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            1. A timeline for terrestrialization: consequences for the carbon cycle in the Palaeozoic

            【外文期刊】 Paul Kenrick ; Charles H. Wellman ; 等 《Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B. Biological Sciences》 2012年367卷1588期 519-536页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 plants; fossil; arthropods;

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            2. Phylogenomic reappraisal of the Neotropical catfish family Loricariidae (Teleostei: Siluriformes) using ultraconserved elements

            【外文期刊】 Roxo, Fabio F. ; Ochoa, Luz E. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2019年135卷 148-165页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Cascudos; Neotropics; Phylogenomics;

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            3. A preliminary phylogeny of the Palearctic naked-toed geckos (Reptilia: Squamata: Gekkonidae) with taxonomic implications

            【外文期刊】 AARON M. BAUER ; RAFAQAT MASROOR ; 等 《Zootaxa》 2013年3599期 301-324页

            【关键词】 Cyrtopodion; Tenuidactylus; Mediodactylus;

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            4. Molecular Memories of a Cambrian Fossil

            【外文期刊】 Babaian, Caryn ; Kumar, Sudhir ; 《The American Biology Teacher: Journal of the National Association of Biology Teachers》 2020年82卷9期 586-595页

            【关键词】 Cambrian fossil; molecular characters; arthropods;

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            5. A Thermodynamic Model for Water Activity and Redox Potential in Evolution and Development

            【外文期刊】 Dick, Jeffrey M. ; 2022年90卷2期 182-199页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Geochemical biology; Protein evolution; Biofilm development;

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            6. Prospects for Building Large Timetrees Using Molecular Data with Incomplete Gene Coverage among Species

            【外文期刊】 Alan Filipski ; Oscar Murillo ; 等 《Molecular biology and evolution》 2014年31卷9期 2542-2550页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 divergence time; timetree; incomplete data;

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            7. Tree of Life Reveals Clock-Like Speciation and Diversification

            【外文期刊】 Hedges, S. Blair ; Marin, Julie ; 等 《Molecular biology and evolution》 2015年32卷4期 835-845页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 biodiversity; diversification; speciation;

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            8. An updated paleontological timetree of lissamphibians, with comments on the anatomy of Jurassic crown-group salamanders (Urodela)

            【外文期刊】 David Marjanovi? ; Michel Laurin ; 《Historical Biology: an international journal of paleobiology》 2014年26卷4期 535-550页

            【关键词】 Lissamphibia; Caudata; Urodela;

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            9. Theoretical Foundation of the RelTime Method for Estimating Divergence Times from Variable Evolutionary Rates

            【外文期刊】 Tamura, Koichiro ; Tao, Qiqing ; 等 《Molecular biology and evolution》 2018年35卷7期 1770-1782页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 divergence times; timetree; evolution;

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            10. Deciphering reticulate evolution of the largest group of polyploid vertebrates, the subfamily cyprininae (Teleostei: Cypriniformes)

            【外文期刊】 Yang, Lei ; Naylor, Gavin J. P. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2022年166卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Fish; Hexaploid; Tetraploid;

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            11. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets

            【外文期刊】 Kumar, Sudhir ; Stecher, Glen ; 等 《Molecular biology and evolution》 2016年33卷7期 1870-1874页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 gene families; timetree; software;

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            12. Molecular clocks and the early evolution of metazoan nervous systems

            【外文期刊】 Wray, Gregory A. ; 《Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B. Biological Sciences》 2015年370卷1684期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 molecular clock; divergence time; timetree;

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            13. Adventures in Evolution: The Narrative of Tardigrada, Trundlers in Time

            【外文期刊】 Babaian, Caryn ; Kumar, Sudhir ; 《The American Biology Teacher: Journal of the National Association of Biology Teachers》 2019年81卷8期 543-552页

            【关键词】 Tardigrada; storytelling; TimeTree;

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            14. Inadvertent Paralog Inclusion Drives Artifactual Topologies and Timetree Estimates in Phylogenomics

            【外文期刊】 Siu-Ting, Karen ; Torres-Sanchez, Maria ; 等 《Molecular biology and evolution》 2019年36卷6期 1344-1356页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 phylogenomics; orthology; paralogy;

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            15. Adventures in Evolution: The Narrative of Tardigrada, Trundlers in Time. oa

            【外文期刊】 Caryn,Babaian ; Sudhir,Kumar ; 《The American biology teacher》 2019年81卷8期 543-552页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Tardigrada; TimeTree; adaptive radiation;

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            16. The Making of Calibration Sausage Exemplified by Recalibrating the Transcriptomic Timetree of Jawed Vertebrates.

            【外文期刊】 David,Marjanović ; 《Frontiers in genetics》 2021年12卷 521693页

            【关键词】 calibration; divergence date; fossil record;

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            17. Molecular phylogeny of marine mites (Acariformes: Halacaridae), the oldest radiation of extant secondarily marine animals.

