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【中文期刊】 Stefan Stanojevic Yijun Li  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷5期 836-849页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Recently developed technologies to generate single-cell genomic data have made a revo-lutionary impact in the field of b...

【关键词】 Single-cell； Multi-omics； Machine learning；

【中文期刊】 Muhammad Junaid Eun Jeong Lee  等 《中国神经再生研究（英文版）》 2025年20卷6期 1525-1540页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Elucidating the complex dynamic cellular organization in the hypothalamus is critical for understanding its role in coor...

【关键词】 cellular diversity； hypothalamus； multi-omics；

【中文期刊】 Yuan Gao Jinning Zhang  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年6期 1224-1231页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Although chromosomal mosaic embryos detected by trophectoderm(TE)biopsy offer healthy embryos available for transfer,hig...

【关键词】 Mosaicism； Pre-implantation genetic testing for aneuploidy； Next-generation sequencing；

【中文期刊】 杨品 任振华  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...

【关键词】 单细胞组学； 空间转录组学； 多模态组学；

【中文期刊】 孟倩 王依玟  等 《中国临床药理学与治疗学》 2024年29卷6期 690-699页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 缺血性脑卒中是一种致残率和死亡率较高的急性脑血管疾病,是中国最常见的死亡原因.尽管已有多年研究,但是仍没有脑卒中生物标志物,其分子机制在很大程度上仍不清楚.近十年来,单细胞测序技术作为高速发展起来的一门新兴技术,能够在单个细胞水平上对基因组...

【关键词】 缺血性脑卒中； 单细胞测序； 单细胞多组学；

【中文期刊】 徐琪 禹雷  等 《海南医学》 2024年35卷11期 1533-1544页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨结直肠癌恶性转变过程中的分子特征及其调控网络扰动,深入剖析结直肠癌恶性转变的微环境异质性并识别潜在治疗靶点.方法 首先从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中收集单细胞转录组测序数据,从欧洲分子生物学实验...

【关键词】 结直肠癌； 单细胞多组学数据； 转录调控网络；

【中文期刊】 王向东 Charles A.Powell  等 《中国临床医学》 2024年31卷5期 691-695页 ISTICCA

【摘要】 随着单细胞检测技术的迅速发展和成熟,单细胞生物学和病理学已成为了解疾病的新兴学科.然而,解决临床医生提出的关于如何将单细胞检测应用于临床实践、将单细胞系统生物学的信号转化为明确的临床表型、并预测患者对治疗反应的问题至关重要.本文提出了一个称...

【关键词】 人工智能； 基因测序； 医疗；

【中文期刊】 董艳 李军  等 《世界中医药》 2023年18卷14期 2081-2087,2091页 ISTICPKUCA

【摘要】 中医药是我国的传统和特色医学,一直以来为人们的健康保驾护航,但随着现代医学的发展,它逐渐面临着如何实现客观化、精确化和靶向化的难题.转录组学是连接基因与表型的桥梁,决定遗传物质表达与否,受外源和内源因素的共同调控,能反映内部基因组与外部物理...

【关键词】 中医药； 靶点； 分子机制；

【中文期刊】 方雯 孙洋  《中国药理学通报》 2023年39卷9期 1601-1606,1612页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 单细胞多组学测序技术是指在单个细胞水平上,对基因组学、表观基因组学、转录组学和蛋白质组学等,进行高通量测序分析的一项新技术,其能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性,在肿瘤学、发育生物学、免疫学及神经科学等领域发挥重要...

【关键词】 单细胞多组学； 单细胞测序； 单细胞技术；

【中文期刊】 Sarthak Sinha Ansuman T.Satpathy  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2021年19卷2期 172-190页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 How distinct transcriptional programs are enacted to generate cellular heterogeneity and plasticity,and enable complex f...

【关键词】 Single-cell ATAC-seq； Gene regulation； Epigenetics；

【中文期刊】 李丁 王婉瑩  等 《中草药》 2025年56卷2期 731-741页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 整合多组学策略为中药安全性评价开辟了新的研究视角,单细胞转录组学、蛋白质修饰组学、代谢组学、影像组学等前沿组学技术实现了从分子、细胞、组织到系统乃至整体不同层面揭示中药的毒性效应机制,帮助识别中药潜在毒性成分并发现特征生物标志物.基于中国知...

