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              1. 围手术期抗菌药物医嘱预点评工具的设计与效果

              【中文期刊】 母立峰 何梅  等 《医药导报》 2024年43卷1期 54-58页 ISTICPKUCA

              【摘要】 目的 设计围手术期抗菌药物医嘱预点评工具,以提高医院围术期抗菌药物管理工作效率.方法 以开源软件R为平台,以相关指导原则和文件为依据,使用tidyverse等R包构建预点评工具,使用shiny包构建web应用程序.使用设计的预点评工具回顾性...

              【关键词】 抗菌药物； 围手术期； 医嘱点评；

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              2. PM2.5致人群死亡在线计算平台(Mortality@PM)的初步应用

              【中文期刊】 陈雨欣 王皓  等 《环境卫生学杂志》 2023年13卷9期 668-673页 ISTIC

              【摘要】 本研究开发了一个交互友好,输入简便的 PM2.5 致多种疾病死亡人数的在线计算平台.以缺血性心脏病、中风、肺癌、下呼吸道感染、慢性阻塞性肺疾病、2 型糖尿病六种疾病为代表,本研究根据 PM2.5 致不同疾病死亡的计算公式,借助于 R shi...

              【关键词】 细颗粒物； 死亡人数； 在线计算平台；

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              3. MetaDTA:一款诊断试验准确性Meta分析在线应用程序

              【中文期刊】 杨水华 姚桂英  等 《中国全科医学》 2025年28卷8期 1023-1032页 ISTICPKUCA

              【摘要】 MetaDTA是一款对诊断试验准确性研究进行Meta分析的在线、交互式应用程序,该应用程序调用R软件中lme4 和shiny程序包实现统计分析并建立交互式用户界面.该应用程序无需用户了解任何有关统计和编程的知识,也无需安装任何专业软件,便于...

              【关键词】 MetaDTA； 诊断试验准确性研究； Meta分析；

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              4. 重构本草——泽兰

              【中文期刊】 王昭博 张伟  等 《吉林中医药》 2024年44卷3期 339-341页 ISTIC

              【摘要】 通过古籍文献调研、中药现代研究进展及其研究成果的梳理,结合中医临床及中药学等学科领域内的专家学者的认识及应用经验,归纳出泽兰:主要功效为活血调经,祛瘀消痈,利水消肿.症靶为水肿、月经不调.现代药理研究发现泽兰及其有效成分具有改善肝肾功能、抗...

              【关键词】 泽兰； 症靶； 水肿；

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              5. OpenNAU:An open-source platform for normalizing,analyzing,and visualizing cancer untargeted metabolomics data

              【中文期刊】 Qingrong Sun Qingqing Xu  等 《中国癌症研究（英文版）》 2023年35卷5期 550-562页 SCIMEDLINEISTICCSCDCA

              【摘要】 Objective:As an important part of metabolomics analysis,untargeted metabolomics has become a powerful tool in the study ...

              【关键词】 Untargeted metabolomics； LAMP architecture； shiny；

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              6. TSR:A User-friendly R Shiny Application for Assessment of Optimal Blood Product Selection in ABO-incompatible Hematopoietic Stem Cell Transplantation

              【中文期刊】 Juan WANG Lin-feng DENG  等 《当代医学科学（英文）》 2023年43卷4期 716-722页 SCIMEDLINE

              【摘要】 Objective:Patients undergoing hematopoietic stem cell transplant(HSCT)need frequent transfusions,until their red blood c...

              【关键词】 transfusion practice； peripheral blood stem cell transplant； transfusion risks；

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              7. 应用R软件包processR实现各类中介模型

              【中文期刊】 刘念 陆泽凯  等 《中国卫生统计》 2023年40卷3期 473-476页 ISTICPKUCSCD

              【摘要】 目的 目前中介效应统计分析软件种类繁多,存在各种缺陷,本研究旨在寻找一种操作相对简单、输出结果丰富详细的途径,以便捷实现各类中介模型统计分析.方法 运用 R 软件包 processR 及其衍生的 Shiny 面板,以Chapman等人在 2...