            【外文期刊】 Almir R,Pepato ; Teofânia H D A,Vidigal ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2018年129卷 182-188页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Algivory; Marine-freshwater transitions; Rhombognathinae;

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            18. Limitations of Phylogenomic Data Can Drive Inferred Speciation Rate Shifts. oa

            【外文期刊】 Jack M,Craig ; Sudhir,Kumar ; 等 《Molecular biology and evolution》 2022年39卷3期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 biodiversity; diversification; speciation;

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            19. Enlarged Multilocus Data set Provides Surprisingly Younger Time of Origin for the Plethodontidae, the Largest Family of Salamanders.

            【外文期刊】 Xing-Xing,Shen ; Dan,Liang ; 等 《Systematic biology》 2016年65卷1期 66-81页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Dispersal; molecular dating; paleogeography;

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            20. Molecular clocks and the early evolution of metazoan nervous systems. oa

            【外文期刊】 Gregory A,Wray ; 《Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences》 2015年370卷1684期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Cambrian explosion; divergence time; metazoan evolution;

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            21. Identification of Structural and Morphogenesis Genes of Sulfitobacter Phage ΦGT1 and Placement within the Evolutionary History of the Podoviruses. oa

            【外文期刊】 Stephen C,Hardies ; Byung Cheol,Cho ; 等 《Viruses》 2023年15卷7期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 bacteriophage evolution; marine virus; podovirus;

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            22. Phylogenomic reappraisal of the Neotropical catfish family Loricariidae (Teleostei: Siluriformes) using ultraconserved elements.

            【外文期刊】 Fábio F,Roxo ; Luz E,Ochoa ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2019年135卷 148-165页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Biodiversity; Cascudos; Neotropics;

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            23. Prospects for building large timetrees using molecular data with incomplete gene coverage among species. oa

            【外文期刊】 Alan,Filipski ; Oscar,Murillo ; 等 《Molecular biology and evolution》 2014年31卷9期 2542-50页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 divergence time; incomplete data; timetree;

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            24. The Timetree of Prokaryotes: New Insights into Their Evolution and Speciation.

            【外文期刊】 Julie,Marin ; Fabia U,Battistuzzi ; 等 《Molecular biology and evolution》 2017年34卷2期 437-446页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 diversification; evolution; prokaryote;

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            25. Molecular timetrees using relaxed clocks and uncertain phylogenies.

            【外文期刊】 Jose,Barba-Montoya ; Sudip,Sharma ; 等 《Frontiers in bioinformatics》 2023年3卷 1225807页

            【关键词】 bootstrap; phylogenetic uncertainty; phylogenomics;

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            26. Using the Fossil Record to Evaluate Timetree Timescales.

            【外文期刊】 Charles R,Marshall ; 《Frontiers in genetics》 2019年10卷 1049页

            【关键词】 absolute time; calibration; cladogram;

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            27. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets. oa

            【外文期刊】 Sudhir,Kumar ; Glen,Stecher ; 等 《Molecular biology and evolution》 2016年33卷7期 1870-4页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 evolution.; gene families; software;

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            28. Inadvertent Paralog Inclusion Drives Artifactual Topologies and Timetree Estimates in Phylogenomics. oa

            【外文期刊】 Karen,Siu-Ting ; María,Torres-Sánchez ; 等 《Molecular biology and evolution》 2019年36卷6期 1344-1356页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Lissamphibia; orthology; paralogy;

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            29. A Machine Learning Method for Detecting Autocorrelation of Evolutionary Rates in Large Phylogenies. oa

            【外文期刊】 Qiqing,Tao ; Koichiro,Tamura ; 等 《Molecular biology and evolution》 2019年36卷4期 811-824页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 TimeTree; phylogenomics; rate autocorrelation;

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            30. TimeTree: A Resource for Timelines, Timetrees, and Divergence Times.

            【外文期刊】 Sudhir,Kumar ; Glen,Stecher ; 等 《Molecular biology and evolution》 2017年34卷7期 1812-1819页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 database; divergence time; software;

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            31. On the fossil record of the Gekkota.

            【外文期刊】 Juan D,Daza ; Aaron M,Bauer ; 等 《Anatomical record (Hoboken, N.J. : 2007)》 2014年297卷3期 433-62页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Gekkonoidea; Pygopodoidea; paleontology;

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            32. Fast and Accurate Estimates of Divergence Times from Big Data.

            【外文期刊】 Beatriz,Mello ; Qiqing,Tao ; 等 《Molecular biology and evolution》 2017年34卷1期 45-50页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Bayesian; computational time; molecular clocks;

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            33. Evolutionary History of the Asian Horned Frogs (Megophryinae): Integrative Approaches to Timetree Dating in the Absence of a Fossil Record.

            【外文期刊】 Stephen,Mahony ; Nicole M,Foley ; 等 《Molecular biology and evolution》 2017年34卷3期 744-771页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Asia.; India; Megophryidae;

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            34. Quantifying the Error of Secondary vs. Distant Primary Calibrations in a Simulated Environment.