【关键词】 组学技术； 多组学策略； 中药；

【中文期刊】 彭涛 李士琪  等 《中国病原生物学杂志》 2023年18卷11期 1350-1354页 ISTICPKUCSCD

【关键词】 遗传多样性； 单细胞分离； 单细胞测序；

【中文期刊】 凌琪 郑树森  等 《中华外科杂志》 2020年58卷10期 737-740页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 肝移植是全球外科领域中的"皇冠"，也是国家医疗水平的重要体现。近半个世纪以来，我国肝移植事业取得了令人瞩目的进步，移植例数位居全球第二，移植存活率达到国际先进水平。但也必须看到我国从肝移植大国迈向强国的过程中，仍然存在诸多瓶颈问题亟须解决，...

【关键词】 肝移植； 基础研究； 多组学；

【中文期刊】 Zhuxia Li Guangdun Peng  《生物物理学报(英文)》 2022年8卷3期 119-135页

【关键词】 Spatial transcriptomics； Spatial data analysis； Spatial multi-omics；

【中文期刊】 Chaoyang Wang Xiaoying Fan  《生物物理学报(英文)》 2022年8卷3期 136-149页

【关键词】 Single-cell sequencing； Multi-omics； Cell heterogeneity；

【中文期刊】 《细胞研究（英文版）》 2017年27卷8期 967-988页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【关键词】 epigenome； single-cell COOL-seq； multi-omics sequencing；

【中文期刊】 《生殖与发育医学（英文）》 2017年1卷1期 30-35页 MEDLINECSCD

【摘要】 We have recently witnessed the rapid development of various single-cell sequencing technologies.Pioneering single cell a...

【关键词】 Early Embryonic Development； Multi-omics Assay； Reproductive Medicine；

【中文期刊】 Wenbo Guo Yining Hu  等 《遗传学报》 2023年50卷9期 641-651页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Spatial omics technologies have become powerful methods to provide valuable insights into cells and tissues within a com...

【关键词】 Laser capture microdissection； Spatial omics； Single-cell resolution；

【中文期刊】 Xabier Martinez-de-Morentin Sumeer A.Khan  等 《定量生物学（英文版）》 2023年11卷3期 246-259页

【摘要】 Background:Single-cell multi-omics technologies allow a profound system-level biology understanding of cells and tissues...

【关键词】 single-cell； multi-omic； Autoencoder；

【中文期刊】 Jianli Lin Xiaohui Xue  等 《细胞研究（英文版）》 2023年33卷11期 879-882页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【外文期刊】 Pinar Demetci ; Rebecca Santorella ; 等 2022年29卷1期 3-18页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 data integration; manifold alignment; multi-omics;

【外文期刊】 Gao Hongli ; Zhang Bin ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷3期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 single-cell multi-omics; information transfer; integration;

【外文期刊】 Athaya Tasbiraha ; Ripan Rony Chowdhury ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷5期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 multi-omics; single-cell; deep learning;

【外文期刊】 Soleto, Irene ; Jimenez-Saiz, Rodrigo ; 等 《Allergy》 2021年76卷8期 2644-2646页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 B cells; cell atlas; mass cytometry;

【外文期刊】 Zhang Feng ; Jiao Huiyuan ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷3期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 chromatin structure; single-cell chromatin accessibility; single-cell 3D genome structure;

【外文期刊】 Shojaee, Abbas ; Saavedra, Michelle ; 等 《Current opinion in plant biology》 2021年63卷 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Single cell; Chromatin accessibility; Plant biology;

【外文期刊】 Peng, Anghui ; Mao, Xiying ; 等 《Proteomics》 2020年20卷13期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 cancer immunotherapy; drug-resistance; multi-omics;

【外文期刊】 Yuru Han ; Congying Huang ; 等 《Journal of Alzheimer's disease: JAD》 2024年97卷3期 1033-1050页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Alzheimer's disease; heterogeneity; multi-omics;

【外文期刊】 Zhiqiang Yan ; Jianting An ; 等 2021年22卷6期 bbab208-1-bbab208-8页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 transcriptomics; epigenomics; early embryo;

【外文期刊】 Hong-Wei Zhang ; Chao Lv ; 等 《Biomedicine & pharmacotherapy =: Biomedecine & pharmacotherapie》 2021年141卷 111833-111833页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Natural product; Target discovery; Multi-omics technologies;

