Kosar Miroslav ; 等 《Chembiochem: A European journal of chemical biology》 2018年19卷23期 2443-2447页
【关键词】 amino-tyrosine; catch-and-release; diazonium;
【外文期刊】 Pedersen JS ; Christensen G ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2004年341卷2期 575-588页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Najor, Matthew S. ; Olsen, Kenneth W. ; 等 《Protein science :》 2014年23卷10期 1392-1402页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Gi alpha 1; tryptophan; fluorescence;
【外文期刊】 Park Y ; Helms V ; 《Bioinformatics》 2007年23卷6期 701-708页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 KNOWLEDGE-BASED SCALE; SOLVENT ACCESSIBILITY; ACCURATE PREDICTION;
【外文期刊】 Lavanya, P. ; Ramaiah, S. ; 等 《Journal of biological inorganic chemistry: JBIC: a publication of the Society of Biological Inorganic Chemistry》 2013年18卷5期 539-545页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 β-Lactamases; C-H···π interactions; Conservation;
【外文期刊】 Howarth JW ; Meller J ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2007年373卷3期 706-722页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 cardiac troponin; modulation by phosphorylation; cardiac specific N-extension of cardiac troponin I;
【外文期刊】 Grinberg VY. ; Burova TV. ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 1998年46卷4期 253-265页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Alpha-lactalbumin; Holo-form; Conformational transitions;
【外文期刊】 Kurochkina N. ; Lee B. ; 《Protein Engineering》 1995年8卷5期 437-442页 MEDLINE
【关键词】 Accessible surface area; Hydrophobic potential; Protein folding;
【外文期刊】 Ceballos-Garzon, Andres ; Monteoliva, Lucia ; 等 2022年77卷3期 585-597页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 SOLVENT ACCESSIBILITY; CELL-WALL; TRANSMEMBRANE TOPOLOGY;
【外文期刊】 Bismuto E ; Sirangelo I ; 等 《Biochemistry》 1996年35卷4期 1173-1178页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Molten globule intermediate; Unfolding pathway; Solvent accessibility;
【外文期刊】 Fraternali F. ; Vangunsteren WF. ; 《Journal of Molecular Biology》 1996年256卷5期 939-948页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Effective solvation; protein simulation; Solvent accessible surface area;
【外文期刊】 Dhole, Kaustubh ; Singh, Gurdeep ; 等 《Journal of Theoretical Biology》 2014年348卷 47-54页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Sequence-based L1-logreg predictor; Leave One Out Cross Validation; Position-specific scoring matrix;
【外文期刊】 Mazur S. ; Ding DY. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2000年300卷2期 321-337页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Dna-drug interaction; Surface plasmon resonance; Isothermal titration calorimetric;
【外文期刊】 Kim,J.-K. ; Cho,Y. ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2014年82卷9期 1829-1849页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Beta-complex; Beta-shape; Cavity;
【外文期刊】 Sabo TM ; Brasher PB ; 等 《Biochemistry》 2007年46卷35期 10089-10101页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 COAGULATION-FACTOR-XIII; FIBRIN STABILIZING FACTOR; PROTEIN-PROTEIN INTERFACES;
【外文期刊】 Pang CNI ; Hayen A ; 等 《Journal of proteome research》 2007年6卷5期 1833-1845页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 post-translational modifications; protein-protein interaction; surface accessibility;
【外文期刊】 Heinkel, Florian ; Gsponer, Joerg ; 《Journal of Molecular Biology》 2016年428卷2 Pt.A期 365-371页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 fast photochemical oxidation of proteins; restrained molecular dynamics simulation; solvent-accessible surface area;
【外文期刊】 Alverdi V ; Mazon H ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2008年375卷5期 1380-1393页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 cGMP-dependent protein kinase 1 alpha; PKG; kinase activation;
【外文期刊】 Cao BQ ; Porollo A ; 等 《Bioinformatics》 2006年22卷3期 303-309页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 INTEGRAL MEMBRANE-PROTEINS; SECONDARY STRUCTURE; TOPOLOGY PREDICTION;
