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            1. Phylogenomic analysis of the hemp family(Cannabaceae)reveals deep cyto-nuclear discordance and provides new insights into generic relationships

            【中文期刊】 Xiao-Gang Fu Shui-Yin Liu  等 《植物分类学报》 2023年61卷5期 806-826页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【关键词】 ancient hybridization； Cannabaceae； Celtis；

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            2. 古DNA证据支持曹操的父系遗传类型属于单倍群O2

            【中文期刊】 文少卿 王传超  等 《人类学学报》 2016年35卷4期 617-625页 ISTICPKUCSCD

            【摘要】 人类Y染色体是研究父系血缘的最佳材料.得益于近年来二代测序技术的发展,以及本实验室在东亚范围内大规模的遗传调查,我们获得了大量具有区分力的Y染色体新遗传标记,并构建了约20万份含有Y-STR和Y-SNP信息的遗传数据库,从而可以根据Y-ST...

            【关键词】 曹操； 古DNA； Y染色体；

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            3. Reconstructing an ancestral mammalian immune supercomplex from a marsupial major histocompatibility complex - art. no. e46

            【外文期刊】 Belov K ; Deakin JE ; 等 《PLoS biology》 2006年4卷3期 317-328页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 MHC CLASS-I; LEUKOCYTE RECEPTOR COMPLEX; ANCIENT ALLELIC LINEAGES;

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            4. Coalescent Methods Are Robust to the Simultaneous Effects of Long Branches and Incomplete Lineage Sorting

            【外文期刊】 Liu, Liang ; Xi, Zhenxiang ; 等 《Molecular biology and evolution》 2015年32卷3期 791-805页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient rapid radiation; coalescent methods; concatenation methods;

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            5. Molecular genetic analysis of 400-year-old human remains found in two Yakut burial sites

            【外文期刊】 Ricaut FX ; Kolodesnikov S ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2006年129卷1期 55-63页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Siberia; Sakha; ancient DNA;

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            6. Mass Extinction, Gradual Cooling, or Rapid Radiation? Reconstructing the Spatiotemporal Evolution of the Ancient Angiosperm Genus Hedyosmum (Chloranthaceae) Using Empirical and Simulated Approaches

            【外文期刊】 Antonelli, Alexandre ; Sanmartin, Isabel ; 《Systematic Biology》 2011年60卷5期 596-615页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 climatic fluctuation; mass extinction; ancient lineage;

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            7. 'Endangered living fossils' (ELFs): Long-term survivors through periods of dramatic climate change

            【外文期刊】 《Environmental and experimental botany》 2020年170卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Ancient lineages; Conservation; EDGE;

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            8. Dietary spectrum in Himalayan wolves: comparative analysis of prey choice in conspecifics across high‐elevation rangelands of Asia

            【外文期刊】 Balajeid Lyngdoh S. ; Habib B. ; 等 2020年310卷1期 24-33页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Wolf diet; carnivore; himalaya;

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            9. Genomic scale data shows that Parastacus nicoleti encompasses more than one species of burrowing continental crayfishes and that lineage divergence occurred with and without gene flow

            【外文期刊】 Amador, Luis ; Leache, Adam D. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2022年169卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Allopatry; Ancient lineages; Chilean Valdivian Forests;

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            10. Population affinities of Neolithic Siberians: A snapshot from prehistoric Lake Baikal

            【外文期刊】 Mooder KP ; Schurr TG ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2006年129卷3期 349-361页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient DNA; mtDNA; biological discontinuity;

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            11. Evolutionary history of the extinct wolf population from France in the context of global phylogeographic changes throughout the Holocene

            【外文期刊】 Karolina Doan ; Annik Schnitzler ; 等 《Molecular ecology》 2023年32卷16期 4627-4647页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancestry replacement; ancient DNA; dietary shift;

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            12. A preliminary analysis of the DNA and diet of the extinct Beothuk: A systematic approach to ancient human DNA

