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【中文期刊】 LI Min ZHANG Yu Lan 等 《生物医学与环境科学(英文版)》 2024年37卷5期 503-510页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Objective VATER/VACTERL-like association is associated with adverse pregnancy outcomes.Genetic evidence of this disorder...
【中文期刊】 Teruhiko Yoshida Yasushi Yatabe 等 《癌症生物学与医学(英文版)》 2024年21卷1期 29-44页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The journey to implement cancer genomic medicine(CGM)in oncology practice began in the 1980s,which is considered the daw...
【关键词】 Cancer genomic medicine; biobank; patient-derived xenograft;
【中文期刊】 FAN Yu Feng LIU Dong Xin 等 《生物医学与环境科学(英文版)》 2024年37卷2期 157-169页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Objective China is among the 30 countries with a high burden of tuberculosis(TB)worldwide,and TB remains a public health...
【关键词】 Mycobacterium tuberculosis; Whole-genome sequencing(WGS); Transmission;
【中文期刊】 孙景昱 赵薇 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷2期 104-110页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 了解吉林省食品中沙门氏菌的分布情况和耐药基因特征,为防控食源性疾病提供科学依据.方法 对2022年吉林省食品中61株沙门菌,采用微量肉汤稀释法进行25种抗生素耐药性试验.利用全基因组测序技术及生物信息学方法对菌株耐药基因进行分析.结果...
【中文期刊】 雷卉 张书 等 《中国防痨杂志》 2024年46卷6期 641-647页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:分析复发肺结核患者感染模式和耐药信息,为结核病患者治疗及防控提供科学依据.方法:采用前瞻性研究方法,参照入组标准从四川省峨眉山市、绵阳市涪城区和江油市3个耐药监测点收集2012-2021年肺结核患者分枝杆菌培养阳性菌株2207株,剔除...
【中文期刊】 李俊霖 胡家萌 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷8期 701-707页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 了解鸭源肠致病性大肠杆菌(EPEC)的耐药情况及全基因组特征,探究鸭源EPEC的致病潜力,为临床治疗提供理论基础.方法 PCR鉴定出EPEC分离株,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验,并对其进行全基因组测序,分析EPEC的血清型、ST型、...
【中文期刊】 周燕霞 郭辉 《中国抗生素杂志》 2024年49卷6期 700-704页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 分析1株多黏菌素和替加环素均耐药的肺炎克雷伯菌基因组特征.方法 肺炎克雷伯菌KP2016分离自我院临床痰液标本.采用微量肉汤稀释法测定KP2016对亚胺培南、美罗培南、多黏菌素和替加环素的最低抑菌浓度.对菌株进行第二代Illumina...
【中文期刊】 刘佳俊 何冬梅 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷10期 950-958页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 了解2020-2022年广东省儿童感染空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的检出率、耐药特征、毒力特征及多位点序列分型等分子流行特征和病原学特征.方法 在广东省广州市2家医院采集2020-2022年疑似感染儿童病例的肛拭子或粪便样本,过滤法分离培养...
【中文期刊】 柯自立 张小玄 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷8期 708-715页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 了解福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征,为深入开展霍乱分子流行病学研究提供依据.方法 收集2008-2022年福建省霍乱病例和带菌者来源O1群霍乱弧菌16株,肉汤稀释法检测抗生素最小抑菌浓度(MIC).运用二代测序技术得到全基因组序...
【中文期刊】 黄枝妙 翁育伟 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷10期 944-949页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 比较扩增子与宏基因组测序在猴痘病毒全基因组测序考核中的应用效果,为猴痘病毒测序溯源与疫情防控提供技术参考.方法 扩增子测序:对猴痘DNA先进行全基因组靶向扩增,再对扩增产物进行二代测序;宏基因组测序:对猴痘DNA直接进行二代测序.获得...
【中文期刊】 季琰 孟楠 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷12期 1134-1139页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 调查健康人粪便中携带blaCTX-M基因的解鸟氨酸拉乌尔菌的存在情况,并阐明其传播机制.方法 从扬州市采集健康人粪便309份,经LB增菌后,在含有2 mg/L头孢噻肟的麦康凯肌醇阿东醇羧苄青霉素平板上筛选阳性菌落,PCR检测blaCT...
