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【中文期刊】 Genan Wang Haisong Yin  等 《食品科学与人类健康（英文）》 2023年12卷4期 1248-1256页

【摘要】 β-Poly(L-malic acid) (PMLA) is a water-soluble biopolymer used in food, medicine and other industries. To date, the bios...

【关键词】 De novo transcriptome analysis； β-Poly(L-malic acid)； Aureobasidium melanogenum；

【中文期刊】 Hao Wen Wenqiang Wang  等 《食品科学与人类健康（英文）》 2022年11卷4期 854-864页

【摘要】 Korla fragrant pear (KFP) with special fragrance is a unique cultivar in Xinjiang, China. In order to explore the biosyn...

【关键词】 Korla fragrant pear； Development period； Chlorogenic acid content；

【中文期刊】 《植物学报（英文版）》 2015年3期 284-299页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 While it is widely accepted that genetic diversity determines the potential of adaptation, the role that gene expression...

【关键词】 Adaptation； artificial selection； de novo assembling；

【中文期刊】 秦志强 莫筱瑾  等 《中国血吸虫病防治杂志》 2017年29卷3期 300-304页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 利用基于RNA-seq的二代测序技术分析日本血吸虫侵袭前后的湖北钉螺转录组的表达,为进一步完善湖北钉螺基因结构信息及挖掘血吸虫感染钉螺相关分子标记提供实验数据.方法 分别提取日本血吸虫毛蚴感染后第7天、第30天湖北钉螺组织和正常钉螺组...

【关键词】 日本血吸虫； 湖北钉螺； RNA测序；

【中文期刊】 耿妍 陈玲玲  等 《热带亚热带植物学报》 2016年24卷2期 128-142页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 为探究华南地区严重入侵植物五爪金龙(Ipomoea cairica)生物入侵的分子机制,对五爪金龙及其近缘种七爪金龙(I.digitata)和裂叶牵牛(I.nil)进行de novo转录组测序和组装,得到56551条unigenes,其中5...

【关键词】 de novo； 转录组； 五爪金龙；

【中文期刊】 《分子植物（英文版）》 2014年7卷2期 323-335页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【关键词】 Nannochloropsis； lipids； biofuel；

【中文期刊】 《分子植物（英文版）》 2013年6卷4期 1074-1090页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【关键词】 pollen tube guidance； attractants； pollen tube；

【中文期刊】 赵磊 Zachary LARSON-RABIN  等 《植物分类与资源学报》 2012年34卷5期 487-501页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 利用公共数据库中果蝇F1代和栽培水稻基于高通量Illumina测序平台的RNA-Seq短序列数据,比较了8个(ABySS,Velvet,SOAPdenovo,Oases,Trinity,Multiple-k,T-IDBA and Trans...

【关键词】 高通量； 二代测序； 转录组；

【中文期刊】 舒江平 刘莉  等 《生物多样性》 2017年25卷6期 675-682页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 植物由水生走向陆生的进化过程中经历了非常复杂的演化,期间产生的大量基因的进化路线可能互不相同,因此仅仅使用系统发育树无法呈现真实的演化关系.系统发育网络图能够清楚地展示包括垂直演化和水平演化在内的复杂网状进化关系.本文选取莱茵衣藻(Chla...

【关键词】 网状进化； 基因树冲突； 系统发育基因组学；

【中文期刊】 《中国昆虫科学（英文版）》 2014年21卷6期 687-698页 MEDLINEISTICCSCDBP

【关键词】 de novo； silk protein； spider；

【中文期刊】 单春会 陈卫  等 《食品与生物技术学报》 2016年35卷8期 806-814页

【关键词】 哈密瓜； 转录组； 测序；

【中文期刊】 易立 仝明薇  等 《中国预防兽医学报》 2015年37卷10期 765-769页

【关键词】 貉； 外周血单核细胞； 转录组；

【中文期刊】 《分子植物（英文版）》 2010年3卷2期 390-405页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The ability to adjust growth and development to the availability of mineral nutrients in the soil is an essential life s...

