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【中文期刊】 罗静初 《生物信息学》 2025年23卷3期 165-174页ISTIC
【摘要】 基于局部序列相似性比对的数据库搜索系统BLAST是生物信息学领域常用工具之一.本文首先介绍数据库相似性搜索的基本概念,包括计分矩阵、空位罚分,以及灵敏度和特异度等;以血红蛋白alpha和beta亚基为例,说明BLAST搜索基本策略,包括分割...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘心雨 姜丹 等 《中国现代中药》 2024年26卷1期 10-17页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:基于内转录间隔区(ITS)序列,运用DNA条形码技术对滇鸡血藤药材及其混伪品进行序列比对分析,根据单核苷酸多态性位点构建滇鸡血藤单倍型数据库,建立快速、准确鉴定滇鸡血藤的分子鉴定方法.方法:以滇鸡血藤及其混伪品为材料,利用DNA提取试...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 卢春芸 张能德 等 《广西医学》 2024年46卷12期 1829-1839页ISTICCA
【摘要】 目的 利用系统动力学方法分析深圳市HIV-1主要流行毒株的有效再生数(Re).方法 从HIV Sequence Database下载2005-2019年深圳市新报告HIV感染者的HIV-1基因序列.对序列进行整理、亚型判定后,利用中国艾滋病...
【关键词】 人类免疫缺陷病毒1型；有效再生数；分子簇；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 秦浥雯 张嘉仪 等 《生物信息学》 2024年22卷4期 277-286页ISTIC
【摘要】 纳米抗体是骆驼科动物中发现的抗体的一个亚类,是由单个多肽链组成的多功能分子结合支架.纳米抗体优越的性能决定了其在生物医学、食品科学等领域的广泛应用.尽管纳米抗体序列和结构数据已十分庞大,但其来源的异质性和缺乏标准化阻碍了纳米抗体信息的可靠收...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Ningbo Chen Weiwei Fu 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2020年18卷2期 186-193页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Next-generation sequencing has yielded a vast amount of cattle genomic data for global characterization of population ge...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王金虎 宁琰萍 等 《高原科学研究》 2023年7卷3期 13-21页
【摘要】 披针叶野决明(Thermopsis lanceolata)具有饲用、有机肥料和药用等多重功效.采用Illumina高通量测序技术,借助K-mer分析工具,揭示了披针叶野决明基因组的多个分子遗传学特征,包括基因组大小、杂合度和GC含量等,此外...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2005年3卷1期 52-57页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Copper and iron play important roles in a variety of biological processes, especially when being chelated with proteins....
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘玉智 门剑龙 等 《天津医药》 2018年46卷6期 610-614页MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 在分子水平探索鼻咽癌的发病机制,筛选鼻咽癌诊断或治疗的潜在分子靶标.方法 在GEO公共数据库中下载编号为GSE12452和GSE13597的基因芯片数据(包含鼻咽癌和对照鼻炎黏膜组织数据),利用R编程语言的相关工具包对原始芯片数据进行...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李嘉熙 宋刘梅 等 《中国医学教育技术》 2013年5期 546-548,549页
【摘要】 近年研究发现pre-miRNA发夹结构两侧的序列对miRNA的成熟至关重要。文章主要介绍了利用“miRBase”和“Ensembl”数据库获得构建microRNA高表达载体的pre-miRNA及其侧翼DNA序列的生物信息学方法：即先通过“m...
【关键词】 “miRBase”数据库；“Ensembl”数据库；成熟miRNA；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《亚太热带生物医学杂志（英文版）》 2012年3期 223-227页
【摘要】 Objective: To establish a polymerase chain reaction (PCR) technique based on cytochrome b (cytb) gene of mitochondria DN...
【关键词】 Molecular tool；Blood meal identification；Polymerase chain reaction；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 方琴 沈月兰 等 《安徽预防医学杂志》 2024年30卷1期 23-27页
【摘要】 目的 分析安徽省蚌埠市2021-2022年新报告HIV感染者基因亚型、治疗前耐药特征和HIV分子传播网络情况,为当地制定干预措施提供依据.方法 收集蚌埠市2021-2022年新报告HIV感染者样本90份,扩增pol基因并测序,借助Blast...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何宏港 吴悠 等 《微生物学报》 2022年62卷7期 2751-2767页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]查明引起湖北仙桃某中华鳖养殖场中华鳖发病死亡的病原及其特征.[方法]本研究分离患病中华鳖的病原,并结合形态特征、生理生化试验、16S rRNA基因鉴定,鉴定分离菌株;通过人工回归感染试验、药敏试验、全基因组测序与分析对分离菌株的致病...
