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【中文期刊】 曾帮智 高显舜 等 《延安大学学报（医学科学版）》 2026年24卷1期 15-24页
【摘要】 目的 利用生物信息学分析方法筛选出中性粒细胞胞外陷阱相关基因(neutrophil extracellular trap-related genes,NRG)与间质性膀胱炎(interstitial cystitis,IC)的核心差异表达基...
【关键词】 间质性膀胱炎；中性粒细胞胞外陷阱相关基因；生物信息学分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Leibovich, Zehavit ; Gronau, Ilan ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2022年29卷9期 974-986页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 pattern elimination;pattern matching;string algorithms;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Alberto Apostolico ; Mary Ellen Bock ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2000年7卷1/2期 71-94页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Design and analysis of algorithms;combinatorics on strings;pattern matching;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Chen, Zhi-Zhong ; Wang, Lusheng ; 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2011年8卷5期 1400-1410页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 DNA motif discovery.;Parameterized algorithm;closest string;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Pellow, David ; Filippova, Darya ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2017年24卷6期 547-557页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Yusah, K. M. ; Fayle, T. M. ; 等 《Biotropica》 2012年44卷1期 73-81页SCISCIE
【关键词】 fogging;Formicidae;greedy algorithm;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Alberto Apostolico ; Laxmi Parida ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2004年11卷1期 15-25页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 design and analysis of algorithms;string matching;pattern discovery;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Sudhakar Tripathi ; Ravi Bhushan Mishra ; 等 《International journal of bioinformatics research and applications》 2019年15卷3期 254-271页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Maulik, U. ; Mukhopadhyay, A. ; 等 《IEEE transactions on information technology in biomedicine: A publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society》 2009年13卷6期 969-975页
【关键词】 Biclustering;mean squared residue (MSR);multiobjective genetic algorithm (GA);
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Maulik, U. ; Mukhopadhyay, A. ; 等 《IEEE transactions on information technology in biomedicine: A publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society》 2009年13卷6期 969-975页
【关键词】 Biclustering;mean squared residue (MSR);multiobjective genetic algorithm (GA);
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Bonizzoni, Paola ; Della Vedova, Gianluca ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2016年23卷3期 137-149页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 string graphs;external-memory algorithms;Burrows-Wheeler transform;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Bonizzoni P. ; Vedova G.D. ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2007年4卷4期 535-543页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Marschall, Tobias ; Herms, Inke ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2012年9卷6期 1737-1750页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 DNA sequencing;Probabilistic automaton;alignment seed;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Vladimir Paar ; Ivan Basar ; 等 《Current genomics》 2007年8卷2期 93-111页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Human genome;alpha satellite;alphoid;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Sanghamitra Bandyopadhyay ; Angshuman Bagchi ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2005年3卷5期 1053-1070页MEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Chan, Yuandong ; Xu, Kai ; 等 《Current Bioinformatics》 2018年13卷5期 479-486页
【关键词】 Approximate string matching;Myers algorithm;Levenshtein distance;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Eastick, Jessica ; Venetis, Christos ; 等 《Zygote》 2023年31卷1期 78-84页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Tao Jiang ; Guohui Lin ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2002年9卷2期 371-388页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Jang, Hoon ; Ozkaynak, Mustafa ; 等 《The journal of asthma》 2021年58卷2期 180-189页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Emergency department;exact-string matching algorithm;pediatric asthma;
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Hoon,Jang ; Mustafa,Ozkaynak ; 等 《The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma》 2021年58卷2期 180-189页SCIMEDLINE
【关键词】 Emergency department;exact-string matching algorithm;pediatric asthma;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Zehavit,Leibovich ; Ilan,Gronau ; 《Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology》 2022年29卷9期 974-986页SCIMEDLINECABP
