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【中文期刊】 李祖任 马褚健 等 《生命科学研究》 2024年28卷6期 583-600页ISTICCA
【摘要】 杂草是农业生产中的重大威胁之一,导致作物产量损失.除草剂因其高效、操作简便和成本效益广泛应用于农作物保护,但其长期大量使用会导致抗性杂草的出现.开发新型高效除草剂是解决杂草抗药性问题的有效策略.基于结构的药物设计(structure-bas...
【关键词】 基于结构的药物设计(SBDD)；农药靶标；分子设计；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Zhao Chen Xintong Ren 等 《微生物与宿主健康（英文）》 2024年2卷5期 211-226页
【摘要】 G-protein coupled receptors(GPCRs)are the largest family of druggable targets.In recent years,GPCR structural biology ha...
【关键词】 G-protein coupled receptor(GPCR)；allosteric pocket；structure-based virtual screening(SBVS)；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 师云凡 鞠壮 等 《四川大学学报（自然科学版）》 2023年60卷4期 152-158页
【摘要】 为寻找新型冠状病毒主蛋白酶天然产物抑制剂,本文以SARS-CoV-2主蛋白酶为研究对象,通过计算机辅助药物筛选方法初步筛选出16个潜在抑制剂并进行体外酶活测试.其中,野黄岑素对SARS-CoV-2主蛋白酶的IC50为(10.79±2.116...
【关键词】 新型冠状病毒主蛋白酶；基于结构的虚拟筛选；没食子儿茶素没食子酸酯；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《计算机与应用化学》 2007年24卷1期 1-10页
【摘要】 总结了计算机辅助药物设计目前的状况,重点讨论了基于结构类的虚拟筛选方法,特别是分子对接方法.在药物发现过程中,这些方法除了在早期的从数据库到命中阶段可节省费用外,还能提供其他有用信息吗?本综述试图通过探究大量现有对接方法的优缺点来回答这一问...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Dongrong Yi Quanjie Li 等 《药学学报（英文版）》 2022年12卷12期 4378-4389页
【摘要】 Ebola virus(EBOV)infection leads to staggeringly high mortality rate.Effective and low-cost treatments are urgently need...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《中国药理学报（英文版）》 2014年35卷10期 1333-1341页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【关键词】 estrogen receptor； subtype-selective ligand； estradiol；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Quanjie Li Dongrong Yi 等 《药学学报（英文版）》 2021年11卷6期 1555-1567页
【摘要】 Severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) has become one major threat to human population health.The ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 邓华 高超 等 《中国药学（英文版）》 2020年29卷6期 383-389页ISTICCSCDCA
【摘要】 三阴性乳腺癌是乳腺癌中最具侵略性的亚型,经常对化疗药物产生耐药性.靶向该肿瘤相关基因的G-四链体结构,有望开发出新的抗肿瘤药物.本研究靶向21-mer端粒G-四链体结构,通过基于结构的高通量虚拟筛选,得到可稳定端粒G-四链体的化合物VB07...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Jiaqi Wang Yonghua Zhu 等 《药学学报（英文版）》 2020年10卷4期 603-614页
【摘要】 Pancreatic cancer is one of the most aggressive cancers with poor prognosis and a low 5-year survival rate.The family of...
【关键词】 PAK1；Pancreatic cancer；Inhibitor；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《药学学报（英文版）》 2019年9卷3期 537-544页
【摘要】 We report in this study the identification of a natural product-like antagonist (1a) of Vps34 as a potent autophagy modu...