- 概要：
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- 结论：
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 胡俊杰 孟翔 等 《昆虫学报》 2017年60卷1期 9-17页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]建立扶桑绵粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley的转录组数据库,揭示扶桑绵粉蚧转录组的整体表达特征.[方法]采用Illumina HiSeqTM 4000测序平台开展对扶桑绵粉蚧雌成虫转录组测定,对原始数据...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 侯丽 詹帅 等 《应用昆虫学报》 2017年54卷5期 693-704页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 随着测序技术的革新和多种组学综合分析方法的应用,昆虫基因组学研究领域得到了迅速的发展.目前,我国昆虫学家已经发表了家蚕Bombyx mori、小菜蛾Plutella xylostella、飞蝗Locusta migratoria榕小蜂Cer...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 林陈胜 阮宁生 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2016年32卷6期 599-606页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)在多个水平参与调节机体的各项基础生物进程,其功能紊乱常伴随疾病的发生.鉴定lncRNA的生物学功能已成为近年来的研究热点.然而,目前从各种真核生物高通量测序中鉴定的几...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 陈苏 陈姜 等 《中国药学杂志》 2016年51卷15期 1349-1352页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 聚酮类化合物(polyketide,PK)和非核糖多肽(nonribosonmal peptide,NRP)是两大类重要的微生物次级代谢产物,其生物合成需要聚酮合成酶(polyketide synthases,PKSs)和非核糖体多肽合成酶...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 罗静初 《生物技术通报》 2015年11期 102-111页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 介绍“实用生物信息技术”研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例，介绍常用生物信息技术和分析方法，包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast数据库相似性搜索、分子系统发生树构建，以及蛋白质结构比较分析等...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 Tsuyoshi HOSOYA Yukiko SAITO 等 《菌物学报》 2013年32卷3期 448-456页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 对日本新记录种Stamnaria americana进行了描述和图示.尽管低温适宜该种子囊孢子的萌发,它在20℃生长最好.DNA序列分析的结果表明,其分类地位应该从柔膜菌科转入锤舌菌科.
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 曹晶晶 王玫 等 《中华临床感染病杂志》 2011年04卷2期 96-101页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨引发医院感染的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的抗药性、来源和分子流行病学特征.方法 采集北京同仁医院2007-2008年分离的明确致病MRSA 57株,结合K-B法、MIC法、多重PCR、自动化重复序列PCR(REP-PCR...
【关键词】 葡萄球菌,金黄色；SCCmec分型；自动化重复序列PCR；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 肖扬 陈隆钟 等 《菌物学报》 2009年28卷4期 548-552页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 采用数据库搜索及ISSR-抑制PCR法开发香菇微卫星标记.由数据库搜索法开发出21对引物,11对有多态性,各位点平均产生3.3个等位基因;通过ISSR-抑制PCR法开发出8对引物,5对具多态性,各位点平均产生3个等位基因.结果表明,在香菇S...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 Le Zhang Lei Zhang 等 《药学学报（英文版）》 2021年11卷10期 3092-3104页
【摘要】 Mitotic catastrophe (MC) is a form of programmed cell death induced by mitotic process dis-orders,which is very importan...
【关键词】 Mitotic catastrophe；Database；Protein sequence analysis；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王芹 刘晓秋 等 《国际放射医学核医学杂志》 2012年36卷3期 157-159页ISTIC
【摘要】 目的 分离和鉴定IRM-2小鼠辐射抗性相关基因.方法 以IRM-2小鼠的21条表达序列标签为模板进行PCR扩增,从IRM-2小鼠全长cDNA文库中测定cDNA克隆的序列,通过与GenBank进行同源序列信息比对,对全长cDNA编码的蛋白质进...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郑坚 邹泽红 等 《中国基层医药》 2010年17卷13期 1729-1731,后插1页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨扩增片段长度多态性(AFLP)技术应用于变态反应疾病等复杂样本的遗传研究之可能性,探讨差异片段后续分析方法.方法 利用公共数据库中获得的遗传背景差异较大的成对材料进行AFLP筛选所得的差异片段,采用不同的BLAST程序进行深入的生...
【关键词】 多态性,限制性片段长度；序列分析,DNA；数据库,遗传学；
- 概要：
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【中文期刊】 《植物学报（英文版）》 2012年54卷5期 345-355页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Associating phenotypic traits and quantitative trait loci (QTL) to causative regions of the underlying genome is a key g...
【关键词】 QTL；bioinformatics；databases.；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 石瑞君 张剑韵 等 《遗传学报》 2007年34卷8期 683-690页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 吡哆醛激酶(EC 2.7.1.35)在ATP和Zn2+的存在下,催化吡哆醛的磷酸化反应生成磷酸吡哆醛(PLP).在生物体内许多酶促反应中,PLP是一种重要的辅酶因子.家蚕和哺乳动物一样,需依赖食物中的维生素B6前体来合成PLP.文章描述了利...
- 概要：
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【中文期刊】 马晓燕 李少英 等 《中山大学学报（医学科学版）》 2018年39卷2期 227-232页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]分析Expressmarker22(EX22)系统检测广东汉族人群中的梯度标准物范围之外(OL)等位基因频率及序列组成,完善频率数据库.[方法]应用EX22系统对3495例广东汉族无关个体进行STR分型,统计等位基因分型OL的等位基...