【关键词】 Hormonal regulation； nutrition； secondary metabolism/natural products；

【中文期刊】 刘新星 陈超  《中国生物工程杂志》 2011年31卷7期 45-53页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为了促进对四倍体拟南芥(A.suecica)的研究,阐明多倍体植物在染色体加倍过程中遗传物质的变化,从而在分子层面上解释多倍体植物的环境适应和进化机制,描述了一套基于第二代测序技术的转录组短序列组装和生物信息学分析方法.通过对23 000 ...

【关键词】 Arabidopsis suecica； 转录组组装； SOAPdenovo；

【外文期刊】 Rao, Guodong ; Zeng, Yanfei ; 等 《Trees. Structure and Function》 2016年30卷5期 1647-1655页

【关键词】 Salix arbutifolia; Transcriptome; RNA-seq;

【外文期刊】 Duran, Ricardo ; Rodriguez, Victoria ; 等 《Trees. Structure and Function》 2019年33卷5期 1505-1511页

【关键词】 Radiata pine; SNP; de novo;

【外文期刊】 Dhania, Narender K. ; Chauhan, Vinod K. ; 等 《Comparative biochemistry and physiology, Part D. Genomics & proteomics》 2019年30D卷 81-90页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Bacillus thuringiensis; Castor semilooper; Larval midgut;

【外文期刊】 《Mechanisms of Development》 2020年161卷 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Axolotl; RNA-Seq; Taste bud development;

【外文期刊】 Andrew R. Raduski ; Adam Herman ; 等 2021年108卷1期 145-158页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Asteraceae; de novo domestication; population genetics;

【外文期刊】 Le Luyer, J. ; Deschamps, M-H ; 等 《Marine genomics》 2014年18卷Pt.B期 141-144页

【关键词】 Transcriptome; RNA-sequencing; De novo assembly;

【外文期刊】 Kang, Se Won ; Patnaik, Bharat Bhusan ; 等 《Comparative biochemistry and physiology, Part D. Genomics & proteomics》 2017年21D卷 77-89页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Satsuma myomphala; Illumina sequencing; De novo annotation;

【外文期刊】 Marchant, A. ; Mougel, F. ; 等 《Insect Biochemistry and Molecular Biology》 2016年69卷 25-33页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Rhodnius prolixus; Chagas disease vectors; Reference transcriptome;

【外文期刊】 Wu Tuheng ; Ye Zhiwei ; 等 《Journal of Basic Microbiology: An International Journal on Morphology, Physiology, Genetics, and Ecology of Microorganisms》 2018年58卷8期 698-703页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 cold‐induced initiation; de novo transcriptome; EST‐SSRs;

【外文期刊】 Eldem, Vahap ; Zararsiz, Gokmen ; 等 《Marine genomics》 2015年20卷 7-9页

【关键词】 Anchovy; Muscle; Transcriptome;

【外文期刊】 Christie, Andrew E. ; Cieslak, Matthew C. ; 等 《Marine genomics》 2018年38卷 67-88页

【关键词】 de novo transcriptome assembly; Bioinformatics; Endocrinology;

【外文期刊】 Perez-Portela, R. ; Turon, X. ; 等 《Molecular ecology resources》 2016年16卷3期 794-808页

【关键词】 coelomocytes; de novo assembly; digestive;

【外文期刊】 Yusuke Kuwahara ; Daisuke Nakajima ; 等 《生薬学雑誌》 2019年73卷2期 369-380页

【关键词】 Saponin biosynthesis; De novo transcriptome assembly; Gleditsia sinensis;

【外文期刊】 Palmieri, Nicola ; Nolte, Viola ; 等 《Molecular ecology resources》 2015年15卷2期 372-381页

【关键词】 alternative splicing; de novo assembly; Drosophila simulans;

【外文期刊】 Kim, Chan-Hee ; Kim, Eun Jeong ; 等 《Marine genomics》 2021年57卷

【关键词】 Triploid abalone; Haliotis discus hannai; Heat-stress;

【外文期刊】 Xiao, Mingsong ; Bao, Fangyin ; 等 《Journal of genetics》 2019年98卷2期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 illumina sequencing; de novo assembly; transcriptome;

