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【中文期刊】 李鑫 丁镌 等 《中国免疫学杂志》 2015年4期 514-516页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的：确认HLA新等位基因HLA－A?01∶130并分析其有异常反应格局的核苷酸序列。方法：应用DNA测序分型技术（ PCR－SBT）进行HLA分型，对可疑新等位基因采用单链测序基因分型技术直接测定基因序列，分析其与同源性最高的HLA等位基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 易忠胜 叶廷文 等 《桂林理工大学学报》 2013年33卷1期 99-106页
【摘要】 在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(k)与萘、内酯衍生物及其他化合物...
【关键词】 细胞色素P450 1A2；抑制剂；定量结构-活性相关；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 焦佩丽 李奕言 等 《中国药学（英文版）》 2020年29卷9期 603-616页ISTICCSCDCA
【摘要】 激酶mTOR是PI3K-AKT信号通路的关键组成部分,该激酶在宫颈癌细胞中被高度激活.本文运用基于结构的药物发现等手段发现了一系列mTOR激酶抑制剂并对其进行生物学评价,发现其可发挥有效的抗宫颈癌作用.酶活性测定结果显示化合物C3具有潜在的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《生物学前沿》 2011年06卷4期 289-299页MEDLINEISTICCA
【摘要】 Computational biology methods are now firmly entrenched in the drug discovery process.These methods focus on modeling an...
【关键词】 computational biology；drug discovery；homology modeling；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《生物医学与环境科学（英文版）》 2009年22卷3期 229-236页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Objective To understand the molecular basis for a potential reaction mechanism and develop novel antibiotics with homolo...
【关键词】 Streptococcus pneumoniae；HMG-CoA synthase；Analysis of dynamics；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 林群 金显仕 等 《生态学报》 2009年29卷7期 3613-3620页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 根据1982年和1992年渤海渔业资源和生态环境调查数据,应用EwE建模软件,构建了两个时期的营养通道模型,并比较分析了10a间渤海生态系统结构以及渔业资源的变化.模型包含鳀、黄鲫、蓝点马鲛、其它中上层鱼类、小黄鱼、花鲈、其它底层鱼类、底栖...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 毕潇文 李娟 等 《医学信息》 2016年29卷7期 28-30页
【摘要】 CASP(critical assessment of structure prediction)是代表蛋白质结构预测领域的世界前沿水平的评比活动。模板依赖型蛋白质结构预测方法(Template-based modeling﹐TBM)可以进...
【关键词】 CASP10；蛋白质结构预测模型质量评估；模板依赖型蛋白质结构预测方法；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Liao, Chenyi ; de Molliens, Mathilde P. ; 等 《Current topics in medicinal chemistry》 2019年19卷16期 1399-1417页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Class B GPCR;Behavioral disorders;Neurodegenerative diseases;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Miriam Sgobba ; Giulio Rasteili ; 《ChemMedChem》 2009年4卷9期 1399-1409页
【关键词】 antitumor agents;chaperones;Hsp90;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Liang,G. ; Choi-Sledeski,Y.M. ; 等 《Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters》 2012年22卷9期 3370-3376页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Asthma;Benzylamine;COPD;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Subramanian, Govindan ; Zhu, Yaqi ; 等 《Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters》 2019年29卷22期 Article 126680-Article 126680页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Bhattacharya, Sutanu ; Bhattacharya, Debswapna ; 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2019年87卷7期 596-606页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 contact assisted threading;protein structure prediction;protein threading;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Liang,G. ; Choi-Sledeski,Y.M. ; 等 《Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters》 2012年22卷4期 1606-1610页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Asthma;Benzylamine;COPD;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Khan A. ; Waqas M. ; 等 2022年213卷 751-767页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Anusuya,S. ; Natarajan,J. ; 《Expert opinion on drug discovery》 2013年8卷10期 1239-1251页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Pappalardo Matteo ; Rayan Mahmoud ; 等 《Molecular informatics.》 2017年36卷8期 1700014-1700014页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Rosas-Trigueros,J.L. ; Ilizaliturri-Flores,I. ; 等 《Current medicinal chemistry》 2012年19卷36期 6081-6094页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Apoptosis;Bcl-2;Bioinformatics;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Clark, Sarah A. ; Tronrud, Dale E. ; 等 《Protein science :》 2015年24卷9期 1528-1542页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Rosetta;superposition;NMR ensemble;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Joo,K. ; Lee,J. ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2014年82卷S2期 188-195页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Miranda, Ana ; Cova, Tania ; 等 《Future medicinal chemistry》 2018年10卷1期 121-131页
【关键词】 blood-brain barrier;cancer treatment;computational modeling;
- 概要：
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【外文期刊】 Olechnovic, Kliment ; Venclovas, Ceslovas ; 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2017年85卷6期 1131-1145页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein structure prediction;protein structure modeling;estimation of model quality;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Gibbons, Garrett S. ; Chakraborty, Amarraj ; 等 《European Journal of Medicinal Chemistry: Chimie Therapeutique》 2020年189卷 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Small-molecule inhibitors;Structure-based virtual screening;Histone methyltransferase;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Yadav, Arun A. ; Chee, Gaik-Lean ; 等 《Bioorganic and medicinal chemistry》 2015年23卷13期 3542-3551页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Divya Jindam ; Lokesh Ravi ; 等 《Research journal of pharmacy and technology》 2018年11卷6期 2203-2208页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Tosatto SCE ; Tosatto SCE ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2005年12卷10期 1316-1327页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Spyrakis, Francesca ; Cavasotto, Claudio N. ; 《Archives of Biochemistry and Biophysics》 2015年583卷 105-119页SCISCIE
【关键词】 Structure-based drug discovery;Homology modeling;Ligand docking;
- 概要：