【中文期刊】 王鹏 周乐乐 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷12期 1146-1151页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对北京某区羊携带产志贺毒素大肠埃希菌(STEC)情况和病原特征进行分析,为STEC感染风险评估、溯源调查及科学防控提供支持.方法 采集北京市某区散养羊粪便标本并进行STEC分离培养,对分离菌株进行15种抗生素耐药性检测和全基因组测序,...
【关键词】 产志贺毒素大肠埃希菌; 基因组测序; 分子分型;
【中文期刊】 郑恩惠 邱玉锋 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷1期 31-39页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 构建ICR小鼠感染模型研究特勒凯比尔血清型沙门菌的致病力,对小鼠分离株进行病原学鉴定.方法 通过感染小鼠临床症状、组织病理学、组织细菌载量等的变化,观察排菌周期,评价该血清型沙门菌对小鼠的致病性,计算小鼠LD50;通过飞行质谱、生化鉴...
【中文期刊】 林兴雨 尹新明 等 《昆虫学报》 2024年67卷10期 1428-1438页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]基于低覆盖度全基因组测序数据和转录组数据重新构建蜡蝉总科(Fulgoroidea)高阶元类群之间的系统发育关系,为理解蜡蝉总科的系统发育关系提供基因组数据.[方法]利用二代测序技术获得了蛾蜡蝉科蜡蝉Flatidasp.1种的低覆盖度...
【中文期刊】 杨欣欣 陈智伟 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷4期 384-390页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对福建省福州市M区1起由进口冷链产品引起的新型冠状病毒暴发疫情进行溯源及基因序列分析.方法 收集2022年9月6日至9月9日期间M区新冠疫情中全部感染者(8名)以及1份阳性冷链产品样本拭子,进行流行病学调查,对采集到的样本进行实时荧光...
【中文期刊】 黄雅轩 蔡依含 等 《中南大学学报(医学版)》 2024年49卷5期 730-736页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)携带的耐药基因会限制临床用药选择,其毒力基因也会严重影响患者预后.本研究旨在探讨重症监护室(intensive ...
【关键词】 重症监护室; 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌; 全基因组测序;
【中文期刊】 杨毅 胡海 等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷11期 1042-1048页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析2018-2021年乌鲁木齐市鼠伤寒沙门菌(S.1,4,[5],12:i:1,2)的基因组特征,为该菌的流行监测及引起的疫情处置提供依据.方法 收集26株乌鲁木齐市肠道门诊监测腹泻样本分离的鼠伤寒沙门菌,利用全基因组测序(WGS)...
【中文期刊】 聂俊伟 周璐 等 《中国感染控制杂志》 2024年23卷4期 467-474页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 了解江苏地区临床分离的铜绿假单胞菌耐药情况及基因特征.方法 收集2016-2021年江苏地区各哨点医院临床分离的铜绿假单胞菌,采用肉汤稀释法对分离株进行10类19种抗菌药物的敏感性测定,对分离株行全基因组测序并多位点序列分型,综合抗菌...
【中文期刊】 张域琪 王娟 等 《西安交通大学学报(医学版)》 2024年45卷6期 885-894页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 了解引起化脓性肝脓肿(pyogenic liver abscess,PLA)的高毒力肺炎克雷伯菌(Hypervirulent Klebsiella pneumoniae,hvKp)的耐药机制、毒力特征及致病作用,同时为该细菌临床抗感染...
【关键词】 高毒力肺炎克雷伯菌(hvKp); 全基因组测序; 耐药性;
【中文期刊】 马海霞 冯丽云 等 《检验医学与临床》 2024年21卷4期 507-510页 ISTICCA
【摘要】 目的 探讨染色体核型分析与全基因组拷贝数变异测序(CNV-Seq)技术在高龄孕妇产前诊断中联合应用的意义.方法 对2020年1月至2022年12月该院收治的723例高龄孕妇的羊水细胞染色体核型分析、CNV-Seq检测结果进行回顾性分析.结果...
