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            1. 丙型肝炎病毒亚型的E1、E2变异性分析

            【中文期刊】 姜宏达 徐华锋  等 《国际免疫学杂志》 2018年41卷4期 395-398页 ISTICCA

            【摘要】 目的 了解丙型肝炎(丙肝)病毒几种亚型(1a、1b、2a、2b、3a、4a、5a和6a)包膜基因的变异性.方法 应用相应的软件分析丙肝病毒包膜蛋白(E1、E2)的核苷酸和氨基酸序列,计算这些包膜基因的非同义突变与同义突变的比值(dN/dS)...

            【关键词】 丙型肝炎病毒； 包膜蛋白； 变异性；

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            2. Genetic load in marine animals: a review

            【中文期刊】 《动物学报（英文版）》 2016年62卷6期 567-579页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【关键词】 dn/ds ratios； high fecundity； larval mortality；

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            3. 卡介苗和结核分枝杆菌中B细胞抗原表位多态性研究

            【学位论文】 作者： 李马超 导师：万康林 李振军 郝琴  中国疾病预防控制中心  生物学 病原生物学（博士） 2016年

            【摘要】 结核病是一种主要由结核分枝杆菌感染导致的慢性传性疾病.传统的观点认为结核病的感染免疫以细胞免疫为主,但越来越多的研究表明B细胞主导的体液免疫反应在抗原呈递、刺激机体产生保护性抗体、调节宿主免疫应答等方面起到重要作用.B细胞抗原表位是抗原表面...

            【关键词】 结核分枝杆菌； 卡介苗；

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            4. Alternatively spliced products lacking exon 12 dominate expression of FMR1 gene in human tissues

            【会议论文】FU XianGuo 第九届全国遗传病诊断与产前诊断学术交流会暨产前诊断和医学遗传学新技术研讨会 2014年

            【关键词】 FMR1； Alternative splicing； Cloning-sequencing；

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            5. Alternatively spliced products lacking exon 12 dominate expression of FMR1 gene in human tissues

            【会议论文】FU XianGuo 第九届全国遗传病诊断与产前诊断学术交流会暨产前诊断和医学遗传学新技术研讨会 2014年

            【关键词】 FMR1； Alternative splicing； Cloning-sequencing；

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            6. 郑氏比蜢线粒体基因组分析及直翅目昆虫线粒体基因组的进化与翅型和生态型的关系研究

            【学位论文】 作者： 杨辉 导师：黄原  陕西师范大学  基础医学 遗传学（硕士） 2011年

            【摘要】 截至2011年4月,在NCBI中已收录的昆虫纲全线粒体基因组序列有240条,其中直翅目昆虫36条,而蜢总科昆虫暂缺.本研究采用Long-PCR和sub-PCR相结合的方法扩增了直翅目蜢总科郑氏比蜢(Pielomastax zhengi)全线...

            【关键词】 直翅目； 郑氏比蜢；

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            7. Molecular footprints of selective pressure in the neuraminidase gene of currently circulating human influenza subtypes and lineages

            【外文期刊】 Correia, Vanessa ; Abecasis, Ana B. ; 等 《Virology》 2018年522卷 122-130页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Influenza; Neuraminidase; dN/dS ratio;

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            8. Complete structure and variation of the chloroplast genome of Agropyron cristatum (L.) Gaertn

            【外文期刊】 Chen, Ning ; Sha, Li-Na ; 等 《Gene: An International Journal Focusing on Gene Cloning and Gene Structure and Function》 2018年640卷 86-96页

            【关键词】 Agropyron cristatum; Chloroplast genome; Dn/ds ratio;

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            9. Secreted Proteins Defy the Expression Level-Evolutionary Rate Anticorrelation

            【外文期刊】 《Molecular biology and evolution》 2017年34卷3期 692-706页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 rates of evolution; dN/dS; expression levels;

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            10. Divergent Positive Selection in Rhodopsin from Lake and Riverine Cichlid Fishes

            【外文期刊】 Schott, Ryan K. ; Refvik, Shannon P. ; 等 《Molecular biology and evolution》 2014年31卷5期 1149-1165页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Neotropical cichlids; evolution of vision; visual pigment;

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            11. Nonsynonymous Polymorphism Counts in Bacterial Genomes: a Comparative Examination

