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【外文期刊】 Preissner R. ; Goede A. ; 等 《Bioinformatics》 1999年15卷10期 832-836页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Surface shape complementarity; Docking; Patches;
【外文期刊】 Na? Alexandra ; Schaller David ; 等 《Molecular informatics.》 2019年38卷5期 1800141-1800141页
【关键词】 Computational chemistry; Molecular modeling; Molecular dynamics;
【外文期刊】 Barik, Amita ; Nithin, C. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2015年33卷11/12期 2738-2751页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein-RNA complexes; protein-RNA interfaces; interfaces area;
【外文期刊】 Jones S. ; Thornton JM. ; 《Journal of Molecular Biology》 1997年272卷1期 133-143页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Molecular recognition; Protein-protein interaction; Prediction;
【外文期刊】 Khor, Bee Yin ; Lim, Theam Soon ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2017年76卷 543-550页
【关键词】 BmR1 antigen; De novo scFv design; Hot-spot -centricapproach;
【外文期刊】 van der Zee, Jens ; Lau, Alvaro ; 等 《Annals of Botany》 2021年128卷6期 725-735页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Crown shyness; complementarity; a shapes;
【外文期刊】 Hayashi, Akiko ; Haruna, Ken-ichi ; 等 《Chembiochem: A European journal of chemical biology》 2021年22卷1期 120-123页
【关键词】 bromotyrosine; Fab; shape complementarity;
【外文期刊】 Inbar Y ; Benyamini H ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2005年349卷2期 435-447页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 multimolecular assembly; docking; combinatorial assembly;
【外文期刊】 Vakser IA. ; 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 1996年39卷3期 455-464页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Protein-protein recognition; Macromolecule-ligand interactions; Monte-carlo docking;
【外文期刊】 Chelliserrykattil J ; Lu H ; 等 《Chembiochem: A European journal of chemical biology》 2008年9卷18期 2976-2980页
【关键词】 benzopyrimidine; DNA replication; DNA;
【外文期刊】 Williams, Gareth ; 《Journal of molecular graphics & modelling》 2018年84卷 69-73页
【关键词】 Protein structure; Protein-protein docking; Shape complementarity;
【外文期刊】 Bahadur,R.P. ; Basak,J. ; 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2014年32卷3/4期 669-681页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Host-pathogen interaction; interface area; nonhost resistance;
【外文期刊】 Schneidman-Duhovny, Dina ; Hammel, Michal ; 等 《Journal of Structural Biology》 2011年173卷3期 461-471页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein complex; protein-protein interaction; sampling resolution;
【外文期刊】 Pierce B ; Tong WW ; 等 《Bioinformatics》 2005年21卷8期 1472-1478页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 MOLECULAR-SURFACE RECOGNITION; NUCLEOSIDE DIPHOSPHATE KINASE; PROTEIN-DOCKING;
【外文期刊】 Shaikh SA ; Ahmed SR ; 等 《Archives of Biochemistry and Biophysics》 2004年429卷1期 81-99页 SCISCIE
【关键词】 DNA-drug interactions; free energy component analysis; A/T specificity;
【外文期刊】 Dong,Liu ; Ye,Lu ; 等 《Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)》 2022年28卷16期 e202104617页 SCIMEDLINECA
【关键词】 Catenane; Half-Sandwich Complexes; Integrative Self-Assembly;
【外文期刊】 Abhijit,Gupta ; Arnab,Mukherjee ; 《Proteins》 2022年90卷9期 1669-1683页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 algorithm; hierarchical clustering; protein;
【外文期刊】 Akiko,Hayashi ; Ken-Ichi,Haruna ; 等 《Chembiochem : a European journal of chemical biology》 2021年22卷1期 120-123页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 Fab; Rituximab; bromotyrosine;
【外文期刊】 Edoardo,Milanetti ; Mattia,Miotto ; 等 《Computational and structural biotechnology journal》 2021年19卷 29-36页 SCIMEDLINE
【关键词】 Molecular surface; Protein-protein interactions; Shape complementarity;
【外文期刊】 Yusuke,Ootani ; Yoshinobu,Akinaga ; 等 《Journal of computational chemistry》 2015年36卷7期 459-66页 SCIMEDLINECA
【关键词】 QM/MM DFT calculation; aza-Cope rearrangement; host-guest interaction;
【外文期刊】 Mattia,Miotto ; Lorenzo,Di Rienzo ; 等 《Frontiers in molecular biosciences》 2021年8卷 607443页
【关键词】 SARS-CoV-2; lactoferrin; molecular dynamics simulation;
【外文期刊】 Giacomo,Parisi ; Roberta,Piacentini ; 等 《Frontiers in molecular biosciences》 2023年10卷 1332359页
【关键词】 biolayer interferometry (BLI); ferritin-based nanoparticle; molecular dynamics simulation;
【外文期刊】 Daniel J,Beltran-Villegas ; Laura,Colón-Meléndez ; 等 《Journal of colloid and interface science》 2016年463卷 242-57页 SCIMEDLINECA
【关键词】 Anisotropic particle assembly; Kinetics of self-assembly; Lock-key colloids;
【外文期刊】 Amita,Barik ; Nithin,C ; 等 《Journal of biomolecular structure & dynamics》 2015年33卷12期 2738-51页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 hydrogen bond; interfaces area; protein-RNA complexes;
【外文期刊】 Alfredo,De Lauro ; Lorenzo,Di Rienzo ; 等 《Frontiers in molecular biosciences》 2022年9卷 874296页
【关键词】 SARS-CoV-2; antibobies; computational modeling;