              【关键词】 中介模型； 自助法； 结构方程模型；

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              8. 基于R-shiny的临床数据分析应用

              【中文期刊】 崔怡丹 魏婷  等 《中国卫生统计》 2022年39卷1期 149-152页 ISTICPKUCSCD

              【摘要】 目的 针对临床数据变量类型多、数据结构复杂的特征,基于R-shiny开发交互式分析临床数据并展示结果的应用.方法 基于R-shiny与R语言,搭建应用的UI(用户界面)和Server(后台功能),将相应代码封装并部署在网页上.以UK Bio...

              【关键词】 R-shiny； 临床数据； 生存分析；

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              9. 酶促酯交换反应制备亚麻籽油、文冠果油和牛油重构脂质

              【中文期刊】 殷振雄  《食品安全导刊》 2023年8期 100-103页

              【摘要】 用冷榨亚麻籽油、文冠果油、牛油为原料,以脂肪酶Novozym 435 为催化剂,研究酯交换产物的制备工艺,并测定评价重构脂质的理化性质、脂肪酸组成和流变特性.研究发现酯交换产物为牛顿流体,其理化性质符合食用油脂的相关规定,且脂肪酸不饱和程度...

              【关键词】 亚麻籽油； 文冠果油； 牛油；

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              10. COVID-ONE-hi:The One-stop Database for COVID-19-specific Humoral Immunity and Clinical Parameters

              【中文期刊】 Zhaowei Xu Yang Li  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2021年19卷5期 669-678页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

              【摘要】 Coronavirus disease 2019(COVID-19),which is caused by SARS-CoV-2,varies with regard to symptoms and mortality rates amon...

              【关键词】 Protein microarray； Humoral immunity； One-stop tool；

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              11. 基于交互式网页计算器的重症监护病房28天内输血的预测模型建立与验证

              【中文期刊】 盛松 高洪阳  等 《中国急救医学》 2022年42卷4期 307-312页 ISTICCSCDCA

              【摘要】 目的 基于交互式网页计算器建立重症监护病房(ICU)28 d内输血的预测模型并进行内部验证.方法 前瞻性连续收集2016年1月至2017年9月在日本千叶大学附属医院外科/内科ICU收治的符合纳入排除标准的患者121例.原始研究收集了性别、年...

              【关键词】 交互式网页计算器； R shiny； 重症监护病房(ICU)；

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              12. 3D基因组结构调控蛋白质的相分离特征分析

              【中文期刊】 邢佳庆 李腾  等 《军事医学》 2022年46卷3期 161-166页 ISTICCSCDCA

              【摘要】 目的 系统分析相分离和3D基因组结构调控蛋白质之间的关系.方法 通过预测所有氨基酸长度>100的人类蛋白质的内在固有无序序列(IDR),进行基于IDR比例的基因集富集分析(GESA),并筛选受相分离调控的3D基因组相关生物过程.结果 总共1...

              【关键词】 3D基因组结构； 相分离； 固有无序序列；

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              13. shinyChromosome:An R/Shiny Application for Interactive Creation of Non-circular Plots of Whole Genomes

              【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2019年17卷5期 535-539页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

              【摘要】 Non-circular plots of whole genomes are natural representations of genomic data aligned along all chromosomes. Currently...

              【关键词】 Genomic data visualization； Non-circular whole genome plot； Shiny application；

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              14. 基于R语言的北京市医耗联动综合改革数据分析Web应用系统的设计与实现

              【中文期刊】 杨辉  《中国数字医学》 2020年15卷7期 22-25页 ISTIC

              【摘要】 北京市医药分开与医耗联动综合改革实施以来,做好改革数据监测与分析工作成为重要内容之一.然而传统数据分析方法存在操作复杂和无法互动展示等缺点.据此本研究借助R语言的shiny、data.table与recharts等软件包,基于图形用户界面搭...

              【关键词】 数据分析； R语言； 可视化；

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              15. 基于Shiny框架的海洋浮标大数据处理实验平台

              【中文期刊】 任鹏 王廷伟  等 《实验室研究与探索》 2018年37卷8期 46-49页

              【摘要】 介绍了一种海洋浮标监测大数据在线获取、存储、处理和可视化实验平台.该平台基于Shiny网页框架进行构建,通过网络爬虫获取美国国家海洋与大气管理局(NOAA)公开的海洋浮标实时监测数据,利用Oracle数据库对数据进行高效存储和管理,进而利用...