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【外文期刊】 Igor Santos Nascimento ; Thiago Aquino ; 等 2022年19卷7期 637-653页
【关键词】 SARS-CoV-2;structure-based drug discovery;virtual screening;
- 概要：
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【外文期刊】 Li-Zhen Sun ; Dong Zhang ; 等 《Annual review of biophysics》 2017年46卷 227-246页
【关键词】 three-dimensional structure prediction;knowledge-based approach;physics-based modeling;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Hassan, Syed A. ; 《Genes genomics》 2015年37卷4期 327-338页
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Jin, Hongwei ; Xia, Jie ; 等 《Chemical biology and drug design》 2021年97卷4期 944-961页
【关键词】 CCR2;flexible docking;ligand-steered homology modeling;
- 概要：
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【外文期刊】 Belgrad, Benjamin A. ; Griffen, Blaine D. ; 《Oikos: A Journal of Ecology》 2020年129卷10期 1552-1565页SCISCIE
【关键词】 agent-based modeling;habitat heterogeneity;intraspecific variation;
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Zhu LP ; Ye DY ; 等 《Journal of molecular modeling》 2007年13卷1期 121-131页SCISCIE
【关键词】 structure-based 3D-QSAR;CoMFA;CoMSIA;
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Xia A. ; Chen H. ; 等 《Trends in Microbiology》 2022年30卷10期 925-929页SCISCIE
【关键词】 biofilm;individual-based model;intercellular interactions;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 R?gen,P. ; Koehl,P. ; 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2013年81卷5期 841-851页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Comparative modeling;Knowledge-based potential;Pair-potential;
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【外文期刊】 Saikat Chakrabarti ; Ganesan Pugalenthi ; 等 《In silico biology: An international on computational biology》 2006年6卷4期 311-319页MEDLINE
【关键词】 Conserved regions;motif-based database search;comparative modeling;
- 概要：
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【外文期刊】 Kunick C ; Zeng ZH ; 等 《Chembiochem: A European journal of chemical biology》 2005年6卷3期 541-549页
【关键词】 enzymes;inhibitors;lactams;
- 概要：
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【外文期刊】 Pewowaruk, Ryan ; Roldan-Alzate, Alejandro ; 2021年20卷5期 1659-1674页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Fluid-structure interactions;Reduced order model;Image based modeling;
- 概要：
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【外文期刊】 Wieder, Marcus ; Perricone, Ugo ; 等 《Biochemical and Biophysical Research Communications》 2016年470卷3期 685-689页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Pharmacophore modeling;Structure-based pharmacophore modeling;Molecular dynamics;
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Brice Dali ; Melalie Keita ; 等 《Chemical biology and drug design》 2012年79卷4期 411-430页
【关键词】 2D-QSAR and 3D-QSAR;antimalarial peptidomimetics;molecular modeling;
- 概要：
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【外文期刊】 Manthena V. Varma ; Yurong Lai ; 等 《Advanced drug delivery reviews》 2017年116卷 92-99页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Quantitative structure-activity relationship (QSAR);Transporter-mediated drug clearance;Extended clearance classification system (ECCS);
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【外文期刊】 Lee,H.W. ; Lee,H.C. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2014年32卷1/2期 308-318页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Knowledge-based modeling;Polytopic membrane proteins;Protein structure;
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【外文期刊】 Kontoyianni,M. ; Liu,Z. ; 《Current medicinal chemistry》 2012年19卷4期 544-556页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Activation mechanism;Conserved motifs;Critical assesment of structure prediction;
- 概要：
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【外文期刊】 Natalya I. Vasilevich ; Ilya I. Afanasyev ; 等 《Chemical biology and drug design》 2014年84卷5期 585-592页
【关键词】 drug design;molecular modeling;protein-protein interaction;
- 概要：
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【外文期刊】 Yoshida,S. ; Yamashita,F. ; 等 《Drug metabolism and pharmacokinetics》 2012年27卷5期 506-512页
【关键词】 Classification tree;Ligand-based modeling;Pregnane X receptor;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Reynolds,C.H. ; 《Current pharmaceutical design》 2014年20卷20期 3380-3386页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Computational chemistry;Computer-aided drug design;Modeling;
- 概要：
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- 结论：
【外文期刊】 Zhang, Cuihua ; Li, Qunlin ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2021年39卷7/8期 2702-2723页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Selective estrogen receptor downregulators;benzothiophene-containing compounds;structure-based drug design;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Gomez, Arnold David ; Bull, David A. ; 等 《Journal of biomechanical engineering.》 2015年137卷10期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 cardiac structure;image-based modeling;diffusion tensor MRI;
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【外文期刊】 Pallo A ; Bencsura A ; 等 《Biochemical and Biophysical Research Communications》 2007年364卷4期 952-958页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 gamma-aminobutyrate;human transporter;crystal structure-based homology modeling;
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- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Sedova, Mayya ; Jaroszewski, Lukasz ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2021年433卷11期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 homology-based modeling;structure modeling;structure prediction;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Vicente González?Charro ; Antonio Rey ; 《European Biophysics Journal》 2014年43卷8/9期 433-443页SCISCIEMEDLINE
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