【关键词】 染色体核型分析; 全基因组拷贝数变异测序; 高龄;
【中文期刊】 董浩 赵明海 等 《实验动物科学》 2024年41卷1期 70-76页 ISTIC
【摘要】 目的 揭示一株从腹泻实验兔中分离到的肠致病性大肠埃希菌 ILAREc-01 的基因组特征、毒力基因和耐药基因分布情况.方法 采用高通量测序法对基因组序列进行测定,采用 VFDB、ARDB、CAZy、SWISS-PROT、COG、CARD、K...
【中文期刊】 王芳 刘晓 等 《检验医学与临床》 2024年21卷24期 3631-3636页 ISTICCA
【摘要】 目的 分析马鞍山市临床检验中心临床培养分离的金黄色葡萄球菌的标本来源、耐药性及毒力基因的特征.方法 以马鞍山市临床检验中心2022年收集的98株金黄色葡萄球菌作为研究对象,使用VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定药敏分析仪检测耐药...
【关键词】 金黄色葡萄球菌; 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌; 肠毒素基因;
【中文期刊】 戚艳 李川 等 《青岛大学学报(医学版)》 2024年60卷4期 591-594页 ISTICCA
【摘要】 目的 探讨肺泡灌洗液(BALF)行宏基因组二代测序技术(mNGS)检测在肺部感染病人分枝杆菌诊断中的应用价值.方法 回顾性分析2021年10月—2023年4月在青岛大学附属医院呼吸科因肺部感染住院的281例病人临床资料和BALF病原体检出情...
【中文期刊】 谢佳宜 杨雪梅 等 《生命科学研究》 2024年28卷5期 437-443页 ISTICCA
【摘要】 致瘿昆虫体内高含量植物激素的来源尚不清楚.为探究细菌对栗瘿蜂(Drycosmusk kuriphilus)体内生长素合成的潜在影响,通过平板培养法分离出栗瘿蜂体内的两株细菌,即芽孢杆菌DK01(Bacillus sp.)和鞘氨醇杆菌DK02...
【关键词】 栗瘿蜂; 生长素; 高效液相色谱-质谱技术(HPLC-MS);
【中文期刊】 姚淑雯 邹洁 等 《检验医学与临床》 2024年21卷3期 289-293页 ISTICCA
【摘要】 目的 比较广州地区腹泻和健康非腹泻人群粪便中产气荚膜梭菌的检出率和序列分型的差异.方法 此项前瞻性研究共收集了广州医科大学附属妇女儿童医疗中心2021年10-12月诊断为腹泻和健康非腹泻人群的粪便标本和腹泻患者大便肛管保存液标本296例,按...
【中文期刊】 朱鑫超 陆定其 等 《浙江中医药大学学报》 2024年48卷5期 530-540页 ISTIC
【摘要】 [目的]评价益气养阴祛瘀方治疗原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)的疗效,并通过全基因组甲基化测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术研究中医药疗效...
【中文期刊】 张新 吕冰 等 《首都公共卫生》 2024年18卷3期 144-149页 ISTIC
【摘要】 目的 了解北京市肠出血性大肠埃希菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)分子特征及流行趋势.方法 收集2014-2022年北京市肠道门诊分离到的肠出血性大肠埃希菌,通过药敏试验及全基因组测序及数据...
【中文期刊】 孙夏瑜 武坚锐 等 《检验医学与临床》 2024年21卷23期 3537-3540页 ISTICCA
【摘要】 目的 应用多种遗传学技术检测诊断400例性发育异常(DSD)患者的遗传学病因,并总结分析其临床特征.方法 选取2018年1月至2023年3月该院收治的400例确诊为DSD的患者作为研究对象,运用G-显带染色体核型分析、荧光原位杂交(FISH...
【关键词】 性发育异常; 遗传学病因; G-显带染色体核型分析;
【中文期刊】 Cen Guo Yang Luo 等 《植物学报(英文版)》 2023年65卷2期 299-323页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The advances accelerated by next-generation se-quencing and long-read sequencing technologies continue to provide an imp...