              【关键词】 海洋数据分析； 可视化； R语言；

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              16. 阶梯整群随机试验的统计分析方法介绍

              【中文期刊】 董昱 黄闪闪  等 《中国循证医学杂志》 2024年24卷3期 355-363页 ISTICPKUCSCD

              【关键词】 阶梯整群随机试验； SW-CRT； 交叉设计；

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              17. 基于R Shiny开发的逆概率处理加权分析工具介绍

              【中文期刊】 胡俊承 王志海  等 《预防医学》 2023年35卷6期 551-552页 ISTIC

              【摘要】 基于医疗大数据的现实世界研究是临床研究的重要手段之一,它不仅能从庞大的数据中归纳和总结医学知识,还能为卫生政策的制定提供依据.与随机对照试验不同,现实世界研究常常是观察性的,研究设计因缺少随机化过程而导致暴露组(实验组)与非暴露组(对照组)...

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              18. 基于R shiny的法定传染病可视化分析系统的设计和初步应用

              【中文期刊】 胡晓雯 薛铭琰  等 《南京医科大学学报（自然科学版）》 2021年41卷3期 444-449,459页 ISTICPKUCSCDCA

              【关键词】 shiny； 传染病； 可视化；

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              19. 基于R-Shiny实现临床试验信息检索及Meta分析的工具开发——以非小细胞肺癌为例

              【中文期刊】 于朝雷 柏建岭  等 《中国临床药理学与治疗学》 2020年25卷9期 984-991页 ISTICPKUCSCDCA

              【摘要】 目的:开发出一个能够提供图形用户界面(graphical user interface,GUI)的临床试验文章数据检索和Meta分析整合的工具.方法:使用R语言Shiny包开发并构建基于Bootstrap框架的Web应用,并基于DT、Met...

              【关键词】 临床试验； Meta分析； Shiny框架；

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              20. 基于R-Shiny的Cox回归模型列线图绘制工具的开发实现

              【中文期刊】 邓强庭 栾嘉  等 《现代预防医学》 2018年45卷24期 4417-4422,4434页 ISTICPKUCA

              【摘要】 目的 开发出一个能提供图形用户界面(GUI)的Cox回归列线图绘制工具.方法 应用R语言和Shiny开发框架,构建B/S架构的Web应用.将R语言下Cox回归预测列线图的绘制代码封装为可视化的Web应用程序.结果 所开发的工具能提供可视化图...

              【关键词】 Cox回归； R软件； Shiny框架；

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              21. Apps can help bridge restoration science and restoration practice

              【外文期刊】 Sperry, Katie P. ; Shaw, Allison K. ; 等 《Restoration ecology》 2019年27卷5期 934-937页 SCISCIE

              【关键词】 digital tools; habitat connectivity; habitat restoration;

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              22. Using Alzheimer's disease blood tests to accelerate clinical trial enrollment

              【外文期刊】 Suzanne E. Schindler ; Yan Li ; 等 《Alzheimer’s & dementia: the journal of the Alzheimer’s Association》 2023年19卷4期 1175-1183页

              【关键词】 amyloid positron emission tomography; blood tests; blood‐based biomarkers;

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              23. Designing and evaluating dose-escalation studies made easy: The MoDEsT web app

              【外文期刊】 Pallmann, Philip ; Wan, Fang ; 等 2020年17卷2期 147-156页

              【关键词】 Phase I clinical trial; dose-finding study; logistic model;

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              24. Negative pigment network and shiny white streaks: A dermoscopic- pathological correlation study

              【外文期刊】 Pizzichetta,M.A. ; Canzonieri,V. ; 等 《American Journal of Dermatopathology》 2014年36卷5期 433-438页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 dermatofibroma; melanocytic nevi; melanoma;

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              25. Assessment methods for inter-laboratory comparisons of the dicentric assay

              【外文期刊】 Gonzalez Mesa, Jorge Ernesto ; Holladay, Bret ; 等 《International Journal of Radiation Biology: Covering the Physical, Chemical, Biological, and Medical Effects of Ionizing and Non-ionizing Radiations》 2023年99卷3期 431-438页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 Dicentric assay; laboratory comparisons; robust algorithms;