            【外文期刊】 Sara L. Loo ; Anna Ong ; 等 《Applied and Environmental Microbiology》 2020年87卷1期 e02002-1-e02002-16页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 nonsynonymous; selection; dN/dS;

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            12. Molecular Evolutionary Analysis of Vertebrate Transducins: A Role for Amino Acid Variation in Photoreceptor Deactivation

            【外文期刊】 Lin, Yi G. ; Weadick, Cameron J. ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2013年77卷5/6期 231-245页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 G proteins; Vision; Rhodopsin;

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            13. Positive selection of cereblon modified function including its E3 ubiquitin ligase activity and binding efficiency with AMPK

            【外文期刊】 Onodera, Wataru ; Asahi, Toru ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2019年135卷 78-85页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Cereblon; E3 ubiquitin ligase; AMPK;

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            14. The phylogeny of the Lepocreadioidea (Platyhelminthes, Digenea) inferred from nuclear and mitochondrial genes: Implications for their systematics and evolution

            【外文期刊】 Bray, RA ; Waeschenbach, A ; 等 《Acta parasitologica》 2009年54卷4期 310-329页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Lepocreadiidae; Plagiorchiida; Digenea;

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            15. Why Time Matters: Codon Evolution and the Temporal Dynamics of dN/dS

            【外文期刊】 Mugal, Carina F. ; Wolf, Jochen B. W. ; 等 《Molecular biology and evolution》 2014年31卷1期 212-231页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 population genetics of dN/dS; codon evolution; genomic signatures of natural selection;

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            16. The effect of multifunctionality on the rate of evolution in yeast

            【外文期刊】 Salathe M ; Ackermann M ; 等 《Molecular biology and evolution》 2006年23卷4期 721-722页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 pleiotropy; dN/dS; evolutionary genomics;

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            17. An Investigation of the Statistical Power of Neutrality Tests Based on Comparative and Population Genetic Data

            【外文期刊】 Zhai Weiwei ; Nielsen Rasmus ; 等 《Molecular biology and evolution》 2009年26卷2期 273-283页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 genetic diversity; allele frequency; frequency spectrum;

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            18. Selective constraint and the evolution of the RNA polymerase II C-terminal domain

            【外文期刊】 Aram D. Stump ; Khrystyna Ostrozhynska ; 《Transcription》 2013年4卷2期 77-86页

            【关键词】 RNA polymerase II; CTD; purifying selection;

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            19. Polymorphism Data Assist Estimation of the Nonsynonymous over Synonymous Fixation Rate Ratio omega for Closely Related Species

            【外文期刊】 Mugal, Carina F. ; Kutschera, Verena E. ; 等 《Molecular biology and evolution》 2020年37卷1期 260-279页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 molecular evolution; codon models; dN/dS;

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            20. Lineage-specific sequence evolution and exon edge conservation partially explain the relationship between evolutionary rate and expression level in A.thaliana

            【外文期刊】 Bush, Stephen J. ; Kover, Paula X. ; 等 《Molecular ecology》 2015年24卷12期 3093-3106页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 dN/dS; Arabidopsis thaliana; lineage-specific evolution;

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            21. Genomic Evidence for Large, Long-Lived Ancestors to Placental Mammals

            【外文期刊】 Romiguier, J. ; Ranwez, V. ; 等 《Molecular biology and evolution》 2013年30卷1期 5-13页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 phylogeny; GC-content; dN/dS ratio;

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            22. Comparative genomic analysis of Lactobacillus plantarum GB-LP4 and identification of evolutionarily divergent genes in high-osmolarity environment

            【外文期刊】 Jung, Jaehoon ; Kim, Kwondo ; 等 《Genes and genomics》 2018年40卷2期 217-223页

            【关键词】 Lactobacillus plantarum; Genome; Comparative genomics;

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            23. Genetic drift and mutational hazard in the evolution of salamander genomic gigantism

            【外文期刊】 Mohlhenrich, Erik Roger ; Mueller, Rachel Lockridge ; 《Evolution: International Journal of Organic Evolution》 2016年70卷12期 2865-2878页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 dN/dS bias; effective population size; genome size;

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            24. Directionality in the evolution of influenza A haemagglutinin

            【外文期刊】 Kryazhimskiy, Sergey ; Bazykin, Georgii A. ; 等 2008年275卷1650期 2455-2464页

            【关键词】 directional selection; dN/dS; haemagglutinin;

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            25. Non-catalytic Binding Sites Induce Weaker Long-Range Evolutionary Rate Gradients than Catalytic Sites in Enzymes

            【外文期刊】 Sharir-Ivry, Avital ; Xia, Yu ; 《Journal of Molecular Biology》 2019年431卷19期 3860-3870页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Ligand binding sites; protein-protein interaction sites; allosteric sites;

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            26. Evidence from a house finch (Haemorhous mexicanus) spleen transcriptome for adaptive evolution and biased gene conversion in passerine birds.