【外文期刊】 Shi, Liuqing ; Gross, Michael L. ; 《Protein and peptide letters》 2019年26卷1期 27-34页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Hydroxyl radical labeling; Fast Photochemical Oxidation of Proteins (FPOP); protein footprinting;
【外文期刊】 Khitrina, L.V. ; 《Biochemistry (Moscow). Supplement, Series A. Membrane and cell biology》 2011年5卷2期 198-204页
【关键词】 bacteriorhodopsin; proton transport; PyMOL;
【外文期刊】 Olofsson A ; Sauer-Eriksson AE ; 等 《Analytical Biochemistry: An International Journal of Analytical and Preparative Methods》 2009年385卷2期 374-376页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 SOLUTION NMR-SPECTROSCOPY; PROBING SOLVENT ACCESSIBILITY; H/D-EXCHANGE;
【外文期刊】 Pramod,Avti ; Arushi,Chauhan ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2022年40卷19期 8894-8904页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Main protease (Mpro); molecular mechanics/Generalized87 Born model and solvent accessibility (MM/GBSA); molecular dynamics (MD);
【外文期刊】 Yokoyama, K. ; Utsumi, H. ; 等 《Applied Microbiology and Biotechnology》 2010年87卷6期 2087-2096页
【关键词】 CORYNEX?; Screening; Solvent-accessibility;
【外文期刊】 Akifumi Oda ; Tomoki Nakayoshi ; 等 《Biochimica et biophysica acta: BBA: International journal of biochemistry, biophysics and molecular biololgy. Proteins and Proteomics》 2018年1866卷7期 783-788页 SCISCIE
【关键词】 d-Aspartic acid; Stereoinversion; Replica exchange molecular dynamics simulation;
【外文期刊】 Banerjee, Arundhati ; Dasgupta, Rakhi ; 等 《Current HIV research》 2017年15卷5期 327-335页
【外文期刊】 Sanbo Qin ; Huan-Xiang Zhou ; 《Biophysical reviews》 2013年5卷1期 41-46页
【关键词】 Solvent accessibility; Protein-protein interaction site; Protein-DNA interaction site;
【外文期刊】 Rajani R. Joshi ; 《Protein and peptide letters》 2007年14卷6期 536-542页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 B-cell epitope; paratope; logistic regression;
【外文期刊】 Bloom JD ; Drummond DA ; 等 《Molecular biology and evolution》 2006年23卷9期 1751-1761页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Chaudhuri,A. ; Sarkar,I. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2014年32卷11/12期 1969-1978页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 hydroxamic acid derivative; simulation; solvent accessibility;
【外文期刊】 CHANGHUI YAN ; JING HU ; 《WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine》 2006年3卷6期 477-482页
【关键词】 Hidden Markov model; Helix-turn-helix; Solvent accessibility;
【外文期刊】 Wei, Hong ; Wang, Boling ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2021年18卷5期 2017-2022页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Moreira,I.S. ; Ramos,R.M. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2014年32卷1/2期 186-197页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Hot-spots; Interfacial water; O-ring theory;
【外文期刊】 Valverde R ; Edwards L ; 等 《The FEBS journal》 2008年275卷11期 2712-2726页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 fragile X mental retardation; interaction motif; KH domains;
【外文期刊】 Sudha Anand ; Anand Anbarasu ; 等 《In silico biology: An international on computational biology》 2008年8卷3/4期 261-273页 MEDLINE
【关键词】 C-H…π interactions; solvent accessibility; short range interactions;
【外文期刊】 Saranya, N. ; Saravanan, K. M. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2016年34卷3/4期 508-516页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein-protein recognition; solvent accessibility; conformation switching;
【外文期刊】 Anand Anbarasu ; Sudha Anand ; 等 《BioSystems》 2007年90卷3期 792-801页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 CHOC interactions; Solvent accessibility; Secondary structure;
【外文期刊】 Lanman J ; Prevelige PE ; 《Current Opinion in Structural Biology》 2004年14卷2期 181-188页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 HYDROGEN-DEUTERIUM EXCHANGE; AMIDE H/H-2 EXCHANGE; CONFORMATIONAL DYNAMICS;
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