【关键词】 Expressmarker22；短串联重复序列；梯度标准物范围之外的等位基因；
- 概要：
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【中文期刊】 郭明璋 许文涛 等 《食品安全质量检测学报》 2014年9期 2951-2955页
【摘要】 目的：氨基酸序列相似性等生物信息学分析方法是转基因食品致敏性评价的重要环节，为了简化转基因食品致敏性生物信息学分析的流程，我们建立了中国食物过敏原数据库。方法将多个数据库中关于过敏原的信息进行了整合并进行本地存储。通过web语言PHP、we...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李贝贝 姜建福 等 《植物遗传资源学报》 2018年19卷2期 338-350页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 利用SSR分子标记技术对314份葡萄品种进行了DNA指纹数据库构建和遗传多样性分析,为葡萄品种鉴定、亲缘关系分析和植物品种权保护提供科学依据.结果表明:9对引物共扩增出199个等位基因,多态性位点为199个,多态性比率达100％,每个标记检...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 杨春利 蔡玉春 等 《中国病原生物学杂志》 2017年12卷2期 110-114页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 通过对专业数据库的搜索,筛选出田鼠巴贝虫棒状体相关蛋白的基因,并进行生物信息学分析预测.方法 搜索NCBI、EMBL-EBI、Uniprot及PiroplasmaDB数据库,筛选田鼠巴贝虫棒状体蛋白基因.通过生物信息学方法,利用多种数...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 邹玖明 张爱平 等 《中国感染与化疗杂志》 2014年3期 186-189页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的：对襄阳市中心医院分离1株疑似霍乱弧菌进行鉴定及药物敏感性试验，并检测其主要毒力基因。方法利用MicroScan WalkAway 40鉴定仪进行生化鉴定及药物敏感性试验，玻片凝集法确定其血清型别，应用 PCR 及测序技术分析其16Sr...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵锐 钱震 等 《生物信息学》 2009年7卷2期 143-145,149页ISTIC
【摘要】 设计一种基于网络的可用来存储和注释海量DNA数据的数据库模型.整个过程分为三部分:首先是构建数据库框架,然后对原始基因组序列数据进行批量注释并输出有效格式导入数据库,最后通过一个友好的用户交互界面,实现对基因组数据的在线读取,查询,注释等操...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 叶婵娟 刘明锋 等 《仲恺农业工程学院学报》 2013年4期 1-7页
【摘要】 利用clustal W软件对42个猕猴桃（ Actinidia spp．）品种及种内不同性别间的rbcL基因序列进行了亲缘关系分析，还根据“和平红阳”猕猴桃雌株和雄株的叶绿体基因rbcL序列与GenBank的其他猕猴桃rbcL基因序列进行U...
【关键词】 猕猴桃 ( Actinidia spp.)；DNA条形码；rbcL基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Munch Kasper ; Boomsma Wouter ; 等 《Systematic Biology》 2008年57卷5期 750-757页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 database sequence retrieval;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Lee HY ; Yoo JE ; 等 《Human Biology: Official Publication of the Human Biology Council》 2008年80卷3期 239-250页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Base Sequence;Bone and Bones;DNA;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Frank AM ; Bandeira N ; 等 《Journal of proteome research》 2008年7卷1期 113-122页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 clustering;MS/MS;database search;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Soto-Cerda, Braulio J. ; Carrasco, Rodrigo A. ; 等 《Plant molecular biology reporter》 2011年29卷3期 753-759页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 alleles;microsatellite marker;primer;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Magrane M ; Apweiler R ; 《Genesis: the journal of genetics and development》 2000年26卷1期 1-4页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Peng CA ; Oliver MJ ; 等 《Plant biology》 2005年7卷3期 315-320页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 desiccation;membrane protein;moss;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Reitzel, A.M. ; Sullivan, J.C. ; 等 《Estuaries and coasts》 2010年33卷4期 930-943页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Board PG ; nu.edu.au ; 等 《Drug Metabolism and Disposition: The Biological Fate of Chemicals》 2001年29卷4 Pt.2期 544-547页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Database Management Systems;Expressed Sequence Tags;Glutathione Transferase genetics;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Blankenberg D ; Taylor J ; 等 《Genome research》 2007年17卷6期 960-964页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Zhou L ; Li-Ling J ; 等 《Genomics》 2008年91卷2期 129-141页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Kyung-Hoon Kwon ; Mioak Kim ; 等 《Proteomics》 2003年3卷12期 2305-2309页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 database search;de nove sequencing;Expressed Sequence Tag;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Ankenbrand, Markus J. ; Keller, Alexander ; 等 《Molecular biology and evolution》 2015年32卷11期 3030-3032页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Wu JL ; Wu CJ ; 等 《Plant Molecular Biology》 2005年59卷1期 85-97页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Allen, Kelly E. ; Yabsley, Michael J. ; 等 《Journal of Parasitology》 2011年97卷4期 648-653页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Ginzinger SW ; Gerick F ; 等 《Journal of Biomolecular NMR》 2007年39卷3期 223-227页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 chemical shifts;re-referencing;NMR;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Ackermann K ; Neidhart T ; 等 《Molecular and Cellular Biochemistry: An International Journal for Chemical Biology》 2005年274卷1/2期 91-101页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein kinase CK2 gene;Alu repeat;transcription control;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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