【关键词】 Autophagy；Natural products；Vps34；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Xue-ping Hu Liu Yang 等 《中国药理学报（英文版）》 2022年43卷6期 1605-1615页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Decaprenylphosphoryl-β-D-ribose oxidase(DprE1)plays important roles in the biosynthesis of mycobacterium cell wall.DprE1...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨志瑜 吕炜 等 《中国药学（英文版）》 2009年18卷2期 151-155页ISTICCSCDCA
【摘要】 5-HT1A是治疗焦虑症、抑郁症和疼痛等精神类疾病的重要靶点.近年来寻找5-HT1A受体配体以及相关药物的发现,一直是研究的热点.本文首先采用同源模建的方法构建了一个5-HT1A受体模型,并通过与MP349进行分子对接研究,得到了一个可靠的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 José Alixandre de Sousa Luis ; Renata Priscila Costa Barros ; 等 2021年21卷18期 2657-2730页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Natural products;natural products databases;virtual screening;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Fenila Christopher ; Elden Berla Thangam ; 等 《Chemical biology and drug design》 2012年79卷5期 749-759页
【关键词】 Histamine H4 receptor;Antagonist;structure-based drug design;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Bajusz, David ; Ferenczy, Gyorgy G. ; 等 《Current topics in medicinal chemistry》 2017年17卷20期 2235-2259页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Drug discovery;Kinase;Structure-based virtual screening;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 《Biotechnology & Biotechnological Equipment》 2008年22卷1期 634-638页
【关键词】 virtual screening;structure-based drug design;docking;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Lokwani, Deepak ; Azad, Rajaram ; 等 《Bioorganic and medicinal chemistry》 2015年23卷15期 4533-4543页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Spyrakis, Francesca ; Cavasotto, Claudio N. ; 《Archives of Biochemistry and Biophysics》 2015年583卷 105-119页SCISCIE
【关键词】 Structure-based drug discovery;Homology modeling;Ligand docking;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Chao Shen ; Zhe Wang ; 等 2020年21卷1期 282-297页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 molecular docking;virtual screening;type II kinase inhibitors;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Haribalaganesh, R ; Rosy, J Christina ; 等 《Indian Journal of Biotechnology》 2018年17卷1期 176-184页
【关键词】 Antiviral drug;Ebola;Structure-based virtual screening;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Lavecchia,A. ; Giovanni,C.D. ; 《Current medicinal chemistry》 2013年20卷23期 2839-2860页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Biologically relevant chemical space;Chemogenomics;Computational methods;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Emilse S. Leal ; M. Gabriela Aucar ; 等 《Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters》 2017年27卷16期 3851-3855页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Envelope protein;Structure-based drug design;Virtual screening;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 da Silva, Iasmin Ramos ; Parise, Michelle Rocha ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2021年39卷15/16期 5872-5891页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Parkinson's disease;catechol-O-methyltransferase;molecular dynamics;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Masood Aleeyar ; Hamid Moghimi ; 等 2021年17卷6期 560-573页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Jiang, Mingjian ; Wei, Zhiqiang ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2019年93卷
【关键词】 Protein binding site prediction;Pocket prediction;Structure-based drug design;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Bassetto, Marcella ; Leyssen, Pieter ; 等 《European Journal of Medicinal Chemistry: Chimie Therapeutique》 2016年123卷 31-47页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Structure-based virtual screening;Substituted thieno-pyrimidines;Anti-HCV activity;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Costantino, Gabriele ; 《Expert opinion on drug discovery》 2014年9卷12期 1487-1489页
【关键词】 computational approaches;ligand-based;molecular dynamics;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Aina Bellver‐Sanchis ; Bhanwar Singh Choudhary ; 等 《ChemMedChem》 2022年17卷13期 202200002-1-202200002-10页
【关键词】 Alzheimer's disease;epigenetics;G9a methyltransferase;
- 概要：
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【外文期刊】 Perez-Sianes, Javier ; Perez-Sanchez, Horacio ; 等 《Current computer-aided drug design》 2019年15卷1期 6-28页
【关键词】 Drug discovery;virtual screening;structure-based virtual screening;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Hao Peng Sun ; Jia Zhu ; 等 《Molecular informatics》 2011年30卷6/7期 579-592页