【外文期刊】 《Molecular Breeding》 2016年36卷10期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Rehmannia glutinosa Libosch; Verbascoside biosynthesis; De novo transcriptome sequencing;

【外文期刊】 《Physiology and Molecular Biology of Plants》 2020年26卷1期 133-142页

【关键词】 Lemna gibba; Transcriptome; De novo assembly;

【外文期刊】 Yang, Yuchen ; Yang, Shuhuan ; 等 《Marine genomics》 2015年23卷 33-36页

【关键词】 Ceriops; Transcriptome; Sequencing;

【外文期刊】 Acevedo, Rani M. ; Avicol, Edgardo H. ; 等 《Planta: An International Journal of Plant Biology》 2019年250卷2期 445-462页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Abiotic stress; De novo transcriptome; Drought stress;

【外文期刊】 《Experimental parasitology》 2018年184卷 90-96页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Metorchis orientalis; Transcriptome; De novo;

【外文期刊】 Arias, Daniela ; Maldonado, Jonathan ; 等 《Molecular genetics and genomics: MGG》 2020年295卷6期 1379-1392页

【关键词】 Carrot; De novo transcriptome; Carotenoid biosynthesis;

【外文期刊】 Raghavan, Venket ; Kraft, Louis ; 等 2022年23卷2期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 de novo; transcriptome; assembly;

【外文期刊】 Razak, Muhammad Raznisyafiq ; Aris, Ahmad Zaharin ; 等 《Marine biotechnology》 2023年25卷3期 473-487页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Moina Micrura; Cladocerans; RNA-seq;

【外文期刊】 Kasaian,K. ; Wiseman,S.M. ; 等 《Journal of Pathology: Journal of the Pathological Society of Great Britain and Ireland》 2013年230卷3期 249-260页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 data integration; de novo assembly; expression analysis;

【外文期刊】 《Asian-Australasian Journal of Animal Sciences》 2017年30卷6期 773-780页 SCIEMEDLINE

【关键词】 Normally Hatched; Assisted Ducklings; Transcriptome;

【外文期刊】 Martinez, Bridget ; Khudyakov, Jane ; 等 《Physiological genomics》 2018年50卷7期 495-503页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 adipose; de novo assembly; extracellular matrix;

【外文期刊】 Kaur Chetan ; Kanth Bashistha Kumar ; 等 《Plant biotechnology reports》 2022年16卷6期 741-755页

【关键词】 De novo assembly; Halophyte; New Zealand spinach;

【外文期刊】 Wang, Gang ; Du, Xilong ; 等 《Gene: An International Journal Focusing on Gene Cloning and Gene Structure and Function》 2015年555卷2期 458-463页

【关键词】 De novo; RNA-seq; Lycium chinense Mill.;

【外文期刊】 Qi, Shan-Shan ; Manoharan, Bharani ; 等 2022年150卷1期 13-26页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Invasive weed; De novo transcriptome assembly; Plant defense;

【外文期刊】 Kim, Seungill ; Kim, Myung-Shin ; 等 《DNA research: an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes》 2015年22卷1期 19-27页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 de novo transcriptome; gene prediction; reference gene set;

【外文期刊】 Ghissing, U. ; Kutty, N. N. ; 等 《Plant biology》 2023年25卷1期 85-95页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Anthocyanin; colour change; Combretum indicum;

【外文期刊】 Zhang, Di ; Ren, Li ; 等 《Gene: An International Journal Focusing on Gene Cloning and Gene Structure and Function》 2015年565卷2期 252-267页

【关键词】 De novo transcriptome sequencing; Dwarfism; Hormonal signaling;

【外文期刊】 Hiki, Kyoshiro ; Nakajima, Nobuyoshi ; 等 《Marine genomics》 2018年39卷 11-14页

【关键词】 De novo transcriptome sequencing; Grandidierella japonica; Zinc;

【外文期刊】 《Plant molecular biology reporter》 2020年38卷1期 130-136页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Pumpkin; Transcriptome; De novo assembly;

【外文期刊】 Li, Changlin ; Zhao, Wang ; 等 2021年40D卷 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Sea cucumber; Thermal stress; RNA-seq;