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【中文期刊】 刘洋 池晴佳 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2025年46卷1期 169-177页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8+T细胞相关的生物标志物并建立预后模型.方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组...
- 概要：
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【中文期刊】 戈艳蕾 孙思怡 等 《南京医科大学学报（自然科学版）》 2025年45卷6期 786-797页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探讨慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)发展过程中MT-RNR2样蛋白1(MT-RNR2 like protein 1,MTRNR2L1)介导的泛凋亡(PANopto...
【关键词】 慢性阻塞性肺疾病；肺损伤；PANoptosis；
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【中文期刊】 穆晓霞 张红梅 等 《郑州大学学报（工学版）》 2025年46卷6期 58-65页
【摘要】 为提升黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂(ICI)治疗响应的预测准确性,提出了一种整合批量 RNA 测序和单细胞 RNA测序数据的新方法.首先,通过皮尔逊相关性分析构建患者-细胞相关性矩阵,采用 Louvain 算法对单细胞RNA测序数据进行细...
【关键词】 黑色素瘤；免疫检查点抑制剂；批量RNA测序和单细胞RNA测序数据；
- 概要：
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【中文期刊】 Xiliang Wang Yao He 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2021年19卷2期 253-266页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) is generally used for profiling transcriptome of individual cells.The droplet-bas...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 Jingwei Fan Yanting Shen 等 《分子植物（英文版）》 2025年18卷4期 669-689页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Soybean is one of the most important crops globally,and its production must be significantly increased to meet increasin...
【关键词】 soybean；bulk RNA-seq；Stereo-seq；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 Marco Gebiola Brandon H.Le 等 《中国昆虫科学（英文版）》 2022年29卷5期 1318-1328页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Transcriptomic studies are an important tool for understanding the molecular pathways underlying host plant use by agric...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 伍智勇 徐孟 等 《中华实验和临床病毒学杂志》 2022年36卷3期 346-353页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 近年来，新型冠状病毒肺炎、流行性感冒、埃博拉出血热等病毒性疾病呈现愈演愈烈、愈发愈快的趋势。为保障人民健康和国民经济的稳定运行，研究病毒的致病机理与宿主免疫调控机制，解析病毒与宿主的基因表达调控规律，监测病原病毒与防治病毒病的重要性逐渐凸显...
- 概要：
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- 结论：
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Kumaran, Girishkumar ; Michaeli, Simon ; 2021年72卷20期 6803-6807页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 ATG5;autophagy;plant vacuole;
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【外文期刊】 Wang, Jirong ; Li, Xiaoran ; 等 2023年335卷 122253-122253页
【关键词】 Bladder cancer;MCM6;Bioinformatics;
- 概要：
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【外文期刊】 Moore C.M. ; Seibold M.A. ; 《The Journal of Allergy and Clinical Immunology》 2022年150卷4期 756-765页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 biomarker;bulk RNA-seq;endotype;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Kuksin, Maria ; Morel, Daphne ; 等 《European journal of cancer: official journal for European Organization for Research and Treatment of Cancer (EORTC) [and] European Association for Cancer Research (EACR)》 2021年149卷 193-210页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Karikomi, Matthew ; Zhou, Peijie ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2022年23卷4期 SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Hillary M. Heiling ; Douglas R. Wilson ; 等 《Biometrics: Journal of the Biometric Society : An International Society Devoted to the Mathematical and Statistical Aspects of Biology》 2023年79卷2期 854-865页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Jin Yulin ; Zhou Tao ; 等 《Marine biotechnology》 2022年24卷1期 174-189页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Bulk segregant analysis;RNA-Seq;ESC;
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【外文期刊】 Fan Jiaxin ; Lyu Yafei ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2022年23卷6期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 multi-condition bulk RNA-seq data;cell-type deconvolution;non-negative least-squares regression;
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【外文期刊】 Satomi Kobayashi ; Yasuo Nagafuchi ; 等 2020年116卷 102547-102547页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Tingru,Zhao ; Yan,Guo ; 等 《Frontiers in immunology》 2024年15卷 1336839页
【关键词】 LST1;ScRNA-seq;bulk RNA-seq;
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【外文期刊】 Xinling,Li ; Greg,Gibson ; 等 《Frontiers in bioinformatics》 2023年3卷 1120290页
【关键词】 10X;bulk RNA-seq;comparison;
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【外文期刊】 Yuanfang,Huang ; Shouxuan,Zhu ; 等 《Trends in genetics : TIG》 2025年41卷3期 218-235页SCIMEDLINECABP
- 概要：
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【外文期刊】 Weijie,Ye ; Zhibing,Chen ; 等 《Clinical and experimental medicine》 2025年25卷1期 251页SCIMEDLINECABP
【关键词】 Bulk RNA-seq ; scRNA-seq ;ALDOA;
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【外文期刊】 D,Weiss ; N,Yeung ; 等 《Cells & development》 2024年180卷 203971页
【关键词】 Bulk RNA-seq;Cell-matrix interactions;Extracellular matrix;