            【外文期刊】 Backstrom, N. ; Zhang, Q. ; 等 《Molecular biology and evolution》 2013年30卷5期 1046-1050页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 house finch; transcriptome; positive selection;

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            27. Nonadaptive evolution of mitochondrial genome size

            【外文期刊】 Boussau, B. ; Brown, J.M. ; 等 《Evolution: International Journal of Organic Evolution》 2011年65卷9期 2706-2711页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Dn/Ds; Genome evolution; Lizards;

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            28. Comparative genomic analysis of mitochondrial protein-coding genes in Veneroida clams: Analysis of superfamily-specific genomic and evolutionary features

            【外文期刊】 Hwang, Jae Yeon ; Lee, Chang-kyu ; 等 《Marine genomics》 2015年24卷Pt.3期 329-334页

            【关键词】 Mitochondrial DNA; dN/dS; Veneroida;

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            29. Mating systems and selection efficacy:a test using chloroplastic sequence data in Angiosperms

            【外文期刊】 S. GLéMIN ; A. MUYLE ; 《Journal of evolutionary biology》 2014年27卷7/8期 1386-1399页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 chloroplast; deleterious mutations; dN/dS ratio;

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            30. Selection and genetic drift in captive versus wild populations: an assessment of neutral and adaptive (MHC-linked) genetic variation in wild and hatchery brown trout (Salmo trutta) populations

            【外文期刊】 Schenekar, Tamara ; Weiss, Steven ; 《Conservation genetics》 2017年18卷5期 1011-1022页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Captive population genetics; Adaptation to captivity; Genetic drift;

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            31. LEC1-LIKE paralog transcription factor: How to survive extinction and fit in NF-Y protein complex

            【外文期刊】 Hilioti,Z. ; Ganopoulos,I. ; 等 《Gene: An International Journal Focusing on Gene Cloning and Gene Structure and Function》 2014年543卷2期 220-233页

            【关键词】 Cysteine variation; Development; DN;

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            32. Internal Transcribed Spacer (ITS) regions: A powerful tool for analysis of the diversity of wheat genotypes

            【外文期刊】 Ahmadi, Hasan ; Solouki, Mahmood ; 等 2022年60卷2期 137-143页 SCISCIE

            【关键词】 dN/dS ratio; Haplotype; Nucleotide Diversity;

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            33. Genome-wide survey of codons under diversifying selection in a highly recombining bacterial species, Helicobacter pylori

            【外文期刊】 Yahara, Koji ; Furuta, Yoshikazu ; 等 《DNA research: an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes》 2016年23卷2期 135-143页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 selection; dN/dS; recombination;

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            34. Molecular convergence and positive selection associated with the evolution of symbiont transmission mode in stony corals

            【外文期刊】 Dixon, Groves B. ; Kenkel, Carly D. ; 《Proceedings of the Royal Society. Biological sciences》 2019年286卷1901期

            【关键词】 intracellular symbiosis; Scleractinia; transcriptomes;

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            35. Extensively Parameterized Mutation-Selection Models Reliably Capture Site-Specific Selective Constraint

            【外文期刊】 Spielman, Stephanie J. ; Wilke, Claus O. ; 《Molecular biology and evolution》 2016年33卷11期 2990-3001页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 mutation-selection models; selection coefficients; protein evolution;

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            36. Evolutionary dynamics of sex‐biased genes expressed in cricket brains and gonads

            【外文期刊】 Carrie A. Whittle ; Arpita Kulkarni ; 等 《Journal of evolutionary biology》 2021年34卷8期 1188-1211页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 brain; dN/dS; gonad;

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            37. Comparative genome analysis of Lactobacillus plantarum GB-LP3 provides candidates of survival-related genetic factors

            【外文期刊】 《Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases》 2017年53卷 218-226页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Bacterial survival; Comparative genomics; dN/dS;

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            38. Slow crabs ‐ fast genomes: Locomotory capacity predicts skew magnitude in crustacean mitogenomes

            【外文期刊】 Ivan Jakovlić ; Hong Zou ; 等 2021年30卷21期 5488-5502页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 adaptive evolution; base composition skew; dN/dS;

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            39. Mitogenomics of the endemic Ethiopian rats: looking for footprints of adaptive evolution in sky islands.