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              26. An R-shiny application to calculate optimal designs for single substance and interaction trials in dose response experiments

              【外文期刊】 Holland-Letz, T. ; Kopp-Schneider, A. ; 《Toxicology Letters: An International Journal Providing a Forum for Original and Pertinent Contributions in Toxicology Research》 2021年337卷 18-27页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 D-optimal design; R-shiny; Dose-response studies;

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              27. PgenePapers: a novel database and search tools of repotted regulatory pseudogenes

              【外文期刊】 Achal Awasthi ; Shenglong Tan ; 等 2020年13卷5/6期 504-519页

              【关键词】 regulatory pseudogene; database; search tools;

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              28. Description of two new marine pleurostomatid ciliates, Loxophyllum choii nov spec. and L-shini nov spec. (Ciliophora, Pleurostomatida) from China

              【外文期刊】 Lin XF ; Song WB ; 等 《European Journal of Protistology》 2007年43卷2期 131-139页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 Loxophyllum choii nov spec.; Loxophyllum shini nov spec.; marine ciliates;

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              29. Two new species of Cardiodectes Wilson, 1917 (Copepoda: Siphonostomatoida: Pennellidae) from gobiid fishes (Actinopterygii: Perciformes) in the western Pacific Ocean

              【外文期刊】 DAISUKE UYENO ; 《Zootaxa》 2013年3664期 301-311页

              【关键词】 parasitic copepods; pennellid; mesoparasite;

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              30. BIMAM-a tool for imputing variables missing across datasets using a Bayesian imputation and analysis model

              【外文期刊】 Elfadaly, Fadlalla G. ; Adamson, Alex ; 等 《International Journal of Epidemiology: Official Journal of the International Epidemiological Association》 2021年50卷5期 1419-1425页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 Multiple imputation methods; systematically missing data; Bayesian methods;

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              31. Elevation impact on seed germination requirements for two Asteraceae species

              【外文期刊】 Alyssa Brown ; Phil S Allen ; 《Native plants journal》 2023年24卷1期 45-53页

              【关键词】 arrowleaf balsamroot; cold stratification; seed dormancy;

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              32. Googling your hand hygiene data: Using Google Forms, Google Sheets, and R to collect and automate analysis of hand hygiene compliance monitoring

              【外文期刊】 Wiemken, Timothy L. ; Furmanek, Stephen P. ; 等 《American Journal of Infection Control》 2018年46卷6期 617-619页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 Hand hygiene; Antisepsis; Open-source software;

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              33. Development of an Interactive Web Application "Shiny App for Frequency Analysis on Homo sapiens Genome (SAFA-HsG)"

              【外文期刊】 Sivaprakasam, Balamurugan ; Sadagopan, Prasanna ; 《Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences》 2019年11卷4期 723-729页

              【关键词】 Human genome; CpG island; R;

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              34. Egg puncture allows shiny cowbirds to assess host egg development and suitability for parasitism

              【外文期刊】 Viviana Massoni ; Juan Carlos Reboreda ; 《The Royal Society Proceedings B》 1999年266卷1431期 1871-1874页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 brood parasitism; shiny cowbirds; yellow-winged blackbirds;

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              35. Technical note: ShinyAnimalCV: open-source cloud-based web application for object detection, segmentation, and three-dimensional visualization of animals using computer vision

              【外文期刊】 Wang, Jin ; Hu, Yu ; 等 2024年102卷

              【关键词】 computer vision; morphological features; object detection;

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              36. DosePredict: A Shiny Application for Generalized Pharmacokinetics-Based Dose Predictions

              【外文期刊】 Malek Okour ; 《Journal of clinical pharmacology.》 2020年60卷11期 1502-1508页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 data analysis; dose; pharmacokinetic;

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              37. Statistical Graphics and Interactive Visualization in Animal Science

              【外文期刊】 Morota, Gota ; 《Journal of Animal Science》 2021年99卷Suppl.3期 45-45页

              【关键词】 data visualization; R shiny; statistical graphics;