【关键词】 pattern elimination;pattern matching;string algorithms;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Shibdas,Bandyopadhyay ; Sartaj,Sahni ; 等 《IEEE ... International Conference on Computational Advances in Bio and Medical Sciences : [proceedings]. IEEE International Conference on Computational Advances in Bio and Medical Sciences》 1-6页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Yongki,Lee ; Taewon,Ahn ; 等 《Sensors (Basel, Switzerland)》 2020年20卷24期 SCIMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Ricardo,Palma Fraga ; Ziho,Kang ; 等 《Journal of eye movement research》 2024年17卷3期
【关键词】 Jaccard coefficient similarity;air traffic control;eye movement;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Felipe A,Louza ; Guilherme P,Telles ; 等 《Algorithms for molecular biology : AMB》 2017年12卷 26页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Burrows–Wheeler transform;External memory algorithms;LCP array;
- 概要：
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【外文期刊】 Shibdas,Bandyopadhyay ; Sartaj,Sahni ; 等 《Algorithms》 2013年6卷4期 805-823页
【关键词】 Planted motif search;multi-core algorithms;parallel string algorithms;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Jana,Novotná ; Karolina,Okrasa ; 等 《Algorithmica》 2021年83卷8期 2634-2650页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Paola,Bonizzoni ; Gianluca Della,Vedova ; 等 《Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology》 2016年23卷3期 137-49页SCIMEDLINECABP
【关键词】 Burrows-Wheeler transform;external-memory algorithms;string graphs;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Ivan,Markić ; Maja,Štula ; 等 《Entropy (Basel, Switzerland)》 2020年23卷1期
【关键词】 algorithm efficiency;algorithm performance;comparison;
- 概要：
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【外文期刊】 Joyanta,Basak ; Nidhibahen,Shah ; 等 《Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology》 15578666261421965页SCIMEDLINECABP
- 概要：
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【外文期刊】 Mark,Brooke ; Yair,Censor ; 等 《International transactions in operational research : a journal of The International Federation of Operational Research Societies》 2023年30卷1期 181-205页
- 概要：
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【外文期刊】 Yu-Ting,Si ; Xue-Song,Xiong ; 等 《Biosensors & bioelectronics》 2024年262卷 116530页SCIMEDLINECABP
【关键词】 Chronic non-atrophic gastritis;Gastric fluid;Intestinal metaplasia;
- 概要：
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【外文期刊】 Abdullah Ammar,Karcioglu ; Hasan,Bulut ; 《Computers in biology and medicine》 2021年136卷 104656页SCIMEDLINEBP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Zsuzsanna,Lipták ; Francesco,Masillo ; 等 《Algorithms for molecular biology : AMB》 2024年19卷1期 11页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Compressed representation;Data structures;Efficient algorithms;
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Abdullah Ammar,Karcioglu ; Hasan,Bulut ; 《Computers in biology and medicine》 2021年131卷 104292页SCIMEDLINEBP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Vladimir,Paar ; Ivan,Basar ; 等 《Current genomics》 2007年8卷2期 93-111页SCIMEDLINECABP
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Borut,Žalik ; Damjan,Strnad ; 等 《Entropy (Basel, Switzerland)》 2023年25卷12期
【关键词】 Hilbert space filling curve;algorithm;computer science;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Keiko,Udaka ; Hiroshi,Mamitsuka ; 等 《Journal of biological physics》 2002年28卷2期 183-94页SCIMEDLINEBP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 David,Pellow ; Darya,Filippova ; 等 《Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology》 2017年24卷6期 547-557页SCIMEDLINECABP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Farah,Haneef ; Muddassar A,Sindhu ; 《Big data》 2024年12卷6期 446-455页
【关键词】 delta inverse transitions;distinguishing string;grammatical inference;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Giulia,Bernardini ; Chang,Liu ; 等 《Data mining and knowledge discovery》 2025年39卷2期 12页
【关键词】 Forbidden patterns;Missing value replacement;String algorithms;
- 概要：
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【外文期刊】 Travis,Gagie ; Simon J,Puglisi ; 《Frontiers in bioengineering and biotechnology》 2015年3卷 12页
【关键词】 approximate pattern matching;data compression;genomic databases;
- 概要：
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【外文期刊】 W F,Smyth ; 《Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences》 2014年372卷2016期 20130138页
【关键词】 algorithm;large scale;massive data;
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【外文期刊】 Sven,Schrinner ; Manish,Goel ; 等 《Algorithms for molecular biology : AMB》 2021年16卷1期 11页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Alignment;Assembly;Longest subsequence;
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