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【中文期刊】 Jiaming Su Ying Qian  《定量生物学（英文版）》 2024年12卷2期 155-163页

【摘要】 Drug-drug interaction(DDI)event prediction is a challenging problem,and accurate prediction of DDI events is critical to...

【关键词】 adaptive learning； graph convolutional networks； interaction prediction；

【外文期刊】 Gao Hongli ; Zhang Bin ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷3期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 single-cell multi-omics; information transfer; integration;

【外文期刊】 Bonthada S. ; Perumal S.P. ; 等 《Biomedical signal processing and control》 2024年90卷Apr.期 1.1-1.9页

【关键词】 Convolutional Neural Network; Early Termination; Excessive Extrapolated Volume;

【外文期刊】 Nikolentzos, Giannis ; Dasoulas, George ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2020年130卷 195-205页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Graph neural networks; Graph mining; Expressivity;

【外文期刊】 Shahabi, Mohsen Sadat ; Shalbaf, Ahmad ; 等 《International Journal of Neural Systems》 2023年33卷2期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Transfer learning; convolutional neural networks; long-short term memory;

【外文期刊】 Wiseman, Stewart J. ; Booth, Tom ; 等 《Human brain mapping》 2018年39卷2期 622-632页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 neural networks; graph theory; white matter hyperintensities;

【外文期刊】 Qi Chang ; Cancheng Li ; 等 2021年29卷 1784-1794页

【关键词】 Electroencephalography; Support vector machines; Brain modeling;

【外文期刊】 Ramirez, Ricardo ; Chiu, Yu-Chiao ; 等 《Methods: A Companion to Methods in Enzymology》 2021年192卷 120-130页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Survival analysis; Graph convolutional neural network; The cancer genome atlas (TCGA);

【外文期刊】 Li, Xue ; Cheng, Yuanzhi ; 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2021年140卷 130-135页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Graph neural networks; Message passing; Power iteration;

【外文期刊】 Hanik, Martin ; Demirtas, Mehmet Arif ; 等 2022年16卷3期 1123-1138页

【关键词】 Regression; Graph neural network; Sample selection;

【外文期刊】 RICCARDO RIZZO ; 《International Journal of Neural Systems》 2005年15卷5期 349-355页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Graph clustering; Self-organization; Growing neural networks;

【外文期刊】 W. Fries ; 《Neurologie & Rehabilitation: die Zeitschrift f黵 Neurologische Rehabilitation und Pr鋠ention : offizielles Organ der Deutschen Gesellschaft f黵 Neurologische Rehabilitation》 2019年25卷1期 41-49页

【关键词】 functional magnetic resonance imaging; tractography; theory of localization;

【外文期刊】 Devi D. ; Sophia S. ; 《Biomedical signal processing and control》 2024年90卷Apr.期 1.1-1.15页

【关键词】 And variability analysis; Cognitive learning; Graph-based conventional attention neural network (GA-CNN);

【外文期刊】 Liu, Xuan ; Song, Congzhi ; 等 2022年23卷1期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Cancer drug response prediction; Graph neural network; Contrastive learning;

【外文期刊】 Gu Jeonghyeon ; Bang Dongmin ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷5期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 drug combination; knowledge graph; drug–drug interaction;

【外文期刊】 Turova TS. ; 《BioSystems》 2002年67卷1/3期 281-286页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Attractor; Neural network; Phase transition;

【外文期刊】 Li, Xiao-Shuang ; Liu, Xiang ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2022年23卷4期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Graph neural network; Graph representation and featurization; Protein-ligand binding;

【外文期刊】 Strokach, Alexey ; Lu, Tian Yu ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2021年433卷11期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 variant effect prediction; stability prediction; affinity prediction;

【外文期刊】 Zhao X. ; Wu J. ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2022年154卷 56-67页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Brain network; Deep reinforcement learning; Graph neural network;

【外文期刊】 Zhou Yuting ; Jiang Yongquan ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷3期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 protein–protein interaction site prediction; graph neural network; deep learning;

【外文期刊】 Zeng, Yuansong ; Wei, Zhuoyi ; 等 2022年23卷2期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 single-cell RNA sequencing; single-cell classification; batch effects;

【外文期刊】 Wang Z. ; Cao Q. ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2022年155卷 74-83页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Convolutional neural networks; Graph classification; Location-aware;

【外文期刊】 Liu, Zhihua ; Tong, Lei ; 等 《IEEE Transactions on Medical Imaging》 2021年40卷7期 1763-1777页

【关键词】 Image segmentation; Tumors; Graph neural networks;

【外文期刊】 Zi-Ang Shen ; Tao Luo ; 等 2021年22卷5期 bbab051-1-bbab051-11页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 graph neural network; ncRNA-protein interaction; noncoding RNA;