【外文期刊】 Velten, Britta ; Stegle, Oliver ; 2023年20卷10期 1462-1474页

【关键词】 GENE REGULATORY NETWORKS; COMMON COORDINATE FRAMEWORK; LONGITUDINAL MULTI-OMICS;

【外文期刊】 Mahdipour-Shirayeh, Ali ; Erdmann, Natalie ; 等 2022年23卷1期 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 single-cell RNA sequencing (scRNA-seq); copy number variation (CNV); normalization;

【外文期刊】 deMel, Sanjay ; Scolnick, Jonahtan ; 等 《Clinical lymphoma, myeloma & leukemia》 2021年21卷Suppl.1期 S432-S432页

【关键词】 multiple myeloma; t(4; 14);

【外文期刊】 Gillen, Joseph ; Bridgwater, Caleb ; 等 《Expert review of proteomics》 2020年17卷1/6期 341-354页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Proteomics; immunology; post-translational modifications;

【外文期刊】 Li, Zhicen ; Wei, Yifan ; 等 《Brain tumor pathology》 2021年38卷3期 234-242页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Medulloblastoma; Single-cell sequencing; Multi-omics analysis;

【外文期刊】 Jennie R. Lill ; William R. Mathews ; 等 2021年18卷7/12期 503-526页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 Biological mass spectrometry; biomarkers; chemoproteomics;

【外文期刊】 Derek H,Janssens ; Dominik J,Otto ; 等 《Genome biology》 2022年23卷1期 81页 SCIMEDLINE

【关键词】 Chromatin profiling; Epigenomic signal deconvolution; Multi-omics;

【外文期刊】 Joseph,Gillen ; Caleb,Bridgwater ; 等 《Expert review of proteomics》 2020年17卷5期 341-354页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 Proteomics; extracellular signaling; immunology;

【外文期刊】 Jordi,Dachs ; Maria,Vila-Costa ; 《Environmental science & technology》 2022年56卷15期 10550-10552页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 bioaccumulation; bioconcentration; multi-omics;

【外文期刊】 Xing,You ; Qiong,Yang ; 等 《Frontiers in genetics》 2021年12卷 790990页

【关键词】 T cells; aplastic anemia; metabolomics;

【外文期刊】 Xin,Ma ; Lijing,Lin ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2024年26卷1期 SCIMEDLINEBP

【关键词】 gene regulation; machine learning; multi-omics;

【外文期刊】 Mukesh,Jain ; 《Current opinion in plant biology》 2024年82卷 102662页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 Abiotic stress; Cell population; Multi-omics;

【外文期刊】 Dominik,Trzupek ; Melanie,Dunstan ; 等 《Genome medicine》 2020年12卷1期 55页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 AbSeq; C-C chemokine receptor type 9 (CCR9); CD4+ T cells;

【外文期刊】 Fabrizia,Bonacina ; Alessia,Di Costanzo ; 等 《Atherosclerosis》 2023年372卷 48-56页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 Atherosclerosis therapy; Cell activation; Cell plasticity;

【外文期刊】 Zhongkang,Li ; Haihan,Gu ; 等 《Frontiers in immunology》 2023年14卷 1288027页

【关键词】 multi-omics; ovarian cancer; single-cell sequencing;

【外文期刊】 Jiamiao,Yuan ; Kangning,Dong ; 等 《Cell genomics》 2024年4卷12期 100703页

【关键词】 anterior cingulate cortex; brain development; cis-regulatory element;

【外文期刊】 L F,Piochi ; A T,Gaspar ; 等 《Advances in protein chemistry and structural biology》 2022年131卷 45-83页

【关键词】 Drug development; Integrative analysis; Ligands;

【外文期刊】 Haiyang,Yu ; Gao,Si ; 等 《Journal of Cancer》 2024年15卷7期 1940-1953页 SCIMEDLINE

【关键词】 Causal Relationships; Esophageal Cancer; Mendelian Randomization;

【外文期刊】 Zhicen,Li ; Yifan,Wei ; 等 《Brain tumor pathology》 2021年38卷3期 234-242页 SCIMEDLINE

【关键词】 Medulloblastoma; Multi-omics analysis; Single-cell sequencing;

【外文期刊】 Vasilios,Zachariadis ; Huaitao,Cheng ; 等 《Molecular cell》 2020年80卷3期 541-553.e5页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 cancer genomics; copy number variation; double-strand break;