【外文期刊】 Ying,Liu ; Ziman,Chen ; 等 《Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)》 2024年11卷21期 e2309243页
【关键词】 boosted enzyme activity; enzyme immobilization; metal–organic frameworks;
【外文期刊】 Gareth,Williams ; 《Journal of molecular graphics & modelling》 2018年84卷 69-73页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 Protein structure; Protein-protein docking; Shape complementarity;
【外文期刊】 Yumeng,Yan ; Sheng-You,Huang ; 《BMC bioinformatics》 2019年20卷Suppl 25期 696页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 Fast-Fourier transform; Molecular docking; Protein-protein Interactions;
【外文期刊】 Edoardo,Milanetti ; Mattia,Miotto ; 等 《Frontiers in molecular biosciences》 2021年8卷 690655页
【关键词】 SARS-CoV-2; shape complementarity; sialic acid;
【外文期刊】 Bee Yin,Khor ; Theam Soon,Lim ; 等 《Journal of molecular graphics & modelling》 2017年76卷 543-550页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 BmR1 antigen; De novo scFv design; Dock-and-design approach;
【外文期刊】 Annika,Leifert ; Yu,Pan ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2013年110卷20期 8004-9页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 complementarity; gold cluster; nanotoxicology;
【外文期刊】 Noriko,Saito-Tarashima ; Noriaki,Minakawa ; 《Chemical & pharmaceutical bulletin》 2018年66卷2期 132-138页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 DNA polymerase; PCR; hydrogen-bonding;
【外文期刊】 Alexandra,Naß ; David,Schaller ; 等 《Molecular informatics》 2019年38卷5期 e1800141页 SCIMEDLINECA
【关键词】 Computational chemistry; Molecular dynamics; Molecular modeling;
【外文期刊】 Laskowski RA. ; Humblet C. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 1996年259卷1期 175-201页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Protein binding sites; Protein modelling; Atom-atom contacts;
【外文期刊】 Li CH. ; Ma XH. ; 等 《Protein Engineering》 2003年16卷4期 265-269页 MEDLINE
【关键词】 Binding free energy; Molecular flexibility; Molecular recognition;
【外文期刊】 Peters KP. ; Frommel C. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 1996年256卷1期 201-213页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Binding sites; Protein structure; Geometry;
【外文期刊】 Chelliah V ; Blundell TL ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2006年357卷5期 1669-1682页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein-protein docking; distance restraints; environment specific substitution tables;
【外文期刊】 Pedro J. Ballester ; Isaac Westwood ; 等 《Journal of the Royal Society Interface》 2010年7卷TN.43期 335-342页
【关键词】 drug lead identification; ligand-receptor shape complementarity; prospective virtual screening;
【外文期刊】 Axenopoulos, Apostolos ; Daras, Petros ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2013年10卷1期 135-150页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Protein docking; local descriptors; physicochemical complementarity;
【外文期刊】 Decanniere K ; Transue TR ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2001年313卷3期 473-478页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Immunoglobulin; Heavy chain antibody; Vhh;
【外文期刊】 Maeda, MH ; Kinoshita, K ; 《Journal of molecular graphics & modelling》 2009年27卷6期 706-711页
【关键词】 Assembling space volume; Delaunay tessellation; Gap volume;
【外文期刊】 Saito-Tarashima, Noriko ; Minakawa, Noriaki ; 《Chemical and Pharmaceutical Bulletin》 2018年66卷2期 132-138页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 unnatural base pair; hydrogen-bonding; shape complementarity;
【外文期刊】 Schneidman-Duhovny D ; Inbar Y ; 等 《Nucleic Acids Research》 2005年33卷Suppl.7期 W363-W367页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 PROTEIN-PROTEIN DOCKING; MOLECULAR-SURFACE RECOGNITION; SHAPE COMPLEMENTARITY;
【外文期刊】 Abhijit Gupta ; Arnab Mukherjee ; 2022年90卷9期 1669-1683页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 algorithm; hierarchical clustering; protein;
【外文期刊】 Axenopoulos, Apostolos ; Daras, Petros ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2011年8卷6期 1441-1457页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Protein docking; geometric complementarity; rigid body;
【外文期刊】 Wahyu Sri Kunto Nugroho ; Sangwook Wu ; 等 《Journal of neurosurgical sciences》 2018年62卷2期 106-112页 MEDLINE
【关键词】 Ice-binding protein; Thermal hysteresis; Ice crystal planes;
【外文期刊】 Bhinge A ; Chakrabarti P ; 等 《Structure》 2004年12卷11期 1989-1999页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 SHAPE COMPLEMENTARITY; RECOGNITION SITES; GEOMETRIC FIT;
【外文期刊】 Robin, Adeline Y. ; Miller, Michelle S. ; 等 2022年29卷9期 1757-1768页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 DOMAIN-SWAPPED DIMER; PROTEIN; DYNAMICS;
【外文期刊】 Maccallum RM. ; Thornton JM. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 1996年262卷5期 732-745页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Molecular recognition; Complementarity determining region; Surface shape;
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