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【外文期刊】 Jian,Sun ; Jianfei,Zhang ; 等 《Frontiers in genetics》 2023年14卷 1085263页
- 概要：
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【外文期刊】 Shaoyi,Cai ; Zhiyou,Chen ; 等 《International journal of molecular sciences》 2022年23卷23期 SCIMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Juber,Herrera-Uribe ; Kyu-Sang,Lim ; 等 《Frontiers in genetics》 2023年14卷 1107462页
- 概要：
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【外文期刊】 Liang,Zhao ; Wenwen,Shao ; 等 《Frontiers in immunology》 2024年15卷 1434300页
- 概要：
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【外文期刊】 Kisung,Sheen ; Seokho,Myung ; 等 《Life (Basel, Switzerland)》 2024年14卷5期
【关键词】 LPS-induced inflammation model;core gene list;whole-blood bulk RNA-seq;
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【外文期刊】 Shanshan,Li ; Junjie,Zhao ; 等 《Archives of dermatological research》 2024年316卷6期 262页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Bulk RNA-seq;Candidate small molecule drugs;Immunotherapy response prediction;
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【外文期刊】 Naveed,Ahmad ; Lei,Hou ; 等 《Genes》 2022年13卷5期 SCIMEDLINECABP
【关键词】 alternative splicing;branch angle;bulk RNA-sequencing (BR-seq);
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【外文期刊】 Jordana,Lindner ; Bareket,Dassa ; 等 《BMC bioinformatics》 2025年26卷1期 79页SCIMEDLINECABP
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【外文期刊】 Lianghe,Yu ; Yan,Shi ; 等 《International journal of genomics》 2025年2025卷 3547543页
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【外文期刊】 Beate C,Braun ; Michał M,Hryciuk ; 等 《BMC genomics》 2025年26卷1期 325页SCIMEDLINECABP
【关键词】 Adipokines;Bulk RNA-Seq;Corpus luteum;
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【外文期刊】 Regie Lyn P,Santos-Cortez ; Helen Z,Gomez ; 等 《Genes》 2024年15卷10期 SCIMEDLINECABP
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【外文期刊】 Anukriti,Singh ; Brian P,Hermann ; 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2023年2656卷 37-70页
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【外文期刊】 Fanding,Zhou ; Alan J,Aw ; 等 《Cell reports methods》 2025年5卷9期 101147页
【关键词】 CP: Computational biology;CP: Systems biology;RNA-seq analysis;
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【外文期刊】 Wentao,Yang ; Wenwen,Lai ; 等 《Oncology letters》 2025年30卷5期 537页SCIMEDLINE
【关键词】 HCC;RFS;bulk RNA-seq;
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【外文期刊】 Maik,Wolfram-Schauerte ; Thomas,Vogel ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2025年26卷4期 SCIMEDLINECABP
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【外文期刊】 Kristine,Roos ; Ilmatar,Rooda ; 等 《Frontiers in endocrinology》 2022年13卷 945347页
【关键词】 IVF;bulk RNA-seq;deconvolution;
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【外文期刊】 Yue,You ; Xueyi,Dong ; 等 《Genome biology》 2023年24卷1期 107页SCIMEDLINE
【关键词】 Differential expression analysis;Group heteroscedasticity;Pseudo-bulk scRNA-seq;
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【外文期刊】 Xuelin,He ; Li,Liu ; 等 《Frontiers in cell and developmental biology》 2021年9卷 644261页
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【外文期刊】 Ambre,Baillou ; Gaël,Auray ; 等 《Frontiers in immunology》 2025年16卷 1639553页
【关键词】 DC3;blood;bulk RNA-seq;
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【外文期刊】 Fiorella,Schischlik ; 《International review of cell and molecular biology》 2022年366卷 25-39页
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【外文期刊】 Zixuan,Wang ; Kaiyuan,Xing ; 等 《International journal of molecular sciences》 2022年23卷20期 SCIMEDLINE
【关键词】 CRC;bulk data;prognostic signature;
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【外文期刊】 Duan,Chen ; Shaoyu,Li ; 等 《Foundations of data science (Springfield, Mo.)》 2022年4卷3期 441-466页
【关键词】 Nonnegative matrix factorization;Primary: 65F22, 65Z05;Secondary: 92B05;
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【外文期刊】 Longfei,Wu ; Rudolph,Fredua-Agyeman ; 等 《International journal of molecular sciences》 2022年23卷17期 SCIMEDLINE
【关键词】 Aphanomyces euteiches;SNPs;bulk segregant RNA-seq analysis;
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【外文期刊】 Libin,Wang ; Peizhi,Xu ; 等 《Discover oncology》 2025年16卷1期 478页
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【外文期刊】 Alex,Haimbaugh ; Danielle,Meyer ; 等 《Frontiers in toxicology》 2022年4卷 821116页
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【外文期刊】 Weijun,Zhou ; Zhuozheng,Hu ; 等 《Oncology letters》 2025年29卷6期 271页SCIMEDLINE
【关键词】 bulk RNA-sequencing;immune-related genes;lung adenocarcinoma;
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【外文期刊】 Stephen M J,Pollo ; Aralia,Leon-Coria ; 等 《Parasites & vectors》 2023年16卷1期 171页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Bulk RNA-seq;Development;Parasite;
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【外文期刊】 Yan-Cheng,Dai ; Dan,Qiao ; 等 《World journal of clinical cases》 2022年10卷33期 12116-12135页
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