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              38. geomorph v4.0 and gmShiny: Enhanced analytics and a new graphical interface for a comprehensive morphometric experience

              【外文期刊】 Erica K. Baken ; Michael L. Collyer ; 等 《Methods in Ecology and Evolution》 2021年12卷12期 2355-2363页

              【关键词】 generalized Procrustes analysis; geometric morphometrics; geomorph;

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              39. Partial host fidelity in nest selection by the shiny cowbird (Molothrus bonariensis), a highly generalist avian brood parasite

              【外文期刊】 Mahler B ; Confalonieri VA ; 等 《Journal of evolutionary biology》 2007年20卷5期 1918-1923页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 brood parasitism; host specificity; Molothrus bonariensis;

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              40. An interactive tool for designing efficient toxicology experiments

              【外文期刊】 William,Gertsch ; Weng Kee,Wong ; 2024年98卷3期 1015-1022页

              【关键词】 Dose–response experiments; Optimal design; Design efficiency;

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              41. EcTracker:Tracking and elucidating ectopic expression leveraging large-scale scRNA-seq studies

              【外文期刊】 Vishakha Gautam ; Aayushi Mittal ; 等 2021年22卷6期 bbab237-1-bbab237-10页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 ectopic expression; single-cell; shiny;

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              42. Phylogenetic analysis of life-history adaptations in parasitic cowbirds [Review]

              【外文期刊】 Mermoz ME. Ornelas JF. ; 《Behavioral Ecology》 2004年15卷1期 109-119页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 Adaptation; Cowbirds; Eggshell;

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              43. Eatomics: Shiny Exploration of Quantitative Proteomics Data

              【外文期刊】 Kraus, Milena ; Stephen, Mariet Mathew ; 等 《Journal of proteome research》 2021年20卷1期 1070-1078页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 R Shiny; application; label-free;

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              44. Web-Based Search Tool for Visualizing Instrument Performance Using the Triple Knockout (TKO) Proteome Standard

              【外文期刊】 JeremyP. Gygi ; Qing Yu ; 等 《Journal of proteome research》 2019年18卷2期 687-693页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 ion interference; iTRAQ; shiny application;

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              45. metaPR2: A database of eukaryotic 18S rRNA metabarcodes with an emphasis on protists

              【外文期刊】 Daniel Vaulot ; Clarence Wei Hung Sim ; 等 《Molecular ecology resources》 2022年22卷8期 3188-3201页

              【关键词】 18S rRNA; database; metabarcodes;

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              46. Patient‐oriented research and the shiny object syndrome

              【外文期刊】 James A. Marcum ; 《Journal of evaluation in clinical practice.》 2023年29卷5期 721-725页

              【关键词】 evidence‐based practice; participatory research; patient‐oriented research;

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              47. OBSERVACIONES SOBRE LA REPRODUCCION Y EL CICLO VITAL DE PLUSIOTIS COSTATA BLANCHARD, 1851 (COLEOPTERA: MELOLONTHIDAE: RUTELINAE)

              【外文期刊】 Miguel Angel Morón ; 《Acta Zoologica Mexicana》 2010年26卷3期 705-720页 MEDLINE

              【关键词】 Anatomía; aparato reproductor; cópula;

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              48. catRlog: a photo-identification project management system based in R

              【外文期刊】 Keen, Eric M. ; Wren, Julia ; 等 《Mammalian Biology》 2022年102卷3期 995-1004页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 Photo-identification; R; Shiny;

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              49. EFFECT OF COWBIRD PARASITISM ON BROOD REDUCTION IN THE BROWN-AND-YELLOW MARSHBIRD

              【外文期刊】 Ruiz NMD ; Mermoz ME ; 等 《The condor》 2008年110卷3期 507-513页 SCISCIEMEDLINE

              【关键词】 brood parasitism; brood reduction; Brown-and-yellow Marshbird;

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              50. Host-parasite coevolution beyond the nestling stage? Mimicry of host fledglings by the specialist screaming cowbird

              【外文期刊】 De Marsico, Maria C. ; Gantchoff, Mariela G. ; 等 2012年279卷1742期 3401-3408页

              【关键词】 brood parasitism; mimicry; coevolution;

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