【外文期刊】 Krishnan, Aravind ; Vinod, Dayanand ; 2024年20卷1期 33-41页

【关键词】 COVID-19; SARS-CoV-2; binding affinity prediction;

【外文期刊】 Jiancheng Zhong ; Pan Cui ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2023年30卷9期 1019-1033页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 drug–disease association; graph convolutional neural network; heterogeneous networks;

【外文期刊】 Liu H. ; Zhang J. ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2022年145卷 308-318页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 DEAP; Emotion classification; Graph neural network;

【外文期刊】 Scarselli, Franco ; Tsoi, Ah Chung ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2018年108卷 248-259页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Vapnik-Chervonenkis dimension; Generalization; Graph neural networks;

【外文期刊】 Shan He ; XiaoYing Lv ; 等 《Human gene therapy》 2024年35卷1/2期 70-79页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 drug repositioning; rare disease; familial ATTR amyloidosis;

【外文期刊】 Shin, Seung Yeon ; Lee, Soochahn ; 等 《Medical image analysis》 2019年58卷 101556-101556页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Vessel segmentation; Convolutional neural network; Graph neural network;

【外文期刊】 Xu, Fangzhou ; Li, Jincheng ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2022年156卷 135-151页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Brain-computer interface; Electroencephalography; Motor imagery;

【外文期刊】 Yaxin Gu ; Yimeng Wang ; 等 2023年42卷7期 2200284-2200284页

【关键词】 Drug-induced liver injury; Hybrid representation; Graph neural network;

【外文期刊】 Yun S. ; Jeong M. ; 等 2022年153卷 104-119页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Graph Neural Networks; Heterogeneous graphs; Machine learning on graphs;

【外文期刊】 Huaixu Zhu ; Xiuquan Du ; 等 《Current Bioinformatics》 2020年15卷4期 368-378页

【关键词】 Feature graph; positional context; protein complex;

【外文期刊】 Liu, Chuang ; Wu, Jia ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2021年142卷 20-33页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Graph neural networks; Neighborhood aggregation; Semi-supervised node classification;

【外文期刊】 Li Yang ; Guo Zihou ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷3期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 disease–gene association prediction; heterogeneous network; graph neural network;

【外文期刊】 Tymofiyeva, Olga ; Connolly, Colm G. ; 等 《Journal of affective disorders》 2017年207卷 18-25页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 MRI; Adolescence; Brain;

【外文期刊】 Huang Yan ; Wuchty Stefan ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷2期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 protein–protein interaction; deep learning; graph convolutional neural network;

【外文期刊】 Hideyuki Jippo ; Tatsuru Matsuo ; 等 《Molecular informatics.》 2020年39卷1/2期 1800155-1800155页

【关键词】 Machine learning; Force field; Graph kernel;

【外文期刊】 Raschka, Sebastian ; Kaufman, Benjamin ; 《Methods: A Companion to Methods in Enzymology》 2020年180卷 89-110页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Molecular representations; GPCR ligands; Drug discovery;

【外文期刊】 Chen Y. ; You J. ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2023年161卷 505-514页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Graph classification; Graph neural networks; Node classification;

【外文期刊】 Jiang Qiangrong ; Qiu Guang ; 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2019年17卷5期 MEDLINE

【关键词】 Protein classification; neural network; graph kernel;

【外文期刊】 ALEXANDER N. GORBAN ; ANDREI ZINOVYEV ; 《International Journal of Neural Systems》 2010年20卷3期 219-232页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Kohonen neural networks; Self-organizing maps; Principal manifolds;

【外文期刊】 Salha-Galvan G. ; Lutzeyer J.F. ; 等 2022年153卷 474-495页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Community detection; Graph autoencoders; Graph neural networks;

【外文期刊】 Su, Xiaorui ; Hu, Lun ; 等 2022年23卷3期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 drug-drug interactions; graph neural network; knowledge graph;

【外文期刊】 Ktena, Sofia Ira ; Parisot, Sarah ; 等 《NeuroImage》 2018年169卷 431-442页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Functional brain connectivity; Spectral graph convolutions; Convolutional neural networks;

【外文期刊】 Lin, Shufei ; Cheng, Ruiqi ; 等 《Nature reviews Cancer》 2018年18卷8期

【关键词】 assisted navigation; place recognition; topological localization;

【外文期刊】 Du, Zhi-Hua ; Wu, Yang-Han ; 等 2022年23卷3期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 transcriptional regulatory network; transcription factor; graph neural network;

【外文期刊】 Cao W. ; Li S. ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2022年154卷 141-151页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Graph neural networks; Human motion predicting; Quaternion;

【外文期刊】 Xiao Y. ; Quan P. ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2022年154卷 413-424页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Graph neural networks; Graph representation learning; Heterogeneous graph;