【关键词】 Protein kinase CK2 inhibitor;Structure-based pharmacophore;Shape;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Jike Wang ; Dongsheng Cao ; 等 2021年22卷3期 bbaa183-1-bbaa183-11页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 atomic charge;deep learning;graph convolutional network;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Ramasamy, Thilagavathi ; Selvam, Chelliah ; 《Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters》 2015年25卷20期 4632-4636页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Rastelli,G. ; 《Pharmaceutical research》 2013年30卷5期 1458-1463页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Dmitry I. Osolodkin ; Vladimir A. Palyulin ; 等 《Chemical biology and drug design》 2011年78卷3期 378-390页
【关键词】 chemoinformatics;glycogen synthase kinase 3b;scoring functions;
- 概要：
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【外文期刊】 Dong, Yawen ; Jiang, Xi ; 等 《Journal of Agricultural and Food Chemistry》 2018年66卷13期 3351-3357页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 chitinase;inhibitors;fragment;
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【外文期刊】 Wang, H. ; Blais, J. ; 等 《Chemical biology and drug design》 2010年76卷6期 480-495页
【关键词】 Kinase;Molecular modeling;Phosphatase;
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【外文期刊】 Wang, Tao ; Wu, Mian-Bin ; 等 《Current topics in medicinal chemistry》 2016年16卷9期 901-916页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Structure-based drug design;Virtual screening;de novo design;
- 概要：
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【外文期刊】 Qu, Hongyan ; Shan, Kai ; 等 《European Journal of Medicinal Chemistry: Chimie Therapeutique》 2021年219卷 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Fatty acid synthase inhibitor;Structure-based virtual screening;S-phase arrest;
- 概要：
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【外文期刊】 Munack, S. ; Leroux, V. ; 等 《Chemistry & biodiversity》 2012年9卷11期 2507-2527页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Jalili-Nik, Mohammad ; Soltani, Arash ; 等 2024年20卷1期 72-86页
【关键词】 HTLV-1;integrase;virtual screening;
- 概要：
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【外文期刊】 Nisthul, A. Amrutha ; Archana, P. R. ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2021年105卷
【关键词】 Molecular docking;Structure-based virtual screening;Fatty acid synthase;
- 概要：
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【外文期刊】 Rongjun He ; Li-Fan Zeng ; 等 《The FEBS journal》 2013年280卷2期 731-750页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 chemical probes;fragment-based focus library;high-throughput screening;
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Sharath Golla ; Brian J. Neely ; 等 《Chemical biology and drug design》 2012年79卷4期 478-487页
【关键词】 drug design;structure-based drug design;virtual screening;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Orazio Nicolotti ; Giovanna Ilaria Passeri ; 等 《International journal of quantitative structure-property relationships》 2018年3卷1期 134-160页
【关键词】 Drug Discovery;Ligand- and Structure-based Approaches;Molecular Database;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Beautrait A ; Leroux V ; 等 《Journal of molecular modeling》 2008年14卷2期 135-148页SCISCIE
【关键词】 multiple-step virtual screening;VSM-G;structure-based drug design;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Rastelli,G. ; Anighoro,A. ; 等 《Cell cycle》 2014年13卷14期 2296-2305页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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- 结论：
【外文期刊】 Patrick McCarren ; Michelle L. Hall ; 等 《Chemical biology and drug design》 2012年80卷2期 203-214页
【关键词】 molecular modeling;structure-based drug design;virtual screening;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Araki, Mitsugu ; Kanda, Naoto ; 等 《Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters》 2020年30卷11期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 TRPA1;Non-electrophilic agonists;Structure-based virtual screening;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Vidhya R. ; Anbumani V.I. ; 等 2022年40卷7/8期 3451-3461页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Human neutrophil elastase;phytochemicals;structure-based virtual screening;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Adamu, Rahma Muhammad ; Majumdhar, Rita Singh ; 等 《Letters in drug design & discovery》 2021年18卷9期 932-942页
- 概要：
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