【关键词】 angiosperms; hybridization; incomplete lineage sorting;
【中文期刊】 ZHANG Wei Wei ZHU Xiao Lin 等 《生物医学与环境科学(英文版)》 2023年36卷5期 406-417页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Objective To explore the genotyping characteristics of human fecal Escherichia coli (E. coli) and the relationships betw...
【关键词】 E.coli; Multidrug resistance; Whole-genome sequencing;
【中文期刊】 梅金周 王云霞 等 《新发传染病电子杂志》 2024年9卷3期 16-20页
【摘要】 目的 评价全基因组测序技术在耐药肺结核诊断中的应用价值,为耐药肺结核的早期诊断提供参考.方法 以2019年1月1日至2021年12月31日深圳市宝安区结核病定点医院确诊登记肺结核患者,痰培养阳性结核分枝杆菌菌株的8种抗结核药物表型药敏试验结...
【中文期刊】 宋祥彬 赵晓雨 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷1期 407-416页
【摘要】 [目的]分析山东省禽源产超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrum β-lactamases,ESBLs)大肠杆菌的耐药情况、耐药机制、毒力基因、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、...
【中文期刊】 徐媛 徐继平 等 《畜牧兽医杂志》 2024年43卷5期 1-7,23页
【摘要】 本研究基于全基因组重测序数据,以全球76个马品种共406匹马为研究对象,采用主成分分析、系统发育树和祖先成分分析三种方法,在遗传学层面综合评估了现代马群体的遗传结构.此外,以核苷酸多样性为指标对现代马群体的遗传多样性进行了评估,并运用Fst...
【中文期刊】 Jun-Jun Qiu Xing-Yu Chang 等 《世界儿科杂志(英文版)》 2024年20卷11期 1179-1195页
【摘要】 Background Congenital malformations of the female genital tract(CM-FGT)are characterized by abnormal development of the ...
【关键词】 Copy number variant; Congenital malformations of the female genital tract; Single nucleotide variants;
【中文期刊】 王娟 刘俊辉 等 《中国动物检疫》 2024年41卷11期 111-117,128页
【摘要】 为探索控制弯曲菌污染的新途径,以弯曲菌NCTC12662 为宿主菌,从养殖场鸡粪便中分离纯化得到弯曲菌噬菌体,并对其进行电镜形态特征观察、生物学特性测定与基因组学分析,同时采用棋盘法,测试噬菌体与抗生素的联合应用效果.结果显示,从山东省胶东...
【中文期刊】 焦凤超 雷震 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷7期 3030-3040页
【摘要】 [目的]试验旨在了解分离自蓝孔雀的奇异变形杆菌PM19的毒力、耐药性以及基因组特征.[方法]采用动物试验、药敏试验和PCR方法对分离菌进行毒力、耐药性以及毒力基因检测,并运用Illumina NovaSeq6000平台进行基因组框架图测序,...
【中文期刊】 任青霞 户行宇 等 《中国食品学报》 2024年24卷9期 184-193页
【摘要】 目前乳酸菌发酵产细菌素的含量较低,因此优化产细菌素的发酵条件是最直接的方式.对分离自内蒙古传统干酪的植物乳杆菌NMGL2的抗生素药敏性、溶血性以及全基因组序列进行分析,结果表明该菌株无明显毒力作用,不携带高毒力因子,抗性基因无转移风险.对植...
【关键词】 植物乳杆菌NMGL2; 全基因组测序; 安全性;
【中文期刊】 梁悦琪 张玉姣 等 《食品科学》 2024年45卷22期 34-42页
【摘要】 本研究采用二代Illumina HiSeq与三代PacBio平台相结合的全基因组测序技术,对分离自郫县豆瓣的产胞外多糖菌株贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)L-39进行全基因组测序.对B.velezensis L-39...
【中文期刊】 马征 翟卫帅 等 《中国兽医杂志》 2024年60卷5期 12-20页
【摘要】 为了解北京地区消毒剂抗性基因分布、携带情况及其与耐药基因之间的关系,本试验采集北京市6 个行政区共计39 家超市及农贸市场的猪肉和鸡肉样品,分离培养沙门菌并进行鉴定,随后结合Seqsero2、Staramr和Diamond等生物信息学软件对...