            【外文期刊】 Kuch M ; Grocke DR ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2007年132卷4期 594-604页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient human DNA; Beothuk peoples; Native American YSNP;

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            13. Microevolution in prehistoric Andean populations: Chronologic mtDNA variation in the desert valleys of northern Chile

            【外文期刊】 Moraga M ; Santoro CM ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2005年127卷2期 170-181页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient mtDNA; microevolution; cultural change;

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            14. Ancient DNA analysis of human neolithic remains found in northeastern Siberia

            【外文期刊】 Ricaut FX ; Fedoseeva A ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2005年126卷4期 458-462页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient DNA; HV1 sequence; STRs;

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            15. Endosymbiotic and horizontal gene transfer in chromalveolates

            【外文期刊】 Bhattacharya D ; Nosenko T ; 《Journal of phycology》 2008年44卷1期 7-10页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 chromalveolates; endosymbiosis; endosymbiotic gene transfer;

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            16. Broadly Sampled Multigene Analyses Yield a Well-Resolved Eukaryotic Tree of Life

            【外文期刊】 《Systematic Biology》 2010年59卷5期 518-533页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 genes GenBank sequence data; taxonomic sampling; endosymbiotic gene transfer;

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            17. Balaenoptera omurai is a newly discovered baleen whale that represents an ancient evolutionary lineage

            【外文期刊】 Sasaki T ; Nikaido M ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2006年41卷1期 40-52页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Baleen whales; evolution; ancient lineage;

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            18. To what extent did Neanderthals and modern humans interact?

            【外文期刊】 Kristian J. Herrera ; Jason A. Somarelli ; 等 《Biological reviews》 2009年84卷2期 245-258页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 archaic Homo lineages; extinction; admixture;

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            19. Intercoalescence Time Distribution of Incomplete Gene Genealogies in Temporally Varying Populations, and Applications in Population Genetic Inference

            【外文期刊】 Chen,H. ; 《Annals of Human Genetics》 2013年77卷2期 158-173页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Ancient lineage; Coalescent theory; Gene genealogy;

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            20. The genetic history of the Southern Andes from present-day Mapuche ancestry

            【外文期刊】 Arango-Isaza, Epifania ; Capodiferro, Marco Rosario ; 等 《Current Biology: CB》 2023年33卷13期 2602-+页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 POPULATION CONTINUITY; NORTH-AMERICA; ANCIENT;

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            21. Phylotranscriptomics of liverworts: revisiting the backbone phylogeny and ancestral gene duplications

            【外文期刊】 Dong, Shanshan ; Yu, Jin ; 等 《Annals of Botany》 2022年130卷7期 951-964页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Liverworts; Marchantiophyta; evolution;

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            22. Habitats hold an evolutionary signal of past climatic refugia

            【外文期刊】 Garcia, Maria B. ; Miranda, Hector ; 等 2022年31卷5/6期 1665-1688页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Ancient lineages; Endemism; Evolutionary distinctiveness (ED);

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            23. mtDNA analysis of human remains from an early Danish Christian cemetery

            【外文期刊】 Rudbeck L ; Gilbert MTP ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2005年128卷2期 424-429页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 haplogroups; mtDNA; teeth;

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            24. Diagnosis of the mechanisms of different types of discordances between phylogenies inferred from nuclear and mitochondrial markers.

            【外文期刊】 A A,Poroshina ; D Y,Sherbakov ; 等 《Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii》 2020年24卷4期 420-426页

            【关键词】 Lake Baikal; ancient lakes; disagreements between phylogenies;

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            25. Mitochondrial DNA D-loop haplogroup contributions to the genetic diversity of East European domestic chickens from Russia.