            【外文期刊】 Christopher Lowell Edward,Powell ; Sydney,Waskin ; 等 《Frontiers in genetics》 2020年11卷 252页

            【关键词】 confidence interval; divergence times; molecular clocks;

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            35. A mitogenomic phylogeny of chitons (Mollusca: Polyplacophora). oa

            【外文期刊】 Iker,Irisarri ; Juan E,Uribe ; 等 《BMC evolutionary biology》 2020年20卷1期 22页 MEDLINE

            【关键词】 Bayesian; Evolution; Fossil;

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            36. Deciphering reticulate evolution of the largest group of polyploid vertebrates, the subfamily cyprininae (Teleostei: Cypriniformes).

            【外文期刊】 Lei,Yang ; Gavin J P,Naylor ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2022年166卷 107323页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Fish; Hexaploid; Tetraploid;

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            37. Tree of life reveals clock-like speciation and diversification. oa

            【外文期刊】 S Blair,Hedges ; Julie,Marin ; 等 《Molecular biology and evolution》 2015年32卷4期 835-45页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 biodiversity; diversification; speciation;

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            38. The measure of success: geographic isolation promotes diversification in Pachydactylus geckos. oa

            【外文期刊】 Matthew P,Heinicke ; Todd R,Jackman ; 等 《BMC evolutionary biology》 2017年17卷1期 9页 MEDLINE

            【关键词】 Allopatry; Ancestral reconstruction; Biogeography;

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            39. The evolutionary history of bees in time and space.

            【外文期刊】 Eduardo A B,Almeida ; Silas,Bossert ; 等 《Current biology : CB》 2023年33卷16期 3409-3422.e6页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Apoidea; Gondwana; Hymenoptera;

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            40. A time-calibrated phylogeny of the diversification of Holoadeninae frogs.

            【外文期刊】 Júlio C M,Chaves ; Fábio,Hepp ; 等 《Frontiers in bioinformatics》 2024年4卷 1441373页

            【关键词】 Anura; MCMCTree; Neobatrachia;

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            41. Molecular Memories of a Cambrian Fossil. oa

            【外文期刊】 Caryn,Babaian ; Sudhir,Kumar ; 《The American biology teacher》 586-595页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Cambrian fossil; TimeTree; arthropods;

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            42. The origin and evolution of shrews (Soricidae, Mammalia). oa

            【外文期刊】 Haobo,Yuan ; Ephriam D,Dickson ; 等 《Proceedings. Biological sciences》 2024年291卷2037期 20241856页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 crocidurinae; dental pigmentation; mosaic evolution;

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            43. Ancient divergence time estimates in Eutropis rugifera support the existence of Pleistocene barriers on the exposed Sunda Shelf.

            【外文期刊】 Benjamin R,Karin ; Indraneil,Das ; 等 《PeerJ》 2017年5卷 e3762页

            【关键词】 Borneo; Phylogeography; Rough-scaled sun skink;

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            44. A review of the fossil record of caecilians (Lissamphibia: Gymnophionomorpha) with comments on its use to calibrate molecular timetrees

            【外文期刊】 Santos, Rodolfo Otavio ; Laurin, Michel ; 等 《Biological Journal of the Linnean Society》 2020年131卷4期 737-755页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 amphibians; caecilians; fossils;

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            45. Molecular phylogeny of marine mites (Acariformes: Halacaridae), the oldest radiation of extant secondarily marine animals

            【外文期刊】 Pepato, Almir R. ; Vidigal, Teofania H. D. A. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2018年129卷 182-188页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Algivory; Rhombognathinae; Timetree;

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            46. TimeTree: A Resource for Timelines, Timetrees, and Divergence Times

            【外文期刊】 Kumar, Sudhir ; Stecher, Glen ; 等 《Systematic and Applied Microbiology》 2017年40卷3期 1812-1819页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 database; software; divergence time;

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            47. Morphology and Bayesian tip-dating recover deep Cretaceous-age divergences among major chrysidid lineages (Hymenoptera: Chrysididae)

            【外文期刊】 Lucena, Daercio A. A. ; Almeida, Eduardo A. B. ; 2022年194卷1期 36-79页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Amiseginae; Bayesian relaxed clock; biogeography;

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            48. Phylogeny of Micronesian emperor fishes and evolution of trophic types

            【外文期刊】 Fabian, Vince ; Houk, Peter ; 等 2021年162卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Lethrinidae; Lethrinus; mitochondrial DNA;

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            49. Time Travel and the Naturalist's Notebook: Vladimir Nabokov Meets the TimeTree of Life

            【外文期刊】 Babaian, Caryn ; 《The American Biology Teacher: Journal of the National Association of Biology Teachers》 2018年80卷9期 650-658页

            【关键词】 drawing-for-evolution; TimeTree of Life; naturalists;

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            50. Molecular phylogeny and divergence times of deuterostome animals

            【外文期刊】 Blair JE ; Hedges SB ; 《Molecular biology and evolution》 2005年22卷11期 2275-2284页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 molecular clock; timetree; genomes;

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