【中文期刊】 陈丽雯 黄宝莹 等 《食品安全质量检测学报》 2024年15卷5期 77-84页
【摘要】 目的 了解流通环节市售婴幼儿配方乳粉和婴幼儿米粉中的蜡样芽胞杆菌流行情况、抗生素耐药性和毒力基因等分子特征.方法 采用GB 4789.14-2014《食品安全国家标准 食品微生物学检验 蜡样芽胞杆菌检验》对样品中的蜡样芽胞杆菌进行检测与生化...
【中文期刊】 Xueyan Mo Mengcheng Zhou 等 《食品科学与人类健康(英文)》 2024年13卷4期 2048-2059页
【摘要】 The application of microorganisms as probiotics is limited due to lack of safety evaluation.Here,a novel multi-stress-to...
【关键词】 Meyerozyma guilliermondii; Safety assessment; Probiotics;
【中文期刊】 Qi Lu Pengcheng Wang 等 《鸟类学研究(英文版)》 2024年15卷1期 1-11页 CSCD
【摘要】 Population genomic data could provide valuable information for conservation efforts;however,limited studies have been co...
【中文期刊】 罗婷 韩著 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 2154-2167页
【摘要】 旨在进一步完善牛支原体全基因组数据库,阐明其生物学功能和遗传进化关系,对西藏牦牛源牛支原体T10株进行了全基因组测序及其序列分析.使用Nanopore和Illumina PE150测序平台对T10株进行全基因组序列测定,利用生物信息学对其进...
【中文期刊】 Dengfeng Ding Yuqiong Zhao 等 《动物模型与实验医学(英文)》 2024年7卷3期 377-387页
【摘要】 Background:Atherosclerosis is a chronic cardiovascular disease of great concern.However,it is difficult to establish a d...
【关键词】 atherosclerosis; candidate genes; genome-wide linkage analysis;
【中文期刊】 孙大庆 齐贺 等 《食品科学》 2024年45卷23期 113-122页
【摘要】 为探究乳酸菌果聚糖代谢机制和开发低果聚糖发酵食品,本研究对287株酸面团来源的乳酸菌进行果聚糖利用能力筛选,获得1株嗜果聚糖乳酸菌19M03,之后利用高通量测序和生物信息学技术对该菌株进行全基因组测序和果聚糖代谢机制分析.测序结果表明,菌株...
【中文期刊】 李颖 王海瑞 等 《中国人兽共患病学报》 2023年39卷6期 539-544页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析散养羊粪便中克罗诺菌的分离与种鉴定,为克罗诺菌相关风险研究奠定基础.方法 采集北京市某区农村地区散养羊粪便标本,参考GB 4789.40-2016标准进行克罗诺菌分离培养;对疑似菌株进行全自动生化鉴定、16S RNA全长序列比对分...
【中文期刊】 白飒 刘保华 等 《中国人兽共患病学报》 2023年39卷11期 1060-1064页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 从病毒基因组水平上了解3株济南市同一时期不同来源的输入性新冠病毒(SARS-CoV-2)的全基因组特征和变异情况,为进一步完善口岸新冠肺炎疫情防控工作提供科学依据.方法 选取济南市3例输入性新冠病毒感染者的鼻咽拭子样本,采用二代测序技...
【中文期刊】 于东瑾 辛蕊 等 《中国抗生素杂志》 2023年48卷7期 766-777页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 青铜小单胞菌MCCC 1K05785分离自海洋近岸沉积物.作为天然产物的来源,它同时表现出了对多种抗生素的耐药性.本研究对该菌株进行了表征,并通过对菌株进行全基因组测序,在基因水平上探索了其潜在含有的耐药相关蛋白,以明确该菌株的耐药机制.首...
【中文期刊】 Wan-Ping Lee Qihui Zhu 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2022年6期 1197-1206页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 We aimed to develop a whole-genome sequencing(WGS)-based copy number variant(CNV)calling algorithm with the potential of...
【关键词】 Copy number variant; Chromosomal microarray assay; Whole-genome sequencing;