            【外文期刊】 Veronika,Bartáková ; Anna,Bryjová ; 等 《Mitochondrion》 2021年57卷 182-191页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Adaptation; Adaptive introgression; NADH dehydrogenase;

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            40. A Single Adaptive Mutation in Sodium Taurocholate Cotransporting Polypeptide Induced by Hepadnaviruses Determines Virus Species Specificity. oa

            【外文期刊】 Junko S,Takeuchi ; Kento,Fukano ; 等 《Journal of virology》 2019年93卷5期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 HBV; NTCP; coevolution;

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            41. Protocols for the Molecular Evolutionary Analysis of Membrane Protein Gene Duplicates.

            【外文期刊】 Laurel R,Yohe ; Liang,Liu ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2019年1851卷 49-62页

            【关键词】 Birth-death models; Gene duplication; Gene tree;

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            42. Data for positive selection test and co-evolutionary analysis on mammalian cereblon.

            【外文期刊】 Wataru,Onodera ; Toru,Asahi ; 等 《Data in brief》 2019年26卷 104499页

            【关键词】 AMPK; Cereblon; E3 ubiquitin ligase;

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            43. Millennial-scale microbiome analysis reveals ancient antimicrobial resistance conserved despite modern selection pressures.

            【外文期刊】 Sankaranarayanan,Gomathinayagam ; Swathi,Kanagalingam ; 等 《Environmental microbiome》 2024年19卷1期 110页

            【关键词】 Ancient permafrost microbiome; Antimicrobial resistance; Bacteriophages;

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            44. Recombination Rate Variation Modulates Gene Sequence Evolution Mainly via GC-Biased Gene Conversion, Not Hill-Robertson Interference, in an Avian System. oa

            【外文期刊】 Paulina,Bolívar ; Carina F,Mugal ; 等 《Molecular biology and evolution》 2016年33卷1期 216-27页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Hill–Robertson interference; dN/dS; divergence;

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            45. Polymorphism Data Assist Estimation of the Nonsynonymous over Synonymous Fixation Rate Ratio ω for Closely Related Species. oa

            【外文期刊】 Carina F,Mugal ; Verena E,Kutschera ; 等 《Molecular biology and evolution》 2020年37卷1期 260-279页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Poisson random field model; codon models; dN/dS;

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            46. The elusive nature of adaptive mitochondrial DNA evolution of an arctic lineage prone to frequent introgression. oa

            【外文期刊】 José,Melo-Ferreira ; Joana,Vilela ; 等 《Genome biology and evolution》 2014年6卷4期 886-96页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Lepus; codon evolution; dN/dS;

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            47. Genomic evolution of human respiratory syncytial virus during a decade (2013-2023): bridging the path to monoclonal antibody surveillance.

            【外文期刊】 Maria,Piñana ; Alejandra,González-Sánchez ; 等 《The Journal of infection》 2024年88卷5期 106153页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Clesrovimab; DN/dS; Evolution;

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            48. Genome-Wide Analysis of Nubian Ibex Reveals Candidate Positively Selected Genes That Contribute to Its Adaptation to the Desert Environment.

            【外文期刊】 Vivien J,Chebii ; Samuel O,Oyola ; 等 《Animals : an open access journal from MDPI》 2020年10卷11期

            【关键词】 Capra nubiana genome; dN/dS analysis; desert adaptation;

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            49. Selective constraint and the evolution of the RNA polymerase II C-Terminal Domain. oa

            【外文期刊】 Aram D,Stump ; Khrystyna,Ostrozhynska ; 《Transcription》 77-86页 MEDLINE

            【关键词】 CTD; RNA Polymerase II; dN/dS;

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            50. Mitochondrial DNA as a tool for reconstructing past life-history traits in mammals.

            【外文期刊】 E,Figuet ; J,Romiguier ; 等 《Journal of evolutionary biology》 2014年27卷5期 899-910页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Cetartiodactyla; Cope's rule; ancestral life-history traits;

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