            【外文期刊】 A G,Dyomin ; M I,Danilova ; 等 《Journal of animal breeding and genetics = Zeitschrift fur Tierzuchtung und Zuchtungsbiologie》 2017年134卷2期 98-108页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Gallus gallus ; Ancient DNA; dispersal of chickens;

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            26. Phylogenomic approaches untangle early divergences and complex diversifications of the olive plant family. oa

            【外文期刊】 Wenpan,Dong ; Enze,Li ; 等 《BMC biology》 2022年20卷1期 92页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Ancient introgression; Gene tree conflict; Incomplete lineage sorting;

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            27. Plastid phylogenomics and fossil evidence provide new insights into the evolutionary complexity of the 'woody clade' in Saxifragales. oa

            【外文期刊】 Linbo,Jia ; Shuying,Wang ; 等 《BMC plant biology》 2024年24卷1期 277页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Ancient extinction; Ancient hybridization; Incomplete lineage sorting;

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            28. Projecting Ancient Ancestry in Modern-Day Arabians and Iranians: A Key Role of the Past Exposed Arabo-Persian Gulf on Human Migrations. oa

            【外文期刊】 Joana C,Ferreira ; Farida,Alshamali ; 等 《Genome biology and evolution》 2021年13卷9期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Arabian Peninsula; Iran; ancient and archaic ancestry;

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            29. Haplotype-Based Approach Represents Locus Specificity in the Genomic Diversification Process in Humans (Homo sapiens). oa

            【外文期刊】 Makoto K,Shimada ; Tsunetoshi,Nishida ; 《Genes》 2024年15卷12期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 S* analysis; ancient; extended haplotype homozygosity (EHH);

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            30. Evidence for widespread selection in shaping the genomic landscape during speciation of Populus.

            【外文期刊】 Jing,Wang ; Nathaniel R,Street ; 等 《Molecular ecology》 2020年29卷6期 1120-1136页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Populus ; ancient introgression; incomplete lineage sorting;

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            31. Multilocus species tree analyses resolve the ancient radiation of the subtribe Zizaniinae (Poaceae).

            【外文期刊】 Liang,Tang ; Xin-hui,Zou ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2015年84卷 232-9页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Ancient rapid radiation; Incomplete lineage sorting; Multilocus data;

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            32. Phylogeny and evolution of Asparagaceae subfamily Nolinoideae: new insights from plastid phylogenomics. oa

            【外文期刊】 Yunheng,Ji ; Jacob B,Landis ; 等 《Annals of botany》 2023年131卷2期 301-312页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Theropogon ; Ancient hybridization; Convallarieae;

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            33. Comprehending Cornales: phylogenetic reconstruction of the order using the Angiosperms353 probe set. oa

            【外文期刊】 Shawn K,Thomas ; Xiang,Liu ; 等 《American journal of botany》 2021年108卷7期 1112-1121页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Angiosperms353; Cornales; ancient reticulation;

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            34. Outgroup effects on root position and tree topology in the AFLP phylogeny of a rapidly radiating lineage of cichlid fish. oa

            【外文期刊】 Paul C,Kirchberger ; Kristina M,Sefc ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2014年70卷 57-62页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Ancient incomplete lineage sorting; Cichlidae; Lake Tanganyika;

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            35. Coalescent methods are robust to the simultaneous effects of long branches and incomplete lineage sorting.

            【外文期刊】 Liang,Liu ; Zhenxiang,Xi ; 等 《Molecular biology and evolution》 2015年32卷3期 791-805页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 ancient rapid radiation; coalescent methods; concatenation methods;

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            36. Plastome data reveal multiple geographic origins of Quercus Group Ilex.

            【外文期刊】 Marco Cosimo,Simeone ; Guido W,Grimm ; 等 《PeerJ》 2016年4卷 e1897页

            【关键词】 Ancient introgression; Decoupled phylogenies; Fagaceae;

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            37. Early diversification trend and Asian origin for extent bat lineages.

            【外文期刊】 W,Yu ; Y,Wu ; 等 《Journal of evolutionary biology》 2014年27卷10期 2204-18页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Asian origin; ancient biogeographic history; early diversification trend;

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            38. Outgroup effects on root position and tree topology in the AFLP phylogeny of a rapidly radiating lineage of cichlid fish q

            【外文期刊】 Paul C. Kirchberger ; Kristina M. Sefc ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2014年70卷 57-62页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Ancient incomplete lineage sorting; Cichlidae; Limnochromini;

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            39. Tracing the genetic history of the Chinese people: Mitochondrial DNA analysis of a neolithic population from the Lajia Site

            【外文期刊】 Gao SZ ; Yang YD ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2007年133卷4期 1128-1136页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient mtDNA; Lajia Site; Chinese people;

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            40. Genetic differences among three colour morphotypes of the black rockfish, Sebastes inermis, inferred from mtDNA and AFLP analyses

            【外文期刊】 Kai Y. ; Nakayama K. ; 等 《Molecular ecology》 2002年11卷12期 2591-2598页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Aflp; Colour morphotypes; Hybridization;

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            41. A SNP-based assay in a non model species: evolutionary lineage assignment of brown trout ancient DNA

            【外文期刊】 Chat, Joelle ; Manicki, Aurelie ; 《Conservation Genetics Resources》 2012年4卷1期 59-62页

            【关键词】 Ancient DNA; Evolutionary lineage; Homoplasy;

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            42. Comparison of maternal lineage and biogeographic analyses of ancient and modern Hungarian populations

            【外文期刊】 Tomory G ; Csanyi B ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2007年134卷3期 354-368页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient DNA; mtDNA; Hungarians;

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            43. Evolution by recombination and transspecies polymorphism in the MHC class I gene of Xenopus laevis

            【外文期刊】 Bos DH ; Waldman B ; 《Molecular biology and evolution》 2006年23卷1期 137-143页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 transspecies evolution; recombination; exon shuffling;

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            44. Early diversification trend and Asian origin for extent bat lineages

            【外文期刊】 W. YU ; Y. WU ; 等 《Journal of evolutionary biology》 2014年27卷9/10期 2204-2218页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient biogeographic history; Asian origin; early diversification trend;

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            45. Molecular characterization of a pre-Columbian mummy and in situ coprolite

            【外文期刊】 Luciani S ; Fornaciari G ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2006年129卷4期 620-629页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient DNA; mtDNA; bacterial DNA;

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            46. Mitochondrial DNA analysis of ancient Peruvian highlanders

            【外文期刊】 Shinoda K ; Adachi N ; 等 《American Journal of Physical Anthropology》 2006年131卷1期 98-107页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Inca; ancient DNA; Urubamba;

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            47. Evidence for widespread selection in shaping the genomic landscape during speciation of Populus

            【外文期刊】 《Molecular ecology》 2020年29卷6期 1120-1136页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ancient introgression; incomplete lineage sorting; linked selection;

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            48. Two patterns of variation among MHC class I loci in tuatara (Sphenodon punctatus)

            【外文期刊】 Miller HC ; Andrews-Cookson M ; 等 《The Journal of Heredity》 2007年98卷7期 666-677页

            【关键词】 MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX; AMINO-ACID SITES; ANCIENT REPTILE LINEAGE;

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            49. Inter-coalescence time distribution of incomplete gene genealogies in temporally varying populations, and applications in population genetic inference

            【外文期刊】 Hua Chen ; 《Annals of Human Genetics》 2013年77卷5期 464-464页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 inter-coalescence time; gene genealogy; incomplete genealogy;

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            50. Phylogeny and evolution of Asparagaceae subfamily Nolinoideae: new insights from plastid phylogenomics

            【外文期刊】 Ji, Yunheng ; Landis, Jacob B. ; 等 《Annals of Botany》 2023年131卷2期 301-312页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Ancient hybridization; Convallarieae; incomplete lineage sorting;

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